Полинуклеобактер
| Полинуклеобактер | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Полинуклеобактер Хекманн и Шмидт 1987 |
| Типовой вид | |
| Полинуклеобактер нецессариус | |
| Разновидность | |
P. acidiphobus Hahn et al . 2011 | |
Polynucleobacter — род бактерий , первоначально установленный Хекманном и Шмидтом (1987) [1] как источник исключительно облигатных эндосимбионтов инфузорий, принадлежащих к роду Euplotes .
Недавно было описано несколько новых видов Polynucleobacter , [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10] , все из которых представляют собой свободноживущие (т. е. не связанные с хозяином) планктонные пресноводные бактерии. Таким образом, род Polynucleobacter в настоящее время включает один вид, содержащий облигатных эндосимбионтов инфузорий, и девять видов, представляющих свободноживущие планктонные штаммы. Типовые штаммы планктонных видов были выделены из пресноводных систем, расположенных в Антарктиде , Армении , Австрии , Китае , Чехии , Финляндии , Франции , Германии , Норвегии , Испании , Уганде и Соединенных Штатах . В настоящее время род насчитывает 31 вид.
Свободноживущие бактерии Poynucleobacter являются важными членами бактериопланктона в пресноводных системах, таких как озера, пруды и ручьи. [11]
Геномика
Завершены два геномных проекта по штаммам P. necessarius : один проект по облигатно свободноживущему штамму, выделенному из кислого пресноводного пруда, [12] и один проект по облигатному эндосимбионту инфузории Euplotes aediculatus . [13]
Анализ последовательностей генома привел к открытию консервативного мотива РНК .
Ссылки
- ^ Хекманн, К. и Х. Дж. Шмидт (1987) Polynucleobacter necessarius gen. nov., sp. nov., облигатно эндосимбиотическая бактерия, живущая в цитоплазме Euplotes aediculatus . Int. J. Syst. Bacteriol. 37:456-457. (doi: 10.1099/00207713-37-4-456)
- ^ Хан, М. В., Э. Ланг, У. Брандт, Х. Люнсдорф, К. Л. Ву и Э. Штакебрандт (2010) Polynucleobacter cosmopolitanus sp. nov., свободноживущие планктонные бактерии, населяющие пресноводные озера и реки. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60:166-173. (doi:10.1099/ijs.0.010595-0)
- ^ Hahn, MW, E. Lang, U. Brandt и C. Spröer (2011) Polynucleobacter acidiphobus sp. nov., представитель многочисленной группы планктонных пресноводных бактерий. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61:788-794. (doi:10.1099/ijs.0.023929-0)
- ^ Хан, М. В., Э. Ланг, М. Тарао и У. Брандт (2011) Polynucleobacter rarus sp. nov., свободноживущая планктонная бактерия, выделенная из кислого озера. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61:781-787 (doi:10.1099/ijs.0.017350-0)
- ^ Hahn, MW, A. Minasyan, E. Lang, U. Koll и C. Spröer (2012) Polynucleobacter difficili s sp. nov., планктонная пресноводная бактерия, связанная с подкластером B1 рода Polynucleobacter . Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 62:376-383. (doi:10.1099/ijs.0.031393-0)
- ^ Hahn, MW, J. Schmidt, A. Pitt, SJ Taipale и E. Lang (2016) Реклассификация четырех штаммов Polynucleobacter necessarius как представителей Polynucleobacter asymbioticus comb. nov., Polynucleobacter duraquae sp. nov., Polynucleobacter yangtzensis sp. nov. и Polynucleobacter sinensis sp. nov., и исправленное описание Polynucleobacter necessarius . Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66: 2883-2892. (doi: 10.1099/ijsem.0.001073)
- ^ Hahn, MW, LR Huymann, U. Koll, J. Schmidt, E. Lang, M. Hoetzinger (2017) Polynucleobacter wuianus sp. nov., свободноживущая пресноводная бактерия, связанная с комплексом криптических видов PnecC. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 67: 379-385. (doi: 10.1099/ijsem.0.001637)
- ^ Питт А., Шмидт Дж., Ланг Э., Уитман В. Б., Войк Т., Хан М. В. (2018). Polynucleobacter meluiroseus sp. nov., бактерия, выделенная из озера, расположенного в горах средиземноморского острова Корсика. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 68 : 1975-1985 [1]
- ^ Hoetzinger M., Schmidt J., Pitt A., Koll U., Lang E., Hahn MW (2019) Polynucleobacter paneuropaeus sp. nov., охарактеризованный шестью штаммами, выделенными из пресноводных озер, расположенных вдоль поперечного сечения с севера на юг длиной 3000 км по всей Европе. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 69:203-213. (doi: 10.1099/ijsem.0.003130)
- ^ Хан М.В., Питт А., Шмидт Дж., Камачо А. (2022) Четырнадцать новых видов Polynucleobacter : P. Brandtiae sp. nov., P. kasalickyi sp. nov., P. antarcticus sp. nov., P. arcticus sp. nov., P. tropicus sp. nov., P. bastaniensis sp. ноябрь, P. corsicus sp. nov., P. finlandensis sp. ноябрь, P. ibericus sp. ноябрь, P. Hallstattensis sp. nov., P. alcilacus sp. nov., P. nymphae sp. nov., P. paludilacus sp. ноябрь и P. parvulilacunae sp. ноябрь Межд. Дж. Сист. Эвол. Микробиол. 72:5408. (doi: 10.1099/ijsem.0.005408)
- ^ Джезберова, Дж., Дж. Джезбера, У. Брандт, Э. С. Линдстрем, С. Лангенхедер и М. В. Хан (2010). Повсеместное распространение Polynucleobacter necessarius ssp. asymbioticus в постных пресноводных местообитаниях на гетерогенной территории площадью 2000 км 2 . Окружающая среда. Микробиол. 12: 658-669.
- ^ ЗОЛОТАЯ КАРТА: Gc00537 Геномный проект: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1, ЗОЛОТО - База данных Genomes OnLine
- ^ ЗОЛОТАЯ КАРТА: Gc00757 Геномный проект: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1, GOLD - Онлайн база данных геномов
Внешние ссылки
- Род: Polynucleobacter - LPSN, Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре
- Polynucleobacter – Браузер таксономии NCBI
