С100А6

С100А6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1К8У, 1К96, 1К9К, 1К9П, 2М1К, 4YBH
Идентификаторы
Псевдонимы	S100A6 , 2A9, 5B10, CABP, CACY, PRA, S100 кальцийсвязывающий белок A6, S10A6
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 114110; МГИ : 1339467; гомологен : 7925; Генные карты : S100A6; ОМА :S100A6 - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	153,536,244 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	90,531,488 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Ахиллово сухожилие; ; слизистая оболочка поперечно-ободочной кишки; ; восходящая аорта; ; верхняя доля левого легкого; ; Нисходящая грудная аорта; ; правая коронарная артерия; ; левая коронарная артерия; ; правое легкое; ; обонятельная зона слизистой оболочки носа; ; большеберцовый нерв;
	Верх выражен в
	строма роговицы; ; переходный эпителий мочевого пузыря; ; левая кишка; ; децидуальная оболочка; ; гаструла; ; гранулоцит; ; эндотелиальная клетка лимфатического сосуда; ; пуповина; ; слизистая клетка желудка; ; кожа наружного уха;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ионов кальция; Связывание белка S100; активность гомодимеризации белка; активность трансмембранного переносчика ионов; связывание ионов цинка; связывание ионов металлов; кальций-зависимое связывание белков; связывание белков; связывание тропомиозином;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; ядерная оболочка; мембрана; рябить; внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны; плазматическая мембрана; перинуклеарная область цитоплазмы; внеклеточная экзосома; ядро; внеклеточная область; внеклеточный матрикс, содержащий коллаген;
Биологический процесс	аксоногенез; позитивная регуляция пролиферации фибробластов; трансмембранный транспорт ионов; передача сигнала;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6277
	20200
	ENSG00000197956
	ENSMUSG00000001025
	Р06703
	Р14069
	NM_014624
	NM_011313
	NP_055439
	NP_035443
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Человеческий белок и кодирующий ген

S100 кальций-связывающий белок A6 ( S100A6 ) — это белок , который у людей кодируется геном S100A6 .^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков S100, содержащих 2 EF-hand кальций-связывающих мотива. Белки S100 локализуются в цитоплазме и/или ядре широкого спектра клеток и участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, таких как прогрессирование клеточного цикла и дифференциация. Гены S100 включают по крайней мере 13 членов, которые расположены в виде кластера на хромосоме 1q21. Этот белок может функционировать в стимуляции Ca2+-зависимого высвобождения инсулина, стимуляции секреции пролактина и экзоцитоза. Хромосомные перестройки и измененная экспрессия этого гена были связаны с меланомой. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что S100A6 взаимодействует с S100B ^[6]^[7] и SUGT1 . ^[8]

Патология

S100A6 будет представлен как возможный диагностический маркер папиллярного рака щитовидной железы . ^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000197956 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000001025 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab "Ген Энтреза: S100A6 S100 кальций-связывающий белок A6".
^ Deloulme JC, Assard N, Mbele GO, Mangin C, Kuwano R, Baudier J (ноябрь 2000 г.). «S100A6 и S100A11 являются специфическими мишенями связывающего кальций и цинк белка S100B in vivo». J. Biol. Chem . 275 (45): 35302– 10. doi : 10.1074/jbc.M003943200 . PMID 10913138.
^ Yang Q, O'Hanlon D, Heizmann CW, Marks A (февраль 1999 г.). «Демонстрация образования гетеродимера между S100B и S100A6 в дрожжевой двугибридной системе и меланоме человека». Exp. Cell Res . 246 (2): 501– 9. doi :10.1006/excr.1998.4314. PMID 9925766.
^ Nowotny M, Spiechowicz M, Jastrzebska B, Filipek A, Kitagawa K, Kuznicki J (июль 2003 г.). «Взаимодействие Sgt1 с S100A6 (кальцином) и другими белками S100, регулируемое кальцием». J. Biol. Chem . 278 (29): 26923– 8. doi : 10.1074/jbc.M211518200 . PMID 12746458.
^ Софиадис А, Динец А, Орре ЛМ, Бранка РМ, Юхлин КК, Фукакис Т, Валлин Г, Хёог А, Хульчий М, Зедениус Дж, Ларссон К, Лехтио Дж (октябрь 2010 г.). «Протеомное исследование опухолей щитовидной железы выявляет частую ап-регуляцию белка S100A6, связывающего Ca2+, при папиллярной карциноме щитовидной железы». Thyroid . 20 (10): 1067–76 . doi :10.1089/thy.2009.0400. PMID 20629554.

Дальнейшее чтение

Schäfer BW, Heizmann CW (1996). «Семейство S100 EF-hand кальций-связывающих белков: функции и патология». Trends Biochem. Sci . 21 (4): 134– 40. doi :10.1016/S0968-0004(96)80167-8. PMID 8701470.
Minami H, Tokumitsu H, Mizutani A, Watanabe Y, Watanabe M, Hidaka H (1992). "Специфическое связывание CAP-50 с кальцициклином". FEBS Lett . 305 (3): 217– 9. doi : 10.1016/0014-5793(92)80671-3 . PMID 1299619.
Engelkamp D, Schäfer BW, Erne P, Heizmann CW (1992). "S100 alpha, CAPL и CACY: молекулярное клонирование и анализ экспрессии трех кальций-связывающих белков из человеческого сердца". Биохимия . 31 (42): 10258– 64. doi :10.1021/bi00157a012. PMID 1384693.
Томида Y, Терасава M, Кобаяши R, Хидака H (1992). «Кальциклин и кальваскулин присутствуют в тромбоцитах человека». Biochem. Biophys. Res. Commun . 189 (3): 1310– 6. doi :10.1016/0006-291X(92)90216-8. PMID 1482346.
Filipek A, Gerke V, Weber K, Kuźnicki J (1991). "Характеристика белка кальцициклина, регулируемого клеточным циклом, из клеток асцитной опухоли Эрлиха. Идентификация двух связывающих белков, полученных с помощью Ca2(+)-зависимой аффинной хроматографии". Eur. J. Biochem . 195 (3): 795– 800. doi : 10.1111/j.1432-1033.1991.tb15768.x . PMID 1999197.
Murphy LC, Murphy LJ, Tsuyuki D, Duckworth ML, Shiu RP (1988). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей высококонсервативный, предполагаемый белок связывания кальция, идентифицированный с помощью антисыворотки к рецептору пролактина». J. Biol. Chem . 263 (5): 2397– 401. doi : 10.1016/S0021-9258(18)69220-8 . PMID 2448309.
Габиус Х. Дж., Бардоси А., Габиус С., Хеллманн КП., Карас М., Кратцин Х. (1989). «Идентификация продукта гена, зависящего от клеточного цикла, как белка, связывающего сиаловую кислоту». Biochem. Biophys. Res. Commun . 163 (1): 506– 12. doi :10.1016/0006-291X(89)92166-9. PMID 2775283.
Феррари С., Калабретта Б., деРиэль Дж.К., Баттини Р., Геццо Ф., Лорет Э., Гриффин С., Эмануэль Б.С., Гурриери Ф., Басерга Р. (1987). «Структурный и функциональный анализ гена, регулирующего рост, человеческого кальциклина». Ж. Биол. Хим . 262 (17): 8325–32 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)47567-9 . hdl : 11380/811306 . ПМИД 3036810.
Калабретта Б., Баттини Р., Качмарек Л., де Риель Дж.К., Басерга Р. (1986). «Молекулярное клонирование кДНК для гена, индуцируемого фактором роста, с сильной гомологией с S-100, кальций-связывающим белком». Ж. Биол. Хим . 261 (27): 12628– 32. doi : 10.1016/S0021-9258(18)67137-6 . hdl : 11380/811299 . ПМИД 3755724.
Schäfer BW, Wicki R, Engelkamp D, Mattei MG, Heizmann CW (1995). "Выделение клона YAC, охватывающего кластер из девяти генов S100 на человеческой хромосоме 1q21: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100". Genomics . 25 (3): 638– 43. doi :10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID 7759097.
Engelkamp D, Schäfer BW, Mattei MG, Erne P, Heizmann CW (1993). «Шесть генов S100 сгруппированы на человеческой хромосоме 1q21: идентификация двух генов, кодирующих два ранее не описанных кальций-связывающих белка S100D и S100E». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (14): 6547– 51. Bibcode : 1993PNAS...90.6547E. doi : 10.1073/pnas.90.14.6547 . PMC 46969. PMID 8341667 .
Филипек А, Войда У (1996). «p30, новый белок-мишень мышиного кальциклина (S100A6)». Биохим. Дж . 320 (Часть 2) (Часть 2): 585–7 . doi : 10.1042/bj3200585. ПМЦ 1217969 . ПМИД 8973570.
Kordowska J, Stafford WF, Wang CL (1998). «Ca2+ и Zn2+ связываются с разными сайтами и вызывают разные конформационные изменения в человеческом кальциклине». Eur. J. Biochem . 253 (1): 57– 66. doi :10.1046/j.1432-1327.1998.2530057.x. PMID 9578461.
Yang Q, O'Hanlon D, Heizmann CW, Marks A (1999). «Демонстрация образования гетеродимера между S100B и S100A6 в дрожжевой двугибридной системе и меланоме человека». Exp. Cell Res . 246 (2): 501– 9. doi :10.1006/excr.1998.4314. PMID 9925766.
Sudo T, Hidaka H (1999). "Характеристика сайта связывания кальцициклина (S100A6) аннексина XI-A с помощью направленного мутагенеза". FEBS Lett . 444 (1): 11– 4. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00014-9 . PMID 10037139.
Deloulme JC, Assard N, Mbele GO, Mangin C, Kuwano R, Baudier J (2000). "S100A6 и S100A11 являются специфическими мишенями связывающего кальций и цинк белка S100B in vivo". J. Biol. Chem . 275 (45): 35302– 10. doi : 10.1074/jbc.M003943200 . PMID 10913138.
Li Y, Yang L, Cui JT, Li WM, Guo RF, Lu YY (2002). «Построение анализа различий в репрезентативных ДНК на основе двух библиотек ДНК и идентификация генов экспрессии, индуцируемых чесноком, в клетках рака желудка человека». World J. Gastroenterol . 8 (2): 208– 12. doi : 10.3748/wjg.v8.i2.208 . PMC 4658352 . PMID 11925593.
Otterbein LR, Kordowska J, Witte-Hoffmann C, Wang CL, Dominguez R (2002). "Кристаллические структуры S100A6 в состояниях, свободных от Ca(2+) и связанных с Ca(2+): механизм сенсора кальция белков S100, выявленный при атомном разрешении". Structure . 10 (4): 557– 67. doi : 10.1016/S0969-2126(02)00740-2 . PMID 11937060.
Filipek A, Jastrzebska B, Nowotny M, Kuznicki J (2002). "CacyBP/SIP, белок, взаимодействующий с кальцином и Siah-1, связывает белки EF-hand семейства S100". J. Biol. Chem . 277 (32): 28848– 52. doi : 10.1074/jbc.M203602200 . PMID 12042313.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 1 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000197956 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000001025 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] "Ген Энтреза: S100A6 S100 кальций-связывающий белок A6".

[pmid10913138-6] Deloulme JC, Assard N, Mbele GO, Mangin C, Kuwano R, Baudier J (ноябрь 2000 г.). «S100A6 и S100A11 являются специфическими мишенями связывающего кальций и цинк белка S100B in vivo». J. Biol. Chem . 275 (45): 35302– 10. doi : 10.1074/jbc.M003943200 . PMID 10913138.

[pmid9925766-7] Yang Q, O'Hanlon D, Heizmann CW, Marks A (февраль 1999 г.). «Демонстрация образования гетеродимера между S100B и S100A6 в дрожжевой двугибридной системе и меланоме человека». Exp. Cell Res . 246 (2): 501– 9. doi :10.1006/excr.1998.4314. PMID 9925766.

[pmid12746458-8] Nowotny M, Spiechowicz M, Jastrzebska B, Filipek A, Kitagawa K, Kuznicki J (июль 2003 г.). «Взаимодействие Sgt1 с S100A6 (кальцином) и другими белками S100, регулируемое кальцием». J. Biol. Chem . 278 (29): 26923– 8. doi : 10.1074/jbc.M211518200 . PMID 12746458.

[9] Софиадис А, Динец А, Орре ЛМ, Бранка РМ, Юхлин КК, Фукакис Т, Валлин Г, Хёог А, Хульчий М, Зедениус Дж, Ларссон К, Лехтио Дж (октябрь 2010 г.). «Протеомное исследование опухолей щитовидной железы выявляет частую ап-регуляцию белка S100A6, связывающего Ca2+, при папиллярной карциноме щитовидной железы». Thyroid . 20 (10): 1067–76 . doi :10.1089/thy.2009.0400. PMID 20629554.