Первоначально PAK5 была клонирована как специфичная для мозга киназа с преобладающей экспрессией в мозге и предполагаемой ролью в росте нейритов в нейрональных клетках . [8] [9] Избирательность сигнализации PAK5 была признана по ее способности стимулировать киназу JNK , но не киназы p38 или ERK . [9]
Генные и сплайсированные варианты
Ген PAK5, самый длинный среди семейства PAK, содержит в общей сложности 12 экзонов , из которых четыре экзона предназначены для 5'-UTR, а оставшиеся 8 экзонов — для кодирования белка (ген из обзора). Альтернативный сплайсинг экзонов гена PAK5 генерирует три транскрипта, и один из транскриптов кодирует белок длиной 719 аминокислот (ген из обзора). Сплайсинг экзонов мышиного гена PAK5 генерирует три транскрипта, два из которых кодируют идентичный полипептид длиной 719 аминокислот , в то время как транскрипт длиной 2,0 кб представляет собой некодирующую РНК с сохраненным интроном .
Белковые домены
Подобно PAK4 , PAK5 состоит из киназы , интерактивного связывающего мотива CDC42 / Rac1 (CRIB). [11]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства PAK протеинкиназ Ser/Thr. Известно, что члены семейства PAK являются эффекторами Rac/Cdc42 GTPases, которые участвуют в регуляции динамики цитоскелета , пролиферации и сигнализации выживания клеток . Эта киназа содержит мотив интерактивного связывания CDC42/Rac1 (CRIB) и, как было показано, связывает CDC42 в присутствии GTP.
Эта киназа преимущественно экспрессируется в мозге. Она способна стимулировать рост нейритов и, таким образом, может играть роль в развитии нейритов. Эта киназа связана с сетями микротрубочек и вызывает стабилизацию микротрубочек . Субклеточная локализация этой киназы строго регулируется во время прогрессирования клеточного цикла. Были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие тот же белок. [7]
Генетическая делеция PAK5 с делецией PAK6 или без нее у мышей, как было показано, связана с дефектной локомоцией , памятью и обучением . [12] [13] PAK5 коэкспрессируется с DISC1 , геном риска психоза , и этот путь, вероятно, участвует в модуляции пластичности синапсов . [14] Физиологический уровень PAK5 связан с общей физической активностью у мышей, поскольку было показано, что делеция PAK5 у мышей связана с повышенной активностью при стимуляции амфетамином . [15] PAK5 также считается одним из генетических вариантов, регулирующих экспрессию генов ( eQTL ), и его экспрессия связана с ингибированной регулируемой глюкозой секрецией инсулина в клетках INS1. [16]
PAK5 фосфорилирует Pacsin-1 и Synaptojanin-1 и регулирует транспорт синаптических везикул . [20] PAK5-опосредованное фосфорилирование GATA1 на S161 и S187 способствует эпителиально-мезенхимальному переходу . [21] PAK5 фосфорилирование p120-катенина на S288 играет роль в ремоделировании цитоскелета. [22] Помимо цитоплазмы , PAK5 также локализуется в митохондриях и фосфорилирует BAD на S112. [23] PAK5 ингибирует активность MARK2/Par1 и модулирует динамику микротрубочек. [24]
Версия этой статьи 2016 года была обновлена внешним экспертом в рамках модели двойной публикации. Соответствующая академическая рецензируемая статья была опубликована в Gene и может быть процитирована как: Rakesh Kumar, Rahul Sanawar, Xiaodong Li, Feng Li (19 декабря 2016 г.). "Structure, biochemistry, and biology of PAK kinases". Gene . Gene Wiki Review Series. 605 : 20– 31. doi :10.1016/J.GENE.2016.12.014. ISSN 0378-1119. PMC 5250584 . PMID 28007610. Wikidata Q38779105.
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000101349 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000039913 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Dan C, Nath N, Liberto M, Minden A (январь 2002 г.). «PAK5, новая мозгоспецифическая киназа, способствует росту нейритов в клетках N1E-115». Молекулярная и клеточная биология . 22 (2): 567–77 . doi :10.1128/MCB.22.2.567-577.2002. PMC 139731. PMID 11756552 .
^ Nagase T, Ishikawa K, Kikuno R, Hirosawa M, Nomura N, Ohara O (октябрь 1999 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Research . 6 (5): 337–45 . doi : 10.1093/dnares/6.5.337 . PMID 10574462.
^ ab "Ген Entrez: PAK7 p21(CDKN1A)-активированная киназа 7".
^ ab Dan C, Nath N, Liberto M, Minden A (январь 2002 г.). "PAK5, новая мозгоспецифическая киназа, способствует росту нейритов в клетках N1E-115". Молекулярная и клеточная биология . 22 (2): 567–77 . doi :10.1128/mcb.22.2.567-577.2002. PMC 139731. PMID 11756552 .
^ abc Пандей А., Дэн И., Кристиансен Т.З., Ватанабэ Н.М., Волдби Дж., Кадзикава Э., Хосрави-Фар Р., Благоев Б., Манн М. (май 2002 г.). «Клонирование и характеристика PAK5, нового члена подсемейства p21-активируемой киназы-II млекопитающих, который преимущественно экспрессируется в мозге». Онкоген . 21 (24): 3939–48 . doi : 10.1038/sj.onc.1205478 . ПМИД 12032833.
^ Kumar A, Molli PR, Pakala SB, Bui Nguyen TM, Rayala SK, Kumar R (июль 2009 г.). «Нить PAK от амебы к млекопитающим». Журнал клеточной биохимии . 107 (4): 579– 85. doi :10.1002/jcb.22159. PMC 2718766. PMID 19350548 .
^ Кумар Р., Ли Д. К. (2016). PAK в прогрессировании рака у человека: от зарождения к терапии рака и будущей онкобиологии . Том 130. С. 137–209 . doi :10.1016/bs.acr.2016.01.002. ISBN9780128047897. PMID 27037753. {{cite book}}: |journal=проигнорировано ( помощь )
^ Фурнари МА, Джобс МЛ, Некрасова Т, Минден А, Вагнер ГЦ (2013). "Функциональные дефициты у мышей с нокаутом PAK5, PAK6 и PAK5/PAK6". PLOS ONE . 8 (4): e61321. Bibcode :2013PLoSO...861321F. doi : 10.1371/journal.pone.0061321 . PMC 3620390 . PMID 23593460.
^ Некрасова Т., Джобс М. Л., Тинг Дж. Х., Вагнер Г. К., Минден А. (октябрь 2008 г.). «Целенаправленное нарушение генов Pak5 и Pak6 у мышей приводит к дефициту обучения и локомоции». Developmental Biology . 322 (1): 95– 108. doi : 10.1016/j.ydbio.2008.07.006 . PMID 18675265.
^ Morris DW, Pearson RD, Cormican P, Kenny EM, O'Dushlaine CT, Perreault LP и др. (июнь 2014 г.). «Унаследованная дупликация гена p21 Protein-Activated Kinase 7 (PAK7) является фактором риска психоза». Human Molecular Genetics . 23 (12): 3316– 26. doi :10.1093/hmg/ddu025. PMC 4030770 . PMID 24474471.
^ Фурнари МА, Джобс МЛ, Некрасова Т, Минден А, Вагнер ГЦ (апрель 2014 г.). «Дифференциальная чувствительность мышей с двойным нокаутом Pak5, Pak6 и Pak5/Pak6 к стимулирующему эффекту амфетамина и изменениям массы тела, вызванным физическими упражнениями». Nutritional Neuroscience . 17 (3): 109– 15. doi :10.1179/1476830513Y.0000000072. PMC 4365912 . PMID 23710594.
^ Fadista J, Vikman P, Laakso EO, Mollet IG, Esguerra JL, Taneera J, Storm P, Osmark P, Ladenvall C, Prasad RB, Hansson KB, Finotello F, Uvebrant K, Ofori JK, Di Camillo B, Krus U, Cilio CM, Hansson O, Eliasson L, Rosengren AH, Renström E, Wollheim CB, Groop L (сентябрь 2014 г.). «Глобальный геномный и транскриптомный анализ островков поджелудочной железы человека выявляет новые гены, влияющие на метаболизм глюкозы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (38): 13924– 9. Bibcode : 2014PNAS..11113924F. doi : 10.1073/pnas.1402665111 . PMC 4183326. PMID 25201977 .
^ ab He S, Feng M, Liu M, Yang S, Yan S, Zhang W, Wang Z, Hu C, Xu Q, Chen L, Zhu H, Xu N (1 декабря 2014 г.). "P21-активированная киназа 7 опосредует резистентность к цисплатину клеток плоскоклеточной карциномы пищевода с повышенной экспрессией Aurora-A". PLOS ONE . 9 (12): e113989. Bibcode :2014PLoSO...9k3989H. doi : 10.1371/journal.pone.0113989 . PMC 4250179 . PMID 25436453.
^ Чжай Дж, Цюй С, Ли Х, Чжун Дж, Чэнь X, Цюй Z, Ву Д (август 2015 г.). «МиР-129 подавляет рост и инвазию опухолевых клеток путем нацеливания на PAK5 при гепатоцеллюлярной карциноме». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 464 (1): 161–7 . doi :10.1016/j.bbrc.2015.06.108. ПМИД 26116538.
^ Zheng J, Li XD, Wang P, Liu XB, Xue YX, Hu Y, Li Z, Li ZQ, Wang ZH, Liu YH (сентябрь 2015 г.). «CRNDE влияет на злокачественные биологические характеристики стволовых клеток глиомы человека, отрицательно регулируя miR-186». Oncotarget . 6 (28): 25339– 55. doi :10.18632/oncotarget.4509. PMC 4694835 . PMID 26231038.
^ Strochlic TI, Concilio S, Viaud J, Eberwine RA, Wong LE, Minden A, Turk BE, Plomann M, Peterson JR (март 2012 г.). «Идентификация нейрональных субстратов указывает на участие Pak5 в синаптическом везикулярном транспорте». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (11): 4116– 21. Bibcode : 2012PNAS..109.4116S. doi : 10.1073/pnas.1116560109 . PMC 3306725. PMID 22371566 .
^ Li Y, Ke Q, Shao Y, Zhu G, Li Y, Geng N, Jin F, Li F (февраль 2015 г.). «GATA1 индуцирует эпителиально-мезенхимальный переход в клетках рака груди через онкогенную сигнализацию PAK5». Oncotarget . 6 (6): 4345– 56. doi :10.18632/oncotarget.2999. PMC 4414194 . PMID 25726523.
^ Wong LE, Reynolds AB, Dissanayaka NT, Minden A (август 2010 г.). "p120-катенин является связывающим партнером и субстратом для киназ группы B Pak". Journal of Cellular Biochemistry . 110 (5): 1244–54 . doi :10.1002/jcb.22639. PMID 20564219. S2CID 24567609.
^ Cotteret S, Jaffer ZM, Beeser A, Chernoff J (август 2003 г.). "p21-активируемая киназа 5 (Pak5) локализуется в митохондриях и ингибирует апоптоз путем фосфорилирования BAD". Molecular and Cellular Biology . 23 (16): 5526– 39. doi :10.1128/mcb.23.16.5526-5539.2003. PMC 166342 . PMID 12897128.
^ Matenia D, Griesshaber B, Li XY, Thiessen A, Johne C, Jiao J, Mandelkow E, Mandelkow EM (сентябрь 2005 г.). «Киназа PAK5 является ингибитором MARK/Par-1, что приводит к стабильным микротрубочкам и динамическому актину». Молекулярная биология клетки . 16 (9): 4410– 22. doi :10.1091/mbc.E05-01-0081. PMC 1196348. PMID 16014608 .
^ Han K, Zhou Y, Gan ZH, Qi WX, Zhang JJ, Fen T, Meng W, Jiang L, Shen Z, Min DL (декабрь 2014 г.). "p21-активируемая киназа 7 является онкогеном при остеосаркоме человека". Cell Biology International . 38 (12): 1394– 402. doi :10.1002/cbin.10351. PMC 4410679. PMID 25052921 .
^ Fang ZP, Jiang BG, Gu XF, Zhao B, Ge RL, Zhang FB (январь 2014 г.). «P21-активируемая киназа 5 играет важную роль в пролиферации и опухолеобразовании гепатоцеллюлярной карциномы человека». Acta Pharmacologica Sinica . 35 (1): 82– 8. doi :10.1038/aps.2013.31. PMC 4075737 . PMID 23685956.
^ Gu J, Li K, Li M, Wu X, Zhang L, Ding Q, Wu W, Yang J, Mu J, Wen H, Ding Q, Lu J, Hao Y, Chen L, Zhang W, Li S, Liu Y (январь 2013 г.). «Роль p21-активируемой киназы 7 в развитии рака желудка». Журнал FEBS . 280 (1): 46–55 . doi : 10.1111/febs.12048 . PMID 23106939. S2CID 38130015.
^ Gu X, Wang C, Wang X, Ma G, Li Y, Cui L, Chen Y, Zhao B, Li K (12 января 2015 г.). «Эффективное ингибирование развития глиомы человека путем подавления PAK5 с помощью РНК-интерференции». International Journal of Biological Sciences . 11 (2): 230– 7. doi :10.7150/ijbs.9193. PMC 4308408 . PMID 25632266.
^ He S, Liu M, Zhang W, Xu N, Zhu H (2016). «Повышенная экспрессия p21-активируемой киназы 7 связана с метастазами в лимфатические узлы при плоскоклеточном раке пищевода». Cancer Biomarkers . 16 (2): 203– 9. doi :10.3233/CBM-150557. PMID 26682509.
^ Gong W, An Z, Wang Y, Pan X, Fang W, Jiang B, Zhang H (август 2009 г.). «P21-активируемая киназа 5 сверхэкспрессируется во время прогрессирования колоректального рака и регулирует адгезию и миграцию клеток колоректальной карциномы». International Journal of Cancer . 125 (3): 548–55 . doi : 10.1002/ijc.24428 . PMID 19415746. S2CID 42711385.
^ ab Li D, Yao X, Zhang P (ноябрь 2013 г.). «Сверхэкспрессия P21-активируемой киназы 5 (PAK5) способствует устойчивости эпителиального рака яичников к паклитакселу». Молекулярная и клеточная биохимия . 383 ( 1– 2): 191– 9. doi :10.1007/s11010-013-1767-7. PMID 23877225. S2CID 5938617.
^ Wang XX, Cheng Q, Zhang SN, Qian HY, Wu JX, Tian H, Pei DS, Zheng JN (октябрь 2013 г.). «Сигнализация PAK5-Egr1-MMP2 контролирует миграцию и инвазию в клетки рака груди». Tumour Biology . 34 (5): 2721– 9. doi :10.1007/s13277-013-0824-x. PMID 23696025. S2CID 15521185.
^ Fawdar S, Trotter EW, Li Y, Stephenson NL, Hanke F, Marusiak AA, Edwards ZC, Ientile S, Waszkowycz B, Miller CJ, Brognard J (июль 2013 г.). «Целевой скрининг генетической зависимости облегчает выявление мутаций, поддающихся действию, в FGFR4, MAP3K9 и PAK5 при раке легких». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (30): 12426– 31. Bibcode : 2013PNAS..11012426F. doi : 10.1073/pnas.1305207110 . PMC 3725071. PMID 23836671 .
^ Wang X, Gong W, Qing H, Geng Y, Wang X, Zhang Y, Peng L, Zhang H, Jiang B (декабрь 2010 г.). «p21-активированная киназа 5 ингибирует апоптоз, вызванный камптотецином, в клетках колоректальной карциномы». Tumour Biology . 31 (6): 575– 82. doi :10.1007/s13277-010-0071-3. PMID 20567954. S2CID 6344093.
^ Zhang DG, Zhang J, Mao LL, Wu JX, Cao WJ, Zheng JN, Pei DS (май 2015 г.). "p21-активированная киназа 5 влияет на апоптоз и пролиферацию, вызванные цисплатином, в клетках гепатоцеллюлярной карциномы". Tumour Biology . 36 (5): 3685– 91. doi :10.1007/s13277-014-3007-5. PMID 25560489. S2CID 11752910.