ПАПОЛА

ПАПОЛА
Идентификаторы
Псевдонимы	PAPOLA , PAP, поли(А) полимераза альфа, PAP-альфа
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605553; МГИ : 109301; гомологен : 23389; GeneCards : ПАПОЛА; ОМА :ПАПОЛА - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 14 (человек)
Конец	96,567,116 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 12 (мышь)
Конец	105,805,203 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	эпителий толстой кишки; ; Эпителий сосудистого сплетения; ; желудочковая зона; ; ганглионарное возвышение; ; Ахиллово сухожилие; ; слизистая оболочка сигмовидной кишки; ; клетки костного мозга; ; тело поджелудочной железы; ; эндометрий; ; слизистая оболочка тонкой кишки;
	Верх выражен в
	генитальный бугорок; ; хвост эмбриона; ; желточный мешок; ; желудочковая зона; ; нервный слой сетчатки; ; брюшная стенка; ; дерма; ; островок Лангерганса; ; сперматид; ; децидуальная оболочка;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ; ; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	трансферазная активность; связывание нуклеотидов; активность нуклеотидилтрансферазы; связывание ионов марганца; связывание ионов металлов; связывание белков; Связывание РНК; Связывание АТФ; связывание ионов магния; активность полинуклеотидаденилилтрансферазы;
Клеточный компонент	цитоплазма; нуклеоплазма; ядро;
Биологический процесс	сплайсинг мРНК через сплайсосому; прекращение транскрипции РНК-полимеразы II; Обработка 3'-конца РНК; процессинг мРНК; полиаденилирование мРНК; мРНК 3'-концевая обработка; регуляция 3'-концевой обработки мРНК; полиаденилирование РНК;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	10914
	18789
	ENSG00000090060
	ENSMUSG00000021111
	Р51003
	Q61183
NM_001252006 ; NM_001252007 ; NM_001293627 ; NM_001293628 ; NM_001293632;
	NM_032632 ; NM_001363662 ; NM_001363664 ; NM_001363665 ; NM_001363666
	NM_011112 ; NM_001347440
NP_001238935 ; NP_001238936 ; NP_001280556 ; NP_001280557 ; NP_001280561;
	NP_116021 ; NP_001350591 ; NP_001350593 ; NP_001350594 ; NP_001350595
	NP_001334369 ; NP_035242
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у человека

Поли(А) полимераза альфа — это фермент , который у людей кодируется геном PAPOLA . [ ^5]^[6]^[7]

PAPOLA связывается с FIP1L1 (фактор, взаимодействующий с PAPOLA и CPSF1), субъединицей комплекса субъединицы 1 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования (CPSF1). Этот комплекс полиаденилирует 3'-конец предшественников мРНК (пре-мРНК) (см. CPSF ). CPSF1 — это белок процессинга РНК , который связывается с богатыми урацилом последовательностями в пре-мРНК, связывается с полинуклеотидаденилилтрансферазной активностью PAPOLA и стимулирует ее, тем самым добавляя остатки аденилила к пре-мРНК. Это полиаденилиловое действие увеличивает созревание пре-мРНК и перемещение из ядра в цитоплазму, при этом значительно увеличивая стабильность мРНК, образованной из пре-мРНК: FIP1L1 — это фактор процессинга 3'-конца пре-мРНК. Слияния гена FIP1L1 с генами рецептора тромбоцитарного фактора роста альфа ( PGDFRA ) или рецептора ретиноевой кислоты альфа (RARA) являются причинами некоторых заболеваний человека, связанных с патологически повышенным уровнем эозинофилов в крови и/или лейкемией . ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000090060 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021111 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Thuresson AC, Astrom J, Astrom A, Gronvik KO, Virtanen A (март 1994). «Множественные формы поли(А) полимераз в клетках человека». Proc Natl Acad Sci USA . 91 (3): 979–83. Bibcode : 1994PNAS...91..979T. doi : 10.1073/pnas.91.3.979 . PMC 521437. PMID 8302877.
^ Yamauchi T, Sugimoto J, Hatakeyama T, Asakawa S, Shimizu N, Isobe M (сентябрь 1999 г.). «Присвоение гена человеческой поли(А) полимеразы (PAP) хромосоме 14q32.1-q32.2 и изоляция полиморфной последовательности повтора CA». J Hum Genet . 44 (4): 253–5. doi : 10.1007/s100380050154 . PMID 10429366.
^ "Ген Энтреза: PAPOLA поли(А) полимераза альфа".
^ «Фактор FIP1L1, взаимодействующий с PAPOLA и CPSF1 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI».

Дальнейшее чтение

Weichs an der Glon C, Ashe M, Eggermont J, Proudfoot NJ (1993). «Tat-зависимая окклюзия сайта поли(А) ВИЧ». EMBO J . 12 (5): 2119–28. doi :10.1002/j.1460-2075.1993.tb05860.x. PMC 413433 . PMID 8491200.
Pendurthi UR, Alok D, Rao LV (1997). «Связывание фактора VIIa с тканевым фактором вызывает изменения в экспрессии генов в клетках фибробластов человека: повышение регуляции поли(А)-полимеразы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (23): 12598–603. Bibcode :1997PNAS...9412598P. doi : 10.1073/pnas.94.23.12598 . PMC 25051 . PMID 9356495.
Varani L, Gunderson SI, Mattaj IW и др. (2000). «Структура ЯМР комплекса белка U1A массой 38 кДа - PIE РНК раскрывает основу кооперативности в регуляции полиаденилирования человеческим белком U1A». Nat. Struct. Biol . 7 (4): 329–35. doi :10.1038/74101. PMID 10742179. S2CID 13432764.
Mouland AJ, Coady M, Yao XJ, Cohen EA (2002). «Гипофосфорилирование поли(А) полимеразы и повышенная активность полиаденилирования связаны с экспрессией Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1». Вирусология . 292 (2): 321–30. doi : 10.1006/viro.2001.1261 . PMID 11878934.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Ким Х, Ли Дж Х, Ли И (2003). «Регулирование поли(А) полимеразы с помощью 14-3-3эпсилон». EMBO J . 22 (19): 5208–19. doi :10.1093/emboj/cdg486. PMC 204469 . PMID 14517258.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала человеческого TNF-альфа/NF-каппа B». Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Кауфманн И., Мартин Г., Фридлейн А. и др. (2005). «Человеческий Fip1 — это субъединица CPSF, которая связывается с богатыми U элементами РНК и стимулирует поли(А)-полимеразу». EMBO J. 23 ( 3): 616–26. doi :10.1038/sj.emboj.7600070. PMC 1271804. PMID 14749727 .
Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S и др. (2005). «Отдельные мотивы последовательности в субъединице 68-кДа фактора расщепления Im опосредуют связывание РНК, белок-белковые взаимодействия и субклеточную локализацию» (PDF) . J. Biol. Chem . 279 (34): 35788–97. doi : 10.1074/jbc.M403927200 . PMID 15169763.
Colland F, Jacq X, Trouplin V и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 14 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000090060 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021111 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8302877-5] Thuresson AC, Astrom J, Astrom A, Gronvik KO, Virtanen A (март 1994). «Множественные формы поли(А) полимераз в клетках человека». Proc Natl Acad Sci USA . 91 (3): 979–83. Bibcode : 1994PNAS...91..979T. doi : 10.1073/pnas.91.3.979 . PMC 521437. PMID 8302877.

[pmid10429366-6] Yamauchi T, Sugimoto J, Hatakeyama T, Asakawa S, Shimizu N, Isobe M (сентябрь 1999 г.). «Присвоение гена человеческой поли(А) полимеразы (PAP) хромосоме 14q32.1-q32.2 и изоляция полиморфной последовательности повтора CA». J Hum Genet . 44 (4): 253–5. doi : 10.1007/s100380050154 . PMID 10429366.

[entrez-7] "Ген Энтреза: PAPOLA поли(А) полимераза альфа".

[nih.gov-8] «Фактор FIP1L1, взаимодействующий с PAPOLA и CPSF1 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI».