RC3H1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
RC3H1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRC3H1 , RNF198, ROQUIN, домены типа «безымянный палец» и CCCH 1, FHL6, IMDSHY
Внешние идентификаторыОМИМ : 609424; МГИ : 2685397; гомологен : 19036; Генные карты : RC3H1; OMA :RC3H1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001300850
NM_001300851
NM_001300852
NM_172071

NM_001024952

RefSeq (белок)

NP_001287779
NP_001287780
NP_001287781
NP_742068
NP_001287779.1

NP_001020123

Местоположение (UCSC)Хр 1: 173.93 – 174.02 МбХр 1: 160,73 – 160,8 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Домены типа «кольцо пальца» и CCCH 1 , также известные как Roquin-1 , представляют собой белок , который у людей кодируется геном RC3H1 . [5]

Функция

Консенсусная первичная последовательность и вторичная структура для сайта связывания Roquin-1 (RC3H1) (также называемого элементом конститутивного распада (CDE)).

Этот ген кодирует белок , содержащий мотивы цинковых пальцев типа RING и C3H1 . Кодируемый белок распознает и связывается с элементом конститутивного распада (CDE) в 3' UTR мРНК , что приводит к деаденилированию и деградации мРНК. Альтернативный сплайсинг приводит к появлению множественных вариантов транскриптов . [предоставлено RefSeq, июль 2014 г.].

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000135870 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000040423 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Энтреза: домены типа безымянного пальца и CCCH 1».

Дальнейшее чтение

  • Bertossi A, Aichinger M, Sansonetti P, Lech M, Neff F, Pal M, Wunderlich FT, Anders HJ, Klein L, Schmidt-Supprian M (август 2011 г.). «Потеря Roquin вызывает раннюю смерть и нарушение иммунной регуляции, но не аутоиммунитет». Журнал экспериментальной медицины . 208 (9): 1749– 56. doi :10.1084/jem.20110578. PMC  3171092. PMID  21844204 .
  • Leppek K, Schott J, Reitter S, Poetz F, Hammond MC, Stoecklin G (май 2013 г.). «Roquin способствует конститутивному распаду мРНК через консервативный класс мотивов распознавания стебель-петля». Cell . 153 (4): 869– 81. doi : 10.1016/j.cell.2013.04.016 . PMID  23663784.
  • Heissmeyer V, Vogel KU (май 2013 г.). «Молекулярный контроль дифференцировки Tfh-клеток белками семейства Roquin». Immunological Reviews . 253 (1): 273– 89. doi : 10.1111/imr.12056 . PMID  23550652. S2CID  22131153.
  • Чанг П.П., Ли С.К., Ху X, Дэйви Дж., Дуан Дж., Чо Дж.Х., Карупия Дж., Срент Дж., Хит В.Р., Бертрам Э.М., Винуэса К.Г. (июль 2012 г.). «Нарушение репрессии мРНК IFN-γ приводит к накоплению аутореактивных эффекторных CD8+ Т-клеток». Журнал иммунологии . 189 (2): 701–10 . doi : 10.4049/jimmunol.1102432 . ПМИД  22685317.
  • Athanasopoulos V, Barker A, Yu D, Tan AH, Srivastava M, Contreras N, Wang J, Lam KP, Brown SH, Goodnow CC, Dixon NE, Leedman PJ, Saint R, Vinuesa CG (май 2010 г.). «Семейство белков ROQUIN локализуется в стрессовых гранулах через домен ROQ и связывает целевые мРНК». Журнал FEBS . 277 (9): 2109– 27. doi : 10.1111/j.1742-4658.2010.07628.x . PMID  20412057.
  • Yu D, Tan AH, Hu X, Athanasopoulos V, Simpson N, Silva DG, Hutloff A, Giles KM, Leedman PJ, Lam KP, Goodnow CC, Vinuesa CG (ноябрь 2007 г.). «Roquin подавляет аутоиммунитет, ограничивая индуцибельную РНК-информацию костимулятора Т-клеток». Nature . 450 (7167): 299– 303. Bibcode :2007Natur.450..299D. doi :10.1038/nature06253. PMID  18172933. S2CID  4398665.
  • Пратама А, Рамискаль РР, Силва Д.Г., Дас СК, Атанасопулос В, Фитч Дж., Ботельо Н.К., Чанг П.П., Ху Х, Хоган Дж.Дж., Манья П., Бернал Д., Корнер Х., Ю Д., Гуднау CC, Кук MC, Винуэса К.Г. (апрель 2013 г.). «Roquin-2 разделяет функции со своим паралогом Roquin-1 в репрессии мРНК, контролирующих Т-фолликулярные хелперные клетки и системное воспаление». Иммунитет . 38 (4): 669–80 . doi : 10.1016/j.immuni.2013.01.011 . ПМИД  23583642.
  • Vinuesa CG, Cook MC, Angelucci C, Athanasopoulos V, Rui L, Hill KM, Yu D, Domaschenz H, Whittle B, Lambe T, Roberts IS, Copley RR, Bell JI, Cornall RJ, Goodnow CC (май 2005 г.). "Член семейства убиквитинлигаз типа RING, необходимый для подавления фолликулярных хелперных Т-клеток и аутоиммунитета". Nature . 435 (7041): 452– 8. Bibcode :2005Natur.435..452V. doi :10.1038/nature03555. PMID  15917799. S2CID  4413889.
  • Linterman MA, Rigby RJ, Wong R, Silva D, Withers D, Anderson G, Verma NK, Brink R, Hutloff A, Goodnow CC, Vinuesa CG (февраль 2009 г.). "Roquin различает специализированные функции дублированных генов костимулирующих рецепторов Т-клеток CD28 и ICOS". Immunity . 30 (2): 228– 41. doi : 10.1016/j.immuni.2008.12.015 . PMID  19217324.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RC3H1&oldid=1183933691"