домен PASTA
| домен PASTA | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Картинка, представляющая домен PASTA из Staphylococcus aureus. Запись PDB 3m9g | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | ПАСТА | ||||||||||
| Пфам | ПФ03793 | ||||||||||
| ИнтерПро | IPR005543 | ||||||||||
| УМНЫЙ | ПАСТА | ||||||||||
| ПРОСИТ | PDOC51178 | ||||||||||
| СКОП2 | 1rp5 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd06573 | ||||||||||
| |||||||||||
Домен PASTA — это небольшой белковый домен , который может связываться с бета-лактамной кольцевой частью различных β-лактамных антибиотиков . [1] Первоначально этот домен был обнаружен в 2002 году Йетсом и его коллегами как область сходства последовательностей, обнаруженная в пенициллин-связывающих белках и PknB-подобных киназах, обнаруженных в некоторых бактериях. Название представляет собой аббревиатуру, полученную от P BP и S erine / T hreonine kinase A ssociated domain.
Структура
Домен PASTA принимает структуру, состоящую из альфа-спирали , за которой следуют три бета-тяжа . Недавние структурные исследования показывают, что внеклеточная область PknB ( протеинкиназа B ), состоящая из четырех доменов PASTA, демонстрирует линейное расположение доменов. [2]
Распространение видов
Домены PASTA обнаружены у различных видов бактерий, включая грамположительные Bacillota и Actinomycetota .
Ссылки
- ^ Yeats C, Finn RD, Bateman A (сентябрь 2002 г.). «Домен PASTA: домен связывания бета-лактама». Trends Biochem. Sci . 27 (9): 438– 440. doi :10.1016/s0968-0004(02)02164-3. PMID 12217513.
- ^ Barthe P, Mukamolova GV, Roumestand C, Cohen-Gonsaud M (май 2010). «Структура внеклеточного домена PASTA PknB от mycobacterium tuberculosis предполагает активацию лиганд-зависимой киназы». Structure . 18 (5): 606– 15. doi : 10.1016/j.str.2010.02.013 . PMID 20462494.
