PIF1 5'-3' ДНК-хеликаза

ПИФ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	5ФХХ
Идентификаторы
Псевдонимы	PIF1 , C15orf20, PIF, PIF1 5'-3' ДНК-хеликаза
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 610953; МГИ : 2143057; гомологен : 99775; GeneCards : PIF1; OMA :PIF1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 15 (человек)
Конец	64,825,668 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	65 595 967 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	желудочковая зона; ; гонада; ; ганглионарное возвышение; ; стромальная клетка эндометрия; ; слизистая оболочка поперечно-ободочной кишки; ; приложение; ; гранулоцит; ; клетки костного мозга; ; селезенка; ; лимфатический узел;
	Верх выражен в
	слуховой пузырек; ; рука; ; Ячейка Панета; ; желудочковая зона; ; примитивная черта; ; хвост эмбриона; ; генитальный бугорок; ; эндотелиальная клетка лимфатического сосуда; ; волосяной фолликул; ; тимус;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание нуклеотидов; связывание ДНК; связывание теломерной ДНК; активность хеликазы; ДНК-хеликазная активность; активность одноцепочечной ДНК-хеликазы; 5'-3' ДНК/РНК геликазная активность; гидролазная активность; Связывание АТФ; связывание ионов магния; активность ингибитора теломеразы; 5'-3' ДНК-хеликазная активность; Связывание ДНК с G-квадруплексом;
Клеточный компонент	репликационная вилка; митохондрия; ядро;
Биологический процесс	рекомбинация ДНК; регуляция поддержания теломер; негативная регуляция активности теломеразы; Раскручивание G-квадруплексной ДНК; клеточный ответ на повреждение ДНК; поддержание теломер; восстановление ДНК; раскручивание дуплекса ДНК; поддержание митохондриального генома; репликация ДНК; негативная регуляция поддержания теломер посредством теломеразы;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	80119
	208084
	ENSG00000140451
	ENSMUSG00000041064
	Q9H611
	Q80SX8
	NM_001286496 ; NM_001286497 ; NM_001286499 ; NM_025049
	НМ_172453 ; НМ_001357526 ; НМ_001357527
	НП_001273425 ; НП_001273426 ; НП_001273428 ; НП_079325
	NP_766041 ; NP_001344455 ; NP_001344456
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

PIF1 5'-3' ДНК-хеликаза — это белок , который у людей кодируется геном PIF1 . [ ^5]

Функция

Этот ген кодирует ДНК-зависимый фермент, метаболизирующий аденозинтрифосфат (АТФ) , который функционирует как 5'-3' ДНК-хеликаза . Кодируемый белок может разрешать структуры G-квадруплекса и гибриды РНК-ДНК на концах хромосом. Он также предотвращает удлинение теломер , ингибируя действие теломеразы . Альтернативный сплайсинг и использование альтернативных стартовых кодонов приводит к образованию множественных изоформ , которые по-разному локализуются либо в митохондриях , либо в ядре. [предоставлено RefSeq, ноябрь 2013 г.].

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000140451 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000041064 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Entrez Gene: PIF1 5'-to-3' ДНК-хеликаза" . Получено 2018-05-17 .

Дальнейшее чтение

Zhang DH, Zhou B, Huang Y, Xu LX, Zhou JQ (2006). «Человеческая геликаза Pif1, потенциальный гомолог Escherichia coli RecD, ингибирует активность теломеразы». Nucleic Acids Res . 34 (5): 1393– 404. doi :10.1093/nar/gkl029. PMC 1390689. PMID 16522649 .
Mateyak MK, Zakian VA (декабрь 2006 г.). "Human PIF helicase is cell cycle adjustable and associated with telomerase". Cell Cycle . 5 (23): 2796– 804. doi : 10.4161/cc.5.23.3524 . PMID 17172855.
Futami K, Shimamoto A, Furuichi Y (сентябрь 2007 г.). «Митохондриальная и ядерная локализация человеческой геликазы Pif1». Biol. Pharm. Bull . 30 (9): 1685– 92. doi : 10.1248/bpb.30.1685 . PMID 17827721.
Gu Y, Masuda Y, Kamiya K (ноябрь 2008 г.). «Биохимический анализ человеческой геликазы PIF1 и функции ее N-концевого домена». Nucleic Acids Res . 36 (19): 6295– 308. doi :10.1093/nar/gkn609. PMC 2577353. PMID 18835853 .
George T, Wen Q, Griffiths R, Ganesh A, Meuth M, Sanders CM (октябрь 2009 г.). «Human Pif1 helicase unwinds synthetic DNA structures similar to stilled DNA replication forks». Nucleic Acids Res . 37 (19): 6491– 502. doi :10.1093/nar/gkp671. PMC 2770657. PMID 19700773 .
Sanders CM (август 2010 г.). «Human Pif1 helicase is a G-quadruplex DNA-binding protein with G-quadruplex DNA-unwinding activity». Biochem. J . 430 (1): 119– 28. doi :10.1042/BJ20100612. PMID 20524933.
Gagou ME, Ganesh A, Thompson R, Phear G, Sanders C, Meuth M (июль 2011 г.). «Подавление апоптоза геликазой PIF1 в опухолевых клетках человека». Cancer Res . 71 (14): 4998– 5008. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-10-4404 . PMID 21616935.
Chisholm KM, Aubert SD, Freese KP, Zakian VA, King MC, Welcsh PL (2012). "Полногеномный скрининг супрессоров перестроек, опосредованных Alu, выявил роль PIF1". PLOS ONE . 7 (2): e30748. Bibcode :2012PLoSO...730748C. doi : 10.1371/journal.pone.0030748 . PMC 3276492 . PMID 22347400.
Ramanagoudr-Bhojappa R, Chib S, Byrd AK, Aarattuthodiyil S, Pandey M, Patel SS, Raney KD (май 2013 г.). "Дрожжевая геликаза Pif1 демонстрирует механизм шагового расщепления с одной парой оснований для раскручивания дуплексной ДНК". J. Biol. Chem . 288 (22): 16185– 95. doi : 10.1074/jbc.M113.470013 . PMC 3668774. PMID 23596008 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9H611 (АТФ-зависимая ДНК-хеликаза PIF1) на сайте PDBe-KB .

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Эта статья о гене на хромосоме 15 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000140451 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000041064 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] "Entrez Gene: PIF1 5'-to-3' ДНК-хеликаза" . Получено 2018-05-17 .