Домен SET, содержащий 6, представляет собой белок у людей, который кодируется геном SETD6 . [ 5]
SETD6 монометилирует субъединицу RelA ядерного фактора каппа B (NF-κB). Монометилирование RelA по лизину 310 (RelAK310me1) приводит к конститутивной репрессии целевых генов RelA путем привлечения белка PKMT G9a (GLP), который катализирует H3K9me2 и приводит к подавлению хроматина и репрессии генов. В ответ на стимуляцию TNFa и липополисахаридом фосфорилирование RelA по серину 311 (RelAS311ph) PKCzeta физически блокирует взаимодействие между GLP и RelAK310me1, что приводит к активации транскрипции. [6]
Метилирование PAK4 с помощью SETD6 способствует активации пути Wnt/β-катенина. SETD6 связывает и метилирует PAK4 как in vitro, так и в клетках на хроматине. Истощение SETD6 в различных клеточных линиях приводит к резкому снижению экспрессии целевых генов Wnt/β-катенина. [7]
SETD6 связывается с DJ1, но не метилирует его. В базальных условиях SETD6 и DJ1 связываются с хроматином, который ингибирует DJ1 для активации транскрипционной активности Nrf2. В ответ на окислительный стресс уровни мРНК и белка SETD6 резко снижаются. [8]
SETD6 специфически связывает и метилирует PLK1 во время митоза в K209 и K413. Истощение SETD6, а также двойная замена остатков лизина (K209/413R) приводит к повышению каталитической активности PLK1, что приводит к ускорению различных стадий митоза, заканчивающихся ранним цитокинезом. [9]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000103037 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031671 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Entrez Gene: SET domain contain 6". Архивировано из оригинала 2010-12-05 . Получено 2017-11-01 .
^ Леви Д., Куо AJ, Чанг Ю, Шефер Ю, Китсон С, Чунг П, Эспехо А, Зи БМ, Лю КЛ, Тангсомбатвисит С, Теннен Р.И., Куо AY, Танцзин С., Ченг Р., Чуа К.Ф., Утц П.Дж., Ши X, Принджа РК, Ли К., Гарсия Б.А., Бедфорд М.Т., Тараховский А, Ченг X, Гозани О (январь 2011 г.). «Метилирование лизина субъединицы RelA NF-κB с помощью SETD6 связывает активность гистон-метилтрансферазы GLP в хроматине с тонической репрессией передачи сигналов NF-κB». Природная иммунология . 12 (1): 29–36 . doi :10.1038/ni.1968. ПМК 3074206 . PMID 21131967.
^ Вершинин З., Фельдман М., Чен А., Леви Д. (март 2016 г.). «Метилирование PAK4 с помощью SETD6 способствует активации пути Wnt/β-катенина». Журнал биологической химии . 291 (13): 6786–95 . doi : 10.1074/jbc.M115.697292 . PMC 4807267. PMID 26841865 .
^ Чен А, Фельдман М, Вершинин З, Леви Д (февраль 2016 г.). «SETD6 — отрицательный регулятор ответа на окислительный стресс». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Механизмы регуляции генов . 1859 (2): 420–7 . doi :10.1016/j.bbagrm.2016.01.003. PMID 26780326.
^ Фельдман М., Вершинин З., Голианд И., Элиа Н., Леви Д. (январь 2019 г.). «Метилтрансфераза SETD6 регулирует митотическую прогрессию посредством метилирования PLK1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (4): 1235– 1240. Bibcode : 2019PNAS..116.1235F. doi : 10.1073/pnas.1804407116 . PMC 6347700. PMID 30622182 .
Дальнейшее чтение
Weil LE, Shmidov Y, Kublanovsky M, Morgenstern D, Feldman M, Bitton R, Levy D (октябрь 2018 г.). «Олигомеризация и автометилирование человеческой лизинметилтрансферазы SETD6». Журнал молекулярной биологии . 430 (21): 4359– 4368. doi :10.1016/j.jmb.2018.08.028. PMID 30189201. S2CID 52167348.
Кублановский М., Ахарони А., Леви Д. (июль 2018 г.). «Улучшенное распознавание субстрата PKMT посредством взаимодействий неактивного сайта». Biochemical and Biophysical Research Communications . 501 (4): 1029– 1033. doi : 10.1016/j.bbrc.2018.05.103. PMID 29778536. S2CID 205956659.
Фельдман М., Леви Д. (январь 2018 г.). «Пептидное ингибирование каталитической активности метилтрансферазы SETD6». Oncotarget . 9 (4): 4875– 4885. doi :10.18632/oncotarget.23591. PMC 5797019 . PMID 29435148.
Мартин-Моралес Л., Фельдман М., Вершинин З., Гарре П., Кальдес Т., Леви Д. (ноябрь 2017 г.). «Доминантно-негативная мутация SETD6 при семейном колоректальном раке типа X». Молекулярная генетика человека . 26 (22): 4481–4493 . doi : 10.1093/hmg/ddx336 . ПМИД 28973356.
Chang Y, Levy D, Horton JR, Peng J, Zhang X, Gozani O, Cheng X (август 2011 г.). «Структурная основа SETD6-опосредованной регуляции сети NF-kB посредством сигнализации метиллизина». Nucleic Acids Research . 39 (15): 6380– 9. doi :10.1093/nar/gkr256. PMC 3159447. PMID 21515635 .
Levy D, Liu CL, Yang Z, Newman AM, Alizadeh AA, Utz PJ, Gozani O (октябрь 2011 г.). "Протеомный подход к идентификации новых субстратов лизинметилтрансферазы". Epigenetics & Chromatin . 4 : 19. doi : 10.1186/1756-8935-4-19 . PMC 3212905 . PMID 22024134.
