PRPF19

PRPF19
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4LG8
Идентификаторы
Псевдонимы	PRPF19 , NMP200, PRP19, PSO4, SNEV, UBOX4, hPSO4, фактор процессинга пре-мРНК 19
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608330; МГИ : 106247; гомологен : 6421; Генные карты : PRPF19; OMA :PRPF19 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 11 (человек)
Конец	60,906,585 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 19 (мышь)
Конец	10,886,923 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Понс; ; правая лобная доля; ; Район Бродмана 9; ; желудочковая зона; ; ганглионарное возвышение; ; префронтальная кора; ; полушарие мозжечка; ; правое полушарие мозжечка; ; передняя доля гипофиза; ; островок Лангерганса;
	Верх выражен в
	аортальный клапан; ; примитивная черта; ; двигательный нейрон; ; восходящая аорта; ; ямка; ; правый желудочек; ; эпибласт; ; Ячейка Панета; ; двигательное ядро лица; ; лодыжка;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность убиквитин-протеинлигазы; активность убиквитин-протеинтрансферазы; активность убиквитин-убиквитинлигазы; связывание белков; идентичное связывание белков; трансферазная активность;
Клеточный компонент	место двухцепочечного разрыва; ядерная пылинка; каталитический шаг 2 сплайсосома; мембрана; липидная капля; шпиндель; комплекс Prp19; Комплекс фактора репликации ДНК А; сплайсосомный комплекс; цитоскелет; ядро; цитоплазма; нуклеоплазма; Каталитическая стадия 1 сплайсосомы типа U2; Сплайсосома каталитического шага 2 типа U2;
Биологический процесс	сплайсинг мРНК через сплайсосому; сборка сплайсосомного комплекса три-snRNP; процесс биосинтеза липидов; негативная регуляция дифференцировки нейронов; позитивная регуляция дифференцировки астроцитов; позитивная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосому; убиквитинирование, связанное с белком K63; процессинг мРНК; полиубиквитинирование белков; внутренняя клеточная масса пролиферация клеток; клеточный ответ на повреждение ДНК; сборка сплайсосомного комплекса; убиквитинирование белка; процесс катаболизма протеасомного белка; нуклеотидная эксцизионная репарация, связанная с транскрипцией; Репарация двухцепочечных разрывов путем негомологичного соединения концов; восстановление ДНК; Сплайсинг РНК; генерация каталитической сплайсосомы для первого этапа переэтерификации; позитивная регуляция дифференциации нейронов;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	27339
	28000
	ENSG00000110107
	ENSMUSG00000024735
	Q9UMS4
	Q99KP6
	NM_014502
	НМ_001253843 ; НМ_001253844 ; НМ_134129
	NP_055317
	НП_001240772 ; НП_001240773 ; НП_598890
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор пре-мРНК-процессинга 19 — это белок , который у людей кодируется геном PRPF19 . [ ^5]^[6]

В S. cerevisiae Pso4 выполняет плейотропные функции в рекомбинации ДНК и в подверженной ошибкам репарации негомологичных концов ДНК. [Предоставлено OMIM] ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что PRPF19 взаимодействует с CDC5L . ^[7]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000110107 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024735 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Махаджан КН, Митчелл БС (сентябрь 2003 г.). «Роль человеческого Pso4 в репарации ДНК млекопитающих и связь с терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазой». Proc Natl Acad Sci USA . 100 (19): 10746– 51. Bibcode : 2003PNAS..10010746M. doi : 10.1073/pnas.1631060100 . PMC 196874. PMID 12960389 .
^ ab "Ген Entrez: гомолог фактора 19 пре-мРНК-процессинга PRPF19 PRP19/PSO4 (S. cerevisiae)".
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса человеческого CDC5L и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии». EMBO J . 19 (23): 6569– 81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846 . PMID 11101529.

Дальнейшее чтение

Gerner C, Holzmann K, Meissner M и др. (1999). «Повторная сборка белков и шаперонов во фракциях белков ядерного матрикса человека». J. Cell. Biochem . 74 (2): 145– 51. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(19990801)74:2<145::AID-JCB1>3.0.CO;2-#. PMID 10404385. S2CID 196598497.
Gotzmann J, Gerner C, Meissner M и др. (2000). "hNMP 200: новый человеческий общий ядерный матричный белок, объединяющий структурные и регуляторные функции". Exp. Cell Res . 261 (1): 166– 79. doi :10.1006/excr.2000.5025. PMID 11082287.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode : 2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа». РНК . 8 (4): 426– 39. doi :10.1017/S1355838202021088. PMC 1370266 . PMID 11991638.
Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2003). "Функциональный протеомный анализ ядрышка человека". Mol. Biol. Cell . 13 ( 11): 4100– 9. doi :10.1091/mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Макарова ОВ, Макаров ЕМ, Урлауб Х и др. (2004). «Подмножество белков 35S U5 человека, включая Prp19, функционирует до каталитического этапа 1 сплайсинга». EMBO J . 23 (12): 2381– 91. doi :10.1038/sj.emboj.7600241. PMC 423283 . PMID 15175653.
Jin J, Smith FD, Stark C и др. (2004). «Протеомный, функциональный и основанный на доменах анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Biol . 14 (16): 1436– 50. Bibcode : 2004CBio...14.1436J. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Löscher M, Fortschegger K, Ritter G и др. (2005). «Взаимодействие U-box E3 лигазы SNEV с PSMB4, субъединицей бета7 протеасомы 20 S». Biochem. J . 388 (Pt 2): 593– 603. doi :10.1042/BJ20041517. PMC 1138967 . PMID 15660529.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Zhang N, Kaur R, Lu X и др. (2006). «Комплекс сплайсинга и восстановления ДНК мРНК Pso4 взаимодействует с WRN для обработки межцепочечных сшивок ДНК». J. Biol. Chem . 280 (49): 40559– 67. doi : 10.1074/jbc.M508453200 . PMID 16223718.
Grillari J, Ajuh P, Stadler G, et al. (2005). "SNEV — это эволюционно консервативный фактор сплайсинга, олигомеризация которого необходима для сборки сплайсосомы". Nucleic Acids Res . 33 (21): 6868– 83. doi :10.1093/nar/gki986. PMC 1310963. PMID 16332694 .
Voglauer R, Chang MW, Dampier B и др. (2006). «Сверхэкспрессия SNEV продлевает продолжительность жизни эндотелиальных клеток человека». Exp. Cell Res . 312 (6): 746–59 . doi :10.1016/j.yexcr.2005.11.025. PMID 16388800.
Lu X, Legerski RJ (2007). «Комплекс ядра Prp19/Pso4 подвергается убиквитинированию и структурным изменениям в ответ на повреждение ДНК». Biochem. Biophys. Res. Commun . 354 (4): 968– 74. doi :10.1016/j.bbrc.2007.01.097. PMC 1810354 . PMID 17276391.
Fortschegger K, Wagner B, Voglauer R, et al. (2007). "Ранняя эмбриональная летальность мышей, лишенных необходимого белка SNEV". Mol. Cell. Biol . 27 (8): 3123– 30. doi :10.1128/MCB.01188-06. PMC 1899945. PMID 17283042 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . PMID 17353931.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 11 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000110107 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024735 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12960389-5] Махаджан КН, Митчелл БС (сентябрь 2003 г.). «Роль человеческого Pso4 в репарации ДНК млекопитающих и связь с терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазой». Proc Natl Acad Sci USA . 100 (19): 10746– 51. Bibcode : 2003PNAS..10010746M. doi : 10.1073/pnas.1631060100 . PMC 196874. PMID 12960389 .

[entrez-6] "Ген Entrez: гомолог фактора 19 пре-мРНК-процессинга PRPF19 PRP19/PSO4 (S. cerevisiae)".

[pmid11101529-7] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса человеческого CDC5L и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии». EMBO J . 19 (23): 6569– 81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846 . PMID 11101529.