ПХК2

ПХК2
Идентификаторы
Псевдонимы	PHC2 , EDR2, HPH2, PH2, полигомеотический гомолог 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602979; МГИ : 1860454; гомологен : 75090; Генные карты : PHC2; OMA :PHC2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	33,431,052 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	128,646,674 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верхний выражен в
	правое легкое; ; большеберцовые артерии; ; слизистая оболочка желудка; ; большеберцовый нерв; ; восходящая аорта; ; левая коронарная артерия; ; ганглионарное возвышение; ; верхняя доля левого легкого; ; Нисходящая грудная аорта; ; левая маточная труба;
	Верхний выражен в
	Ростральный миграционный поток; ; наружная сонная артерия; ; внутренняя сонная артерия; ; желудочковая зона; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; генитальный бугорок; ; вторичный ооцит; ; зигота; ; слой серого вещества мозжечка; ; первичный ооцит;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ДНК; связывание белков; идентичное связывание белков; связывание ионов металлов; связывание ионов цинка;
Клеточный компонент	гетерохроматин; комплекс PRC1; Комплекс белка PcG; ядро; нуклеоплазма;
Биологический процесс	сперматогенез; развитие многоклеточного организма;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	1912
	54383
	ENSG00000134686
	ENSMUSG00000028796
	Q8IXK0
	Q9QWH1
	НМ_004427 ; НМ_198040 ; НМ_001330488
	НМ_001195083 ; НМ_001195130 ; НМ_018774
	НП_001317417 ; НП_004418 ; НП_932157
	НП_001182012 ; НП_001182059 ; НП_061244
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Полигомеозисный белок 2 — это белок , который у людей кодируется геном PHC2 . [ ^5]^[6]^[7]

Функция

У Drosophila melanogaster группа генов «Polycomb» (PcG) является частью клеточной системы памяти, которая отвечает за стабильное наследование активности генов. Белки PcG образуют большой мультимерный, хроматин-ассоциированный белковый комплекс. Белок, кодируемый этим геном, имеет гомологию с белком PcG Drosophila «полигомеотическим» (Ph) и, как известно, гетеродимеризуется с EDR1 и колокализуется с BMI1 в интерфазных ядрах человеческих клеток. Конкретная функция в человеческих клетках пока не определена. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что PHC2 взаимодействует с MAPKAPK2 , ^[8] PHC1 , ^[5]^[9] BMI1 ^[5] и MCRS1 . ^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000134686 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028796 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ abc Gunster MJ, Satijn DP, Hamer KM, den Blaauwen JL, de Bruijn D, Alkema MJ, van Lohuizen M, van Driel R, Otte AP (апрель 1997 г.). «Идентификация и характеристика взаимодействий между белком поликомб-группы позвоночных BMI1 и гомологами полигомеотизма человека». Молекулярная и клеточная биология . 17 (4): 2326–35. дои : 10.1128/mcb.17.4.2326. ПМК 232081 . ПМИД 9121482.
^ Tonkin E, Hagan DM, Li W, Strachan T (октябрь 2002 г.). «Идентификация и характеристика новых млекопитающих гомологов полигомеозисного семейства Drosophila позволяет по-новому взглянуть на взаимоотношения между членами полигомеозисного семейства». Генетика человека . 111 (4–5): 435–42. doi :10.1007/s00439-002-0814-3. PMID 12384788. S2CID 22192470.
^ ab "Ген Entrez: полигомеотический гомолог 2 PHC2 (Drosophila)".
^ Yannoni YM, Gaestel M, Lin LL (апрель 2004 г.). «P66(ShcA) взаимодействует с киназой MAPKAP 2 и регулирует ее активность». FEBS Letters . 564 (1–2): 205–11. doi :10.1016/S0014-5793(04)00351-5. PMID 15094067. S2CID 43606580.
^ ab Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кишикава Т., Дрико А., Ли Н, Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж. , Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Дальнейшее чтение

Satijn DP, Gunster MJ, van der Vlag J, Hamer KM, Schul W, Alkema MJ, Saurin AJ, Freemont PS, van Driel R, Otte AP (июль 1997 г.). "RING1 связан с белковым комплексом группы поликомб и действует как транскрипционный репрессор". Молекулярная и клеточная биология . 17 (7): 4105–13. doi :10.1128/mcb.17.7.4105. PMC 232264. PMID 9199346 .
Gunther M, Laithier M, Brison O (июль 2000 г.). «Набор белков, взаимодействующих с фактором транскрипции Sp1, выявленный в двухгибридном скрининге». Молекулярная и клеточная биохимия . 210 (1–2): 131–42. doi :10.1023/A:1007177623283. PMID 10976766. S2CID 1339642.
Levine SS, Weiss A, Erdjument-Bromage H, Shao Z, Tempst P, Kingston RE (сентябрь 2002 г.). «Ядро репрессивного комплекса поликомба по составу и функциям консервативно у мух и людей». Молекулярная и клеточная биология . 22 (17): 6070–8. doi :10.1128/MCB.22.17.6070-6078.2002. PMC 134016. PMID 12167701 .
Yannoni YM, Gaestel M, Lin LL (апрель 2004 г.). «P66(ShcA) взаимодействует с киназой MAPKAP 2 и регулирует ее активность». FEBS Letters . 564 (1–2): 205–11. doi :10.1016/S0014-5793(04)00351-5. PMID 15094067. S2CID 43606580.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (август 2004 г.). "Масштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H, Vidal M, Tempst P, Jones RS, Zhang Y (октябрь 2004 г.). «Роль убиквитинирования гистона H2A в подавлении Polycomb». Nature . 431 (7010): 873–8. Bibcode :2004Natur.431..873W. doi :10.1038/nature02985. PMID 15386022. S2CID 4344378.
Voncken JW, Niessen H, Neufeld B, Rennefahrt U, Dahlmans V, Kubben N, Holzer B, Ludwig S, Rapp UR (февраль 2005 г.). "Киназа MAPKAP 3pK фосфорилирует и регулирует ассоциацию хроматина белка группы поликомб Bmi1". Журнал биологической химии . 280 (7): 5178–87. doi : 10.1074/jbc.M407155200 . PMID 15563468.
Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 1 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000134686 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028796 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9121482-5] Gunster MJ, Satijn DP, Hamer KM, den Blaauwen JL, de Bruijn D, Alkema MJ, van Lohuizen M, van Driel R, Otte AP (апрель 1997 г.). «Идентификация и характеристика взаимодействий между белком поликомб-группы позвоночных BMI1 и гомологами полигомеотизма человека». Молекулярная и клеточная биология . 17 (4): 2326–35. дои : 10.1128/mcb.17.4.2326. ПМК 232081 . ПМИД 9121482.

[pmid12384788-6] Tonkin E, Hagan DM, Li W, Strachan T (октябрь 2002 г.). «Идентификация и характеристика новых млекопитающих гомологов полигомеозисного семейства Drosophila позволяет по-новому взглянуть на взаимоотношения между членами полигомеозисного семейства». Генетика человека . 111 (4–5): 435–42. doi :10.1007/s00439-002-0814-3. PMID 12384788. S2CID 22192470.

[entrez-7] "Ген Entrez: полигомеотический гомолог 2 PHC2 (Drosophila)".

[pmid15094067-8] Yannoni YM, Gaestel M, Lin LL (апрель 2004 г.). «P66(ShcA) взаимодействует с киназой MAPKAP 2 и регулирует ее активность». FEBS Letters . 564 (1–2): 205–11. doi :10.1016/S0014-5793(04)00351-5. PMID 15094067. S2CID 43606580.

[pmid16189514-9] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кишикава Т., Дрико А., Ли Н, Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж. , Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.