Пикрофилус торридус

Пикрофилус торридус
Научная классификация
Домен:	Археи
Королевство:	Эвриархеоты
Тип:	Эвриархеоты
Сорт:	Термоплазмата
Заказ:	Термоплазменные
Семья:	Пикрофиловые
Род:	Пикрофилус
Разновидность:	P. torridus
Биномиальное имя
	Пикрофилус торридус; Шлепер и др. 1996

Виды археев

Picrophilus torridus — это вид архей, описанный в 1996 году. ^[1] Picrophilus torridus был обнаружен в почве около горячего источника на Хоккайдо , Япония . Уровень pH почвы был менее 0,5. ^[2] P. torridus также имеет один из самых маленьких геномов среди организмов, которые являются свободноживущими и непаразитарными, и высокую плотность кодирования, что означает, что большинство его генов являются кодирующими областями и предоставляют инструкции для построения белков. Текущие исследования показывают, что два враждебных условия (высокие температуры и низкий уровень pH), благоприятствуемые P. torridus, оказали селективное давление в сторону наличия небольшого и компактного генома, который с меньшей вероятностью будет поврежден суровой средой. ^[3]^[4]

Ссылки

^ Schleper; Pühler; Klenk & Zillig (июль 1996 г.). «Picrophilus oshimae и Picrophilus tomdus fam. nov., gen. nov., sp. nov., Two Species of Hyperacidophilic, Thermophilic, Heterotrophic, Aerobic Archae». Международный журнал систематической бактериологии . 46 (3). Международный союз микробиологических обществ : 814– 816. doi : 10.1099/00207713-46-3-814 . ISSN 1466-5034. OCLC 807119723.
^ Сиддики; Томас, ред. (2008). "Термоацидофилы и их адаптация белков к низкому pH и высокой температуре". Адаптация белков у экстремофилов . Nova Publishers . ISBN 9781604560190. Получено 31 октября 2013 г.
^ Ангелов, А.; Либль, В. (2006-10-20). «Взгляд на экстремальную термоацидофилию на основе анализа генома Picrophilus torridus и других термоацидофильных архей». Журнал биотехнологии . Аспекты исследований прокариотического генома. 126 (1): 3– 10. doi :10.1016/j.jbiotec.2006.02.017. ISSN 0168-1656. PMID 16621083.
^ Шеперс, Б.; Тиманн, В.; Антраникян, Г. (июнь 2006 г.). «Характеристика новой глюкоамилазы из термоацидофильной археи Picrophilus torridus, гетерологично экспрессируемой в E. coli». Engineering in Life Sciences . 6 (3): 311– 317. doi :10.1002/elsc.200620131. ISSN 1618-0240. S2CID 85128507.

Дальнейшее чтение

Арора, Жасмин; Госвами, Кастури; Саха, Свати (январь 2014 г.). «Характеристика инициатора репликации Orc1/Cdc6 из архея Picrophilus torridus». Журнал бактериологии . 196 (2): 276– 286. doi :10.1128/JB.01020-13. PMC 3911243. PMID 24187082 .
Фрик, Эдуард; Шпатцаль, Томас; Герхардт, Стефан; Андреас, Кремер; Оливер, Айнсле; Вольфганг, Хюттель (13 апреля 2014 г.). «Структурная и функциональная характеристика 4-гидроксифенилпируватдиоксигеназы из термоацидофильной археи Picrophilus torridus». Extremophiles . 18 (4): 641– 651. doi :10.1007/s00792-014-0645-x. ISSN 1433-4909. PMID 24794033. S2CID 13898874.
Раджпут, Ринки; Верма, Вед Врат; Чаудхари, Вишал; Гупта, Рани (январь 2013 г.). «Гидролитическая гамма-глутамилтранспептидаза из термоацидофильной археи Picrophilus torridus: мутагенез связывающего кармана и транспептидация». Extremophiles . 17 (1): 29– 41. doi :10.1007/s00792-012-0490-8. PMID 23104165. S2CID 17563963.
Реер, Матиас; Фюрер, Тобиас; Ботт, Майкл; Шонхайт, Питер (5 декабря 2009 г.). «Нефосфорилирующий путь Энтнера-Дудорова у термоацидофильных эвриархей Picrophilus torridus включает новую 2-кето-3-дезоксиглюконат-специфическую альдолазу». Журнал бактериологии . 192 (23): 964–974 . doi :10.1128/JB.01281-09. ПМЦ 2812977 . ПМИД 20023024.
Термер, Андреа; Фойгт, Биргит; Ангелов, Ангел; Альбрехт, Дирк; Хеккер, Михаэль; Либль, Вольфганг (декабрь 2011 г.). «Протеомный анализ чрезвычайно термоацидофильной археи Picrophilus torridus при значениях pH и температуры, близких к пределу ее роста». Протеомика . 11 (23): 4559– 4568. doi :10.1002/pmic.201000829. PMID 22114103. S2CID 25035919.

Внешние ссылки

Типовой штамм Picrophilus torridus в BacDive — базе метаданных бактериального разнообразия

[International_Journal_of_Systematic_Bacteriology_-_July_1996_-_Picrophilus_oshimae_and_Picrophilus_tomdus_fam._nov.,_gen._nov.,_sp._nov.,_Two_Species_of_Hyperacidophilic,_Thermophilic,_Heterotrophic,_Aerobic_Archae-1] Schleper; Pühler; Klenk & Zillig (июль 1996 г.). «Picrophilus oshimae и Picrophilus tomdus fam. nov., gen. nov., sp. nov., Two Species of Hyperacidophilic, Thermophilic, Heterotrophic, Aerobic Archae». Международный журнал систематической бактериологии . 46 (3). Международный союз микробиологических обществ : 814– 816. doi : 10.1099/00207713-46-3-814 . ISSN 1466-5034. OCLC 807119723.

[Protein_Adaptation_in_Extremophiles_-_chapter_V_-_Thermoacidophiles_and_their_Protein_Adaptation_to_Low_pH_and_High_Temperatures_-_Antranikian_in_Siddiqui_and_Thomas_(eds)-2] Сиддики; Томас, ред. (2008). "Термоацидофилы и их адаптация белков к низкому pH и высокой температуре". Адаптация белков у экстремофилов . Nova Publishers . ISBN 9781604560190. Получено 31 октября 2013 г.

[3] Ангелов, А.; Либль, В. (2006-10-20). «Взгляд на экстремальную термоацидофилию на основе анализа генома Picrophilus torridus и других термоацидофильных архей». Журнал биотехнологии . Аспекты исследований прокариотического генома. 126 (1): 3– 10. doi :10.1016/j.jbiotec.2006.02.017. ISSN 0168-1656. PMID 16621083.

[4] Шеперс, Б.; Тиманн, В.; Антраникян, Г. (июнь 2006 г.). «Характеристика новой глюкоамилазы из термоацидофильной археи Picrophilus torridus, гетерологично экспрессируемой в E. coli». Engineering in Life Sciences . 6 (3): 311– 317. doi :10.1002/elsc.200620131. ISSN 1618-0240. S2CID 85128507.