СПСБ1

СПСБ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2JK9, 3F2O
Идентификаторы
Псевдонимы	SPSB1 , SSB-1, SSB1, домен рецептора splA/рианодина и блок SOCS, содержащий 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 611657; МГИ : 1921896; Гомологен : 11832; Генные карты : SPSB1; OMA :SPSB1 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	9,369,532 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	150,039,500 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	децидуальная оболочка; ; Нисходящая грудная аорта; ; восходящая аорта; ; большеберцовые артерии; ; слизистая оболочка желудка; ; подкожная вена; ; желчный пузырь; ; полая вена; ; правая коронарная артерия; ; левая коронарная артерия;
	Верх выражен в
	децидуальная оболочка; ; кучевые ячейки; ; гаструла; ; сердечная мышечная ткань левого желудочка; ; молярный; ; восходящая аорта; ; эпителий хрусталика; ; аортальный клапан; ; средняя оболочка зоны аорты; ; лодыжка;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; активность убиквитин-протеинтрансферазы; активность адаптера убиквитинлигазы-субстрата;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; SCF убиквитин лигазный комплекс;
Биологический процесс	убиквитинирование белка; полиубиквитинирование белков; посттрансляционная модификация белка; убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка; опосредованный протеасомой убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	80176
	74646
	ENSG00000171621
	ENSMUSG00000039911
	Q96BD6
	Q9D5L7
	NM_025106
	NM_029035
	NP_079382
	NP_083311
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок SOCS-box 1, содержащий домен SPRY, представляет собой белок , который у людей кодируется геном SPSB1 . ^[5]^[6]^[7]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000171621 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000039911 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ван Д., Ли З., Мессинг Э.М., Ву Г. (апрель 2005 г.). «Содержащий домен SPRY белок SOCS box 1 (SSB-1) взаимодействует с MET и усиливает путь элемента ответа сыворотки Erk-Elk-1, индуцированный фактором роста гепатоцитов». J Biol Chem . 280 (16): 16393– 401. doi : 10.1074/jbc.M413897200 . PMID 15713673.
^ Kile BT, Schulman BA, Alexander WS, Nicola NA, Martin HM, Hilton DJ (июнь 2002 г.). «Коробка SOCS: история разрушения и деградации». Trends Biochem Sci . 27 (5): 235– 41. doi :10.1016/S0968-0004(02)02085-6. PMID 12076535.
^ «Ген Entrez: домен рецептора SPSB1 splA/рианодина и блок SOCS, содержащий 1».

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY и др. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Anal. Biochem . 236 (1): 107– 13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC и др. (1997). «Масштабное конкатенационное секвенирование ДНК». Genome Res . 7 (4): 353– 8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Woo JS, Imm JH, Min CK и др. (2006). «Структурное и функциональное понимание домена B30.2/SPRY». EMBO J . 25 (6): 1353– 63. doi :10.1038/sj.emboj.7600994. PMC 1422157 . PMID 16498413.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация человеческой хромосомы 1». Nature . 441 (7091): 315– 21. Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 1 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000171621 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000039911 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid15713673-5] Ван Д., Ли З., Мессинг Э.М., Ву Г. (апрель 2005 г.). «Содержащий домен SPRY белок SOCS box 1 (SSB-1) взаимодействует с MET и усиливает путь элемента ответа сыворотки Erk-Elk-1, индуцированный фактором роста гепатоцитов». J Biol Chem . 280 (16): 16393– 401. doi : 10.1074/jbc.M413897200 . PMID 15713673.

[pmid12076535-6] Kile BT, Schulman BA, Alexander WS, Nicola NA, Martin HM, Hilton DJ (июнь 2002 г.). «Коробка SOCS: история разрушения и деградации». Trends Biochem Sci . 27 (5): 235– 41. doi :10.1016/S0968-0004(02)02085-6. PMID 12076535.

[entrez-7] «Ген Entrez: домен рецептора SPSB1 splA/рианодина и блок SOCS, содержащий 1».