Белок-аргининдезиминаза
| протеин-аргининдезиминаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Белок-аргининдеиминаза 4, димер, Человек | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 3.5.3.15 | ||||||||
| Номер CAS | 75536-80-0 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
В энзимологии протеин -аргининдезиминаза ( EC 3.5.3.15) представляет собой фермент , который катализирует форму посттрансляционной модификации, называемую деиминированием аргинина или цитруллинированием :
- белок L -аргинин + H 2 O белок L -цитруллин + NH 3
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются белок L -аргинин (остаток аргинина внутри белка) и H 2 O , тогда как его двумя продуктами являются белок L -цитруллин и NH 3 :
Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз , которые действуют на связи углерод-азот , отличные от пептидных связей , в частности, в линейных амидинах . Систематическое название этого класса ферментов — протеин-L-аргинин иминогидролаза . Этот фермент также называют пептидиларгининдеиминазой .
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 года было решено семь структур этого класса ферментов с кодами доступа PDB 1WD8, 1WD9, 1WDA, 2DEW, 2DEX, 2DEY и 2DW5.
Белки млекопитающих
У млекопитающих есть 5 протеин-аргининдезиминаз, с символами
за исключением грызунов , там регистр букв другой:
- Пади1, Пади2, Пади3, Пади4, Пади6 [3]
Другой случай — это просто исторический артефакт. Он не указывает на то, что белки грызунов являются особенными.
Ссылки
- ^ Сэмс, К. Л.; Мукай, К.; Маркс, БА; Миттал, К.; Деметер, EA; Нелиссен, С.; Гренье, Дж. К.; Тейт, А. Е.; Ахмед, Ф.; Кунрод, СА (октябрь 2022 г.). «Задержка полового созревания, аномалии гонадотропина и субфертильность у самцов мышей с двойным нокаутом Padi2/Padi4». Reprod Biol Endocrinol . 20 (1): 150. doi : 10.1186/s12958-022-01018-w . PMC 9555066. PMID 36224627 .
- ^ "Результаты поиска для "пептидил аргининдеиминаза"". Vertebrate Gene Nomenclature Committee . Получено 9 февраля 2022 г. .
- ^ «Детали суперсемейства белков: Белок-аргинин_деиминаза». Информатика генома мыши.
- Фудзисаки М., Сугавара К. (январь 1981 г.). «Свойства пептидиларгининдезиминазы из эпидермиса новорожденных крыс». J. Biochem . 89 (1). Токио: 257–63 . doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a133189. PMID 7217033.
- белок-аргинин+дезиминаза в Национальной медицинской библиотеке США, медицинские предметные рубрики (MeSH)
