Портоглобовирусы
| Портоглобовирусы | |
|---|---|
 | |
| Вирион Портоглобовируса | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Вариднавирия (?) |
| Семья: | Портоглобовирусы |
Portogloboviridae — это семейство вирусов dsDNA , которые заражают археи . Это предполагаемое семейство изобласти Varidnaviria , но ICTV официально называет его вирусом incertae sedis . Вирусы в этом семействе связаны с Helvetiavirae . Капсидные белки этих вирусов и их характеристики имеют эволюционное значение для происхождения других вирусов Varidnaviria, поскольку они, по-видимому, сохраняют изначальные признаки. [1]
Описание
Вирионы этого семейства имеют капсид с икосаэдрической геометрией и вирусную оболочку , которая защищает генетический материал . Диаметр составляет от 83 до 87 нанометров. Геном представляет собой кольцевую двухцепочечную ДНК длиной 20 222 пар оснований. Геном содержит 45 открытых рамок считывания (ОРС), которые тесно расположены и занимают 89,1% генома. ОРС, как правило, короткие, со средней длиной 103 кодона . Вирионы имеют 10 белков в диапазоне от 20 до 32 кДа. Из этих белков 8 кодируют капсид и два — вирусную оболочку, включая один, который представляет собой капсидный белок вертикального одиночного рулета (SJR) . Проникновение в клетку-хозяина происходит путем проникновения. Репликация вируса происходит при хронической инфекции без литического цикла . [2]
Вирусы Portogloboviridae вместе с Halopanivirales имеют эволюционное значение в эволюции других вирусов Varidnaviria, поскольку они, по-видимому, являются реликтами того, какими были первые вирусы этой области. Portogloboviridae вместе с Halopanivirales могли инфицировать последнего универсального общего предка (LUCA) и возникли до этого организма. [1]
Было высказано предположение, что это может быть связано с происхождением Varidnaviria следующим образом. [1]
| Вариднавирия |
| ||||||
Таксономия
Семейство включает один род, включающий два вида: [3]
- Альфапортоглобовирус
- Альфапортоглобовирус SPV2
- Sulfolobus альфапортоглобовирус 1
| Имя | Имя | Сокращ. | ГенБанк | РЕФСЕКВ |
|---|---|---|---|---|
| Альфапортоглобовирус SPV2 | Полиэдрический вирус Sulfolobus 2 | СПВ2 | МК064567 | NC_055116 |
| Sulfolobus альфапортоглобовирус 1 | Полиэдрический вирус Sulfolobus 1 | СПВ1 | KY780159 | NC_038017 |
Ссылки
- ^ abc Krupovic M, Dolja VV, Koonin EV (14 июля 2020 г.). «LUCA и его сложный виром». Nat Rev Microbiol . 18 (11): 661–670. doi :10.1038/s41579-020-0408-x. PMID 32665595. S2CID 220516514. Получено 22 октября 2020 г.
- ^ Liu Y, Ishino S, Ishino Y, Pehau-Arnaudet G, Krupovic M, Prangishvili D (9 июля 2017 г.). "Новый тип полиэдральных вирусов, заражающих гипертермофильные археи". J Virol . 91 (13): e00589-17. doi :10.1128/JVI.00589-17. PMC 5469268. PMID 28424284 .
- ^ "Virus Taxonomy: 2022 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 г. Получено 20 августа 2023 г.
