ПКМ1
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ПКМ1
Идентификаторы
ПсевдонимыPCM1 , PTC4, RET/PCM-1, перицентриолярный материал 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 600299; МГИ : 1277958; гомологен : 4518; GeneCards : PCM1; OMA :PCM1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

5108

18536

Ансамбль

ENSG00000078674

ENSMUSG00000031592

UniProt

Q15154

Q9R0L6

РефСек (мРНК)

НМ_006197
НМ_001315507
НМ_001315508

NM_023662

RefSeq (белок)
Местоположение (UCSC)н/дХр 8: 41.24 – 41.33 Мб
Поиск в PubMed[2][3]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Перицентриолярный материал 1 , также известный как PCM1 , представляет собой белок , который у людей кодируется геном PCM1 . [ 4] [5] [6]

Функция

Белок PCM1 был первоначально идентифицирован благодаря его отчетливой, зависящей от клеточного цикла ассоциации с комплексом центросомы и микротрубочками . По-видимому, белок ассоциируется с комплексом центросомы во время клеточного цикла. Диссоциация происходит во время митоза, когда PCM1 рассеивается по всей клетке. Проведенные исследования иммуномаркирования показали, что PCM1 присутствует в центриолярных сателлитах и ​​в электронно-плотных гранулах диаметром от 70 до 100 нм. Первоначально считалось, что они разбросаны только вокруг центросом, но дальнейшие исследования доказали, что PCM1 также обнаружен по всей цитоплазме.

Было показано, что PCM1 необходим для деления клеток, поскольку антитела PCM1 вызывают остановку клеточного цикла при микроинъекции в оплодотворенные мышиные яйца. Нацеливание центрина , перицентрина и нинеина также резко снизилось после истощения PCM1 с использованием siRNA, сверхэкспрессии мутантов делеции PCM1 и микроинъекции антител PCM1. [7] В результате этого истощения было обнаружено, что радиальная организация микротрубочек нарушена, но, по-видимому, не повлияла на зарождение микротрубочек.

Структура гена

PCM1 имеет четыре известных транскрипта, самый длинный из которых имеет 39 экзонов. Открытая рамка считывания PCM1 кодирует белок из 2024 аминокислот. Белок содержит спиральные области между областями низкой сложности, а также домен аденозинтрифосфата ( АТФ )/ ГТФазы , домен ядерной локализации и домен эукариотического молибдоптерина. Эукариотический домен связывания молибдоптерина в настоящее время обнаружен только в пяти других человеческих генах: ксантиндегидрогеназе , сульфитоксидазе (митохондриальном предшественнике), альдегидоксидазе , предшественнике рецептора эритропоэтина и кассете связывания АТФ, подсемействе A, члене 2 ( ABCA2 ).

Распределение в тканях

Было обнаружено, что экспрессия мРНК PCM1 в мозге мышей наиболее высока в гиппокампе . [8] У людей она выше среднего уровня экспрессии центральной нервной системы (ЦНС) в большинстве частей мозга. [9]

Клиническое значение

Было показано, что мутации в гене PCM1 вызывают генетическую восприимчивость к шизофрении . Если изменение аминокислоты изолейцина в PCM1 наследуется, риск развития шизофрении составил 68% в двух независимых выборках из южной Англии и Шотландии. Это означает, что теперь можно предложить очень ограниченное генетическое консультирование небольшой части людей с шизофренией, которые также являются носителями этой мутации. [10] [11]

PCM1 образует комплекс в центросоме с нарушенным при шизофрении белком 1 ( DISC1 ) и белком синдрома Барде-Бидля 4 ( BBS4 ), что обеспечивает связь между аберрантным PCM1 и аномальным развитием коры, связанным с патологией шизофрении. [12]

Взаимодействия

Было показано, что PCM1 взаимодействует с PCNT . [13]

Ссылки

  1. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031592 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Ген Энтреза: перицентриолярный материал PCM1 1".
  5. ^ Balczon R, Bao L, Zimmer WE (март 1994). "PCM-1, 228-kD центросомный аутоантиген с отчетливым распределением клеточного цикла". J. Cell Biol . 124 (5): 783–93 . doi :10.1083/jcb.124.5.783. PMC 2119948. PMID  8120099 . 
  6. ^ Hames RS, Crookes RE, Straatman KR, Merdes A, Hayes MJ, Faragher AJ, Fry AM (апрель 2005 г.). «Динамическое привлечение киназы Nek2 в центросому вовлекает микротрубочки, PCM-1 и локализованную протеасомную деградацию». Mol. Biol. Cell . 16 (4): 1711– 24. doi :10.1091/mbc.E04-08-0688. PMC 1073654. PMID 15659651  . 
  7. ^ Даммерманн, А.; Мердес, А. (2002). «Сборка центросомальных белков и организация микротрубочек зависят от PCM-1». Журнал клеточной биологии . 159 (2): 255– 266. doi :10.1083/jcb.200204023. PMC 2173044. PMID  12403812 . 
  8. ^ "Gene Expression Summary for Pcm1; pericentriolar material 1". Институт мозга Аллена . Получено 2009-04-30 .
  9. ^ "PCM1, Probe set 202174_s_at". BioGPS - ваша система Gene Portal . Получено 2009-04-30 .
  10. ^ Datta SR, McQuillin A, Rizig M, Blaveri E, Thirumalai S, Kalsi G, Lawrence J, Bass NJ, Puri V, Choudhury K, Pimm J, Crombie C, Fraser G, Walker N, Curtis D, Zvelebil M, Pereira A, Kandaswamy R, St Clair D, Gurling HM (декабрь 2008 г.). «Миссенс-мутация треонина в изолейцин в гене перицентриолярного материала 1 сильно связана с шизофренией». Mol. Psychiatry . 15 (6): 615–28 . doi : 10.1038/mp.2008.128 . PMID  19048012.
  11. ^ Gurling HM, Critchley H, Datta SR, McQuillin A, Blaveri E, Thirumalai S, Pimm J, Krasucki R, Kalsi G, Quested D, Lawrence J, Bass N, Choudhury K, Puri V, O'Daly O, Curtis D, Blackwood D, Muir W, Malhotra AK, Buchanan RW, Good CD, Frackowiak RS, Dolan RJ (август 2006 г.). «Исследования генетических ассоциаций и морфологии мозга и ген перицентриолярного материала 1 хромосомы 8p22 (PCM1) в восприимчивости к шизофрении». Arch. Gen. Psychiatry . 63 (8): 844– 54. doi :10.1001/archpsyc.63.8.844. PMC 2634866 . PMID  16894060. 
  12. ^ Камия А., Тан П.Л., Кубо К., Энгельхард С., Исидзука К., Кубо А., Цукита С., Пулвер А.Е., Накадзима К., Каселла Н.Г., Кацанис Н., Сава А. (сентябрь 2008 г.). «PCM1 рекрутируется в центросому в результате совместного действия DISC1 и BBS4 и является кандидатом на психиатрическое заболевание». Арх. Общая психиатрия . 65 (9): 996–1006 . doi :10.1001/archpsyc.65.9.996. ПМЦ 2727928 . ПМИД  18762586. 
  13. ^ Li, Q; Hansen D; Killilea A; Joshi HC; Palazzo RE; Balczon R (февраль 2001 г.). «Кендрин/перицентрин-B, белок центросомы с гомологией перицентрину, который образует комплексы с PCM-1». J. Cell Sci . 114 (Pt 4): 797– 809. doi :10.1242/jcs.114.4.797. ISSN  0021-9533. PMID  11171385.

Дальнейшее чтение

  • Tollenaere MAX; Mailand N; Bekker-Jensen S (2014). «Центриолярные сателлиты: ключевые медиаторы функций центросом». Cell. Mol. Life Sci . 72 (1): 11– 23. doi :10.1007/s00018-014-1711-3. PMC 11114028.  PMID 25173771.  S2CID 2243856  .
  • Ohata H, Fujiwara Y, Koyama K, Nakamura Y (1995). «Картирование гена человеческого аутоантигена перицентриолярного материала 1 (PCM1) на хромосоме 8p21.3-p22». Genomics . 24 (2): 404– 6. doi :10.1006/geno.1994.1640. PMID  7698772.
  • Balczon R, Bao L, Zimmer WE (1994). "PCM-1, 228-кДа центросомный аутоантиген с отчетливым распределением клеточного цикла". J. Cell Biol . 124 (5): 783–93 . doi :10.1083/jcb.124.5.783. PMC  2119948. PMID  8120099 .
  • Engelender S, Sharp AH, Colomer V и др. (1998). «Huntingtin-associated protein 1 (HAP1) interacts with the p150Glued subunit of dynactin». Hum. Mol. Genet . 6 (13): 2205– 12. doi : 10.1093/hmg/6.13.2205 . PMID  9361024.
  • Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S и др. (2000). «Метод дробового секвенирования человеческого транскриптома с использованием экспрессируемых ORF-тегов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3491– 6. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D. doi : 10.1073 /pnas.97.7.3491 . PMC  16267. PMID  10737800.
  • Corvi R, Berger N, Balczon R, Romeo G (2000). "RET/PCM-1: новый ген слияния при папиллярной карциноме щитовидной железы". Oncogene . 19 (37): 4236– 42. doi : 10.1038/sj.onc.1203772 . PMID  10980597.
  • Ли Кью, Хансен Д., Киллилеа А. и др. (2001). «Кендрин/перицентрин-B, белок центросомы с гомологией перицентрину, который образует комплексы с PCM-1». J. Cell Sci . 114 (Pt 4): 797– 809. doi :10.1242/jcs.114.4.797. PMID  11171385.
  • Kumar S, Connor JR, Dodds RA и др. (2001). «Идентификация и начальная характеристика 5000 экспрессированных секвенированных меток (EST) из библиотек ДНК нормального и остеоартритного хряща взрослого человека». Osteoarthr. Cartil . 9 (7): 641– 53. doi : 10.1053/joca.2001.0421 . PMID  11597177.
  • Даммерманн А., Мердес А. (2002). «Сборка центросомальных белков и организация микротрубочек зависят от PCM-1». J. Cell Biol . 159 (2): 255– 66. doi :10.1083/jcb.200204023. PMC 2173044.  PMID 12403812  .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ansley SJ, Badano JL, Blacque OE и др. (2003). «Дисфункция базального тельца является вероятной причиной плейотропного синдрома Барде-Бидля». Nature . 425 (6958): 628– 33. Bibcode :2003Natur.425..628A. doi :10.1038/nature02030. PMID  14520415. S2CID  4310157.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Kim JC, Badano JL, Sibold S, et al. (2004). «Белок Барде-Бидля BBS4 направляет груз в перицентриолярную область и необходим для закрепления микротрубочек и прогрессирования клеточного цикла». Nat. Genet . 36 (5): 462–70 . doi : 10.1038/ng1352 . PMID  15107855.
  • Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование участков фосфорилирования тирозина из человеческих Т-клеток с использованием иммобилизованной металл-аффинной хроматографии и тандемной масс-спектрометрии». Anal. Chem . 76 (10): 2763– 72. doi :10.1021/ac035352d. PMID  15144186.
  • Armes JE, Hammet F, de Silva M и др. (2004). «Кандидатные гены-супрессоры опухолей на плече хромосомы 8p при раннем и высоком уровне рака молочной железы». Oncogene . 23 (33): 5697– 702. doi : 10.1038/sj.onc.1207740 . PMID  15184884.
  • Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Mol. Cell. Proteomics . 3 (11): 1093– 101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID  15345747.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Hames RS, Crookes RE, Straatman KR и др. (2005). «Динамическое привлечение киназы Nek2 в центросому задействует микротрубочки, PCM-1 и локальную протеасомальную деградацию». Mol. Biol. Cell . 16 (4): 1711– 24. doi :10.1091/mbc.E04-08-0688. PMC  1073654. PMID  15659651 .
  • Reiter A, Walz C, Watmore A и др. (2005). «T(8;9)(p22;p24) — это рецидивирующая аномалия при хроническом и остром лейкозе, которая сливает PCM1 с JAK2». Cancer Res . 65 (7): 2662– 7. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-4263 . PMID  15805263.
  • Murati A, Gelsi-Boyer V, Adélaïde J, et al. (2005). "Слияние PCM1-JAK2 при миелопролиферативных расстройствах и остром эритроидном лейкозе с транслокацией t(8;9)". Leukemia . 19 (9): 1692– 6. doi : 10.1038/sj.leu.2403879 . PMID  16034466.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PCM1&oldid=1257530305"