Робин Кэмпбелл Оллшир (родился 19 мая 1960 года) — британский ученый, профессор хромосомной биологии [3] в Эдинбургском университете и главный научный сотрудник Wellcome Trust . [4] [1] Его исследовательская группа в Центре клеточной биологии Wellcome Trust [5] фокусируется на эпигенетических механизмах, управляющих сборкой специализированных доменов хроматина и их передачей в процессе деления клеток. [6]
В 1985 году Оллшир присоединился к исследовательской группе Николаса Хасти в MRC Human Genetics Unit, Эдинбург (ранее MRC Clinical and Population Cytogentics Unit) в качестве постдокторанта , где он обнаружил, что теломеры млекопитающих состоят из простых повторяющихся последовательностей, похожих на таковые у одноклеточных эукариот [10] , и что длина теломер в клетках крови сокращается с возрастом и еще больше уменьшается в раковых клетках. [11] Эта работа стала результатом наблюдения за судьбой теломер делящихся дрожжей ( Schizosaccharomyces pombe ) после введения хромосом делящихся дрожжей в клетку мыши в сотрудничестве с Питером Фантесом. [12] В 1989 году он занял должность независимого приглашенного ученого в лаборатории Cold Spring Harbor (CSHL) в течение 18 месяцев, прежде чем присоединиться к MRC Human Genetics Unit в качестве младшего руководителя группы. Во время работы в CSHL он решил переключить свое внимание на исследование хромосомных элементов в генетически управляемых делящихся дрожжах. [13] В MRC HGU в Эдинбурге (1990–2002 гг.), а затем в Wellome Trust Centre for Cell Biology, University of Edinburgh (2002–настоящее время) он обнаружил, что гены подавляются при помещении в центромеры [14] [15] и теломеры делящихся дрожжей, [16] , а затем использовал это подавление генов для получения фундаментальных знаний о процессах сегрегации хромосом, [17] [18] [19] и гетерохроматина [20] [21] [22] [23] и кинетохорного хроматина CENP-A [24] [25] [26] [27] [28] [29] установления [30] [31] и поддержания. [32] [33] [34] Он особенно интересуется эпигенетическими механизмами, которые обеспечивают сохранение специализированных доменов хроматина в ходе множественных делений клеток и мейоза. [35] Он исследовал, как интерференция РНК (РНКi) опосредует образование гетерохроматина [36] [37] [38] и показал, что факторы сплайсинга способствуют целостности гетерохроматина посредством генерации siRNA и РНКi. [39] [40] Он продемонстрировал, как транскрипция и полученная некодирующая РНК могут влиять на сборку специализированного хроматина CENP-A [41] [42] [43] [44] и продемонстрировал, что некоторые акты транскрипции lncRNA реагируют на стимулы окружающей среды и регулируют соседние гены посредством транскрипционной интерференции. [45] [46] Недавно его команда, используя делящиеся дрожжи, обнаружила эпигенетический механизм, который позволяет грибкам вырабатывать устойчивость к противогрибковым препаратам без изменения их ДНК. [47] Это открытие важно для понимания того, как патогенные грибки становятся устойчивыми к ограниченному числу доступных противогрибковых препаратов как в клинической, так и в сельскохозяйственной сфере.
^ ab Робин Оллшир публикации, проиндексированные Google Scholar
^ abc Allshire, Robin Campbell (1985). Конструирование и анализ векторов на основе вируса папилломы крупного рогатого скота (диссертация на соискание степени доктора философии). Эдинбургский университет. hdl :1842/11176. OCLC 606010479. EThOS uk.bl.ethos.355979.
^ "Члены лаборатории Оллшира".
^ "Главные исследовательские стипендии: люди, которых мы финансировали". wellcome.ac.uk . Wellcome Trust .
^ "Wellcome Centre for Cell Biology - Wellcome Centre for Cell Biology". Эдинбургский университет.
^ "Wellcome Trust lab". 11 января 2024 г.
^ "ALLSHIRE, Arthur: Уведомление о смерти - Irish Times Family Notices". The Irish Times .
^ "ALLSHIRE, Freda Margaret: Уведомление о смерти - Irish Times Family Notices". The Irish Times .
^ «ЭПИГЕНЕТИКА И СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫЙ ХРОМАТИН».
^ Allshire, Robin C; Gosden, John R; Cross, Sally H; Cranston, Gwen; Rout, Derek; Sugawara, Neal; Szostak, Jack W; Fantes, Peter A; Hastie, Nicholas D (1988). "Теломерный повтор от T. Thermophila cross hybridizes with human telomeres". Nature . 332 (6165): 656–9. Bibcode :1988Natur.332..656A. doi :10.1038/332656a0. PMID 2833706. S2CID 4352376.
^ Hastie, Nicholas D; Dempster, Maureen; Dunlop, Malcolm G; Thompson, Alastair M; Green, Daryll K; Allshire, Robin C (1990). «Сокращение теломер при колоректальной карциноме у человека и со старением». Nature . 346 (6287): 866–8. Bibcode :1990Natur.346..866H. doi :10.1038/346866a0. PMID 2392154. S2CID 4258451.
^ Allshire, R. C; Cranston, G; Gosden, J. R; Maule, J. C; Hastie, N. D; Fantes, P. A (1987). «Делящаяся дрожжевая хромосома может автономно реплицироваться в мышиных клетках». Cell . 50 (3): 391–403. doi :10.1016/0092-8674(87)90493-4. PMID 3475186. S2CID 2193386.
^ Allshire, R. C (1990). «Введение больших линейных минихромосом в Schizosaccharomyces pombe с помощью улучшенной процедуры трансформации». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (11): 4043–7. Bibcode : 1990PNAS...87.4043A. doi : 10.1073/pnas.87.11.4043 . PMC 54043. PMID 2349217.
^ Allshire, R. C; Javerzat, J. P; Redhead, N. J; Cranston, G (1994). "Пестрота эффекта положения в центромерах делящихся дрожжей". Cell . 76 (1): 157–69. doi :10.1016/0092-8674(94)90180-5. PMID 8287474. S2CID 42369473.
^ Allshire, R. C; Nimmo, E. R; Ekwall, K; Javerzat, J. P; Cranston, G (1995). «Мутации, вызывающие подавление молчащих центромерных доменов у делящихся дрожжей, нарушают сегрегацию хромосом». Genes & Development . 9 (2): 218–33. doi : 10.1101/gad.9.2.218 . PMID 7851795.
^ Ниммо, Э. Р.; Крэнстон, Г.; Оллшир, Р. К. (1994). «Связанный с теломерами разрыв хромосом у делящихся дрожжей приводит к неоднородной экспрессии соседних генов». Журнал EMBO . 13 (16): 3801–11. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06691.x. PMC 395293. PMID 8070408 .
^ Ниммо, Элейн Р.; Пиду, Элисон Л.; Перри, Пол Э.; Оллшир, Робин К. (1998). «Дефектный мейоз у мутантов Schizosaccharomyces pombe, подавляющих теломеры». Nature . 392 (6678): 825–8. Bibcode :1998Natur.392..825N. doi :10.1038/33941. PMID 9572142. S2CID 4412433.
^ Pidoux, A. L; Uzawa, S; Perry, P. E; Cande, W. Z; Allshire, R. C (2000). «Живой анализ отстающих хромосом во время анафазы и их влияние на скорость удлинения веретена у делящихся дрожжей». Journal of Cell Science . 113 Pt 23 (23): 4177–91. doi :10.1242/jcs.113.23.4177. PMID 11069763.
^ Бернард, П.; Мор, Дж. Ф.; Партридж, Дж. Ф.; Дженье, С.; Джаверзат, Дж. П.; Оллшир, Р. К. (2001). «Требование гетерохроматина для сцепления в центромерах». Science . 294 (5551): 2539–42. Bibcode :2001Sci...294.2539B. doi :10.1126/science.1064027. PMID 11598266. S2CID 31166180.
^ Партридж, Дж. Ф.; Скотт, К. С.; Баннистер, А. Дж.; Кузаридес, Т.; Оллшир, Р. К. (2002). «Цис-действующая ДНК из центромер делящихся дрожжей опосредует метилирование гистона H3 и привлечение факторов сайленсинга и когезина в эктопический сайт». Current Biology . 12 (19): 1652–60. doi : 10.1016/S0960-9822(02)01177-6 . PMID 12361567.
^ Пиду, Элисон Л.; Ричардсон, Уильям; Оллшир, Робин К. (2003). «Sim4». Журнал клеточной биологии . 161 (2): 295–307. doi :10.1083/jcb.200212110. PMC 2172903. PMID 12719471 .
^ Кастильо, А. Г.; Меллоне, Б. Г.; Партридж, Дж. Ф.; Ричардсон, В.; Гамильтон, Г. Л.; Оллшир, Р. К.; Пиду, А. Л. (2007). «Пластичность хроматина CENP-A делящихся дрожжей, обусловленная относительными уровнями гистона H3 и H4». PLOS Genetics . 3 (7): e121. doi : 10.1371/journal.pgen.0030121 . PMC 1934396. PMID 17677001 .
^ Данливи, Элейн М.; Пиду, Элисон Л.; Моне, Мари; Бонилла, Каролина; Ричардсон, Уильям; Гамильтон, Джорджина Л.; Эквалл, Карл; Маклафлин, Пол Дж.; Оллшир, Робин К. (2007). «Связанный с NASP (N1/N2) белок, Sim3, связывает CENP-A и необходим для его отложения в делящихся дрожжевых центромерах». Molecular Cell . 28 (6): 1029–44. doi :10.1016/j.molcel.2007.10.010. PMC 2193228 . PMID 18158900.
^ Санчес-Пулидо, Луис; Пиду, Элисон Л; Понтинг, Крис П; Оллшир, Робин К (2009). «Общее происхождение шаперонов CENP-A Scm3 и HJURP». Cell . 137 (7): 1173–4. doi :10.1016/j.cell.2009.06.010. PMC 4397584. PMID 19563746 .
^ Subramanian, L; Toda, NR T; Rappsilber, J; Allshire, R. C (2014). "Eic1 связывает Mis18 с комплексом CCAN/Mis6/Ctf19 для содействия сборке CENP-A". Open Biology . 4 (4): 140043. doi :10.1098/rsob.140043. PMC 4043117 . PMID 24789708.
^ Folco, H. D; Pidoux, A. L; Urano, T; Allshire, R. C (2008). «Гетерохроматин и РНКi необходимы для установления хроматина CENP-A в центромерах». Science . 319 (5859): 94–7. Bibcode :2008Sci...319...94F. doi :10.1126/science.1150944. PMC 2586718 . PMID 18174443.
^ Каганский, А.; Фолко, Х. Д.; Алмейда, Р.; Пиду, А. Л.; Букаба, А.; Симмер, Ф.; Урано, Т.; Гамильтон, Г. Л.; Оллшир, Р. К. (2009). «Синтетический гетерохроматин обходит РНК-интерференцию и центромерные повторы, чтобы установить функциональные центромеры». Science . 324 (5935): 1716–9. Bibcode :2009Sci...324.1716K. doi :10.1126/science.1172026. PMC 2949999 . PMID 19556509.
^ Партридж, Дж. Ф.; Боргстрём, Б.; Оллшир, Р. К. (2000). «Отдельные домены взаимодействия белков и распространение белков в сложной центромере». Гены и развитие . 14 (7): 783–91. doi :10.1101/gad.14.7.783. PMC 316498. PMID 10766735 .
^ Trewick, Sarah C; Minc, Elsa; Antonelli, Richard; Urano, Takeshi; Allshire, Robin C (2007). «Домен белка JmjC Epe1 предотвращает нерегулируемую сборку и разборку гетерохроматина». The EMBO Journal . 26 (22): 4670–82. doi :10.1038/sj.emboj.7601892. PMC 2048757. PMID 17948055 .
^ Бускайно, Алессия; Лежен, Эрван; Одергон, Полин; Гамильтон, Джорджина; Пиду, Элисон; Оллшир, Робин К. (2013). «Различные роли Sir2 и РНКi в зарождении, распространении и поддержании центромерного гетерохроматина». Журнал EMBO . 32 (9): 1250–64. doi :10.1038/emboj.2013.72. PMC 3642681. PMID 23572080 .
^ Audergon, PNC B; Catania, S; Kagansky, A; Tong, P; Shukla, M; Pidoux, A. L; Allshire, R. C (2015). «Ограниченное эпигенетическое наследование метилирования H3K9». Science . 348 (6230): 132–5. Bibcode :2015Sci...348..132A. doi :10.1126/science.1260638. PMC 4397586 . PMID 25838386.
^ Simmer, Femke; Buscaino, Alessia; Kos-Braun, Isabelle C; Kagansky, Alexander; Boukaba, Abdelhalim; Urano, Takeshi; Kerr, Alastair RW; Allshire, Robin C (2010). «Hairpin RNA induces secondary small interfering RNA synthesis and silencing in trans in fission yeast». EMBO Reports . 11 (2): 112–8. doi :10.1038/embor.2009.273. PMC 2828748. PMID 20062003 .
^ Bayne, Elizabeth H; White, Sharon A; Kagansky, Alexander; Bijos, Dominika A; Sanchez-Pulido, Luis; Hoe, Kwang-Lae; Kim, Dong-Uk; Park, Han-Oh; Ponting, Chris P; Rappsilber, Juri; Allshire, Robin C (2010). "Stc1: Критическая связь между РНК-интерференцией и модификацией хроматина, необходимая для целостности гетерохроматина". Cell . 140 (5): 666–77. doi :10.1016/j.cell.2010.01.038. PMC 2875855 . PMID 20211136.
^ Бускайно, Алессия; Уайт, Шарон А; Хьюстон, Дуглас Р; Лежен, Эрван; Симмер, Фемке; Де Лима Алвес, Флавия; Диёра, Пиюш Т; Урано, Такеши; Бейн, Элизабет Х; Раппсилбер, Юри; Оллшир, Робин К (2012). «Raf1 является DCAF для белка, подобного Rik1 DDB1, и имеет раздельные роли в генерации siRNA и модификации хроматина». PLOS Genetics . 8 (2): e1002499. doi : 10.1371/journal.pgen.1002499 . PMC 3271066 . PMID 22319459.
^ Bayne, E. H; Portoso, M; Kagansky, A; Kos-Braun, I. C; Urano, T; Ekwall, K; Alves, F; Rappsilber, J; Allshire, R. C (2008). «Факторы сплайсинга способствуют подавлению активности делящихся дрожжей, направленному на РНК-интерференцию». Science . 322 (5901): 602–6. Bibcode :2008Sci...322..602B. doi :10.1126/science.1164029. PMC 2585287 . PMID 18948543.
^ Bayne, Elizabeth H; Bijos, Dominika A; White, Sharon A; Alves, Flavia de Lima; Rappsilber, Juri; Allshire, Robin C (2014). «Систематический генетический скрининг выявляет новые факторы, влияющие на целостность центромерного гетерохроматина у делящихся дрожжей». Genome Biology . 15 (10): 481. doi : 10.1186/s13059-014-0481-4 . PMC 4210515 . PMID 25274039.
^ Чой, Ын Шик; Стрэлфорс, Аннели; Кастильо, Арасели Г; Дюран-Дюбьеф, Микаэль; Эквалл, Карл; Оллшир, Робин К (2011). «Идентификация некодирующих транскриптов из хроматина CENP-A в центромерах делящихся дрожжей». Журнал биологической химии . 286 (26): 23600–7. doi : 10.1074/jbc.M111.228510 . PMC 3123123. PMID 21531710 .
^ Чой, Ын Шик; Стрэлфорс, Аннели; Катания, Сандра; Кастильо, Арасели Г; Свенссон, Дж. Питер; Пиду, Элисон Л; Эквалл, Карл; Оллшир, Робин К (2012). «Факторы, способствующие целостности хроматина H3 во время транскрипции, предотвращают беспорядочное отложение CENP-ACnp1 в делящихся дрожжах». PLOS Genetics . 8 (9): e1002985. doi : 10.1371/journal.pgen.1002985 . PMC 3447972. PMID 23028377 .
^ Катания, Сандра; Пиду, Элисон Л.; Оллшир, Робин К. (2015). «Особенности последовательности и транскрипционная остановка в ДНК центромеры способствуют образованию хроматина CENP-A». PLOS Genetics . 11 (3): e1004986. doi : 10.1371/journal.pgen.1004986 . PMC 4349457. PMID 25738810 .
^ Шукла М., Ману; Оллшир, Робин К. (2018). «ДНК-центромера дестабилизирует нуклеосомы H3, способствуя отложению CENP-A во время клеточного цикла». Current Biology . 28 (24): 3924–3936. doi :10.1016/j.cub.2018.10.049. PMC 6303189. PMID 30503616 .
^ Ард, Райан; Оллшир, Робин С. (2016). «Транскрипционно-связанные изменения хроматина лежат в основе подавления генов с помощью транскрипционной интерференции». Nucleic Acids Research . 44 (22): 10619–10630. doi :10.1093/nar/gkw801. PMC 5159543. PMID 27613421 .
↑ Анон (2011). «Профессор Робин Оллшир FRS». royalsociety.org .Одно или несколько из предыдущих предложений включают текст с сайта royalsociety.org, где: