PADI2

PADI2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4N20, 4N22, 4N24, 4N25, 4N26, 4N28, 4N2A, 4N2B, 4N2C, 4N2D, 4N2E, 4N2F, 4N2G, 4N2H, 4N2I, 4N2K, 4N2L, 4N2M, 4N2N
Идентификаторы
Псевдонимы	PADI2 , PAD-H19, PAD2, PDI2, пептидил аргининдезиминаза 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 607935; МГИ : 1338892; гомологен : 7214; Генные карты : PADI2; OMA :PADI2 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	17,119,451 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	140,679,897 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	внутренний бледный шар; ; Сегмент С1; ; ягодичные мышцы; ; нижнее оливковое ядро; ; нижний ганглий блуждающего нерва; ; средняя лобная извилина; ; внешний бледный шар; ; субталамическое ядро; ; икроножная мышца; ; передняя большеберцовая мышца;
	Верх выражен в
	вестибулярная мембрана улиткового протока; ; децидуальная; ; гаструла; ; мешочек; ; слезная железа; ; двубрюшная мышца; ; пигментный эпителий сетчатки; ; грудино-ключично-сосцевидная мышца; ; сосудистая полоска; ; вестибулярный сенсорный эпителий;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ионов кальция; связывание рецепторов эстрогена; гидролазная активность; активность протеин-аргининдеиминазы; активность гомодимеризации белка; связывание ионов металлов;
Клеточный компонент	внеклеточная экзосома; цитоплазма; цитозоль; внеклеточная область; ядро; азурофильные гранулы просвет;
Биологический процесс	негативная регуляция хемокин-опосредованного сигнального пути; развитие черной субстанции; внутриклеточный сигнальный путь эстрогенового рецептора; отрицательная регуляция хемотаксиса лимфоцитов; организация хроматина; дегрануляция нейтрофилов; клеточный ответ на фактор, ингибирующий лейкемию;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	11240
	18600
	ENSG00000117115
	ENSMUSG00000028927
	Q9Y2J8
	Q08642
	NM_007365
	NM_008812
	NP_031391
	NP_032838
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Протеин-аргининдезиминаза типа 2 — это фермент , который у человека кодируется геном PADI2 . [ ^5]^[6]

Этот ген кодирует член семейства ферментов пептидил аргининдеиминазы , которые катализируют посттрансляционное деиминирование белков путем преобразования остатков аргинина в цитруллины в присутствии ионов кальция . Члены семейства имеют различную субстратную специфичность и тканеспецифичные паттерны экспрессии . Фермент типа II является наиболее широко экспрессируемым членом семейства. Известные субстраты для этого фермента включают основной белок миелина в центральной нервной системе и виментин в скелетных мышцах и макрофагах .

Этот фермент, как полагают, играет роль в возникновении и прогрессировании нейродегенеративных заболеваний человека, включая болезнь Альцгеймера и рассеянный склероз , а также участвует в патогенезе глаукомы . Этот ген существует в кластере с четырьмя другими паралогичными генами. ^[6]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000117115 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028927 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ватанабэ К, Сеншу Т (октябрь 1989 г.). «Выделение и характеристика клонов кДНК, кодирующих пептидил-аргинин-дезиминазу скелетных мышц крысы». J Biol Chem . 264 (26): 15255– 60. doi : 10.1016/S0021-9258(19)84818-4 . PMID 2768262.
^ ab "Ген Энтреза: пептидил аргининдезиминаза PADI2, тип II".

Дальнейшее чтение

Воссенаар Э.Р., Зендман А.Дж., ван Венрой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2004). «PAD, растущее семейство цитруллинирующих ферментов: гены, особенности и участие в заболеваниях». Биоэссе . 25 (11): 1106– 18. doi :10.1002/bies.10357. PMID 14579251. S2CID 22194514.
Chavanas S, Méchin MC, Nachat R и др. (2006). «Пептидиларгиназы и деиминирование в биологии и патологии: отношение к гомеостазу кожи». J. Dermatol. Sci . 44 (2): 63–72 . doi :10.1016/j.jdermsci.2006.07.004. PMID 16973334.
Moscarello MA, Mastronardi FG, Wood DD (2007). «Роль цитруллинированных белков предполагает новый механизм в патогенезе рассеянного склероза». Neurochem. Res . 32 (2): 251– 6. doi :10.1007/s11064-006-9144-5. PMC 1794624. PMID 17031564 .
Нагасе Т., Ишикава К., Суяма М. и др. (1999). «Предсказание кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 6 (1): 63–70 . doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032.
Venter JC, Adams MD, Myers EW и др. (2001). «Последовательность генома человека». Science . 291 (5507): 1304– 51. Bibcode :2001Sci...291.1304V. doi : 10.1126/science.1058040 . PMID 11181995.
Ишигами А., Осава Т., Асага Х. и др. (2002). «Человеческая пептидиларгининдезиминаза II типа: молекулярное клонирование, организация генов и экспрессия в коже человека». Arch. Biochem. Biophys . 407 (1): 25– 31. doi :10.1016/S0003-9861(02)00516-7. PMID 12392711.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Chavanas S, Méchin MC, Takahara H и др. (2004). «Сравнительный анализ кластеров генов пептидиларгининдезиминазы мыши и человека выявил высококонсервативные некодирующие сегменты и новый человеческий ген PADI6». Gene . 330 : 19– 27. doi :10.1016/j.gene.2003.12.038. PMID 15087120.
Sambandam T, Belousova M, Accaviti-Loper MA и др. (2005). «Повышение пептидиларгининдезиминазы II типа в гипоксических астроцитах». Biochem. Biophys. Res. Commun . 325 (4): 1324– 9. doi :10.1016/j.bbrc.2004.10.173. PMID 15555572.
Накаяма-Хамада М., Сузуки А., Кубота К. и др. (2005). «Сравнение ферментативных свойств hPADI2 и hPADI4». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 327 (1): 192–200 . doi :10.1016/j.bbrc.2004.11.152. ПМИД 15629448.
Ишигами А., Осава Т., Хирацука М. и др. (2005). «Аномальное накопление цитруллинированных белков, катализируемое пептидиларгининдезиминазой в экстрактах гиппокампа у пациентов с болезнью Альцгеймера». J. Neurosci. Res . 80 (1): 120– 8. doi :10.1002/jnr.20431. PMID 15704193. S2CID 45747014.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация человеческой хромосомы 1». Nature . 441 (7091): 315– 21. Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414.
Bhattacharya SK, Crabb JS, Bonilha VL и др. (2006). «Протеомика вовлекает пептидил аргинин дезиминазу 2 и цитруллинирование зрительного нерва в патогенез глаукомы». Invest. Ophthalmol. Vis. Sci . 47 (6): 2508– 14. doi : 10.1167/iovs.05-1499 . PMID 16723463.
Mastronardi FG, Noor A, Wood DD и др. (2007). «Остров CpG пептидил аргининдеиминазы 2 в белом веществе при рассеянном склерозе гипометилирован». J. Neurosci. Res . 85 (9): 2006–16 . doi :10.1002/jnr.21329. PMID 17469138. S2CID 27139497.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 1 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000117115 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028927 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2768262-5] Ватанабэ К, Сеншу Т (октябрь 1989 г.). «Выделение и характеристика клонов кДНК, кодирующих пептидил-аргинин-дезиминазу скелетных мышц крысы». J Biol Chem . 264 (26): 15255– 60. doi : 10.1016/S0021-9258(19)84818-4 . PMID 2768262.

[entrez-6] "Ген Энтреза: пептидил аргининдезиминаза PADI2, тип II".