Белок репарации и рекомбинации ДНК RAD54B — это белок , который у людей кодируется геном RAD54B . [5] [6] [7]
Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к суперсемейству DEAD-подобных геликаз. Он имеет сходство с RAD54 и RDH54 Saccharomyces cerevisiae , оба из которых участвуют в гомологичной рекомбинации и репарации ДНК. Этот белок связывается с двухцепочечной ДНК и проявляет активность АТФазы в присутствии ДНК. Этот ген высоко экспрессируется в яичках и селезенке, что предполагает активную роль в мейотической и митотической рекомбинации. Гомозиготные мутации этого гена наблюдались при первичной лимфоме и раке толстой кишки. [7]
Ген RAD54B соматически мутирует или удаляется при многочисленных типах рака, включая колоректальный рак (~3,3%), рак молочной железы (~3,4 % ) и рак легких (~2,6%). [8] В Северной Америке только эти три вида рака ежегодно диагностируют около 20 500 человек с дефектным раком RAD54B . В доклиническом исследовании было установлено, что клетки рака толстой кишки с дефектом RAD54B избирательно уничтожаются ингибиторами белка репарации ДНК PARP1 . [8] Ингибиторы PARP1, вероятно, препятствуют альтернативным реакциям репарации ДНК, которые в противном случае могли бы компенсировать потерю пути RAD54B в раковых клетках. Таким образом, раковые клетки с дефицитом RAD54B, обработанные ингибитором PARP1, по-видимому, более уязвимы для уничтожения естественными повреждениями ДНК, чем нераковые клетки без дефекта RAD54 (см. статью Синтетическая летальность ).
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000197275 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000078773 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хирамото Т, Наканиси Т, Сумиёси Т, Фукуда Т, Мацуура С, Таучи Х, Комацу К, Сибасаки Ю, Инуи Х, Вататани М, Ясутоми М, Сумии К, Кадзияма Г, Камада Н, Миягава К, Камия К (июнь) 1999). «Мутации нового гомолога RAD54 человека, RAD54B, при первичном раке». Онкоген . 18 (22): 3422–6 . doi :10.1038/sj.onc.1202691. PMID 10362364. S2CID 24095399.
^ ab Tanaka K, Hiramoto T, Fukuda T, Miyagawa K (сентябрь 2000 г.). "Новый гомолог человеческого rad54, Rad54B, ассоциируется с Rad51". J Biol Chem . 275 (34): 26316– 21. doi : 10.1074/jbc.M910306199 . PMID 10851248.
^ ab "Ген Entrez: RAD54B RAD54 гомолог B (S. cerevisiae)".
^ ab McAndrew EN, Lepage CC, McManus KJ (декабрь 2016 г.). «Синтетическое летальное уничтожение клеток колоректального рака с дефицитом RAD54B путем ингибирования PARP1 усиливается при ингибировании SOD1». Oncotarget . 7 (52): 87417– 87430. doi :10.18632/oncotarget.13654. PMC 5349998 . PMID 27902462.
Дальнейшее чтение
Миягава К, Цуруга Т, Киномура А и др. (2002). «Роль RAD54B в гомологичной рекомбинации в клетках человека». EMBO J . 21 ( 1– 2): 175– 80. doi :10.1093/emboj/21.1.175. PMC 125815 . PMID 11782437.
Tanaka K, Kagawa W, Kinebuchi T и др. (2002). «Человеческий Rad54B — это зависимая от двухцепочечной ДНК АТФаза, обладающая биохимическими свойствами, отличными от его структурного гомолога в дрожжах, Tid1/Rdh54». Nucleic Acids Res . 30 (6): 1346– 53. doi :10.1093/nar/30.6.1346. PMC 101365. PMID 11884632 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Sehorn MG, Sigurdsson S, Bussen W и др. (2004). «Человеческая мейотическая рекомбиназа Dmc1 способствует АТФ-зависимому гомологичному обмену цепями ДНК». Nature . 429 (6990): 433– 7. Bibcode :2004Natur.429..433S. doi :10.1038/nature02563. PMID 15164066. S2CID 4316803.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Wesoly J, Agarwal S, Sigurdsson S и др. (2006). «Дифференциальный вклад паралогов Rad54 млекопитающих в рекомбинацию, восстановление повреждений ДНК и мейоз». Mol. Cell. Biol . 26 (3): 976– 89. doi : 10.1128 /MCB.26.3.976-989.2006. PMC 1347043. PMID 16428451.
Сараи Н., Кагава В., Кинебути Т. и др. (2006). «Стимуляция Dmc1-опосредованного обмена цепей ДНК человеческим белком Rad54B». Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (16): 4429– 37. doi :10.1093/nar/gkl562. ПМЦ 1636354 . ПМИД 16945962.
Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . PMID 17353931.
Bryś M, Nowacka-Zawisza M, Romanowicz-Makowska H, et al. (2007). «Потеря гетерозиготности в регионе RAD54B не является предиктором карциномы молочной железы». Pol J Pathol . 58 (1): 3– 6. PMID 17585536.
