Тихоокеанские Бионауки
Американская биотехнологическая компания

37°28′43″с.ш. 122°09′03″з.д. / 37.4787°с.ш. 122.1507°з.д. / 37.4787; -122.1507 (штаб-квартира)

Pacific Biosciences of California, Inc.
Тип компанииПубличный
ПромышленностьБиотехнология
Основан2004 ; 21 год назад ( 2004 )
Штаб-квартира
Менло-Парк, Калифорния
,
Соединенные Штаты
Ключевые люди
ДоходУвеличивать 200,5 млн долларов США (2023)
Увеличивать 306,7 млн ​​долл. США (2023 г.)
Всего активовУвеличивать 1,75 млрд долларов США (2023)
Количество сотрудников
796 (декабрь 2023 г.)
Веб-сайтpacb.com
Сноски / ссылки
[1] Результаты PacBio Q4 2023

Pacific Biosciences of California, Inc. (также известная как PacBio) — американская биотехнологическая компания, основанная в 2004 году, которая разрабатывает и производит системы для секвенирования генов и некоторых новых биологических наблюдений в реальном времени. [2] [3] [ проверка не удалась ] PacBio имеет две основные платформы секвенирования: секвенирование отдельных молекул в реальном времени (SMRT), основанное на свойствах волноводов с нулевой модой, и секвенирование путем связывания (SBB) химии, которая использует собственные нуклеотиды и безрубцовое включение для связывания и удлинения ДНК . [4] [5]

История

Компания была основана на исследованиях, проведенных в Корнеллском университете , которые объединили обработку полупроводников и фотонику с исследованиями в области биотехнологий. [2] Три аспиранта лаборатории профессоров Уотта У. Уэбба — Йонас Корлах — и Гарольда Крейгхеда — Стив Тернер и Матье Фоке — стали первыми сотрудниками.

Она начиналась под названием Nanofluidics, Inc. Компания привлекла около 400 000 000 долларов США в шести раундах преимущественно венчурного финансирования , что сделало ее одним из самых капитализированных стартапов в 2010 году, предшествовавших их публичному размещению акций в октябре того же года. [6] Ключевыми инвесторами были Mohr Davidow Ventures, Kleiner, Perkins, Caufield & Byers , Alloy Ventures и Wellcome Trust . [2]

Первый коммерческий продукт компании, PacBio RS, был продан ограниченному кругу клиентов в 2010 году и был выпущен в продажу в начале 2011 года. [7] [8] Последующая версия секвенатора под названием PacBio RS II была выпущена в апреле 2013 года. [9]

Лидерство

В 2004 году генеральный директор компании Kleiner Perkins Хью Мартин стал ее постоянным предпринимателем. 6 января 2012 года член совета директоров Майкл Хункапиллер, доктор философии, занял должность генерального директора. [10] Хункапиллер вышел на пенсию в сентябре 2020 года, и его заменил председатель совета директоров Кристиан Генри. [11] Генри был бывшим исполнительным вице-президентом и главным коммерческим директором Illumina до того, как в июле 2018 года вошел в совет директоров PacBio. [12]

Illumina: попытка приобретения

1 ноября 2018 года Illumina, Inc. согласилась приобрести PacBio за 1,2 млрд долларов США наличными. Ожидалось, что сделка будет закрыта в четвертом квартале 2019 года. [13] В декабре 2019 года Федеральная торговая комиссия подала в суд, чтобы заблокировать приобретение. [14] [15] Сделка была расторгнута с объявлением 2 января 2020 года. Illumina также согласилась выплатить Pacific Biosciences сбор за расторжение в размере 98 млн долларов США плюс ранее согласованные платежи за продление сделки в размере 22 млн долларов США в феврале и 6 млн долларов США в марте 2020 года. [16]

Технология секвенирования

Инструменты для секвенирования

Секвенатор PacBio RSII
Длиннокодирующий секвенатор PacBio Revio

Первый научный инструмент компании, названный PacBio RS, был выпущен для ограниченного круга клиентов в конце 2010 года, а полный коммерческий выпуск состоялся в начале 2011 года. [17] [8] Поставщик секвенирования GATC Biotech был выбран Pacific Biosciences в качестве своего первого европейского поставщика услуг в конце 2010 года. [18] Новая версия секвенатора была выпущена в апреле 2013 года, она производила более длинные считывания последовательностей и более высокую пропускную способность, чем оригинальный инструмент RS. [9] Инструмент RS будет официально поддерживаться до конца 2021 года. [19] В сентябре 2015 года компания выпустила новый инструмент секвенирования, Sequel System, с увеличенной производительностью секвенирования при меньшем размере и более низкой цене по сравнению с PacBio RS II. [20] Впоследствии, в октябре 2022 года, PacBio запустила новую систему секвенирования, которая может секвенировать 1300 человеческих геномов в год по сравнению с 86 в год предыдущими машинами для секвенирования PacBio. [21]

Реагенты и ячейки SMRT

Чтобы использовать любой из инструментов, клиенты должны также приобрести наборы реагентов для подготовки и секвенирования ДНК и небольшие расходные материалы, называемые «ячейками SMRT». Ячейки для ранних форм секвенатора имеют площадь чуть меньше одного квадратного сантиметра и содержат десятки тысяч волноводов нулевой моды , [4] тогда как более новые системы имеют более высокую плотность ячеек и содержат 25 миллионов волноводов нулевой моды (ZMWG), что позволяет быстрее секвенировать ДНК. [22] [21] [23]

Программное обеспечение и приложения

Их продукт вторичного анализа биоинформатики для RS, названный «SMRT Analysis», был с открытым исходным кодом . [24] Для системы Sequel программное обеспечение вторичного анализа было реорганизовано в приложение «SMRT Link». В 2013 году компания выпустила новые инструменты биоинформатики для автоматизированной сборки генома (HGAP) и завершения (Quiver). [25] [26] [27]

  • Веб-сайт компании
  • Профиль Wall Street Journal
  • Бизнес-данные для PacBio:
    • Google
    • Документы SEC
    • Йаху!

Ссылки

  1. ^ "Pacific Biosciences Form 8-K". Комиссия по ценным бумагам и биржам США . 15 февраля 2024 г.
  2. ^ abc bloomberg.com https://www.bloomberg.com/businessweek/globalbiz/content/dec2009/gb2009123_706120.htm. {{cite web}}: Отсутствует или пусто |title=( помощь ) [ постоянная мертвая ссылка ‍ ]
  3. ^ Бракманн, Сюзанна (5 апреля 2010 г.). «Рибосома в действии». Nature . 464 (7291): 987– 988. doi : 10.1038/464987a . PMID  20393548. S2CID  1742990.
  4. ^ ab Rhoads, Anthony; Au, Kin Fai (1 октября 2015 г.). «PacBio Sequencing and Its Applications». Genomics, Proteomics & Bioinformatics . 13 (5): 278– 289. doi : 10.1016/j.gpb.2015.08.002 . ISSN  1672-0229. PMC 4678779 . PMID  26542840. 
  5. ^ Эйзенштейн, Майкл (1 января 2023 г.). «Illumina сталкивается с соперниками по короткому чтению». Nature Biotechnology . 41 (1): 3– 5. doi :10.1038/s41587-022-01632-4. ISSN  1546-1696. PMID  36653497. S2CID  255971472 . Получено 8 марта 2023 г. .
  6. ^ Остин, Колин Дебейс и Скотт (9 марта 2010 г.). «Оценка перспективных молодых фирм» . Wall Street Journal – через www.wsj.com.
  7. ^ "PacBio раскрывает спецификации бета-системы для RS; заявляет, что коммерческий релиз запланирован на первую половину 2011 года" . GenomeWeb . 7 декабря 2010 г.
  8. ^ ab "PacBio поставляет первые две коммерческие системы; портфель заказов увеличивается до 44" . GenomeWeb . 3 мая 2011 г.
  9. ^ ab "Новые продукты: RS II от PacBio; Запонки" . GenomeWeb . 16 апреля 2013 г.
  10. ^ "Майкл Ханкапиллер вступил, Хью Мартин ушел с поста генерального директора Pacific Biosciences". 6 января 2012 г. Получено 10 августа 2020 г.
  11. ^ "Pacific Biosciences назначает Кристиана Генри президентом и генеральным директором". 7 августа 2020 г. Получено 10 августа 2020 г.
  12. ^ "Люди в новостях: Кристиан Генри, Майк Хункапиллер, Карен Тэй Кох, Майкл Вунацос и другие". 6 марта 2020 г. Получено 10 августа 2020 г.
  13. ^ Фарр, Кристина (1 ноября 2018 г.). «Гигант секвенирования ДНК Illumina только что купил конкурента Pac Bio за 1,2 миллиарда долларов — вот почему». CNBC. Архивировано из оригинала 14 июля 2019 г.
  14. ^ Мэтью, Херпер (17 декабря 2019 г.). «FTC предпринимает шаги, чтобы заблокировать приобретение PacBio секвенатором ДНК Illumina». STAT News . Получено 31 марта 2021 г.
  15. ^ "FTC Challenges Illumina's Proposed Acquisition of PacBio". Федеральная торговая комиссия . 17 декабря 2019 г. Получено 31 марта 2021 г.
  16. ^ "Illumina отказывается от сделки на 1,2 миллиарда долларов по покупке конкурента Pacific Biosciences". CNBC. 2 января 2020 г. Архивировано из оригинала 3 января 2020 г. Получено 3 января 2020 г.
  17. ^ "PacBio называет имена первых 10 клиентов для секвенатора одной молекулы стоимостью 695 000 долларов; первые поставки запланированы на второй квартал" . GenomeWeb . 23 февраля 2010 г.
  18. ^ "GATC Biotech станет первым европейским поставщиком услуг для PacBio RS" . GenomeWeb . 21 сентября 2010 г.
  19. ^ "PacBio планирует сиквел-модернизации, прекратит выпуск RSII в 2021 году" . GenomeWeb . 3 августа 2018 г.
  20. ^ http://www.pacb.com/blog/introducing-the-sequel-system-the-scalable-platform-for-smrt-sequencing/ [ самостоятельно опубликованный источник ]
  21. ^ ab Hale, Conor. "PacBio представляет свой первый секвенсор ДНК с коротким считыванием и усовершенствованную систему с длинным считыванием". Fierce Biotech . Получено 7 марта 2023 г.
  22. ^ Levene, MJ; Korlach, J.; Turner, SW; Foquet, M.; Craighead, HG; Webb, WW (31 января 2003 г.). «Волноводы с нулевым режимом для анализа одиночных молекул при высоких концентрациях». Science . 299 (5607): 682– 686. Bibcode :2003Sci...299..682L. doi :10.1126/science.1079700. ISSN  0036-8075. PMID  12560545. S2CID  6060239.
  23. ^ LeMieux, Julianna (1 декабря 2022 г.). «PacBio стремится вытеснить конкурентов в переполненном пространстве секвенирования». GEN Biotechnology . 1 (6): 476– 478. doi :10.1089/genbio.2022.29066.jle. ISSN  2768-1572. S2CID  255024364. Получено 8 марта 2023 г.
  24. ^ Pacific Biosciences (23 февраля 2015 г.) «Анализ» [ самостоятельно опубликованный источник ]
  25. ^ "Новые продукты: анализ SMRT 1.4 от PacBio" . GenomeWeb . 29 января 2013 г.
  26. ^ «Завершение геномов с помощью HGAP». 6 мая 2013 г.
  27. ^ Чин, Чен-Шань; Александр, Дэвид Х.; Маркс, Патрик; Кламмер, Аарон А.; Дрейк, Джеймс; Хайнер, Шерил; Клам, Алисия; Коупленд, Алекс; Хаддлстон, Джон; Эйхлер, Эван Э.; Тернер, Стивен В.; Корлах, Джонас (5 июня 2013 г.). "Негибридные, законченные сборки микробного генома из данных секвенирования SMRT с длинными прочтениями" . Nature Methods . 10 (6): 563– 569. doi :10.1038/nmeth.2474. PMID  23644548. S2CID  205421576.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Pacific_Biosciences&oldid=1253590403"