СПТБН5

СПТБН5
Идентификаторы
Псевдонимы	SPTBN5 , BSPECV, HUBSPECV, HUSPECV, спектрин бета, неэритроцитарный 5
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605916; МГИ : 2685200; Гомологен : 41150; GeneCards : SPTBN5; OMA :SPTBN5 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 15 (человек)
Конец	41,894,053 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	119,916,159 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	икроножный нерв; ; полушарие мозжечка; ; правое полушарие мозжечка; ; яичко; ; верхушка сердца; ; пигментный эпителий сетчатки; ; кожа живота; ; гранулоцит; ; левый желудочек; ; правая доля щитовидной железы;
	Верх выражен в
	пищевод; ; мышца бедра; ; Гипоталамус; ; мышечная ткань; ; скелетная мышечная ткань; ; четырехглавая мышца бедра; ; губа; ; полосатое тело нейрона; ; зона кожи; ; островок Лангерганса;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание динактина; самоассоциация белков; связывание кинезина; связывание миозина с хвостом; связывание актина; динеин промежуточное связывание цепи; связывание спектрина;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; спектрин; мембрана; фоторецептор, соединяющий ресничку; фоторецепторный дисковый мембранный; цитоскелет; центр организации микротрубочек; нитевидный актин;
Биологический процесс	организация Гольджи; каскад МАРК; аксонное руководство; транспорт от эндоплазматического ретикулума к везикулам Гольджи; укупоривание актиновых нитей; лизосомальный транспорт; гомоолигомеризация белка; организация актинового цитоскелета;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	51332
	640524
	ENSG00000137877
	ENSMUSG00000074899
	Q9NRC6
	н/д
	NM_016642
	NM_001370938
	NP_057726
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Спектрин, бета, неэритроцитарный 5, также известный как SPTBN5 , представляет собой белок , который у людей кодируется геном SPTBN5 . [ ^5] SPTBN5 принадлежит к семейству спектринов цитоскелетных белков.

Структура и функции

SPTBN5 содержит следующие домены : ^[5]

актин-связывающий домен
домен мембранной ассоциации-1
домен самоассоциации
С-концевой домен гомологии плекстрина .

На основании этих структурных особенностей предполагается, что SPTBN5, вероятно, образует гетеродимеры и олигомеры с альфа-спектрином и напрямую взаимодействует с клеточными мембранами. ^[5]

SPTBN5 высоко экспрессируется в эмбриональных тельцах . ^[6]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000137877 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000074899 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ abc Stabach PR, Morrow JS (июль 2000 г.). «Идентификация и характеристика бета-V-спектрина, ортолога бета-H-спектрина у млекопитающих». J. Biol. Chem . 275 (28): 21385– 95. doi : 10.1074/jbc.C000159200 . PMID 10764729.
^ Чаеркади Р., Керр К. Л., Маримуту А., Келкар Д. С., Кашьяп М. К., Гучек М., Гирхарт Дж. Д., Пандей А. (январь 2009 г.). «Временной анализ нейронной дифференциации с использованием количественной протеомики». J. Proteome Res . 8 (3): 1315– 26. doi :10.1021/pr8006667. PMC 2693473. PMID 19173612 .

Дальнейшее чтение

Оделл А.Ф., Ван Хелден Д.Ф., Скотт Дж.Л. (2008). «Цитоскелет спектрина влияет на поверхностную экспрессию и активацию каналов 4 транзиторного рецепторного потенциала человека». J. Biol. Chem . 283 (7): 4395– 407. doi : 10.1074/jbc.M709729200 . hdl : 1959.13/39937 . PMID 18048348.
Огури М., Като К., Ёкой К. и др. (2010). «Оценка полиморфизма SDK1 при гипертонии у японцев». Am. J. Hypertens . 23 (1): 70–7 . doi : 10.1038/ajh.2009.190 . PMID 19851296.
Shoeman RL, Hartig R, Hauses C, Traub P (2002). «Организация очаговых адгезионных бляшек нарушается под действием протеазы ВИЧ-1». Cell Biol. Int . 26 (6): 529–39 . doi :10.1006/cbir.2002.0895. PMID 12119179. S2CID 39778155.
Chardin P, Camonis JH, Gale NW и др. (1993). "Человеческий Sos1: фактор обмена гуаниновых нуклеотидов для Ras, который связывается с GRB2". Science . 260 (5112): 1338– 43. Bibcode :1993Sci...260.1338C. doi :10.1126/science.8493579. PMID 8493579.

Эта статья о гене на хромосоме 15 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000137877 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000074899 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10764729-5] Stabach PR, Morrow JS (июль 2000 г.). «Идентификация и характеристика бета-V-спектрина, ортолога бета-H-спектрина у млекопитающих». J. Biol. Chem . 275 (28): 21385– 95. doi : 10.1074/jbc.C000159200 . PMID 10764729.

[pmid19173612-6] Чаеркади Р., Керр К. Л., Маримуту А., Келкар Д. С., Кашьяп М. К., Гучек М., Гирхарт Дж. Д., Пандей А. (январь 2009 г.). «Временной анализ нейронной дифференциации с использованием количественной протеомики». J. Proteome Res . 8 (3): 1315– 26. doi :10.1021/pr8006667. PMC 2693473. PMID 19173612 .