Phikzvirus
| Phikzvirus | |
|---|---|
 | |
| Электронная микрофотография вириона вируса Pseudomonas phiKZ | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Дуплоднавирия |
| Королевство: | Хынгонгвире |
| Тип: | Уровирикота |
| Сорт: | Каудовирицеты |
| Семья: | Чималливирусы |
| Род: | Phikzvirus |
Phikzvirus (синоним: PhiKZ-подобные вирусы , Phikzlikevirus до 2015 года) — род вирусов в порядке Caudovirales , семейства Chimalliviridae . Бактерии служат естественными хозяевами. В этом роде три вида. [1] [2] [3]
Фаги этого рода считаются большими или «гигантскими» фагами. Известно, что три фага этого рода (φKZ, φPA3 и 201φ2-1) собирают структуру «фагового ядра», похожую по функциям на ядро эукариотической клетки , которое охватывает ДНК, а также репликационную и транскрипционную машины. Реплицирующаяся ДНК окружена двумерной белковой решеткой, которая, как в настоящее время известно, состоит только из белка Phage Nuclear Enclosure (PhuN). Эти фаги также устанавливают биполярное веретено, используя тубулин -подобный белок PhuZ , который центрирует ядро фага. Он обеспечивает иммунитет к защитным реакциям хозяина, таким как рестриктазы и системы CRISPR -Cas. [4]
Таксономия
К роду относят следующие три вида: [2]
- Вирус псевдомонад PA7
- вирус псевдомонад phiKZ
- Вирус псевдомонад SL2
Структура
Phikzviruses не имеют оболочки , имеют голову и хвост. Голова имеет икосаэдрическую симметрию (T=27) с относительно большим диаметром около 140 нм. Хвост имеет длину около 160 нм, ширину 35 нм. [1]
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Phikzvirus | Голова-Хвост | Т=27 | Необолоченный | Круговой | Однодольный |
Геном
Геномы кольцевые, около 280kb в длину. [1] Два из трех видов были полностью секвенированы и доступны на ICTV. Они варьируются от 211k до 280k нуклеотидов, с 201 до 306 белков. Полные геномы, вместе с одним другим похожим, но неклассифицированным геномом, доступны здесь. [3]
Жизненный цикл
Репликация вируса цитоплазматическая. Вирус прикрепляется к клетке-хозяину с помощью своих терминальных волокон и выбрасывает вирусную ДНК в цитоплазму хозяина посредством сокращения хвостовой оболочки. Методом транскрипции является транскрипция с использованием шаблона ДНК. После репликации вирусных генов собирается и упаковывается прокапсид. Затем собирается хвост, и зрелые вирионы высвобождаются посредством лизиса. Бактерии служат естественным хозяином. Пути передачи — пассивная диффузия. [1]
| Род | Подробности о хозяине | Тканевой тропизм | Подробности записи | Подробности релиза | Место репликации | Место сборки | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Phikzvirus | Бактерии | Никто | Инъекция | Лизис | Цитоплазма | Цитоплазма | Пассивная диффузия |
История
Согласно отчету ICTV за 2009 год, род вирусов PhiKZ-like впервые был принят в качестве нового рода, одновременно со всеми тремя содержащимися в нем видами. Это предложение доступно здесь. В 2012 году название было изменено на Phikzlikevirus . Это предложение доступно здесь. [5] Позднее род был переименован в Phikzvirus .
Ссылки
- ^ abcd "Viral Zone". ExPASy . Получено 1 июля 2015 г. .
- ^ ab "Virus Taxonomy: 2020 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 11 мая 2021 г.
- ^ ab NCBI. "Phikzlikevirus Complete Genomes" . Получено 17 февраля 2015 г.
- ^ Chaikeeratisak, V; Nguyen, K; Egan, ME; Erb, ML; Vavilina, A; Pogliano, J (15 августа 2017 г.). «Ядро фага и веретено тубулина сохраняются среди крупных фагов Pseudomonas». Cell Reports . 20 (7): 1563– 1571. doi :10.1016/j.celrep.2017.07.064. PMC 6028189 . PMID 28813669.
- ^ ICTV. "Virus Taxonomy: 2013 Release" . Получено 17 февраля 2015 г. .
Внешние ссылки
- Вирусная зона: Phikzlikevirus
- ИКТВ
