Семейство холина Phi11

Семейство Phi11 Холин (φ11 Холин) (TC# 1.E.11) составляет Суперсемейство Холин I. [ ^1]

Один из охарактеризованных членов этого семейства, пневмококковый фаг EJ-1 холин (EJh; TC# 1.E.11.1.3), представляет собой гидрофобный пептид длиной 85 аминокислотных остатков (aas) с 2 предполагаемыми трансмембранными сегментами (TMS), демонстрирующими летальную активность по разрушению внутренней мембраны. ^[2] Синтетический N-концевой TMS, фланкированный его N-концевыми положительно заряженными остатками, сворачивается в трансмембранную α-спираль, которая увеличивает проницаемость мембраны. Олигомерные каналы различных размеров образуются в зависимости от соотношения пептида к липиду. С помощью атомно-силовой микроскопии можно увидеть индуцированные пептидом мембранные отверстия. ^[3]

Представительный список белков, принадлежащих к семейству холиновых белков φ11, можно найти в базе данных классификации транспортеров.

Смотрите также

Дальнейшее чтение

Бон, Дж.; Мани, Н.; Джаясвал, РК (1 июля 1997 г.). «Молекулярный анализ литических генов бактериофага 80 альфа золотистого стафилококка». Канадский журнал микробиологии 43 (7): 612–616. ISSN 0008-4166. PMID 9246739.
Cerca, N.; Oliveira, R.; Azeredo, J. (2007-09-01). «Восприимчивость планктонных клеток и биопленок Staphylococcus epidermidis к литическому действию бактериофага стафилококка K». Letters in Applied Microbiology 45 (3): 313–317. doi :10.1111/j.1472-765X.2007.02190.x. ISSN 0266-8254. PMID 17718845.
Кертин, Джон Дж.; Донлан, Родни М. (01.04.2006). «Использование бактериофагов для снижения образования биопленок, связанных с катетером, Staphylococcus epidermidis». Antimicrobial Agents and Chemotherapy 50 (4): 1268–1275. doi :10.1128/AAC.50.4.1268-1275.2006. ISSN 0066-4804. PMC 1426991. PMID 16569839.
Iandolo, John J.; Worrell, Veronica; Groicher, Kajetan H.; Qian, Yudong; Tian, Runying; Kenton, Steve; Dorman, Angela; Ji, Honggui; Lin, Shaoping (2002-05-01). "Сравнительный анализ геномов умеренных бактериофагов φ11, φ12 и φ13 Staphylococcus aureus 8325". Gene 289 (1–2): 109–118. doi :10.1016/S0378-1119(02)00481-X.
Лесснер, М.Дж.; Гаенг, С.; Вендлингер, Г.; Майер, СК; Шерер, С. (1998-05-15). «Двухкомпонентная система лизиса бактериофага Staphylococcus aureus Twort: большой TTG-стартовый холин и ассоциированная амидаза эндолизин». FEMS Microbiology Letters 162 (2): 265–274. ISSN 0378-1097. PMID 9627962.
Мартинес, Вирджиния; Гарсиа, Педро; Гарсиа, Хосе Луис; Прието, Мария Ауксилиадора (1 июля 2011 г.). «Контролируемый аутолиз облегчает восстановление полигидроксиалканоата у Pseudomonas putida KT2440». Микробная биотехнология 4 (4): 533–547. дои : 10.1111/j.1751-7915.2011.00257.x. ISSN 1751-7915. ПМЦ 3815265. ПМИД 21418544.
Seal, Bruce S.; Fouts, Derrick E.; Simmons, Mustafa; Garrish, Johnna K.; Kuntz, Robin L.; Woolsey, Rebekah; Schegg, Kathleen M.; Kropinski, Andrew M.; Ackermann, Hans-W. (01.01.2011). "Бактериофаги Clostridium perfringens ΦCP39O и ΦCP26F: геномная организация и протеомный анализ вирионов". Архивы вирусологии 156 (1): 25–35. doi :10.1007/s00705-010-0812-z. ISSN 1432-8798. PMC 4127328. PMID 20963614.
Ся, Гоцин; Вольц, Кристиан (01.01.2014). «Фаги золотистого стафилококка и их влияние на эволюцию хозяина». Инфекция, генетика и эволюция 21 : 593–601. doi :10.1016/j.meegid.2013.04.022.

Ссылки

^ Редди, Бхаскара Л.; Сайер, Милтон Х. (1 ноября 2013 г.). «Топологический и филогенетический анализ семейств и суперсемейств бактериальных холинов». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1828 (11): 2654–2671 . doi :10.1016/j.bbamem.2013.07.004. ISSN 0006-3002. ПМЦ 3788059 . ПМИД 23856191.
^ Диас, Э.; Мунтхали, М.; Лунсдорф, Х.; Холтье, Дж. В.; Тиммис, К. Н. (1996-02-01). «Двухступенчатая система лизиса пневмококкового бактериофага EJ-1 функциональна у грамотрицательных бактерий: запуск основного пневмококкового аутолизина в Escherichia coli». Молекулярная микробиология . 19 (4): 667– 681. doi :10.1046/j.1365-2958.1996.399929.x. ISSN 0950-382X. PMID 8820638. S2CID 22961185.
^ Аро, Ампаро; Велес, Марисела; Гурмати, Эрик; Лаго, Сантьяго; Васкес, Хесус; Андреу, Дэвид; Гассет, Мария (7 февраля 2003 г.). «Восстановление активности холина с помощью синтетического пептида, содержащего область последовательности 1-32 EJh, холина фага EJ-1». Журнал биологической химии . 278 (6): 3929–3936 . doi : 10.1074/jbc.M211334200 . ISSN 0021-9258. ПМИД 12464609.

По состоянию на 10 марта 2016 года эта статья полностью или частично взята из Базы данных классификации транспортных средств (TCDB) . Владелец авторских прав лицензировал содержимое таким образом, что позволяет повторное использование в соответствии с CC BY-SA 3.0 и GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены. Исходный текст был на "1.E.11 φ11 Holin (φ11 Holin) Family"

[1] Редди, Бхаскара Л.; Сайер, Милтон Х. (1 ноября 2013 г.). «Топологический и филогенетический анализ семейств и суперсемейств бактериальных холинов». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1828 (11): 2654–2671 . doi :10.1016/j.bbamem.2013.07.004. ISSN 0006-3002. ПМЦ 3788059 . ПМИД 23856191.

[2] Диас, Э.; Мунтхали, М.; Лунсдорф, Х.; Холтье, Дж. В.; Тиммис, К. Н. (1996-02-01). «Двухступенчатая система лизиса пневмококкового бактериофага EJ-1 функциональна у грамотрицательных бактерий: запуск основного пневмококкового аутолизина в Escherichia coli». Молекулярная микробиология . 19 (4): 667– 681. doi :10.1046/j.1365-2958.1996.399929.x. ISSN 0950-382X. PMID 8820638. S2CID 22961185.

[3] Аро, Ампаро; Велес, Марисела; Гурмати, Эрик; Лаго, Сантьяго; Васкес, Хесус; Андреу, Дэвид; Гассет, Мария (7 февраля 2003 г.). «Восстановление активности холина с помощью синтетического пептида, содержащего область последовательности 1-32 EJh, холина фага EJ-1». Журнал биологической химии . 278 (6): 3929–3936 . doi : 10.1074/jbc.M211334200 . ISSN 0021-9258. ПМИД 12464609.