РНФ7

РНФ7
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2ECL
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF7 , CKBBP1, ROC2, SAG, белок безымянного пальца 7, rbx2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603863; МГИ : 1337096; гомологен : 84476; GeneCards : RNF7; OMA :RNF7 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 3 (человек)
Конец	141,747,560 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	96,360,728 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	левый надпочечник; ; кора левого надпочечника; ; правый надпочечник; ; кора правого надпочечника; ; правое яичко; ; мышечный слой сигмовидной кишки; ; левое яичко; ; передняя доля гипофиза; ; тело поджелудочной железы; ; мышца бедра;
	Верх выражен в
	Эпителий сосудистого сплетения; ; мочеточник; ; морула; ; морула; ; ирис; ; срединное возвышение; ; гаструла; ; супраоптическое ядро; ; эпителий хрусталика; ; вестибулярная мембрана улиткового протока;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; связывание ионов цинка; связывание ионов меди; связывание белков семейства куллинов; связывание ионов металлов; Активность трансферазы NEDD8; активность убиквитин-протеинлигазы;
Клеточный компонент	нуклеоплазма; ядро; Комплекс убиквитинлигазы Cul5-RING; цитоплазма; цитозоль; Комплекс убиквитинлигазы Cul2-RING; Комплекс убиквитинлигазы Cul3-RING; Комплекс убиквитинлигазы Cul7-RING; ядерный SCF убиквитин лигазный комплекс; Комплекс убиквитинлигазы Cul4-RING E3; комплекс убиквитинлигазы cullin-RING;
Биологический процесс	ответ на окислительно-восстановительное состояние; убиквитинирование белка; неддиляция белка; посттрансляционная модификация белка; SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка; убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	9616
	19823
	ENSG00000114125
	ENSMUSG00000051234
	Q9UBF6
	Q9WTZ1
	НМ_001201370 ; НМ_014245 ; НМ_183063 ; НМ_183237
	NM_011279 ; NM_001311135
	НП_001188299 ; НП_055060 ; НП_899060
	NP_001298064 ; NP_035409
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок RING-box 2 — это белок , который у людей кодируется геном RNF7 . [ ^5]^[6]^[7]

Белок, кодируемый этим геном, является высококонсервативным белком безымянного пальца. Он является неотъемлемой субъединицей убиквитинлигаз протеина SKP1-cullin/CDC53-F box, которые являются частью механизма деградации белка, важного для прогрессирования клеточного цикла и передачи сигнала. Этот белок взаимодействует с казеинкиназой II (CSNK2A1/CKII) и является ее субстратом. Было показано, что фосфорилирование этого белка CSNK2A1 способствует деградации IkappaBalpha (CHUK/IKK-alpha/IKBKA) и p27Kip1(CDKN1B). Сообщалось о вариантах транскриптов, кодирующих различные изоформы, сплайсированных альтернативным способом. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что RNF7 взаимодействует с CSNK2B . ^[8]

Смотрите также

Домен пальца RING

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000114125 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000051234 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Duan H, Wang Y, Aviram M, Swaroop M, Loo JA, Bian J, Tian Y, Mueller T, Bisgaier CL, Sun Y (апрель 1999 г.). "SAG, новый белок цинкового кольца, защищающий клетки от апоптоза, вызванного окислительно-восстановительными агентами". Mol Cell Biol . 19 (4): 3145–55 . doi : 10.1128/MCB.19.4.3145. PMC 84108. PMID 10082581.
^ Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (май 1999). "ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров куллина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы". Mol Cell . 3 (4): 535– 41. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80482-7 . PMID 10230407. S2CID 19371828.
^ ab "Ген Энтреза: белок безымянного пальца 7 RNF7".
^ Ahn BH, Kim TH, Bae YS (октябрь 2001 г.). «Картирование домена взаимодействия бета-субъединицы протеинкиназы CKII с целевыми белками». Mol. Cells . 12 (2). Корея (Южная): 158– 63. doi : 10.1016/S1016-8478(23)17077-4 . ISSN 1016-8478. PMID 11710515.

Дальнейшее чтение

Тан П., Фукс С.Ю., Чен А. и др. (1999). «Привлечение убиквитинлигазы ROC1-CUL1 с помощью Skp1 и HOS для катализа убиквитинирования I каппа B альфа». Мол. Клетка . 3 (4): 527–33 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)80481-5 . ПМИД 10230406.
Swaroop M, Bian J, Aviram M и др. (1999). «Экспрессия, очистка и биохимическая характеристика SAG, белка, чувствительного к окислительно-восстановительному потенциалу безымянного пальца». Free Radic. Biol. Med . 27 ( 1– 2): 193– 202. doi :10.1016/S0891-5849(99)00078-7. PMID 10443936.
Sun Y (1999). «Изменения мРНК SAG в линиях раковых клеток человека: потребность в домене RING finger для защиты от апоптоза». Carcinogenesis . 20 (10): 1899–903 . doi : 10.1093/carcin/20.10.1899 . PMID 10506102.
Son MY, Park JW, Kim YS и др. (1999). «Протеинкиназа CKII взаимодействует с белком SAG, содержащим мотив кольца H2, и фосфорилирует его». Biochem. Biophys. Res. Commun . 263 (3): 743– 8. doi :10.1006/bbrc.1999.1460. PMID 10512750.
Chen A, Wu K, Fuchs SY и др. (2000). «Консервативный палец RING-H2 ROC1 необходим для лигирования убиквитина». J. Biol. Chem . 275 (20): 15432– 9. doi : 10.1074/jbc.M907300199 . PMID 10748083.
Swaroop M, Wang Y, Miller P и др. (2000). «Дрожжевой гомолог человеческого SAG/ROC2/Rbx2/Hrt2 необходим для роста клеток, но не для прорастания: профилирование чипа подразумевает его роль в регуляции клеточного цикла». Oncogene . 19 (24): 2855– 66. doi : 10.1038/sj.onc.1203635 . PMID 10851089.
Furukawa M, Zhang Y, McCarville J, et al. (2000). "C-концевая последовательность CUL1 и ROC1 необходимы для эффективного ядерного накопления, модификации NEDD8 и убиквитинлигазной активности CUL1". Mol. Cell. Biol . 20 (21): 8185– 97. doi :10.1128/MCB.20.21.8185-8197.2000. PMC 86428. PMID 11027288 .
Duan H, Tsvetkov LM, Liu Y и др. (2001). «Стимулирование входа S-фазы и роста клеток при голодании сыворотки с помощью SAG/ROC2/Rbx2/Hrt2, компонента убиквитинлигазы E3: связь с ингибированием накопления p27». Mol. Carcinog . 30 (1): 37– 46. doi :10.1002/1098-2744(200101)30:1<37::AID-MC1011>3.0.CO;2-7. PMID 11255262. S2CID 12999764.
Swaroop M, Gosink M, Sun Y (2001). "SAG/ROC2/Rbx2/Hrt2, компонент убиквитинлигазы SCF E3: геномная структура, вариант сплайсинга и два псевдогена семейства" (PDF) . DNA Cell Biol . 20 (7): 425–34 . doi :10.1089/104454901750361488. hdl : 2027.42/63441 . PMID 11506706.
Ahn BH, Kim TH, Bae YS (2002). «Картирование домена взаимодействия бета-субъединицы протеинкиназы CKII с целевыми белками». Mol. Cells . 12 (2): 158– 63. doi : 10.1016/S1016-8478(23)17077-4 . PMID 11710515.
Furukawa M, Ohta T, Xiong Y (2002). «Активация убиквитин-конъюгирующего фермента UBC5 с помощью RING-пальца ROC1 и сборка активных убиквитинлигаз всеми кулинами». J. Biol. Chem . 277 (18): 15758– 65. doi : 10.1074/jbc.M108565200 . PMID 11861641.
Kim SY, Bae YS, Park JW (2002). "Тиол-связанная пероксидазная активность белка человеческого гена, чувствительного к апоптозу (SAG)". Free Radic. Res . 36 (1): 73– 8. doi :10.1080/10715760210164. PMID 11999705. S2CID 39810540.
Kim YS, Ha KS, Kim YH, Bae YS (2003). «Мотив пальца Ring-H2 CKBBP1/SAG необходим для взаимодействия с протеинкиназой CKII и оптимальной пролиферации клеток». J. Biochem. Mol. Biol . 35 (6): 629– 36. doi : 10.5483/bmbrep.2002.35.6.629 . PMID 12470599.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Kim SY, Lee JH, Yang ES и др. (2003). «Человеческий чувствительный к апоптозу генный белок ингибирует повреждение ДНК, вызванное пероксинитритом». Biochem. Biophys. Res. Commun . 301 (3): 671– 4. doi :10.1016/S0006-291X(03)00018-4. PMID 12565832.
Kim YS, Lee JY, Son MY и др. (2003). «Фосфорилирование треонина 10 на CKBBP1/SAG/ROC2/Rbx2 протеинкиназой CKII способствует деградации IkappaBalpha и p27Kip1». J. Biol. Chem . 278 (31): 28462– 9. doi : 10.1074/jbc.M302584200 . PMID 12748192.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Внешние ссылки

RNF7+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 3 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000114125 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000051234 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10082581-5] Duan H, Wang Y, Aviram M, Swaroop M, Loo JA, Bian J, Tian Y, Mueller T, Bisgaier CL, Sun Y (апрель 1999 г.). "SAG, новый белок цинкового кольца, защищающий клетки от апоптоза, вызванного окислительно-восстановительными агентами". Mol Cell Biol . 19 (4): 3145–55 . doi : 10.1128/MCB.19.4.3145. PMC 84108. PMID 10082581.

[pmid10230407-6] Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (май 1999). "ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров куллина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы". Mol Cell . 3 (4): 535– 41. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80482-7 . PMID 10230407. S2CID 19371828.

[entrez-7] "Ген Энтреза: белок безымянного пальца 7 RNF7".

[pmid11710515-8] Ahn BH, Kim TH, Bae YS (октябрь 2001 г.). «Картирование домена взаимодействия бета-субъединицы протеинкиназы CKII с целевыми белками». Mol. Cells . 12 (2). Корея (Южная): 158– 63. doi : 10.1016/S1016-8478(23)17077-4 . ISSN 1016-8478. PMID 11710515.