Руминококк

Руминококк
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Бациллота
Сорт:	Клостридии
Заказ:	Эубактерии
Семья:	Осциллоспировые
Род:	Руминококк; Сейпестайн, 1948 г.

Род бактерий

Ruminococcus — род бактерий класса Clostridia .^[1] Это анаэробные, грамположительные кишечные микробы . Один или несколько видов этого рода встречаются в значительных количествах в микробиоте кишечника человека . Типовой вид — R. flavefaciens . Как обычно, таксономия бактерий находится в состоянии изменения, при этом Clostridia являются парафилетическими , а некоторые ошибочные члены Ruminococcus были перенесены в новый род Blautia на основе последовательностей генов 16S рРНК .^[2]

Одной из наиболее цитируемых статей, посвященных роду Ruminococcus, является статья, описывающая межвидовой перенос водорода между Ruminococcus albus и Wolinella succinogenes . ^[3]

В 1972 году сообщалось, что в кишечнике человека был обнаружен Ruminococcus bromii , который стал первым из нескольких обнаруженных видов. ^[4] Они могут играть роль в разрушении клеточной стенки растений в толстой кишке . ^[5]

В одном исследовании было обнаружено, что R. albus , R. callidus и R. bromii встречаются реже у людей с воспалительными заболеваниями кишечника . ^[6] Ruminococcus также встречается реже у пациентов с болезнью Паркинсона ^[7] и боковым амиотрофическим склерозом . ^[8]^[9] R. gnavus ассоциируется с болезнью Крона . ^[10]

Разновидность

Руминококкус белый
Руминококкус бромий
Руминококкус каллидус
Руминококк флавефациенс

Виды, принадлежащие к семейству [[Oscillospiraceae ^[11] ]] и поэтому нуждающиеся в реклассификации:

Руминококкус гаувреауи
Руминококкус гнавус
Руминококкус лактарис
Руминококкус тучный
Руминококк торк

Ссылки

^ таксономия. "Обозреватель таксономии (Ruminococcus)". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2016-04-05 .
^ Liu C, Finegold SM, Song Y, Lawson PA (август 2008 г.). «Реклассификация Clostridium coccoides, Ruminococcus hansenii, Ruminococcus hydrotrophicus, Ruminococcus luti, Ruminococcus productus и Ruminococcus schinkii как Blautia coccoides gen. nov., comb. nov., Blautia hansenii comb. nov., Blautia hydrotropica comb. nov., Blautia luti comb. nov., Blautia producta comb. nov., Blautia schinkii comb. nov. и описание Blautia wexlerae sp. nov., выделенного из человеческих фекалий». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (ч. 8). Общество общей микробиологии: 1896–902 . doi : 10.1099/ijs.0.65208-0 . PMID 18676476.
^ Iannotti EL, Kafkewitz D, Wolin MJ, Bryant MP (июнь 1973 г.). «Продукты ферментации глюкозы в Ruminococcus albus, выращенном в непрерывной культуре с Vibrio succinogenes: изменения, вызванные межвидовым переносом H 2». Journal of Bacteriology . 114 (3): 1231– 40. doi :10.1128/JB.114.3.1231-1240.1973. PMC 285387 . PMID 4351387.
^ Rajilić-Stojanović M, de Vos WM (сентябрь 2014 г.). «Первые 1000 культивируемых видов микробиоты желудочно-кишечного тракта человека». FEMS Microbiology Reviews . 38 (5): 996– 1047. doi :10.1111/1574-6976.12075. PMC 4262072. PMID 24861948 .
^ Ze, Xiaolei; Duncan, Sylvia H.; Louis, Petra; Flint, Harry J. (2012). «Ruminococcus bromii — ключевой вид для деградации резистентного крахмала в толстой кишке человека». Журнал ISME . 6 (8): 1535–1543 . Bibcode : 2012ISMEJ...6.1535Z. doi : 10.1038/ismej.2012.4 . PMC 3400402. PMID 22343308 .
^ Нагао-Китамото Х, Камада Н (февраль 2017 г.). «Взаимодействие хозяина и микробов при воспалительных заболеваниях кишечника». Иммунная сеть . 17 (1): 1– 12. doi :10.4110/in.2017.17.1.1. PMC 5334117. PMID 28261015 .
^ Хилл-Бернс, EM; Дебелиус, JW; Мортон, JT; Виссеманн, WT; Льюис, MR; Валлен, ZD; Педдада, SD; Фактор, SA; Молхо, E; Забетиан, CP; Найт, R; Пайами, H (май 2017 г.). «Болезнь Паркинсона и лекарства от болезни Паркинсона имеют различные сигнатуры микробиома кишечника». Двигательные расстройства . 32 (5): 739– 749. doi :10.1002/mds.26942. PMC 5469442. PMID 28195358 .
^ Бреннер, Д.; Иергейст, А.; Адис, К.; Майер, Б.; Гесснер, А.; Лудольф, А.С.; Вайсхаупт, Дж.Х. (январь 2018 г.). «Фекальный микробиом пациентов с БАС». Neurobiol Aging . 61 : 132–137 . doi :10.1016/j.neurobiolaging.2017.09.023. PMID 29065369. S2CID 296116.
^ Rowin, J; Xia, Y; Jung, B; Sun, J (сентябрь 2017 г.). «Воспаление кишечника и дисбиоз при заболевании двигательных нейронов человека». Physiol Rep . 5 (18): e13443. doi :10.14814/phy2.13443. PMC 5617930. PMID 28947596 .
^ Хенке, Мэтью Т.; Кенни, Дуглас Дж.; Кассилли, Челси Д.; Вламакис, Гера; Ксавье, Рамник Дж.; Кларди, Джон (2019-06-25). «Ruminococcus gnavus, член микробиома кишечника человека, связанный с болезнью Крона, производит воспалительный полисахарид». Труды Национальной академии наук . 116 (26): 12672– 12677. Bibcode : 2019PNAS..11612672H. doi : 10.1073/pnas.1904099116 . ISSN 0027-8424. PMC 6601261. PMID 31182571 .
^ «Руминококк».

[1] таксономия. "Обозреватель таксономии (Ruminococcus)". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2016-04-05 .

[2] Liu C, Finegold SM, Song Y, Lawson PA (август 2008 г.). «Реклассификация Clostridium coccoides, Ruminococcus hansenii, Ruminococcus hydrotrophicus, Ruminococcus luti, Ruminococcus productus и Ruminococcus schinkii как Blautia coccoides gen. nov., comb. nov., Blautia hansenii comb. nov., Blautia hydrotropica comb. nov., Blautia luti comb. nov., Blautia producta comb. nov., Blautia schinkii comb. nov. и описание Blautia wexlerae sp. nov., выделенного из человеческих фекалий». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (ч. 8). Общество общей микробиологии: 1896–902 . doi : 10.1099/ijs.0.65208-0 . PMID 18676476.

[3] Iannotti EL, Kafkewitz D, Wolin MJ, Bryant MP (июнь 1973 г.). «Продукты ферментации глюкозы в Ruminococcus albus, выращенном в непрерывной культуре с Vibrio succinogenes: изменения, вызванные межвидовым переносом H 2». Journal of Bacteriology . 114 (3): 1231– 40. doi :10.1128/JB.114.3.1231-1240.1973. PMC 285387 . PMID 4351387.

[4] Rajilić-Stojanović M, de Vos WM (сентябрь 2014 г.). «Первые 1000 культивируемых видов микробиоты желудочно-кишечного тракта человека». FEMS Microbiology Reviews . 38 (5): 996– 1047. doi :10.1111/1574-6976.12075. PMC 4262072. PMID 24861948 .

[5] Ze, Xiaolei; Duncan, Sylvia H.; Louis, Petra; Flint, Harry J. (2012). «Ruminococcus bromii — ключевой вид для деградации резистентного крахмала в толстой кишке человека». Журнал ISME . 6 (8): 1535–1543 . Bibcode : 2012ISMEJ...6.1535Z. doi : 10.1038/ismej.2012.4 . PMC 3400402. PMID 22343308 .

[6] Нагао-Китамото Х, Камада Н (февраль 2017 г.). «Взаимодействие хозяина и микробов при воспалительных заболеваниях кишечника». Иммунная сеть . 17 (1): 1– 12. doi :10.4110/in.2017.17.1.1. PMC 5334117. PMID 28261015 .

[7] Хилл-Бернс, EM; Дебелиус, JW; Мортон, JT; Виссеманн, WT; Льюис, MR; Валлен, ZD; Педдада, SD; Фактор, SA; Молхо, E; Забетиан, CP; Найт, R; Пайами, H (май 2017 г.). «Болезнь Паркинсона и лекарства от болезни Паркинсона имеют различные сигнатуры микробиома кишечника». Двигательные расстройства . 32 (5): 739– 749. doi :10.1002/mds.26942. PMC 5469442. PMID 28195358 .

[8] Бреннер, Д.; Иергейст, А.; Адис, К.; Майер, Б.; Гесснер, А.; Лудольф, А.С.; Вайсхаупт, Дж.Х. (январь 2018 г.). «Фекальный микробиом пациентов с БАС». Neurobiol Aging . 61 : 132–137 . doi :10.1016/j.neurobiolaging.2017.09.023. PMID 29065369. S2CID 296116.

[9] Rowin, J; Xia, Y; Jung, B; Sun, J (сентябрь 2017 г.). «Воспаление кишечника и дисбиоз при заболевании двигательных нейронов человека». Physiol Rep . 5 (18): e13443. doi :10.14814/phy2.13443. PMC 5617930. PMID 28947596 .

[10] Хенке, Мэтью Т.; Кенни, Дуглас Дж.; Кассилли, Челси Д.; Вламакис, Гера; Ксавье, Рамник Дж.; Кларди, Джон (2019-06-25). «Ruminococcus gnavus, член микробиома кишечника человека, связанный с болезнью Крона, производит воспалительный полисахарид». Труды Национальной академии наук . 116 (26): 12672– 12677. Bibcode : 2019PNAS..11612672H. doi : 10.1073/pnas.1904099116 . ISSN 0027-8424. PMC 6601261. PMID 31182571 .

[11] «Руминококк».