PADI1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
PADI1
Идентификаторы
ПсевдонимыPADI1 , HPAD10, PAD1, PDI, PDI1, пептидил аргининдезиминаза 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 607934; МГИ : 1338893; гомологен : 7881; Генные карты : PADI1; OMA :PADI1 – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_013358

NM_011059

RefSeq (белок)

NP_037490

NP_035189

Местоположение (UCSC)Хр 1: 17.21 – 17.25 МбХр 4: 140,54 – 140,57 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Пептидил-аргининдезиминаза, тип I , также известная как PADI1 , представляет собой белок , который у людей кодируется геном PADI1 . [5] [6]

Этот ген кодирует член семейства ферментов пептидил аргинин деиминазы , которые катализируют посттрансляционное деиминирование белков путем преобразования остатков аргинина в цитруллины в присутствии ионов кальция. Члены семейства имеют различную субстратную специфичность и тканеспецифичные паттерны экспрессии. Фермент типа I участвует в поздних стадиях эпидермальной дифференциации, где он деиминирует филагрин и кератин K1 , что поддерживает гидратацию рогового слоя и, следовательно, функцию кожного барьера. Этот фермент также может играть роль в формировании волосяного фолликула . ​​Этот ген существует в кластере с четырьмя другими паралогичными генами. [5]

Ссылки

  1. ^ abc ENSG00000281459 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000142623, ENSG00000281459 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000025329 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab "Ген Энтреза: пептидил аргининдезиминаза PADI1, тип I".
  6. ^ Guerrin M, Ishigami A, Méchin MC, Nachat R, Valmary S, Sebbag M, Simon M, Senshu T, Serre G (февраль 2003 г.). «cDNA cloning, gene organization and expression analysis of human peptidylarginine deiminase type I». The Biochemical Journal . 370 (Pt 1): 167–74 . doi :10.1042/BJ20020870. PMC 1223146. PMID  12416996 . 

Дальнейшее чтение

  • Воссенаар Э.Р., Зендман А.Дж., ван Венрой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2004). «PAD, растущее семейство цитруллинирующих ферментов: гены, особенности и участие в заболеваниях» (PDF) . Биоэссе . 25 (11): 1106– 18. doi :10.1002/bies.10357. PMID  14579251. S2CID  22194514.
  • Chavanas S, Méchin MC, Nachat R и др. (2006). «Пептидиларгиназы и деиминирование в биологии и патологии: отношение к гомеостазу кожи». J. Dermatol. Sci . 44 (2): 63–72 . doi :10.1016/j.jdermsci.2006.07.004. PMID  16973334.
  • Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Guerrin M, Ishigami A, Méchin MC и др. (2003). «Клонирование кДНК, организация генов и анализ экспрессии человеческой пептидиларгининдезиминазы типа I». Biochem. J . 370 (Pt 1): 167–74 . doi :10.1042/BJ20020870. PMC  1223146 . PMID  12416996.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Chavanas S, Méchin MC, Takahara H и др. (2004). «Сравнительный анализ кластеров генов пептидиларгининдезиминазы мыши и человека выявил высококонсервативные некодирующие сегменты и новый человеческий ген PADI6». Gene . 330 : 19– 27. doi :10.1016/j.gene.2003.12.038. PMID  15087120.
  • Иида А., Накамура И. (2004). «Идентификация 45 новых SNP в области 83 кб, содержащей локусы пептидиларгининдезиминазы типов 1 и 3 на хромосомной полосе 1p36.13». J. Hum. Genet . 49 (7): 387–90 . doi : 10.1007/s10038-004-0156-1 . PMID  15150696.
  • Nachat R, Méchin MC, Takahara H и др. (2005). «Изоформы пептидиларгининдеиминазы 1-3 экспрессируются в эпидермисе и участвуют в деиминировании K1 и филаггрина». J. Invest. Dermatol . 124 (2): 384–93 . doi : 10.1111/j.0022-202X.2004.23568.x . PMID  15675958.
  • Méchin MC, Enji M, Nachat R и др. (2005). «Пептидиларгининдезиминазы, экспрессируемые в эпидермисе человека, различаются по своей субстратной специфичности и субклеточному расположению». Cell. Mol. Life Sci . 62 (17): 1984– 95. doi :10.1007/s00018-005-5196-y. PMC  11139075 . PMID  16091842. S2CID  23610590.
  • Gregory SG, Barlow KF, McLay KE и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация человеческой хромосомы 1». Nature . 441 (7091): 315– 21. Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID  16710414.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PADI1&oldid=1259005277"