Пептидогликангликозилтрансфераза
| пептидогликангликозилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.4.1.129 | ||||||||
| Номер CAS | 79079-04-2 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Пептидогликангликозилтрансфераза ( EC 2.4.1.129) — фермент, используемый в биосинтезе пептидогликана . Он переносит дисахарид-пептид из донорского субстрата для синтеза гликановой цепи. [1]
Этот фермент принадлежит к семейству гликозилтрансфераз , а именно гексозилтрансфераз. Систематическое название этого класса ферментов — ундекапренилдифосфо-(N-ацетил-D-глюкозаминил-(1->4)-(N-ацетил-D-мурамоилпентапептид):ундекапренилдифосфо-(N-ацетил-D-глюкозаминил-(1->4)-N-ацетил-D-мурамоилпентапептид) дисахаридтрансфераза . Другие общеупотребительные названия включают PG-II , бактопренилдифосфо-N-ацетилмурамоил-(N-ацетил-D-глюкозаминил)- , пентапептид:пептидогликан , N-ацетилмурамоил-N-ацетил-D-глюкозаминилтрансфераза , пенициллинсвязывающий белок (3 или 1B) и пептидогликантрансгликозилаза .
Функция
Пептидогликангликозилтрансфераза соединяет субъединицы липида II для синтеза пептидогликановых цепей. Транспептидазы сшивают углеводные цепи, обеспечивая каркас для клеточной стенки. [2]
Он катализирует химическую реакцию.
- [GlcNAc-(1->4)-Mur 2 Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n-дифосфоундекапренол + GlcNAc-(1->4 )-Mur 2 Ac(ойл-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)-дифосфоундекапренол
- ⇌
- [GlcNAc-(1->4)-Mur 2 Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n + 1-дифосфоундекапренол + ундекапренилдифосфат
Двумя субстратами этого фермента являются
- [GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n-дифосфоундекапренол,
- GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)-дифосфоундекапренол,
в то время как его 2 продукта - это
- [GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n+1-дифосфоундекапренол и
- ундекапренилдифосфат . [3]
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов были определены три структуры с кодами доступа PDB 2BG1, 2UWX и 2UWY.
Ссылки
- ^ Mesleh MF, Rajaratnam P, Conrad M, Chandrasekaran V, Liu CM, Pandya BA и др. (февраль 2016 г.). «Нацеливание синтеза пептидогликана бактериальной клеточной стенки путем ингибирования активности гликозилтрансферазы». Chemical Biology & Drug Design . 87 (2): 190–199. doi :10.1111/cbdd.12662. PMID 26358369.
- ^ Юань И, Барретт Д, Чжан И, Кане Д, Слиз П, Уокер С (март 2007 г.). «Кристаллическая структура пептидогликановой гликозилтрансферазы предлагает модель для процессивного синтеза гликановой цепи». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (13): 5348–5353. Bibcode : 2007PNAS..104.5348Y. doi : 10.1073/pnas.0701160104 . PMC 1817829. PMID 17360321 .
- ^ "Информация о EC 2.4.1.129 - пептидогликангликозилтрансфераза - База данных ферментов BRENDA". www.brenda-enzymes.org . Получено 13.05.2022 .
