Лидер рибосомального белка L13

РНК-семейство
L13_лидер
Консенсусная вторичная структура и сохранение последовательности лидера рибосомального белка L13
Идентификаторы
СимволL13_лидер
РфамРФ00555
Другие данные
Тип РНКЦис-рег ; лидер
ИДТИGO:0010468
ТАКSO:0000233
Структуры PDBПДБе
РНК-семейство
L13-Бактероидии
Консенсусная вторичная структура и сохранение последовательности лидера рибосомального белка L13-Bacteroidia
Идентификаторы
СимволL13-Бактероидии
РфамРФ03127
Другие данные
Тип РНКЦис-рег ; лидер
ТАКSO:0000837
Структуры PDBПДБе

Лидеры рибосомальных белков L13 играют роль в биогенезе рибосом как часть механизма саморегуляции для контроля концентрации рибосомальных белков L13. Три структурных класса лидеров рибосомальных белков L13 были обнаружены различными биоинформатическими подходами: в B. subtilis и других низко-GC грамположительных бактериях ., [1] в E. coli [2] [3] и в Bacteroidia . [4] Хотя ожидается, что эти РНК выполняют одну и ту же биологическую функцию, они, по-видимому, структурно не связаны друг с другом. Пример E. coli был экспериментально подтвержден, хотя эксперименты не являются исчерпывающими. [3] [2] Другие две лидерные структуры до сих пор не основаны на экспериментальной поддержке.

Смотрите также

Лидер рибосомального белка

Ссылки

  1. ^ Yao Z, Barrick J, Weinberg Z, Neph S, Breaker R, Tompa M, Ruzzo WL (июль 2007 г.). "Вычислительный конвейер для высокопроизводительного обнаружения цис-регуляторной некодирующей РНК у прокариот". PLOS Comput Biol . 3 (7): e126. Bibcode : 2007PLSCB...3..126Y. doi : 10.1371 /journal.pcbi.0030126 . PMC  1913097. PMID  17616982.
  2. ^ ab Mustoe AM, Busan S, Rice GM, Hajdin CE, Peterson BK, Ruda VM, Kubica N, Nutiu R, Baryza JL, Weeks KM (март 2018 г.). «Всепроникающие регуляторные функции структуры мРНК, выявленные с помощью высокоразрешающего зондирования SHAPE». Cell . 173 (1): 181–195.e18. doi :10.1016/j.cell.2018.02.034. PMC 5866243 . PMID  29551268. 
  3. ^ ab Meyer MM (март 2018 г.). "Мимикрия рРНК в регуляции экспрессии генов". Microbiol Spectr . 6 (2). doi :10.1128/microbiolspec.RWR-0006-2017. PMC 11633770. PMID  29546840 . 
  4. ^ Экерт, И; Вайнберг, З (24 мая 2020 г.). «Открытие 20 новых кандидатов на роль рибосомального лидера у бактерий и архей». BMC Microbiology . 20 (130): 130. doi : 10.1186/s12866-020-01823-6 . PMC 7247131. PMID  32448158 . 
  • Страница лидера рибосомального белка L13 в Rfam


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Рибосомальный_белок_L13_leader&oldid=1263342230"