PubMed
Онлайновая биомедицинская база данных

PubMed
Контакт
Исследовательский центрНациональная медицинская библиотека США (NLM)
Дата выпускаЯнварь 1996 г .; 29 лет назад ( 1996-01 )
Доступ
Веб-сайтpubmed.ncbi.nlm.nih.gov

PubMed — это бесплатная база данных , включающая в себя в первую очередь базу данных MEDLINE ссылок и рефератов по биологическим наукам и биомедицинским темам. Национальная медицинская библиотека США (NLM) в Национальном институте здравоохранения поддерживает базу данных как часть системы поиска информации Entrez . [1]

С 1971 по 1997 год онлайн-доступ к базе данных MEDLINE осуществлялся в основном через институциональные учреждения, такие как университетские библиотеки . [2] PubMed, впервые выпущенный в январе 1996 года, открыл эру частного, бесплатного, домашнего и офисного поиска MEDLINE. [3] Система PubMed стала предлагаться бесплатно для публики с июня 1997 года. [2]

Содержание

Помимо MEDLINE, PubMed предоставляет доступ к:

  • старые ссылки из печатной версии Index Medicus , начиная с 1951 года и ранее
  • ссылки на некоторые журналы до того, как они были проиндексированы в Index Medicus и MEDLINE, например, Science , BMJ и Annals of Surgery
  • очень недавние записи в записях для статьи до ее индексации в Медицинских предметных рубриках (MeSH) и добавления в MEDLINE
  • коллекция книг, доступных в полном тексте и других подмножествах записей NLM [4]
  • Цитаты PMC
  • Книжная полка NCBI

Многие записи PubMed содержат ссылки на полные тексты статей, некоторые из которых находятся в свободном доступе, часто в PubMed Central [5] и локальных зеркалах, таких как Europe PubMed Central . [6]

Информация о журналах, индексированных в MEDLINE и доступных через PubMed, находится в каталоге NLM. [7]

По состоянию на 23 мая 2023 года [обновлять]в PubMed имеется более 35 миллионов ссылок и рефератов, датируемых с 1966 года, выборочно с 1865 года и очень выборочно с 1809 года. По состоянию на ту же дату [обновлять]24,6 миллиона записей PubMed перечислены с их рефератами, а 26,8 миллиона записей имеют ссылки на полнотекстовые версии (из которых 10,9 миллиона статей доступны в виде полных текстов бесплатно). [8] За последние 10 лет (по состоянию на 31 декабря 2019 года) в среднем каждый год добавлялось около миллиона новых записей.

В 2016 году NLM изменила систему индексации, чтобы издатели могли напрямую исправлять опечатки и ошибки в статьях, проиндексированных PubMed. [9]

Сообщалось, что PubMed включает некоторые статьи, опубликованные в хищных журналах. Политики MEDLINE и PubMed по выбору журналов для включения в базу данных немного различаются. Слабости в критериях и процедурах индексации журналов в PubMed Central могут позволить публикациям из хищных журналов просочиться в PubMed. [10]

Характеристики

Дизайн веб-сайта

Новый интерфейс PubMed был запущен в октябре 2009 года и поощрял использование таких быстрых поисковых формулировок, как у Google; их также называют поиском «телеграмм». [11] По умолчанию результаты сортируются по «Самым последним», но это можно изменить на «Лучшее совпадение», «Дата публикации», «Первый автор», «Последний автор», «Журнал» или «Название». [12]

Дизайн и домен веб-сайта PubMed были обновлены в январе 2020 года и стали использоваться по умолчанию 15 мая 2020 года с обновленными и новыми функциями. [13] Была критическая реакция со стороны многих исследователей, которые часто используют сайт. [14]

PubMed для карманных компьютеров/мобильных телефонов

Доступ к PubMed/MEDLINE можно получить с помощью портативных устройств, например, с помощью опции «PICO» (для специализированных клинических вопросов), созданной NLM. [15] Также доступна опция «PubMed Mobile», обеспечивающая доступ к мобильной, упрощенной версии PubMed. [16]

Простой поиск в PubMed можно выполнить, введя ключевые аспекты темы в окно поиска PubMed.

PubMed переводит эту первоначальную формулировку поиска и автоматически добавляет названия полей, соответствующие термины MeSH (Медицинские предметные рубрики), синонимы, логические операторы и «вкладывает» полученные термины соответствующим образом, значительно улучшая формулировку поиска, в частности, путем регулярного объединения (с использованием оператора OR) текстовых слов и терминов MeSH. [ необходима ссылка ]

Для оптимального поиска в PubMed необходимо понимать его основной компонент, MEDLINE, и особенно контролируемый словарь MeSH (Medical Subject Headings), используемый для индексации статей MEDLINE. Они также могут потребовать сложных стратегий поиска, использования названий полей (тегов), правильного использования ограничений и других функций; библиотекари-справочники и специалисты по поиску предлагают услуги поиска. [17] [18]

Поиск в окне поиска PubMed рекомендуется только для поиска однозначных тем или новых вмешательств, для которых еще не создан заголовок MeSH, а также для поиска коммерческих марок лекарств и имен собственных. Он также полезен, когда нет подходящего заголовка или дескриптор представляет собой частичный аспект. Поиск с использованием тезауруса MeSH более точен и даст меньше нерелевантных результатов. Кроме того, он избавляет от недостатка поиска свободного текста, при котором необходимо учитывать орфографические, единственное/множественное число или сокращения. С другой стороны, статьи, недавно включенные в базу данных, которым еще не были назначены дескрипторы, не будут найдены. Поэтому, чтобы гарантировать исчерпывающий поиск, необходимо использовать комбинацию контролируемых языковых заголовков и свободных текстовых терминов. [19]

Параметры статьи журнала

При индексации журнальной статьи извлекаются многочисленные параметры статьи и сохраняются в виде структурированной информации. К таким параметрам относятся: Тип статьи (термины MeSH, например, «Клиническое исследование»), Вторичные идентификаторы (термины MeSH), Язык, Страна журнала или история публикации (дата электронной публикации, дата публикации печатного журнала).

Тип публикации: Клинические запросы/систематические обзоры

Параметр типа публикации позволяет осуществлять поиск по типу публикации , включая отчеты о различных видах клинических исследований. [20]

Вторичный идентификатор

С июля 2005 года процесс индексации статей MEDLINE извлекает идентификаторы из аннотации статьи и помещает их в поле, называемое Вторичный идентификатор (SI). Поле вторичного идентификатора предназначено для хранения номеров доступа к различным базам данных молекулярных последовательностей, экспрессии генов или химических соединений и идентификаторов клинических испытаний. Для клинических испытаний PubMed извлекает идентификаторы испытаний из двух крупнейших реестров испытаний: ClinicalTrials.gov (идентификатор NCT) и Международный стандартный регистр рандомизированных контролируемых испытаний (идентификатор IRCTN). [21]

Смотрите также

Ссылка, которая считается особенно релевантной, может быть отмечена, и могут быть идентифицированы «связанные статьи». Если релевантно, можно выбрать несколько исследований и сгенерировать связанные статьи для всех них (в PubMed или любой другой базе данных NCBI Entrez) с помощью опции «Найти связанные данные». Затем связанные статьи перечисляются в порядке «связанности». Чтобы создать эти списки связанных статей, PubMed сравнивает слова из заголовка и аннотации каждой цитаты, а также назначенные заголовки MeSH, используя мощный алгоритм взвешивания слов. [22] Функция «связанные статьи» была признана настолько точной, что авторы статьи предложили использовать ее вместо полного поиска. [23]

Сопоставление с MeSH

PubMed автоматически ссылается на термины и подзаголовки MeSH. Примерами могут служить: «плохое дыхание» ссылается на (и включает в поиск) «галитоз», «сердечный приступ» на «инфаркт миокарда», «рак груди» на «новообразования груди». Где это уместно, эти термины MeSH автоматически «расширяются», то есть включают более конкретные термины. Такие термины, как «уход» автоматически ссылаются на «Уход [MeSH]» или «Уход [Подзаголовок]». Эта функция называется «Автоматическое сопоставление терминов» и по умолчанию применяется при свободном текстовом поиске, но не при точном поиске фраз (т. е. при заключении поискового запроса в двойные кавычки). [24] Эта функция делает поиск PubMed более чувствительным и избегает ложноотрицательных (пропущенных) результатов, компенсируя разнообразие медицинской терминологии. [24]

PubMed не применяет автоматическое сопоставление термина в следующих случаях: при написании фразы в кавычках (например, «почечный аллотрансплантат»), при усечении на звездочке (например, почечный аллотрансплантат*) и при поиске с метками полей (например, Рак [ti]). [19]

Мой NCBI

Дополнительная функция PubMed «Мой NCBI» (с бесплатной регистрацией) предоставляет инструменты для

  • сохранение поисков
  • фильтрация результатов поиска
  • настройка автоматических обновлений, отправляемых по электронной почте
  • сохранение наборов ссылок, полученных в ходе поиска PubMed
  • настройка форматов отображения или выделение поисковых терминов

и широкий спектр других опций. [25] Доступ к разделу "My NCBI" возможен с любого компьютера с доступом в Интернет. Более ранняя версия "My NCBI" называлась "PubMed Cubby". [26]

LinkOut

LinkOut — это средство NLM для связывания и предоставления доступа к полным текстам местных журналов. [27] Около 3200 сайтов (в основном академические учреждения) участвуют в этом средстве NLM (по состоянию на март 2010 г. [обновлять]), от Университета Ольборга в Дании до ZymoGenetics в Сиэтле. [28] Пользователи этих учреждений видят логотип своего учреждения в результатах поиска PubMed (если журнал хранится в этом учреждении) и могут получить доступ к полному тексту. Link out объединяется с Outside Tool с момента крупного обновления платформы, которое состоится летом 2019 г. [29]

PubMed Commons

В 2016 году PubMed позволяет авторам статей комментировать статьи, индексируемые PubMed. Эта функция изначально тестировалась в пилотном режиме (с 2013 года) и стала постоянной в 2016 году. [30] В феврале 2018 года PubMed Commons был закрыт из-за того, что «использование оставалось минимальным». [31] [32]

спроситеMEDLINE

askMEDLINE, инструмент для создания свободных текстовых запросов на естественном языке для MEDLINE/PubMed, разработанный NLM, также подходящий для портативных устройств. [33]

Идентификатор PubMed

PMID (идентификатор PubMed или уникальный идентификатор PubMed) [34] — это уникальное целочисленное значение , начинающееся с , назначаемое каждой записи PubMed. PMID — это не то же самое, что PMCID ( идентификатор PubMed Central), который является идентификатором для всех работ, опубликованных в свободном доступе PubMed Central . [35]1

Присвоение PMID или PMCID публикации ничего не говорит читателю о типе или качестве контента. PMID присваиваются письмам редактору , редакционным мнениям, колонкам и любым другим материалам, которые редактор решает включить в журнал, а также рецензируемым статьям. Наличие идентификационного номера также не является доказательством того, что статьи не были отозваны из -за мошенничества, некомпетентности или неправомерного поведения. Объявлению о любых исправлениях в исходных статьях может быть присвоен PMID.

Каждое число, введенное в окно поиска PubMed, по умолчанию рассматривается как PMID. Таким образом, любая ссылка в PubMed может быть найдена с помощью PMID.

Альтернативные интерфейсы

MEDLINE — одна из баз данных, доступ к которой осуществляется через PubMed. Несколько компаний предоставляют доступ к MEDLINE через свои платформы.

Национальная медицинская библиотека сдает в аренду информацию MEDLINE ряду частных поставщиков, таких как Embase , Ovid , Dialog , EBSCO , Knowledge Finder и многим другим коммерческим, некоммерческим и академическим поставщикам. [36] По состоянию на октябрь 2008 года [обновлять]было выдано более 500 лицензий, более 200 из них — поставщикам за пределами США. Поскольку лицензии на использование данных MEDLINE предоставляются бесплатно, NLM фактически предоставляет бесплатную испытательную площадку для широкого спектра [37] альтернативных интерфейсов и сторонних дополнений к PubMed, одной из очень немногих крупных, профессионально курируемых баз данных, которая предлагает такую ​​возможность.

Лу определяет выборку из 28 текущих и бесплатных веб-версий PubMed, не требующих установки или регистрации, которые сгруппированы в четыре категории: [37]

  1. Ранжирование результатов поиска, например: eTBLAST ; MedlineRanker; [38] MiSearch; [39]
  2. Кластеризация результатов по темам, авторам, журналам и т. д., например: Anne O'Tate ; [40] ClusterMed; [41]
  3. Улучшение семантики и визуализации, например: EBIMed; [42] MedEvi. [43]
  4. Улучшенный интерфейс поиска и возможности поиска, например, askMEDLINE [44] [45] BabelMeSH; [46] и PubCrawler. [47]

Поскольку большинство из этих и других альтернатив в основном полагаются на данные PubMed/MEDLINE, взятые в аренду по лицензии у NLM/PubMed, был предложен термин «производные PubMed». [37] Без необходимости хранить около 90 ГБ исходных наборов данных PubMed, любой может писать приложения PubMed, используя программный интерфейс eutils-application, как описано в «The E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More» Эрика Сэйерса, доктора философии. [48] Различные генераторы форматов цитирования, принимающие номера PMID в качестве входных данных, являются примерами веб-приложений, использующих программный интерфейс eutils-application. Примеры веб-страниц включают Citation Generator – Mick Schroeder, Pubmed Citation Generator – Ultrasound of the Week, PMID2cite и Cite this for me.

Интеллектуальный анализ данных PubMed

Альтернативные методы добычи данных в PubMed используют среды программирования, такие как Matlab , Python или R. В этих случаях запросы PubMed пишутся как строки кода и передаются в PubMed, а затем ответ обрабатывается непосредственно в среде программирования. Код может быть автоматизирован для систематического запроса с различными ключевыми словами, такими как болезнь, год, органы и т. д.

Для массовой обработки полная база данных PubMed доступна в формате XML, который можно загрузить с FTP-сервера. Ежегодная базовая линия выпускается в декабре, за ней следуют ежедневные файлы обновлений. [49]

В дополнение к своей традиционной роли биомедицинской базы данных, PubMed стал общим ресурсом для обучения моделей биомедицинского языка . [50] Недавние достижения в этой области включают разработку таких моделей, как PubMedGPT, модель с 2,7 млрд параметров, обученная на данных PubMed Стэнфордским CRFM, и BiomedCLIP-PubMedBERT от Microsoft, которая использует пары рисунок-подпись из PubMed Central для обработки зрения-языка. Эти модели демонстрируют значительный потенциал данных PubMed в расширении возможностей ИИ в медицинских исследованиях и приложениях здравоохранения. Такие достижения подчеркивают растущее пересечение между крупномасштабным интеллектуальным анализом данных и разработкой ИИ в области биомедицины.

Данные, доступные через PubMed, можно отразить локально с помощью неофициального инструмента, такого как MEDOC. [51]

Миллионы записей PubMed дополняют различные открытые наборы данных об открытом доступе , такие как Unpaywall . Инструменты анализа данных, такие как Unpaywall Journals, используются библиотеками для помощи в отмене крупных сделок : библиотеки могут избежать подписки на материалы, уже обслуживаемые мгновенным открытым доступом через открытые архивы, такие как PubMed Central. [52]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ "PubMed". Архивировано из оригинала 13 декабря 2020 г. Получено 22 февраля 2019 г.
  2. ^ ab Lindberg DA (2000). «Интернет-доступ к Национальной медицинской библиотеке» (PDF) . Эффективная клиническая практика . 3 (5): 256–60 . PMID  11185333. Архивировано из оригинала (PDF) 2 ноября 2013 г.
  3. ^ "PubMed празднует свое 10-летие". Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США . 5 октября 2006 г. Архивировано из оригинала 23 апреля 2018 г. Получено 22 марта 2011 г.
  4. ^ "PubMed: MEDLINE Retrieval on the World Wide Web". Информационный листок . Национальная медицинская библиотека США. 7 июня 2002 г. Архивировано из оригинала 1 сентября 2018 г. Получено 22 марта 2011 г.
  5. ^ Roberts RJ (январь 2001 г.). «PubMed Central: Генбанк опубликованной литературы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (2): 381– 2. Bibcode : 2001PNAS...98..381R. doi : 10.1073/pnas.98.2.381 . PMC 33354. PMID  11209037 . 
  6. ^ McEntyre JR, Ananiadou S, Andrews S, Black WJ, Boulderstone R, Buttery P, et al. (Январь 2011 г.). "UKPMC: ресурс полнотекстовых статей для наук о жизни". Nucleic Acids Research . 39 (выпуск базы данных): D58-65. doi :10.1093/nar/gkq1063. PMC 3013671. PMID  21062818 . 
  7. ^ "Каталог NLM: Журналы, на которые есть ссылки в базах данных NCBI". NCBI. 2011. Архивировано из оригинала 13 октября 2023 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  8. ^ "PubMed". PubMed . Архивировано из оригинала 6 января 2022 года . Получено 5 января 2023 года .Поисковый запрос «1800:2100[dp]» извлекает все результаты, дата публикации которых находится в диапазоне от 1800 до 2100 года включительно.
  9. ^ "MEDLINE/PubMed Production Improvements Underway". Технический бюллетень NLM (411): e1. Июль–август 2016 г. Архивировано из оригинала 29 марта 2023 г. Получено 29 июля 2016 г.
  10. ^ Manca A, Moher D, Cugusi L, Dvir Z, Deriu F (сентябрь 2018 г.). «Как хищнические журналы просачиваются в PubMed». CMAJ . 190 (35): E1042 – E1045 . doi :10.1503/cmaj.180154. PMC 6148641 . PMID  30181150.  
  11. ^ Кларк Дж., Венц Р. (сентябрь 2000 г.). «Прагматичный подход эффективен в здравоохранении, основанном на доказательствах». BMJ . 321 (7260): 566– 7. doi :10.1136/bmj.321.7260.566/a. PMC 1118450 . PMID  10968827. 
  12. ^ Fatehi F, Gray LC, Wootton R (январь 2014 г.). «Как улучшить поиск PubMed/MEDLINE: 2. настройки отображения, сложные поисковые запросы и поиск по темам». Журнал телемедицины и телеухода . 20 (1): 44– 55. doi : 10.1177/1357633X13517067. PMID  24352897. S2CID  43725062.
  13. ^ Trawick B (21 января 2020 г.). «Новый и улучшенный PubMed®». NLM Musings From the Mezzanine . Архивировано из оригинала 7 октября 2023 г. Получено 23 мая 2020 г.
  14. ^ Прайс М (22 мая 2020 г.). «Они переделали PubMed, любимый сайт. Он не очень хорошо себя проявил». Наука . Архивировано из оригинала 21 мая 2022 г. Получено 30 июня 2022 г.
  15. ^ "PubMed via handhelds (PICO)". Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2004. Архивировано из оригинала 30 мая 2023 года . Получено 7 апреля 2016 года .
  16. ^ "PubMed Mobile Beta". Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2011. Архивировано из оригинала 11 апреля 2023 года . Получено 7 апреля 2016 года .
  17. ^ Jadad AR, McQuay HJ (июль 1993 г.). «Поиск литературы. Будьте систематичны в своем поиске». BMJ . 307 (6895): 66. doi :10.1136/bmj.307.6895.66-a. PMC 1678459 . PMID  8343701. 
  18. ^ Allison JJ, Kiefe CI, Weissman NW, Carter J, Centor RM (весна 1999 г.). «Искусство и наука поиска в MEDLINE для ответа на клинические вопросы. Поиск нужного количества статей». Международный журнал оценки технологий в здравоохранении . 15 (2): 281– 96. doi : 10.1017/S0266462399015214. PMID  10507188. S2CID  11023273. Архивировано из оригинала 19 февраля 2022 г. Получено 13 декабря 2019 г.
  19. ^ ab Кампос-Асенсио C (2018). «Как разработать библиографическую стратегию». Enfermería Intensiva (на испанском языке). 29 (4): 182–186 . doi :10.1016/j.enfi.2018.09.001. PMID  30291015. S2CID  188132546.
  20. ^ Объяснение терминов фильтра клинических запросов. NCBI. 2010. Архивировано из оригинала 29 ноября 2022 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  21. ^ Huser V, Cimino JJ (июнь 2013 г.). «Оценка соблюдения политики Международного комитета редакторов медицинских журналов по обязательной своевременной регистрации клинических испытаний». Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 20 (e1): e169-74. doi :10.1136/amiajnl-2012-001501. PMC 3715364. PMID  23396544 . 
  22. ^ "Computation of Related Articles explained". NCBI. Архивировано из оригинала 18 декабря 2008 года . Получено 8 сентября 2017 года .
  23. ^ Chang AA, Heskett KM, Davidson TM (февраль 2006 г.). «Поиск литературы с использованием медицинских предметных заголовков по сравнению с текстовыми словами с помощью PubMed» (PDF) . The Laryngoscope . 116 (2): 336– 40. doi : 10.1097/01.mlg.0000195371.72887.a2 . PMID  16467730. S2CID  42510351. Получено 11 сентября 2018 г.
  24. ^ ab Fatehi F, Gray LC, Wootton R (март 2014 г.). «Как улучшить поиск PubMed/MEDLINE: 3. расширенный поиск, MeSH и My NCBI». Журнал телемедицины и телеухода . 20 (2): 102– 12. doi : 10.1177/1357633X13519036. PMID  24614997. S2CID  9948223.
  25. ^ "My NCBI Help". My NCBI explained. NCBI. 13 декабря 2010 г. Архивировано из оригинала 26 июля 2023 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  26. ^ "PubMed Cubby". Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2000. Архивировано из оригинала 20 февраля 2023 года . Получено 7 апреля 2016 года .
  27. ^ "Обзор LinkOut". NCBI. 2010. Архивировано из оригинала 10 сентября 2023 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  28. ^ "LinkOut Participants 2011". NCBI. 2011. Архивировано из оригинала 14 октября 2017 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  29. ^ "An Updated PubMed is on its Way". Архивировано из оригинала 16 мая 2023 года . Получено 1 апреля 2019 года .
  30. ^ PubMed Commons Team (17 декабря 2015 г.). «Комментарии к PubMed: успешный пилотный проект». Архивировано из оригинала 25 октября 2017 г. Получено 29 июля 2016 г.
  31. ^ "PubMed Commons будет прекращен". NCBI Insights . 1 февраля 2018 г. Архивировано из оригинала 28 августа 2023 г. Получено 2 февраля 2018 г.
  32. ^ "PubMed закрывает функцию комментариев, PubMed Commons". Retraction Watch . 2 февраля 2018 г. Архивировано из оригинала 28 июня 2022 г. Получено 2 февраля 2018 г.
  33. ^ "askMedline". NCBI. 2005. Архивировано из оригинала 17 июля 2013 года . Получено 3 апреля 2011 года .
  34. ^ "Описания и теги полей поиска". Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано из оригинала 11 июля 2013 г. Получено 15 июля 2013 г.
  35. ^ Кинер М. «PMID против PMCID: в чем разница?» (PDF) . Чикагский университет. Архивировано из оригинала (PDF) 6 июля 2014 г. . Получено 19 января 2014 г. .
  36. ^ "Аренда цитирований журналов из PubMed/Medline". NLM. 2011. Архивировано из оригинала 9 июля 2023 г. Получено 7 апреля 2016 г.
  37. ^ abc Lu Z (2011). "PubMed и дальше: обзор веб-инструментов для поиска биомедицинской литературы". База данных . 2011 : baq036. doi :10.1093/database/baq036. PMC 3025693. PMID  21245076 . 
  38. ^ Fontaine JF, Barbosa-Silva A, Schaefer M, Huska MR, Muro EM, Andrade-Navarro MA (июль 2009 г.). "MedlineRanker: гибкий рейтинг биомедицинской литературы". Nucleic Acids Research . 37 (выпуск веб-сервера): W141-6. doi :10.1093/nar/gkp353. PMC 2703945. PMID  19429696 . 
  39. ^ States DJ, Ade AS, Wright ZC, Bookvich AV, Athey BD (апрель 2009 г.). «MiSearch — адаптивный инструмент поиска pubMed». Биоинформатика . 25 (7): 974– 6. doi :10.1093/bioinformatics/btn033. PMC 2660869. PMID  18326507 . 
  40. ^ Smalheiser NR, Zhou W, Torvik VI (февраль 2008 г.). «Anne O'Tate: инструмент для поддержки управляемого пользователем резюмирования, детализации и просмотра результатов поиска PubMed». Journal of Biomedical Discovery and Collaboration . 3 : 2. doi : 10.1186/1747-5333-3-2 . PMC 2276193. PMID  18279519 . 
  41. ^ "ClusterMed". Vivisimo Clustering Engine. 2011. Архивировано из оригинала 11 августа 2011 года . Получено 3 июля 2011 года .
  42. ^ Rebholz-Schuhmann D, Kirsch H, Arregui M, Gaudan S, Riethoven M, Stoehr P (январь 2007 г.). "EBIMed — обработка текста для сбора фактов о белках из Medline". Биоинформатика . 23 (2): e237-44. doi : 10.1093/bioinformatics/btl302 . PMID  17237098.
  43. ^ Ким Дж. Дж., Пезик П., Ребхольц-Шухманн Д. (июнь 2008 г.). «MedEvi: извлечение текстовых доказательств связей между биомедицинскими концепциями из Medline». Биоинформатика . 24 (11): 1410– 2. doi :10.1093/bioinformatics/btn117. PMC 2387223. PMID  18400773 . 
  44. ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M, Schardt CM, Keitz SA (2006). "askMEDLINE: отчет о годовом опыте". AMIA ... Ежегодные труды симпозиума. Симпозиум AMIA . 2006 : 923. PMC 1839379. PMID  17238542 . 
  45. ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M (2005). "MeSH Speller + askMEDLINE: автоматически заполняет термины MeSH, а затем ищет в MEDLINE/PubMed с помощью свободных текстовых запросов на естественном языке". AMIA ... Ежегодные труды симпозиума. Симпозиум AMIA . 2005 : 957. PMC 1513542. PMID  16779244 . 
  46. ^ Fontelo P, Liu F, Leon S, Anne A, Ackerman M (2007). «PICO Linguist и BabelMeSH: разработка и частичная оценка основанных на фактических данных многоязыковых инструментов поиска для MEDLINE/PubMed». Исследования в области медицинских технологий и информатики . 129 (Pt 1): 817–21 . PMID  17911830. Архивировано из оригинала 18 октября 2023 г. Получено 31 мая 2014 г.
  47. ^ Hokamp K, Wolfe KH (июль 2004 г.). «PubCrawler: как поддерживать связь с PubMed и GenBank». Nucleic Acids Research . 32 (выпуск веб-сервера): W16-9. doi : 10.1093/nar/gkh453. PMC 441591. PMID  15215341. 
  48. ^ Эрик Сэйерс, доктор философии (24 октября 2018 г.). E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More. NCBI. Архивировано из оригинала 23 июня 2023 г. Получено 8 сентября 2017 г.
  49. ^ Bramley R, Howe S, Marmanis H (4 ноября 2023 г.). «Заметки о качестве данных библиографических записей из базы данных MEDLINE». База данных . 2023 . doi :10.1093/database/baad070. ISSN  1758-0463. PMC 10630407 . PMID  37935584. 
  50. ^ Singhal K, Azizi S, Tu T, Mahdavi SS, Wei J, Chung HW и др. (3 августа 2023 г.). «Большие языковые модели кодируют клинические знания». Nature . 620 (7972): 172– 180. arXiv : 2212.13138 . Bibcode :2023Natur.620..172S. doi :10.1038/s41586-023-06291-2. PMC 10396962 . PMID  37438534. 
  51. ^ MEDOC на GitHub
  52. ^ Дениз Вулф (7 апреля 2020 г.). «SUNY Negotiates New, Modified Agreement with Elsevier – Libraries News Center University at Buffalo Libraries». library.buffalo.edu . University at Buffalo . Архивировано из оригинала 6 декабря 2020 г. . Получено 18 апреля 2020 г. .
Wikidata имеет свойство:
  • Идентификатор публикации PubMed (P698) (см. использование )
  • Официальный сайт
  • Теги поиска PubMed и квалификаторы полей

[[Категория:Национальная медицинская библиотека США|PubMed]

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PubMed&oldid=1267432997"