RAP1GDS1

RAP1GDS1
Идентификаторы
Псевдонимы	RAP1GDS1 , GDS1, SmgGDS, Rap1 Стимулятор диссоциации ГТФазы-ГДФ 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 179502; МГИ : 2385189; гомологен : 41422; GeneCards : RAP1GDS1; OMA :RAP1GDS1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 4 (человек)
Конец	98,443,861 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	138,780,962 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	латеральная группа ядер таламуса; ; Понс; ; pars compacta; ; тройничный ганглий; ; pars reticulata; ; средняя височная извилина; ; спинномозговые ганглии; ; верхнее вестибулярное ядро; ; сперма; ; мозолистое тело;
	Верх выражен в
	медиальное дорсальное ядро; ; медиальное коленчатое ядро; ; латеральное коленчатое ядро; ; околоносовая кора; ; нижние холмики; ; обонятельный эпителий; ; зрительная кора; ; ядра моста; ; первичная моторная кора; ; поле CA3;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; Активность активатора ГТФазы;
Клеточный компонент	цитозоль; внеклеточная экзосома; эндоплазматический ретикулум; митохондрия;
Биологический процесс	отрицательная регуляция концентрации ионов кальция в эндоплазматическом ретикулуме; позитивная регуляция концентрации ионов кальция в митохондриях; сокращение гладких мышц, связанных с сосудами; сборка миозиновых нитей; передача сигнала, опосредованная малой ГТФазой; положительная регуляция активности ГТФазы;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	5910
	229877
	ENSG00000138698
	ENSMUSG00000028149
	Р52306
	E9Q912
NM_001100426 ; NM_001100427 ; NM_001100428 ; NM_001100429 ; NM_001100430;
	NM_021159
	NM_001040690 ; NM_001286759 ; NM_145544 ; NM_001356388
NP_001093896 ; NP_001093897 ; NP_001093898 ; NP_001093899 ; NP_001093900;
	NP_066982
	НП_001035780 ; НП_001273688 ; НП_001343317 ; НП_663519
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Стимулятор диссоциации ГТФазы-ГДФ Rap1 1 — это фермент , который у человека кодируется геном RAP1GDS1 . [ ^5]^[6]^[7]

Взаимодействия

Было показано, что RAP1GDS1 взаимодействует с KIFAP3 , ^[8] HRAS ^[9] и RHOA . ^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000138698 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028149 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Рисс О, Эпплен С, Сидлацк И, Эпплен Дж. Т. (январь 1994 г.). «Хромосомное назначение гена стимулятора диссоциации GDP человека smg на хромосому человека 4q21-q25». Hum Genet . 92 (6): 629–30 . doi :10.1007/BF00420952. PMID 8262526. S2CID 21189125.
^ Tew GW, Lorimer EL, Berg TJ, Zhi H, Li R, Williams CL (январь 2008 г.). «SmgGDS регулирует пролиферацию клеток, миграцию и транскрипционную активность NF-kappaB при немелкоклеточной карциноме легких». J Biol Chem . 283 (2): 963–76 . doi : 10.1074/jbc.M707526200 . PMID 17951244.
^ "Ген Энтреза: RAP1GDS1 RAP1, стимулятор диссоциации ГТФ-ГДФ 1".
^ Shimizu K, Kawabe H, Minami S, Honda T, Takaishi K, Shirataki H, Takai Y (октябрь 1996 г.). "SMAP, белок, ассоциированный с Smg GDS, имеющий повторы плеч и фосфорилируемый тирозинкиназой Src". J. Biol. Chem . 271 (43): 27013– 7. doi : 10.1074/jbc.271.43.27013 . ISSN 0021-9258. PMID 8900189.
^ ab Vikis HG, Stewart Scott, Guan Kun-Liang (апрель 2002 г.). «SmgGDS демонстрирует дифференциальную связывающую и обменную активность по отношению к различным изоформам Ras». Oncogene . 21 (15): 2425– 32. doi :10.1038/sj.onc.1205306. ISSN 0950-9232. PMID 11948427. S2CID 6647800.

Дальнейшее чтение

Кикучи А., Кайбучи К., Хори Й. и др. (1992). «Молекулярное клонирование человеческой кДНК для стимулирующего белка обмена GDP/GTP для c-Ki-ras p21 и smg p21». Онкоген . 7 (2): 289–93 . PMID 1549351.
Shimizu K, Kawabe H, Minami S и др. (1996). "SMAP, белок, ассоциированный с Smg GDS, имеющий повторы плеч и фосфорилируемый тирозинкиназой Src". J. Biol. Chem . 271 (43): 27013– 7. doi : 10.1074/jbc.271.43.27013 . PMID 8900189.
Vikis HG, Stewart S, Guan KL (2002). «SmgGDS проявляет дифференциальную связывающую и обменную активность по отношению к различным изоформам Ras». Oncogene . 21 (15): 2425– 32. doi :10.1038/sj.onc.1205306. PMID 11948427. S2CID 6647800.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
de Bruyn KM, Zwartkruis FJ, de Rooij J, et al. (2003). «Малая GTPase Rap1 активируется турбулентностью и участвует в адгезии клеток, опосредованной интегрином [альфа]IIb[бета]3, в мегакариоцитах человека». J. Biol. Chem . 278 (25): 22412– 7. doi : 10.1074/jbc.M212036200 . PMID 12690117.
Tiwari S, Felekkis K, Moon EY и др. (2004). «Среди циркулирующих гемопоэтических клеток B-CLL уникально экспрессирует функциональный EPAC1, но активация Rap1, опосредованная EPAC1, не объясняет апоптоз, вызванный ингибитором PDE4». Blood . 103 (7): 2661– 7. doi : 10.1182/blood-2003-06-2154 . PMID 14615375.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 4 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000138698 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028149 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8262526-5] Рисс О, Эпплен С, Сидлацк И, Эпплен Дж. Т. (январь 1994 г.). «Хромосомное назначение гена стимулятора диссоциации GDP человека smg на хромосому человека 4q21-q25». Hum Genet . 92 (6): 629–30 . doi :10.1007/BF00420952. PMID 8262526. S2CID 21189125.

[pmid17951244-6] Tew GW, Lorimer EL, Berg TJ, Zhi H, Li R, Williams CL (январь 2008 г.). «SmgGDS регулирует пролиферацию клеток, миграцию и транскрипционную активность NF-kappaB при немелкоклеточной карциноме легких». J Biol Chem . 283 (2): 963–76 . doi : 10.1074/jbc.M707526200 . PMID 17951244.

[entrez-7] "Ген Энтреза: RAP1GDS1 RAP1, стимулятор диссоциации ГТФ-ГДФ 1".

[pmid8900189-8] Shimizu K, Kawabe H, Minami S, Honda T, Takaishi K, Shirataki H, Takai Y (октябрь 1996 г.). "SMAP, белок, ассоциированный с Smg GDS, имеющий повторы плеч и фосфорилируемый тирозинкиназой Src". J. Biol. Chem . 271 (43): 27013– 7. doi : 10.1074/jbc.271.43.27013 . ISSN 0021-9258. PMID 8900189.

[pmid11948427-9] Vikis HG, Stewart Scott, Guan Kun-Liang (апрель 2002 г.). «SmgGDS демонстрирует дифференциальную связывающую и обменную активность по отношению к различным изоформам Ras». Oncogene . 21 (15): 2425– 32. doi :10.1038/sj.onc.1205306. ISSN 0950-9232. PMID 11948427. S2CID 6647800.