Роберт Стивенс (ученый)

Роберт Стивенс
Роберт Стивенс
Рожденный
Роберт Дэвид Стивенс

( 1965-02-11 )11 февраля 1965 г. (59 лет)
Национальностьбританский
Альма-матер
ИзвестныйТЭМБИС [6] [7] [8]
Научная карьера
Поля
УчрежденияМанчестерский университет
ТезисПринципы проектирования слуховых интерфейсов для представления сложной информации слепым людям  (1996)
научный руководительАлистер Эдвардс [5]
Веб-сайтwww.research.manchester.ac.uk/portal/robert.stevens.html

Роберт Дэвид Стивенс (родился в 1965 году) — профессор биомедицинской информатики . [9] [10] и бывший глава кафедры компьютерных наук в Манчестерском университете [11]

Образование

Стивенс получил степень бакалавра наук по биохимии в Университете Бристоля в 1986 году, [12] степень магистра наук по биоинформатике в 1991 году и степень доктора философии по компьютерным наукам в 1996 году, обе в Университете Йорка . [5]

Карьера и исследования

Текущие исследовательские интересы Стивенса [4] [13] [14] [15] включают построение биологических онтологий , [16] [17] таких как онтология генов , [18] [19] [20] [21] и согласование семантической гетерогенности [22] в биоинформатике. [23] [24] Это исследование было профинансировано Советом по исследованиям в области инженерных и физических наук (EPSRC) , [25] [26] Советом по исследованиям в области биотехнологии и биологических наук (BBSRC) [27] и Европейским союзом . [28]

Стивенс был главным исследователем ряда исследовательских проектов, включая Ondex, [29] [30] ComparaGrid, [31] SWAT (Semantic Web Authoring Tool) [25] и Ontogenesis Network. [25]

Стивенс был председателем программы и соорганизатором Международной конференции по биомедицинской онтологии (ICBO) 2012 года [32] и соучредителем UK Ontology Network. [33] Он также принимал участие в работе Группы по интересам в области здравоохранения и наук о жизни (HCLSIG) Консорциума Всемирной паутины (W3C) . [34] В настоящее время Стивенс входит в редколлегию журнала Journal of Biomedical Semantics . [35] Стивенс начинал как преподаватель , затем стал старшим преподавателем, рецензентом и стал профессором в августе 2013 года.

Стивенс преподавал на нескольких курсах бакалавриата и магистратуры по программной инженерии, базам данных, биоинформатике и ведет вводные и продвинутые курсы по языку веб-онтологии . Он был главным научным руководителем пяти успешных аспирантов [36] [37] [38] [39] [40] и был соруководителем нескольких других. [41] [42] [43]

С июля 2016 года он занимает должность заведующего кафедрой компьютерных наук в Манчестерском университете. [11]

Ссылки

  1. ^ Field, D.; Garrity, G.; Gray, T.; Morrison, N.; Selengut, J.; Sterk, P.; Tatusova, T.; Thomson, N.; Allen, MJ; Angiuoli, SV; Ashburner, M.; Axelrod, N.; Baldauf, S.; Ballard, S.; Boore, J.; Cochrane, G.; Cole, J.; Dawyndt, P.; De Vos, P.; Depamphilis, C.; Edwards, R.; Faruque, N.; Feldman, R.; Gilbert, J.; Gilna, P.; Glöckner, FO; Goldstein, P.; Guralnick, R.; Haft, D.; et al. (2008). "Минимальная информация о спецификации последовательности генома (MIGS)". Nature Biotechnology . 26 (5): 541– 7. doi : 10.1038/nbt1360. PMC  2409278. PMID  18464787 .
  2. ^ Goble, C .; Harper, S.; Stevens, R. (2000). "Труды слабовидящих интернет-путешественников" (PDF) . Труды одиннадцатого ACM по гипертексту и гипермедиа - HYPERTEXT '00. стр. 1. doi :10.1145/336296.336304. ISBN 978-1581132274. S2CID  7099946.
  3. ^ Стивенс, Роберт (2007). «День из жизни ученого-инвалида(?): Незрячие в науке» (PDF) . Биохимик . doi : 10.1042/BIO02903030 . Получено 20 июня 2013 г. .
  4. ^ ab Публикации Роберта Стивенса, проиндексированные Google Scholar
  5. ^ ab Стивенс, Роберт Дэвид (1996). Принципы проектирования слуховых интерфейсов для представления сложной информации слепым людям (PDF) (диссертация). Йоркский университет. OCLC  931328170. EThOS  uk.bl.ethos.319718.
  6. ^ Goble, CA ; Stevens, R .; Ng, G.; Bechhofer, S.; Paton, NW ; Baker, PG; Peim, M.; Brass, A. (2001). «Прозрачный доступ к нескольким источникам биоинформатической информации» (PDF) . IBM Systems Journal . 40 (2): 532– 551. doi :10.1147/sj.402.0532.
  7. ^ Стивенс, Р .; Бейкер, П.; Беххофер, С.; Нг, Г.; Якоби, А.; Патон, Н.У .; Гобл, К.А .; Брасс, А. (2000). «TAMBIS: прозрачный доступ к множественным источникам биоинформатической информации». Биоинформатика . 16 (2): 184– 185. doi : 10.1093/bioinformatics/16.2.184 . PMID  10842744.
  8. ^ Бейкер, ПГ; Брасс, А.; Беххофер, С.; Гобл, К.; Патон, Н.; Стивенс, Р. (1998). «TAMBIS — прозрачный доступ к множественным источникам биоинформатической информации». Труды. Международная конференция по интеллектуальным системам для молекулярной биологии . 6 : 25–34 . PMID  9783206.
  9. ^ "Профессор Роберт Стивенс, исследовательский профиль - личные данные (Манчестерский университет)". Архивировано из оригинала 28 декабря 2011 года . Получено 10 июня 2012 года .
  10. ^ Klein, J.; Eales, J.; Zürbig, P.; Vlahou, A.; Mischak, H.; Stevens, R. (2013). "Proteasix: инструмент для автоматизированного и крупномасштабного прогнозирования протеаз, участвующих в естественной генерации пептидов". Proteomics . 13 (7): 1077– 1082. doi :10.1002/pmic.201200493. PMID  23348921. S2CID  8604093.
  11. ^ ab "Еженедельный информационный бюллетень Школы компьютерных наук". 11 июля 2016 г. Архивировано из оригинала 3 октября 2019 г.
  12. ^ Meng, YB; Stevens, RD ; China, W.; McGill, S.; Ashburner, M. (1988). "Пять генов глицил-тРНК в комплексе генов noc Drosophila melanogaster". Nucleic Acids Research . 16 (14): 7189. doi :10.1093/nar/16.14.7189. PMC 338370. PMID  3136440 . 
  13. ^ Роберт Стивенс на сервере библиографии DBLP
  14. ^ Публикации Роберта Стивенса, проиндексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  15. ^ Страница профиля автора Роберта Стивенса в ACM Digital Library
  16. ^ Malone, J.; Brown, A.; Lister, AL; Ison, J.; Hull, D.; Parkinson, H.; Stevens, R. (2014). «Онтология программного обеспечения (SWO): ресурс для воспроизводимости в анализе, курировании и цифровом сохранении биомедицинских данных». Журнал биомедицинской семантики . 5 : 25. doi : 10.1186/2041-1480-5-25 . PMC 4098953. PMID  25068035 . 
  17. ^ Лорд, П.; Стивенс, Р. (2010). Фридберг, Иддо (ред.). «Добавление немного реальности к построению онтологий для биологии». PLOS ONE . 5 (9): e12258. Bibcode : 2010PLoSO ...512258L. doi : 10.1371/journal.pone.0012258 . PMC 2933225. PMID  20838431. 
  18. ^ Jupp, S.; Stevens, R .; Hoehndorf, R. (2012). «Логические аннотации онтологии генов (GOAL): исследование аннотаций онтологии генов с помощью OWL». Журнал биомедицинской семантики . 3 (Приложение 1): S3. doi : 10.1186/2041-1480-3-S1-S3 . PMC 3337258. PMID  22541594 . 
  19. ^ Каланкеш, Л. Р.; Стивенс, Р .; Брасс, А. (2012). «Язык онтологии генов: анализ закона Ципфа». BMC Bioinformatics . 13 : 127. doi : 10.1186/1471-2105-13-127 . PMC 3473240. PMID  22676436 . 
  20. ^ Лорд, П. У.; Стивенс, Р. Д .; Брасс, А.; Гобл, К. А. (2003). «Семантические меры сходства как инструменты для исследования онтологии генов» (PDF) . Тихоокеанский симпозиум по биовычислениям : 601– 612. doi : 10.1142/9789812776303_0056. ISBN 978-981-238-217-7. PMID  12603061.
  21. ^ Wroe, CJ; Stevens, R .; Goble, CA ; Ashburner, M. (2003). «Методология переноса онтологии гена в среду логики описания с использованием DAML+OIL». Тихоокеанский симпозиум по биовычислениям : 624–635 . CiteSeerX 10.1.1.121.5880 . doi :10.1142/9789812776303_0058. ISBN  978-981-238-217-7. PMID  12603063.
  22. ^ "Семантическая гетерогенность в ресурсах биоинформатики". Cs.man.ac.uk . Получено 10 января 2019 г. .
  23. ^ Лорд, П. У.; Стивенс, Р. Д.; Брасс , А .; Гобл, К. А. (2003). «Исследование мер семантического сходства в онтологии генов: связь между последовательностью и аннотацией». Биоинформатика . 19 (10): 1275–1283 . doi : 10.1093/bioinformatics/btg153 . PMID  12835272.
  24. ^ Hastings, J.; Magka, D.; Batchelor, C.; Duan, L.; Stevens, R .; Ennis, M.; Steinbeck, C. (2012). «Классификация и онтология на основе структуры в химии». Journal of Cheminformatics . 4 : 8. doi : 10.1186/1758-2946-4-8 . PMC 3361486. ​​PMID  22480202 . 
  25. ^ abc "Гранты, предоставленные Роберту Стивенсу EPRSC" . Получено 21 июня 2012 г.
  26. ^ "Архивная копия". Архивировано из оригинала 22 февраля 2015 года . Получено 22 февраля 2015 года .{{cite web}}: CS1 maint: архивная копия как заголовок ( ссылка )
  27. ^ "Сведения о следователе/руководителе - Роберт Стивенс @ BBSRC" . Получено 21 июня 2012 г.
  28. ^ Дак, Г.; Ненадик, Г.; Брасс, А .; Робертсон, Д.Л.; Стивенс, Р. (2013). «BioNerDS: исследование базы данных и программного обеспечения биоинформатики посредством анализа литературы». BMC Bioinformatics . 14 : 194. doi : 10.1186/1471-2105-14-194 . PMC 3693927. PMID  23768135 . 
  29. ^ Kohler, J.; Baumbach, J.; Taubert, J.; Specht, M.; Skusa, A.; Rüegg, A.; Rawlings, C.; Verrier, P.; Philippi, S. (2006). «Анализ на основе графов и визуализация экспериментальных результатов с помощью ONDEX». Биоинформатика . 22 (11): 1383–1390 . doi : 10.1093/bioinformatics/btl081 . PMID  16533819.
  30. ^ "Подробности о награде BBSRC BB/F006012/1: Ondex" .
  31. ^ «Подробности премии BBSRC BBS/B/17131: ComparaGrid — внедрение технологий GRID в сравнительную геномику».
  32. ^ "ICBO FOIS 2012" . Проверено 19 июня 2012 г.
  33. ^ Сеть онтологий Великобритании http://www.ukontology.org/
  34. ^ "Re: введение: Эрик Миллер, w3c от Роберта Стивенса от 2005-12-01 (public-semweb-lifesci@w3.org от декабря 2005)". Lists.w3.org . Получено 10 января 2019 .
  35. ^ "Журнал биомедицинской семантики". Журнал биомедицинской семантики . Получено 10 января 2019 г. .
  36. ^ Эганья Арангурен, Микель (2009). Роль и применение шаблонов проектирования онтологий в биоонтологиях (диссертация на соискание ученой степени доктора философии). Манчестерский университет.
  37. ^ Бренчли, Рэйчел (2009). На пути к автоматизированной аннотации протеинфосфатаз (диссертация на соискание степени доктора философии). Манчестерский университет. OCLC  855121149. EThOS  uk.bl.ethos.509724}.
  38. ^ Браун, Эндрю Дж. (2007). Невизуальное взаимодействие с графиками (диссертация на степень доктора философии). Манчестерский университет. Архивировано из оригинала 3 февраля 2014 г.
  39. ^ Фишер, Пол Райан (2009). К систематическому подходу к крупномасштабному анализу корреляций генотипа и фенотипа (диссертация). Манчестерский университет. OCLC  711956205. EThOS  uk.bl.ethos.516331.
  40. ^ Халл, Дункан (2008). Семантическое соответствие биоинформатических веб-сервисов (диссертация). Манчестерский университет. OCLC  1064135556. EThOS  uk.bl.ethos.497578.
  41. ^ Yesilada, Yeliz (2005). Аннотирование и преобразование веб-страниц для улучшения мобильности пользователей с нарушениями зрения (диссертация на соискание степени доктора философии). Университет Манчестера. Copac  36711980.
  42. ^ Чжао, Цзюнь (2007). Концептуальная модель происхождения электронной науки (PDF) (диссертация). Университет Манчестера. Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2012 г.
  43. ^ "Профессор Роберт Стивенс - Манчестерский университет". Research.manchester.ac.uk . Получено 10 января 2019 г. .
Академические офисы
ПредшествовалЗаведующий кафедрой компьютерных наук, Манчестерский университет
, 2016–настоящее время		Действующий
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Роберт_Стивенс_(ученый)&oldid=1194964359"