Лидер рибосомального S15
| Лидер рибосомального S15 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности S15 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | С15 |
| Рфам | РФ00114 |
| Другие данные | |
| Тип РНК | Цис-рег ; лидер |
| Домены | Бактерии |
| ТАК | SO:0005836 |
| Структуры PDB | ПДБе |
Лидеры рибосомальных белков S15 выполняют важную регуляторную функцию в биогенезе рибосом . [1] Они использовались в качестве ауторегуляторного механизма для контроля концентрации рибосомальных белков S15. Структура расположена в 5'-нетранслируемых областях мРНК , кодирующих рибосомальные белки S15 (rpsO). Известно несколько различных структурных типов лидеров рибосомальных белков S15 в разных организмах.
Лидер рибосомы S15 E. coli — это элемент РНК , который может образовывать две альтернативные структуры, обнаруженные в рибосомальном белке S15. Одна из двух альтернативных структур представляет собой серию из трех шпилек , другая включает псевдоузел . [2] [1] Эта структура вызывает трансляционную регуляцию белка S15 . Только последние две шпильки сохраняются у других видов.
Другой пример для бактерий был предсказан в Flavobacteria . [3] Вторичная структура его предполагаемого рибосомного лидера состоит из шпильки у большинства видов. Однако у некоторых видов эта шпилька отсутствует. Такое отсутствие очевидной вторичной структуры было бы необычно для рибосомного лидера, что делает этого кандидата на рибосомный лидер менее определенным предсказанием. [3]
Были предсказаны два примера в Archaea (один в Halobacteria и один в Methanomicrobia ). [3] В этой структуре были обнаружены сходства между сайтом связывания рРНК рибосомального белка S15 и сайтом связывания лидера рибосомального белка S15. [3] Это говорит о том, что рибосомальные лидеры в этих организмах функционируют, имитируя сайт связывания S15 в рРНК.
Смотрите также
Ссылки
- ^ ab Meyer MM (март 2018 г.). "Мимикрия рРНК в регуляции экспрессии генов". Microbiol Spectr . 6 (2). doi :10.1128/microbiolspec.RWR-0006-2017. PMC 11633770. PMID 29546840 .
- ^ Бенар Л., Филипп С., Эресманн Б., Эресманн С., Портье С. (1996). «Псевдоузел и трансляционный контроль в экспрессии рибосомального белка S15». Biochimie . 78 (7): 568– 576. doi :10.1016/S0300-9084(96)80003-4. PMC 7131963 . PMID 8955900.
- ^ abcde Экерт, И; Вайнберг, З (24 мая 2020 г.). «Открытие 20 новых кандидатов на роль рибосомального лидера у бактерий и архей». BMC Microbiology . 20 (130): 130. doi : 10.1186/s12866-020-01823-6 . PMC 7247131 . PMID 32448158.
Внешние ссылки
- Страница лидера рибосомального S15 в Rfam
 | Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
