Белок 1, содержащий цинковые пальцы типа RanBP и C3HC4 (также известный как HOIL-1), представляет собой белок , который у людей кодируется геном RBCK1 . [5]
Белок, кодируемый этим геном, похож на взаимодействующий белок UIP28/UbcM4 мыши. В этом локусе наблюдался альтернативный сплайсинг, что привело к появлению различных изоформ. [5]
HOIL-1 — это E3-убиквитинлигаза и часть комплекса сборки линейной цепи убиквитина (LUBAC), единственной известной убиквитинлигазы, генерирующей линейные (Met1) полиубиквитиновые связи. [6] Хотя HOIL-1 не отвечает за генерацию линейного убиквитина, он является необходимым компонентом LUBAC и обеспечивает его правильную сборку и функционирование. [7] Интересно, что в отличие от большинства E3-убиквитинлигаз , HOIL-1 способна катализировать образование оксиэфирной связи между C-концом мономера убиквитина и Ser/Thr другого белка. Эта недавно обнаруженная функция HOIL-1 до сих пор была описана в контексте сигнализации MyD88. [8] Кроме того, каталитически неактивный мутант HOIL-1 (HOIL-1 C458S ) привел к длительной активации IKK и увеличению продукции воспалительных цитокинов цитотоксическими Т-клетками. Предложенный механизм заключается в том, что связанные с эфиром цепи убиквитина ограничивают размер связанных с изопептидом (K63 и/или M1) цепей убиквитина. [9]
Клиническое значение
Был обнаружен семейный квартет с двумя детьми, оба из которых страдали ранее не зарегистрированным заболеванием, характеризующимся прогрессирующей мышечной слабостью и кардиомиопатией, с нормальным интеллектом. В ходе исследования был обнаружен еще один неродственный пациент с сопоставимым фенотипом. Из данных последовательности всего генома RBCK1, ген, кодирующий лигазу убиквитин-протеина E3, был идентифицирован как наиболее вероятный ген-кандидат с двумя мутациями, укорачивающими белок, у пробандов в первой семье. Секвенирование по Сэнгеру выявило частный гомозиготный вариант сплайсинга в RBCK1 у пробанда во второй семье, однако генотипирование однонуклеотидного полиморфизма (SNP) выявило нейтральную по копированию область гомозиготности размером 1,2 Мб, охватывающую RBCK1. РНК-Seq подтвердил аберрантный сплайсинг транскриптов RBCK1, что привело к образованию укороченных белковых продуктов. [10] Было идентифицировано десять других лиц с мутациями в RBCK1 и перекрывающимися фенотипами. [11]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000125826 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027466 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab "Ген Entrez: цинковый палец типа RBCK1 RanBP и типа C3HC4, содержащий 1".
^ Кирисако Т., Камей К., Мурата С., Като М., Фукумото Х., Кани М. и др. (октябрь 2006 г.). «Комплекс убиквитинлигазы собирает линейные полиубиквитиновые цепи». Журнал ЭМБО . 25 (20): 4877–4887 . doi :10.1038/sj.emboj.7601360. ПМК 1618115 . ПМИД 17006537.
^ Peltzer N, Darding M, Montinaro A, Draber P, Draberova H, Kupka S и др. (май 2018 г.). «LUBAC необходим для эмбриогенеза, предотвращая гибель клеток и обеспечивая гемопоэз». Nature . 557 (7703): 112– 117. Bibcode :2018Natur.557..112P. doi :10.1038/s41586-018-0064-8. PMC 5947819 . PMID 29695863.
^ Kelsall IR, Zhang J, Knebel A, Arthur JS, Cohen P (июль 2019 г.). «Лигаза E3 HOIL-1 катализирует образование эфирной связи между убиквитином и компонентами миддосомы в клетках млекопитающих». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (27): 13293– 13298. Bibcode : 2019PNAS..11613293K. doi : 10.1073/pnas.1905873116 . PMC 6613137. PMID 31209050 .
^ Петрова Т., Чжан Дж., Нанда СК., Фигерас-Вадилло К., Коэн П. (октябрь 2021 г.). «HOIL-1-катализируемое, связанное с эфиром убиквитинирование ограничивает сигнализацию IL-18 в цитотоксических Т-клетках, но способствует передаче сигналов TLR в макрофагах». Журнал FEBS . 288 (20): 5909– 5924. doi :10.1111/febs.15896. PMID 33932090. S2CID 233472285.
^ Ван К., Ким С., Брэдфилд Дж., Го И., Тоскала Э., Отиено Ф.Г. и др. (2013). «Полногеномное секвенирование ДНК/РНК выявляет укороченные мутации в RBCK1 при новом менделевском заболевании с нейромышечным и сердечным поражением». Genome Medicine . 5 (7): 67. doi : 10.1186/gm471 . PMC 3971341 . PMID 23889995.
^ Nilsson J, Schoser B, Laforet P, Kalev O, Lindberg C, Romero NB и др. (декабрь 2013 г.). «Миопатия полиглюкозановых тел, вызванная дефектной убиквитинлигазой RBCK1». Annals of Neurology . 74 (6): 914–919 . doi :10.1002/ana.23963. PMID 23798481. S2CID 205344695.
Дальнейшее чтение
Martinez-Noel G, Niedenthal R, Tamura T, Harbers K (июль 1999). «Семейство структурно родственных белков RING finger специфически взаимодействует с убиквитин-конъюгирующим ферментом UbcM4». FEBS Letters . 454 (3): 257– 261. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00823-6 . PMID 10431818. S2CID 46159115.
Яманака К., Исикава Х., Мегуми Ю., Токунага Ф., Кани М., Руо Т.А. и др. (апрель 2003 г.). «Идентификация убиквитин-протеиновой лигазы, которая распознает окисленный IRP2». Природная клеточная биология . 5 (4): 336–340 . doi : 10.1038/ncb952. PMID 12629548. S2CID 20453941.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль РНК-надзора». Genome Biology . 5 (2): R8. doi : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . PMC 395752. PMID 14759258 .
Tatematsu K, Yoshimoto N, Koyanagi T, Tokunaga C, Tachibana T, Yoneda Y и др. (июнь 2005 г.). «Ядерно-цитоплазматический челнок белка RING-IBR RBCK1 и его функциональное взаимодействие с белками ядерного тела». Журнал биологической химии . 280 (24): 22937– 22944. doi : 10.1074/jbc.M413476200 . PMID 15833741.
Zhang Y, Wolf-Yadlin A, Ross PL, Pappin DJ, Rush J, Lauffenburger DA, White FM (сентябрь 2005 г.). «Масс-спектрометрия с временным разрешением участков фосфорилирования тирозина в сигнальной сети рецептора эпидермального фактора роста выявляет динамические модули». Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (9): 1240– 1250. doi : 10.1074/mcp.M500089-MCP200 . PMID 15951569.
Yoshimoto N, Tatematsu K, Koyanagi T, Okajima T, Tanizawa K, Kuroda S (сентябрь 2005 г.). «Цитоплазматическое связывание белка RING RBCK1 его вариантом сплайсинга, лишенным домена RING». Biochemical and Biophysical Research Communications . 335 (2): 550– 557. doi :10.1016/j.bbrc.2005.07.104. PMID 16083853.
Бэйл Дж., Лопес С., Иваи К., Дюбрей П., Де Сепульведа П. (май 2006 г.). «Убиквитинлигаза E3 HOIL-1 индуцирует полиубиквитинирование и деградацию белков, связанных с SOCS6». Письма ФЭБС . 580 (11): 2609–2614 . doi : 10.1016/j.febslet.2006.03.093 . PMID 16643902. S2CID 44648698.
Tian Y, Zhang Y, Zhong B, Wang YY, Diao FC, Wang RP и др. (июнь 2007 г.). «RBCK1 отрицательно регулирует активацию NF-kappaB, вызванную фактором некроза опухоли и интерлейкином-1, путем нацеливания TAB2/3 на деградацию». Журнал биологической химии . 282 (23): 16776– 16782. doi : 10.1074/jbc.M701913200 . PMID 17449468.
Wang K, Kim C, Bradfield J, Guo Y, Toskala E, Otieno FG и др. (2013). «Полногеномное секвенирование ДНК/РНК выявляет укороченные мутации в RBCK1 при новом менделевском заболевании с нейромышечным и сердечным поражением». Genome Medicine . 5 (7): 67. doi : 10.1186/gm471 . PMC 3971341 . PMID 23889995.
Эта статья о гене на человеческой хромосоме 20 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.
