Пататин — это семейство гликопротеинов, обнаруженных в картофеле ( Solanum tuberosum ), также известное как туберин, поскольку оно обычно встречается в вакуолях паренхимной ткани клубня растения . Они состоят примерно из 366 аминокислот, все из которых составляют изоэлектрическую точку 4,9. Они имеют молекулярную массу от 40 до 45 кДа, но обычно встречаются в виде димера массой 80 кДа. [1] Основная функция пататина — быть запасным белком, но он также обладает липазной активностью и может расщеплять жирные кислоты из мембранных липидов. [2] [3] Белок пататин составляет около 40% растворимого белка в клубнях картофеля. [4] Члены этого семейства белков также были обнаружены у животных.
Пататин считается основной причиной аллергии на картофель. [5] Было обнаружено, что он похож на латекс, и при контакте с открытой кожей наблюдается увеличение иммуноглобулина E , который вызывает некоторые аллергические реакции и симптомы, такие как астматические симптомы или атопический дерматит . [6] Неясно, почему растение это делает, однако это может быть потенциальным защитным механизмом от насекомых. [7]
Функционально пататин служит ключевым фактором антиоксидантной активности в клубнях картофеля, чтобы сохранить картофель свежим. Кроме того, они функционируют как ацилгидролазы, которые расщепляют различные типы субстратов. В частности, пататины также демонстрируют активность β-1,3-глюканазы, что предполагает их участие в расщеплении полисахаридов. Эта разнообразная ферментативная активность способствует обеспечению питательного состава картофеля. Помимо своей роли в качестве запасных белков, пататины играют значительную роль в защитных механизмах растения от вредителей и грибковых патогенов. Считается, что активность галактолипазы и β-1,3-глюканазы, проявляемая пататинами, способствует устойчивости растения к внешним угрозам. Эта двойная функциональность подчеркивает важность пататинов в защите картофельного растения от потенциальных экологических проблем. [8]
Помимо своей роли в качестве белка хранения, функции пататина распространяются на антиоксидантную активность и категоризацию как комплекса ферментов эстеразы. Он демонстрирует ферментативную активность в метаболизме липидов через липидные ацилгидролазы (LAH) и ацилтрансферазы. Эта активность варьируется в зависимости от сортов картофеля, методов экстракции и субстратов жирных кислот. [9]
Гены пататина расположены в одном основном локусе, включающем как функциональные, так и нефункциональные гены. Изоформы пататина демонстрируют значительную изменчивость среди различных сортов картофеля. Основное местонахождение пататина в вакуоли, наряду с вариантами ингибиторов протеазы, позиционирует его как основного игрока в белках клубней картофеля. Программное обеспечение ngLOC предсказывает 296 вакуолярных белков, из которых 450 предполагаемых вакуолярных белков идентифицированы с помощью масс-спектрометрического секвенирования. Примечательно, что вакуоль клубня распознается как вакуоль для хранения белка с явным отсутствием протеолитических или гликолитических ферментов. Структурно пататин появляется как третичный стабилизированный белок, демонстрирующий стабильность до 45 °C. За этим порогом его вторичная структура начинает разворачиваться, при этом α-спиральная часть денатурирует при 55 °C. Эта уязвимость к изменениям температуры подчеркивает тонкий баланс в поддержании его структурной целостности. [10]
Гидролазная активность пататина, приписываемая его параллельному β-слою ядра с каталитическим серином, расположенным в нуклеофильной петле локтя, помещает его в семейство гидролаз. Эта структура ядра имеет решающее значение для его липидной ацилгидролазной (LAH) активности, предоставляя понимание его ферментативных функций и потенциального участия в защите растений. [11]
Существует исследование, углубляющееся в многогранные свойства пататина, преобладающего белка в картофеле, раскрывающее его структурное разнообразие посредством идентификации нескольких изоформ. Пататин, особенно богатый незаменимыми аминокислотами, является ценным источником питания. Гликопротеиновая природа пататина, характеризующаяся O-связанным гликозилированием, включает различные моносахариды, включая фукозу, что указывает на структурную особенность фукозилированного гликана. Специфическое связывание пататина с AAL, фукозо-аффинным лектином, подчеркивает его отличительный гликановый состав. Выходя за рамки его молекулярных характеристик, исследование изучает регуляторные эффекты пататина на липидный обмен, катаболизм жиров, абсорбцию жиров и активность липазы у личинок данио-рерио, подвергнутых кормлению с высоким содержанием жиров. Результаты показывают, что пататин в концентрации 37,0 мкг/мл способствует метаболизму распада липидов на 23% и проявляет ингибирующее действие на активность липазы и абсорбцию жира, позиционируя его как потенциальный природный компонент со свойствами против ожирения. Эти результаты освещают различные грани пататина, проливая свет на его питательную значимость и его потенциальную роль в борьбе с ожирением. [12]
Пататин — это сложная совокупность белков, представленных двумя мультигенными семействами: класс I в больших концентрациях в клубне и класс II в меньших концентрациях по всему растению картофеля. Изоформы A, B, C и D демонстрируют различия на основе заряда, причем изоформа A имеет самый низкий поверхностный заряд. Эти изоформы, гомологичные по своей природе, различаются по молекулярным массам и соотношениям, демонстрируя свое структурное разнообразие.
Изоформы пататина подвергаются гликозилированию, что влияет на их молекулярные массы и способствует вариациям между изоформами. Экспериментальные расхождения в молярных массах указывают на потенциальное гликозилирование между белком и углеводами в картофеле. Это гликозилирование может играть роль в функциональных характеристиках белка. [11]
Домен пататиноподобной фосфолипазы (PNPLA), обнаруженный в белках, кодирующих пататин, широко распространен в различных формах жизни, охватывая эукариот и прокариот. Эти белки участвуют в различных биологических функциях, включая индукцию сепсиса, колонизацию хозяина, метаболизм триглицеридов и мембранный транспорт. Ключевые особенности белков, содержащих домен PNPLA, включают их липазные и трансацилазные свойства, что указывает на их важную роль в поддержании липидного и энергетического гомеостаза в различных организмах и биологических контекстах. [13]