PSMD6
Фермент, обнаруженный у людей
PSMD6
Идентификаторы
ПсевдонимыPSMD6 , Rpn7, S10, SGA-113M, p42A, p44S10, субъединица протеасомы 26S, не-АТФаза 6
Внешние идентификаторыОМИМ : 617857; МГИ : 1913663; Гомологен : 7157; Генные карты : PSMD6; ОМА :PSMD6 - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

9861

66413

Ансамбль

н/д

ENSMUSG00000021737

UniProt

Q15008

Q99JI4

РефСек (мРНК)

NM_001271779
NM_001271780
NM_001271781
NM_014814

NM_025550

RefSeq (белок)

NP_001258708
NP_001258709
NP_001258710
NP_055629

NP_079826

Местоположение (UCSC)н/дХр 14: 8.35 – 8.36 Мб
Поиск в PubMed[2][3]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Регуляторная субъединица 6 не-АТФазы протеасомы 26S представляет собой фермент , который у человека кодируется геном PSMD6 . [ 4] [5]

Клиническое значение

Протеасома и ее субъединицы имеют клиническое значение по крайней мере по двум причинам: (1) нарушенная сложная сборка или дисфункциональная протеасома могут быть связаны с базовой патофизиологией определенных заболеваний, и (2) их можно использовать в качестве лекарственных мишеней для терапевтических вмешательств. В последнее время все больше усилий было приложено для рассмотрения протеасомы с целью разработки новых диагностических маркеров и стратегий. Улучшенное и всестороннее понимание патофизиологии протеасомы должно привести к ее клиническому применению в будущем.

Протеасомы образуют основной компонент для системы убиквитин-протеасома (UPS) [6] и соответствующего контроля качества клеточного белка (PQC). Убиквитинирование белка и последующий протеолиз и деградация протеасомой являются важными механизмами в регуляции клеточного цикла , роста и дифференциации клеток , транскрипции генов, передачи сигнала и апоптоза . [7] Впоследствии, нарушенная сборка и функционирование комплекса протеасомы приводят к снижению протеолитической активности и накоплению поврежденных или неправильно свернутых видов белка. Такое накопление белка может способствовать патогенезу и фенотипическим характеристикам при нейродегенеративных заболеваниях, [8] [9] сердечно-сосудистых заболеваниях, [10] [11] [12] воспалительных реакциях и аутоиммунных заболеваниях, [13] и системных реакциях на повреждение ДНК, приводящих к злокачественным новообразованиям . [14]

Несколько экспериментальных и клинических исследований показали, что аберрации и нарушения регуляции UPS способствуют патогенезу нескольких нейродегенеративных и миодегенеративных заболеваний, включая болезнь Альцгеймера [15] , болезнь Паркинсона [16] и болезнь Пика [17] , боковой амиотрофический склероз ( БАС ), [17] болезнь Хантингтона [16] , болезнь Крейтцфельдта-Якоба [18] и заболевания двигательных нейронов , полиглутаминовые (PolyQ) заболевания, мышечные дистрофии [19] и несколько редких форм нейродегенеративных заболеваний, связанных с деменцией [20] . Как часть убиквитин-протеасомной системы (UPS) , протеасома поддерживает гомеостаз сердечного белка и, таким образом, играет важную роль в ишемическом повреждении сердца [21] гипертрофии желудочков [22] и сердечной недостаточности . [23] Кроме того, накапливаются доказательства того, что UPS играет существенную роль в злокачественной трансформации. Протеолиз UPS играет важную роль в ответах раковых клеток на стимулирующие сигналы, которые имеют решающее значение для развития рака. Соответственно, экспрессия генов путем деградации факторов транскрипции , таких как p53 , c-jun , c-Fos , NF-κB , c-Myc , HIF-1α, MATα2, STAT3 , стерол-регулируемые элементы-связывающие белки и андрогеновые рецепторы , все контролируются UPS и, таким образом, участвуют в развитии различных злокачественных новообразований. [24] Более того, UPS регулирует деградацию продуктов генов-супрессоров опухолей, таких как аденоматозный полипоз толстой кишки ( APC ) при колоректальном раке, ретинобластома (Rb). и супрессор опухолей фон Гиппеля–Линдау (VHL), а также ряд протоонкогенов ( Raf , Myc , Myb , Rel , Src , Mos , ABL ). UPS также участвует в регуляции воспалительных реакций. Эта активность обычно приписывается роли протеасом в активации NF-κB, который далее регулирует экспрессию провоспалительных цитокинов, таких как TNF-α , IL-β, IL-8 ,молекулы адгезии ( ICAM-1 , VCAM-1 , P-селектин ), простагландины и оксид азота (NO). [13] Кроме того, UPS также играет роль в воспалительных реакциях в качестве регуляторов пролиферации лейкоцитов, в основном посредством протеолиза циклинов и деградации ингибиторов CDK . [25] Наконец, у пациентов с аутоиммунными заболеваниями, такими как СКВ , синдром Шегрена и ревматоидный артрит (РА), в основном обнаруживаются циркулирующие протеасомы, которые можно использовать в качестве клинических биомаркеров. [26]

Во время обработки антигена для главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса I протеасома является основным механизмом деградации, который разрушает антиген и представляет полученные пептиды цитотоксическим Т-лимфоцитам. [27] [28] Считается, что иммунопротеасома играет решающую роль в улучшении качества и количества генерируемых лигандов класса I.

Взаимодействия

Было показано, что PSMD6 взаимодействует с PSMD13 . [29]

Ссылки

  1. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021737 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Ren S, Smith MJ, Louro ID, McKie-Bell P, Bani MR, Wagner M, Zochodne B, Redden DT, Grizzle WE, Wang Nd, Smith DI, Herbst RA, Bardenheuer W, Opalka B, Schütte J, Trent JM, Ben-David Y, Ruppert JM (март 2000 г.). «Локус p44S10, кодирующий субъединицу регуляторной частицы протеасомы, усиливается во время прогрессирования кожной злокачественной меланомы». Oncogene . 19 (11): 1419– 27. doi : 10.1038/sj.onc.1203462 . PMID  10723133.
  5. ^ "Ген Энтреза: субъединица 26S протеасомы PSMD6 (просома, макропаин), не-АТФаза, 6".
  6. ^ Kleiger G, Mayor T (июнь 2014 г.). «Опасное путешествие: экскурсия по системе убиквитин-протеасома». Trends in Cell Biology . 24 (6): 352– 9. doi : 10.1016 /j.tcb.2013.12.003. PMC 4037451. PMID  24457024. 
  7. ^ Goldberg AL, Stein R, Adams J (август 1995 г.). «Новые взгляды на функцию протеасомы: от архебактерий до разработки лекарств». Химия и биология . 2 (8): 503– 8. doi : 10.1016/1074-5521(95)90182-5 . PMID  9383453.
  8. ^ Sulistio YA, Heese K (январь 2015). «Система убиквитин-протеасома и нарушение регуляции молекулярных шаперонов при болезни Альцгеймера». Молекулярная нейробиология . 53 (2): 905– 31. doi :10.1007/s12035-014-9063-4. PMID  25561438. S2CID  14103185.
  9. ^ Ортега З., Лукас Дж. Дж. (2014 ) . «Участие системы убиквитин-протеасома в болезни Хантингтона». Frontiers in Molecular Neuroscience . 7 : 77. doi : 10.3389/fnmol.2014.00077 . PMC 4179678. PMID  25324717. 
  10. ^ Sandri M, Robbins J (июнь 2014 г.). «Протеотоксичность: недооцененная патология при сердечных заболеваниях». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии . 71 : 3– 10. doi : 10.1016/j.yjmcc.2013.12.015. PMC 4011959. PMID  24380730. 
  11. ^ Drews O, Taegtmeyer H (декабрь 2014 г.). «Воздействие на систему убиквитин-протеасомы при заболеваниях сердца: основа новых терапевтических стратегий». Антиоксиданты и окислительно-восстановительная сигнализация . 21 (17): 2322– 43. doi :10.1089/ars.2013.5823. PMC 4241867. PMID  25133688 . 
  12. ^ Wang ZV, Hill JA (февраль 2015). «Контроль качества белка и метаболизм: двунаправленный контроль в сердце». Cell Metabolism . 21 (2): 215–26 . doi :10.1016/j.cmet.2015.01.016. PMC 4317573. PMID 25651176  . 
  13. ^ ab Karin M, Delhase M (февраль 2000 г.). «Киназа I каппа B (IKK) и NF-каппа B: ключевые элементы провоспалительной сигнализации». Семинары по иммунологии . 12 (1): 85–98 . doi :10.1006/smim.2000.0210. PMID  10723801.
  14. ^ Ермолаева МА, Даховник А, Шумахер Б (январь 2015). «Механизмы контроля качества в клеточных и системных реакциях на повреждение ДНК». Ageing Research Reviews . 23 (Pt A): 3– 11. doi :10.1016/j.arr.2014.12.009. PMC 4886828. PMID  25560147 . 
  15. ^ Чеклер Ф, да Коста Калифорния, Анколио К, Шевалье Н, Лопес-Перес Э, Марамбо П (июль 2000 г.). «Роль протеасомы в болезни Альцгеймера». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1502 (1): 133–8 . doi : 10.1016/s0925-4439(00)00039-9 . ПМИД  10899438.
  16. ^ ab Chung KK, Dawson VL, Dawson TM (ноябрь 2001 г.). «Роль убиквитин-протеасомного пути при болезни Паркинсона и других нейродегенеративных расстройствах». Trends in Neurosciences . 24 (11 Suppl): S7–14. doi :10.1016/s0166-2236(00)01998-6. PMID  11881748. S2CID  2211658.
  17. ^ ab Ikeda K, Akiyama H, Arai T, Ueno H, Tsuchiya K, Kosaka K (июль 2002 г.). «Морфометрическая переоценка системы двигательных нейронов болезни Пика и бокового амиотрофического склероза с деменцией». Acta Neuropathologica . 104 (1): 21– 8. doi :10.1007/s00401-001-0513-5. PMID  12070660. S2CID  22396490.
  18. ^ Манака Х, Като Т, Курита К, Катагири Т, Шикама Ю, Куджирай К, Каванами Т, Сузуки Ю, Нихей К, Сасаки Х (май 1992 г.). «Заметное увеличение убиквитина спинномозговой жидкости при болезни Крейтцфельдта-Якоба». Письма по неврологии . 139 (1): 47–9 . doi :10.1016/0304-3940(92)90854-z. PMID  1328965. S2CID  28190967.
  19. ^ Mathews KD, Moore SA (январь 2003 г.). «Поясно-конечностная мышечная дистрофия». Current Neurology and Neuroscience Reports . 3 (1): 78– 85. doi :10.1007/s11910-003-0042-9. PMID  12507416. S2CID  5780576.
  20. ^ Mayer RJ (март 2003 г.). «От нейродегенерации к нейрогомеостазу: роль убиквитина». Drug News & Perspectives . 16 (2): 103– 8. doi :10.1358/dnp.2003.16.2.829327. PMID  12792671.
  21. ^ Calise J, Powell SR (февраль 2013 г.). «Система протеасомы убиквитина и ишемия миокарда». Американский журнал физиологии. Физиология сердца и кровообращения . 304 (3): H337–49. doi :10.1152/ajpheart.00604.2012. PMC 3774499. PMID  23220331 . 
  22. ^ Predmore JM, Wang P, Davis F, Bartolone S, Westfall MV, Dyke DB, Pagani F, Powell SR, Day SM (март 2010 г.). «Дисфункция убиквитин-протеасомы при гипертрофических и дилатационных кардиомиопатиях у человека». Circulation . 121 (8): 997– 1004. doi :10.1161/CIRCULATIONAHA.109.904557. PMC 2857348 . PMID  20159828. 
  23. ^ Powell SR (июль 2006 г.). «Система убиквитин-протеасома в физиологии и патологии сердца». Американский журнал физиологии. Физиология сердца и кровообращения . 291 (1): H1 – H19 . doi :10.1152/ajpheart.00062.2006. PMID  16501026. S2CID  7073263.
  24. ^ Адамс Дж (апрель 2003 г.). «Потенциал ингибирования протеасом при лечении рака». Drug Discovery Today . 8 (7): 307– 15. doi :10.1016/s1359-6446(03)02647-3. PMID  12654543.
  25. ^ Ben-Neriah Y (январь 2002). «Регуляторные функции убиквитинирования в иммунной системе». Nature Immunology . 3 (1): 20– 6. doi :10.1038/ni0102-20. PMID  11753406. S2CID  26973319.
  26. ^ Egerer K, Kuckelkorn U, Rudolph PE, Rückert JC, Dörner T, Burmester GR, Kloetzel PM, Feist E (октябрь 2002 г.). «Циркулирующие протеасомы являются маркерами повреждения клеток и иммунологической активности при аутоиммунных заболеваниях». Журнал ревматологии . 29 (10): 2045–52 . PMID  12375310.
  27. ^ Basler M, Lauer C, Beck U, Groettrup M (ноябрь 2009 г.). «Ингибитор протеасом бортезомиб повышает восприимчивость к вирусной инфекции». Журнал иммунологии . 183 (10): 6145–50 . doi : 10.4049/jimmunol.0901596 . PMID  19841190.
  28. ^ Rock KL, Gramm C, Rothstein L, Clark K, Stein R, Dick L, Hwang D, Goldberg AL (сентябрь 1994 г.). «Ингибиторы протеасомы блокируют деградацию большинства клеточных белков и генерацию пептидов, представленных на молекулах MHC класса I». Cell . 78 (5): 761– 71. doi :10.1016/s0092-8674(94)90462-6. PMID  8087844. S2CID  22262916.
  29. ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID  17353931 . 

Дальнейшее чтение

  • Гофф СП (2003). «Смерть от дезаминирования: новая система ограничения хозяина для ВИЧ-1». Cell . 114 (3): 281– 3. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00602-0 . PMID  12914693. S2CID  16340355.
  • Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А., Сазука Т., Секи Н., Сато С., Табата С., Исикава К., Каварабаяси Ю., Котани Х. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Рез . 2 (1): 37–43 . doi : 10.1093/dnares/2.1.37 . ПМИД  7788527.
  • Сигер М., Феррелл К., Фрэнк Р., Дубиель В. (1997). «ВИЧ-1 tat ингибирует протеасому 20 S и ее активацию, опосредованную регулятором 11 S». J. Biol. Chem . 272 ​​(13): 8145– 8. doi : 10.1074/jbc.272.13.8145 . PMID  9079628.
  • Мадани Н., Кабат Д. (1998). «Эндогенный ингибитор вируса иммунодефицита человека в лимфоцитах человека преодолевается вирусным белком Vif». Дж. Вирол . 72 (12): 10251–5 . doi :10.1128/JVI.72.12.10251-10255.1998. ПМК  110608 . ПМИД  9811770.
  • Simon JH, Gaddis NC, Fouchier RA, Malim MH (1998). «Доказательства недавно обнаруженного клеточного фенотипа анти-ВИЧ-1». Nat. Med . 4 (12): 1397– 400. doi :10.1038/3987. PMID  9846577. S2CID  25235070.
  • Mulder LC, Muesing MA (2000). «Деградация интегразы ВИЧ-1 по пути правила N-конца». J. Biol. Chem . 275 (38): 29749– 53. doi : 10.1074/jbc.M004670200 . PMID  10893419.
  • Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (2002). «Выделение человеческого гена, который ингибирует инфекцию ВИЧ-1 и подавляется вирусным белком Vif». Nature . 418 (6898): 646– 50. Bibcode :2002Natur.418..646S. doi :10.1038/nature00939. PMID  12167863. S2CID  4403228.
  • Huang X, Seifert U, Salzmann U, Henklein P, Preissner R, Henke W, Sijts AJ, Kloetzel PM, Dubiel W (2002). "Сайт RTP, общий для белка Tat ВИЧ-1 и регуляторной субъединицы 11S альфа, имеет решающее значение для их влияния на функцию протеасомы, включая обработку антигенов". J. Mol. Biol . 323 (4): 771– 82. doi :10.1016/S0022-2836(02)00998-1. PMID  12419264.
  • Gaddis NC, Chertova E, Sheehy AM, Henderson LE, Malim MH (2003). «Комплексное исследование молекулярного дефекта в вирионах вируса иммунодефицита человека типа 1 с дефицитом vif». J. Virol . 77 (10): 5810– 20. doi : 10.1128 /JVI.77.10.5810-5820.2003. PMC  154025. PMID  12719574.
  • Lecossier D, Bouchonnet F, Clavel F, Hance AJ (2003). "Гипермутация ДНК ВИЧ-1 в отсутствие белка Vif". Science . 300 (5622): 1112. doi :10.1126/science.1083338. PMID  12750511. S2CID  20591673.
  • Zhang H, Yang B, Pomerantz RJ, Zhang C, Arunachalam SC, Gao L (2003). «Цитидиндезаминаза CEM15 индуцирует гипермутацию в недавно синтезированной ДНК ВИЧ-1». Nature . 424 (6944): 94– 8. Bibcode :2003Natur.424...94Z. doi :10.1038/nature01707. PMC  1350966 . PMID  12808465.
  • Mangeat B, Turelli P, Caron G, Friedli M, Perrin L, Trono D (2003). «Широкая антиретровирусная защита с помощью человеческого APOBEC3G посредством летального редактирования зарождающихся обратных транскриптов». Nature . 424 (6944): 99– 103. Bibcode :2003Natur.424...99M. doi :10.1038/nature01709. PMID  12808466. S2CID  4347374.
  • Harris RS, Bishop KN, Sheehy AM, Craig HM, Petersen-Mahrt SK, Watt IN, Neuberger MS, Malim MH (2003). «Дезаминирование ДНК опосредует врожденный иммунитет к ретровирусной инфекции». Cell . 113 (6): 803– 9. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00423-9 . PMID  12809610. S2CID  544971.
  • Harris RS, Sheehy AM, Craig HM, Malim MH, Neuberger MS (2003). «Дезаминирование ДНК: не только триггер для диверсификации антител, но и механизм защиты от ретровирусов». Nat. Immunol . 4 (7): 641– 3. doi :10.1038/ni0703-641. PMID  12830140. S2CID  5549252.
  • Gu Y, Sundquist WI (2003). «Good to CU». Nature . 424 (6944): 21– 2. Bibcode : 2003Natur.424...21G. doi : 10.1038/424021a . PMID  12840737. S2CID  4430569.
  • Mariani R, Chen D, Schröfelbauer B, Navarro F, König R, Bollman B, Münk C, Nymark-McMahon H, Landau NR (2003). "Видовое исключение APOBEC3G из вирионов ВИЧ-1 с помощью Vif". Cell . 114 (1): 21– 31. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00515-4 . PMID  12859895. S2CID  1789911.
  • KewalRamani VN, Coffin JM (2003). «Вирусология. Оружие мутационного разрушения». Science . 301 (5635): 923– 5. doi :10.1126/science.1088965. PMID  12920286. S2CID  82480782.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PSMD6&oldid=1116086141"