Пальмитоил(протеин)гидролаза

Класс ферментов

Семейство белков
Пальмитоилпротеинтиоэстераза
Пальмитоилпротеинтиоэстераза 1. Красная плоскость показывает углеводородную границу липидного бислоя.
Идентификаторы
СимволPalm_thioest
ПфамПФ02089
Клан ПФАМCL0028
ИнтерПроIPR002472
СКОП21exw / SCOPe / SUPFAM
суперсемейство OPM127
белок ОПМ1эх5
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
пальмитоил [протеин] гидролаза
Идентификаторы
Номер ЕС3.1.2.22
Номер CAS150605-49-5
Базы данных
ИнтЭнзIntEnz вид
БРЕНДАзапись BRENDA
ExPASyNiceZyme вид
КЕГГзапись KEGG
МетаЦикметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDBRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки

Пальмитоил протеингидролаза/тиоэстераза — это фермент (EC 3.1.2.22), который удаляет тиоэстер -связанные жирные ацильные группы, такие как пальмитат, из модифицированных остатков цистеина в белках или пептидах во время лизосомальной деградации . Он катализирует реакцию

пальмитоил[белок] + H 2 O пальмитат + белок {\displaystyle \rightleftharpoons}

Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз , в частности, тех, которые действуют на тиоэфирные связи. Систематическое названиепальмитоил[протеин]гидролаза . Другие общеупотребительные названия — пальмитоил-протеин тиоэстераза и пальмитоил-(протеин) гидролаза . Этот фермент участвует в удлинении жирных кислот в митохондриях.

Нейрональные цероидные липофусцинозы (NCL) представляют собой группу энцефалопатий, которые встречаются у 1 из 12 500 детей. Мутации в гене пальмитоилпротеинтиоэстеразы, вызывающие инфантильный нейрональный цероидный липофусциноз. [1] Наиболее распространенная мутация приводит к внутриклеточному накоплению полипептида и неопределяемой активности фермента в мозге. Прямое секвенирование кДНК, полученных из мозговой РНК пациентов с INCL, показало ошибочную трансверсию A на T в нуклеотидной позиции 364, что приводит к замене Trp на Arg в позиции 122 в белке - Arg 122 непосредственно примыкает к консенсусной последовательности липазы, которая содержит предполагаемый активный сайт Ser PPT. Возникновение этой и двух других независимых мутаций в гене PPT убедительно свидетельствует о том, что дефекты в этом гене вызывают INCL.

Примеры

Человеческие белки, содержащие этот домен, включают:

пальмитоил-протеин тиоэстераза 1
Идентификаторы
СимволПП1
Альтернативные символыППT
ген NCBI5538
HGNC9325
ОМИМ600722
РефСекNM_000310
UniProtР50897
Другие данные
Номер ЕС3.1.2.22
ЛокусХр. 1 стр. 32
Искать
СтруктурыШвейцарская модель
ДоменыИнтерПро
пальмитоил-протеин тиоэстераза 2
Идентификаторы
СимволПП2
Альтернативные символыГ14
ген NCBI9374
HGNC9326
ОМИМ603298
РефСекNM_138717
UniProtQ9UMR5
Другие данные
Номер ЕС3.1.2.22
ЛокусХр. 6 стр. 21.3
Искать
СтруктурыШвейцарская модель
ДоменыИнтерПро

Структурные исследования

По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов были определены 4 структуры с кодами доступа PDB 1EH5, 1EI9, 1EXW и 1PJA.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Hofmann SL, Vesa J, Hellsten E, Verkruyse LA, Camp LA, Rapola J, Santavuori P, Peltonen L (1995). «Мутации в гене тиоэстеразы пальмитоилового белка, вызывающие инфантильный нейрональный цероидный липофусциноз». Nature . 376 (6541): 584– 587. Bibcode :1995Natur.376..584V. doi :10.1038/376584a0. PMID  7637805. S2CID  4322423.

Дальнейшее чтение

  • Camp LA, Hofmann SL (1995). "Анализ и выделение пальмитоил-протеинтиоэстеразы из бычьего мозга с использованием пальмитоилированного H-Ras в качестве субстрата". Липидные модификации белков . Методы в энзимологии. Т. 250. С.  336–47 . doi :10.1016/0076-6879(95)50083-9. ISBN 978-0-12-182151-7. PMID  7651163.
  • Schriner JE, Yi W, Hofmann SL (1996). "cDNA и геномное клонирование человеческой пальмитоил-протеинтиоэстеразы (PPT), фермента, дефектного при инфантильном нейрональном цероидном липофусцинозе". Genomics . 34 (3): 317– 22. doi :10.1006/geno.1996.0292. PMID  8786130.
  • Verkruyse LA, Hofmann SL (1996). "Лизосомальное нацеливание пальмитоил-протеинтиоэстеразы". J. Biol. Chem . 271 (26): 15831– 6. doi : 10.1074/jbc.271.26.15831 . PMID  8663305.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR002472


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Пальмитоил(протеин)_гидролаза&oldid=1194446539"