Ингибитор циклинзависимой киназы 1С

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
CDKN1C
Идентификаторы
ПсевдонимыCDKN1C , BWCR, BWS, KIP2, WBS, p57, p57Kip2, ингибитор циклинзависимой киназы 1C, ингибитор циклинзависимой киназы 1C
Внешние идентификаторыОМИМ : 600856; МГИ : 104564; гомологен : 133549; GeneCards : CDKN1C; OMA :CDKN1C — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

1028

12577

Ансамбль

ENSG00000273707
ENSG00000129757

ENSMUSG00000037664

UniProt

P49918

P49919

РефСек (мРНК)

NM_000076
NM_001122630
NM_001122631
NM_001362474
NM_001362475

НМ_001161624
НМ_009876
НМ_001354981

RefSeq (белок)

NP_000067
NP_001116102
NP_001116103
NP_001349403
NP_001349404

НП_001155096
НП_034006
НП_001341910

Местоположение (UCSC)Хр 11: 2.88 – 2.89 МбХр 7: 143.01 – 143.01 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Ингибитор циклинзависимой киназы 1C (p57, Kip2) , также известный как CDKN1C , представляет собой белок , который у людей кодируется импринтированным геном CDKN1C . [5]

Функция

Ингибитор циклинзависимой киназы 1C является прочно связывающимся ингибитором нескольких комплексов G1 циклин/Cdk и отрицательным регулятором пролиферации клеток. Мутации CDKN1C связаны со спорадическими раковыми заболеваниями и синдромом Беквита-Видеманна, что позволяет предположить, что он является кандидатом на роль супрессора опухолей. [5]

CDKN1C — это ген- супрессор опухолей человека на хромосоме 11 (11p15), принадлежащий к семейству генов cip/kip . Он кодирует ингибитор клеточного цикла , который связывается с комплексами циклин-CDK G1. [6] Таким образом, p57KIP2 вызывает остановку клеточного цикла в фазе G1 .

Было обнаружено, что CDKN1C приводит к покою раковых клеток ; экспрессия его гена регулируется активностью глюкокортикоидных рецепторов (GR) посредством ремоделирования хроматина , опосредованного SWI/SNF . [7]

Методы исследования

Поскольку было установлено, что мутация в этом гене, подавляющем опухоль, может иметь драматические последствия для новорожденного, такие как макроглоссия, было проведено большое исследование для определения генетического значения. CDKN1C склонен к ошибкам в процессе импринтинга гена. Процесс импринтинга гена происходит совместно с метилированием ДНК. Это делает ген транскрипционно молчащим с отцовской стороны, позволяя материнскому гену быть активным. [8] Если этот ген не будет должным образом метилирован или получит мутацию, будет отсутствовать подавление клеточного цикла, что приведет к росту детской опухоли. [9]

Методы исследования этого гена включали различные методы секвенирования, такие как секвенирование по Сэнгеру. Этот метод секвенирования представляет собой трехэтапный процесс, включающий ПЦР, гель-электрофорез и компьютерный анализ для определения последовательностей ДНК. [10] Секвенирование может быть полезным для идентификации мутаций пар оснований. Исследование, проведенное для оценки фенотипических эффектов, которые мутации в этом гене будут иметь, потребовало генетического секвенирования когорты лиц, известных как затронутые мутацией в этом гене. [11] В этом исследовании они обнаружили 37 мутаций, связанных с 38 различными родословными. Это пошло на доказательство того, что мутации в CDKN1C на хромосоме 11 на самом деле будут иметь фенотипические эффекты для людей. Эти эффекты далее обсуждаются с помощью различных клинических случаев, которые могут иметь место.

Клиническое значение

Мутация этого гена может привести к потере контроля над клеточным циклом, что приводит к неконтролируемой клеточной пролиферации . p57KIP2 был связан с синдромом Беквита-Видеманна (BWS), который характеризуется повышенным риском образования опухолей в детстве. [12] Было также показано, что мутации потери функции в этом гене связаны с синдромом IMAGe (задержка внутриутробного развития, метафизарная дисплазия, врожденная гипоплазия надпочечников и аномалии половых органов). [13] Полные пузырные заносы состоят только из отцовской ДНК, и, таким образом, в клетках отсутствует экспрессия p57, поскольку ген отцовски импринтирован (заглушен). Иммуногистохимические окраски на p57 могут помочь в диагностике пузырных заносов. [14]

Взаимодействия

Было показано, что ингибитор циклинзависимой киназы 1С взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc ENSG00000129757 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000273707, ENSG00000129757 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000037664 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab "Ген Entrez: ингибитор циклин-зависимой киназы CDKN1C 1C (p57, Kip2)".
  6. ^ Matsuoka S, Edwards MC, Bai C, Parker S, Zhang P, Baldini A, Harper JW, Elledge SJ (март 1995 г.). "p57KIP2, структурно отличный член семейства ингибиторов Cdk p21CIP1, является кандидатом на роль гена-супрессора опухолей". Genes & Development . 9 (6): 650–62 . doi : 10.1101/gad.9.6.650 . PMID  7729684.
  7. ^ Prekovic S, Schuurman K, Mayayo-Peralta I, Manjón AG, Buijs M, Yavuz S, Wellenstein MD, Barrera A, Monkhorst K, Huber A, Morris B (июль 2021 г.). «Глюкокортикоидный рецептор запускает обратимое состояние покоя, толерантное к лекарствам, с приобретенной терапевтической уязвимостью при раке легких». Nature Communications . 12 (1): 4360. Bibcode :2021NatCo..12.4360P. doi : 10.1038/s41467-021-24537-3 . PMC 8285479 . PMID  34272384. 
  8. ^ Амачер С. "Эпигенетический импринтинг" (PDF) . Калифорнийский университет в Беркли .
  9. ^ Cedar H, Bergman Y (май 2009). «Связывание метилирования ДНК и модификации гистонов: закономерности и парадигмы». Nature Reviews. Genetics . 10 (5): 295–304 . doi :10.1038/nrg2540. PMID  19308066. S2CID  5450674.
  10. ^ "Шаги и метод секвенирования по Сэнгеру". Merck KGaA . Дармштадт, Германия.
  11. ^ Brioude F, Netchine I, Praz F, Le Jule M, Calmel C, Lacombe D и др. (сентябрь 2015 г.). «Мутации импринтированного гена CDKN1C как причина синдрома чрезмерного роста Беквита-Видеманна: клинический спектр и функциональная характеристика». Human Mutation . 36 (9): 894–902 . doi : 10.1002/humu.22824 . PMID  26077438. S2CID  37398295.
  12. ^ Хатада I, Набетани А, Морисаки Х, Синь З, Охиши С, Тоноки Х, Ниикава Н, Иноуэ М, Комото Ю, Окада А, Стейхен Э, Охаси Х, Фукусима Ю, Накаяма М, Мукаи Т (октябрь 1997 г.). «Новые мутации p57KIP2 при синдроме Беквита-Видемана». Генетика человека . 100 ( 5–6 ): 681–3 . doi : 10.1007/s004390050573. PMID  9341892. S2CID  21120202.
  13. ^ Риччио А., Кубеллис М.В. (июль 2012 г.). «Усиление функции в CDKN1C». Природная генетика . 44 (7): 737–8 . doi : 10.1038/ng.2336 . PMID  22735584. S2CID  205345787.
  14. ^ LeGallo RD, Stelow EB, Ramirez NC, Atkins KA (май 2008 г.). «Диагностика пузырного заноса с использованием иммуногистохимии p57 и флуоресцентной гибридизации HER2 in situ». American Journal of Clinical Pathology . 129 (5): 749–755 . doi : 10.1309/7XRL378C22W7APBT . PMID  18426735.
  15. ^ Yokoo T, Toyoshima H, Miura M, Wang Y, Iida KT, Suzuki H, Sone H, Shimano H, Gotoda T, Nishimori S, Tanaka K, Yamada N (декабрь 2003 г.). "p57Kip2 регулирует динамику актина путем связывания и транслокации LIM-киназы 1 в ядро". Журнал биологической химии . 278 (52): 52919– 23. doi : 10.1074/jbc.M309334200 . PMID  14530263.
  16. ^ Хоакин М., Уотсон Р. Дж. (ноябрь 2003 г.). «Фактор транскрипции B-Myb, регулируемый клеточным циклом, преодолевает ингибирующую активность циклин-зависимой киназы p57(KIP2) путем взаимодействия с его доменом, связывающим циклин». Журнал биологической химии . 278 (45): 44255– 64. doi : 10.1074/jbc.M308953200 . PMID  12947099.
  17. ^ Рейно EG, Лейбович MP, Тинтиньяк LA, Пелпель K, Гильер M, Лейбович SA (июнь 2000 г.). «Стабилизация MyoD путем прямого связывания с p57(Kip2)». Журнал биологической химии . 275 (25): 18767– 76. doi : 10.1074/jbc.M907412199 . PMID  10764802.
  18. ^ Watanabe H, Pan ZQ, Schreiber-Agus N, DePinho RA, Hurwitz J, Xiong Y (февраль 1998 г.). «Подавление трансформации клеток ингибитором циклинзависимой киназы p57KIP2 требует связывания с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (4): 1392– 7. Bibcode : 1998PNAS ...95.1392W. doi : 10.1073/pnas.95.4.1392 . PMC 19016. PMID  9465025. 

Дальнейшее чтение

  • Seizinger BR (декабрь 1991 г.). «Гены, связанные с подавлением опухолей и контролем роста в нервной системе человека». Cancer and Metastasis Reviews . 10 (4): 281– 7. doi :10.1007/BF00554790. PMID  1786629. S2CID  22809027.
  • Lee MH, Reynisdóttir I, Massagué J (март 1995 г.). «Клонирование p57KIP2, ингибитора циклин-зависимой киназы с уникальной структурой домена и распределением в тканях». Genes & Development . 9 (6): 639–49 . doi : 10.1101/gad.9.6.639 . PMID  7729683.
  • Matsuoka S, Edwards MC, Bai C, Parker S, Zhang P, Baldini A, Harper JW, Elledge SJ (март 1995 г.). "p57KIP2, структурно отличный член семейства ингибиторов Cdk p21CIP1, является кандидатом на роль гена-супрессора опухолей". Genes & Development . 9 (6): 650– 62. doi : 10.1101/gad.9.6.650 . PMID  7729684.
  • Matsuoka S, Thompson JS, Edwards MC, Bartleta JM, Grundy P, Kalikin LM, Harper JW, Elledge SJ, Feinberg AP (апрель 1996 г.). «Импринтинг гена, кодирующего ингибитор циклинзависимой киназы человека, p57KIP2, на хромосоме 11p15». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (7): 3026– 30. Bibcode : 1996PNAS...93.3026M. doi : 10.1073/pnas.93.7.3026 . PMC  39755. PMID  8610162 .
  • Reid LH, Crider-Miller SJ, West A, Lee MH, Massagué J, Weissman BE (март 1996 г.). «Геномная организация гена p57KIP2 человека и ее анализ в анализе опухоли Вильмса G401». Cancer Research . 56 (6): 1214– 8. PMID  8640800.
  • Tokino T, Urano T, Furuhata T, Matsushima M, Miyatsu T, Sasaki S, Nakamura Y (май 1996). «Характеристика гена p57KIP2 человека: альтернативный сплайсинг, полиморфизмы вставок/делеций в последовательностях VNTR в кодирующей области и мутационный анализ». Human Genetics . 97 (5): 625– 31. doi :10.1007/BF02281873. PMID  8655143. S2CID  1833559.
  • Хатада И, Охаси Х, Фукусима Ю, Канеко Ю, Иноуэ М, Комото Ю, Окада А, Оиси С, Набетани А, Морисаки Х, Накаяма М, Ниикава Н, Мукаи Т (октябрь 1996 г.). «Импринтированный ген p57KIP2 мутирует при синдроме Беквита-Видемана». Природная генетика . 14 (2): 171–3 . doi : 10.1038/ng1096-171. PMID  8841187. S2CID  1765772.
  • Furuhata T, Tokino T, Urano T, Nakamura Y (ноябрь 1996 г.). «Выделение нового GPI-закрепленного гена, специфически регулируемого p53; корреляция между его экспрессией и чувствительностью к противораковым препаратам». Oncogene . 13 (9): 1965–70 . PMID  8934543.
  • LaBaer J, Garrett MD, Stevenson LF, Slingerland JM, Sandhu C, Chou HS, Fattaey A, Harlow E (апрель 1997 г.). «Новые функциональные активности для семейства ингибиторов CDK p21». Genes & Development . 11 (7): 847–62 . doi : 10.1101/gad.11.7.847 . PMID  9106657.
  • Watanabe H, Pan ZQ, Schreiber-Agus N, DePinho RA, Hurwitz J, Xiong Y (февраль 1998 г.). «Подавление трансформации клеток ингибитором циклинзависимой киназы p57KIP2 требует связывания с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (4): 1392– 7. Bibcode : 1998PNAS...95.1392W. doi : 10.1073/pnas.95.4.1392 . PMC  19016. PMID  9465025.
  • Бхуян З.А., Яцуки Х., Сасагури Т., Джо К., Соэджима Х., Чжу Х., Хатада И., Морисаки Х., Морисаки Т., Мукаи Т. (март 1999 г.). «Функциональный анализ мутации гена p57KIP2 при синдроме Беквита-Видемана». Генетика человека . 104 (3): 205– 10. doi : 10.1007/s004390050937. PMID  10323243. S2CID  25081259.
  • Лам В.В., Хатада И., Охиши С., Мукаи Т., Джойс Дж.А., Коул Т.Р., Доннаи Д., Рейк В., Шофилд П.Н., Махер Э.Р. (июль 1999 г.). «Анализ мутаций CDKN1C (p57KIP2) зародышевой линии при семейном и спорадическом синдроме Беквита-Видемана (BWS) обеспечивает новую корреляцию генотип-фенотип». Журнал медицинской генетики . 36 (7): 518–23 . doi :10.1136/jmg.36.7.518. ПМЦ  1734395 . ПМИД  10424811.
  • Reynaud EG, Leibovitch MP, Tintignac LA, Pelpel K, Guillier M, Leibovitch SA (июнь 2000 г.). «Стабилизация MyoD путем прямого связывания с p57(Kip2)». Журнал биологической химии . 275 (25): 18767– 76. doi : 10.1074/jbc.M907412199 . PMID  10764802.
  • Fink JR, LeBien TW (апрель 2001 г.). «Новая экспрессия ингибиторов циклинзависимой киназы в предшественниках В-клеток человека». Experimental Hematology . 29 (4): 490– 8. doi : 10.1016/S0301-472X(01)00619-1 . PMID  11301189.
  • Kido K, Doerks A, Lochelt M, Flügel RM (апрель 2002 г.). «Идентификация и функциональная характеристика внутригенного сайта связывания ДНК для трансактиватора spumaretroviral в гене человека p57Kip2». Журнал биологической химии . 277 (14): 12032– 9. doi : 10.1074/jbc.M108747200 . PMID  11815601.
  • Balint E, Phillips AC, Kozlov S, Stewart CL, Vousden KH (март 2002 г.). "Индукция экспрессии p57(KIP2) с помощью p73beta". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (6): 3529– 34. Bibcode : 2002PNAS...99.3529B. doi : 10.1073/pnas.062491899 . PMC  122557. PMID  11891335 .
  • Ito Y, Yoshida H, Nakano K, Kobayashi K, Yokozawa T, Hirai K, Matsuzuka F, Matsuura N, Kuma K, Miyauchi A (апрель 2002 г.). «Экспрессия белка p57/Kip2 в нормальных и неопластических тканях щитовидной железы». Международный журнал молекулярной медицины . 9 (4): 373– 6. doi :10.3892/ijmm.9.4.373. PMID  11891530.
  • Kikuchi T, Toyota M, Itoh F, Suzuki H, Obata T, Yamamoto H, Kakiuchi H, Kusano M, Issa JP, Tokino T, Imai K (апрель 2002 г.). «Инактивация p57KIP2 гиперметилированием регионального промотора и деацетилированием гистонов в опухолях человека». Oncogene . 21 (17): 2741– 9. doi : 10.1038/sj.onc.1205376 . PMID  11965547.
  • Li Y, Nagai H, Ohno T, Yuge M, Hatano S, Ito E, Mori N, Saito H, Kinoshita T (октябрь 2002 г.). «Аберрантное метилирование ДНК гена p57(KIP2) в промоторной области при лимфоидных злокачественных новообразованиях фенотипа B-клеток». Blood . 100 (7): 2572– 7. doi : 10.1182/blood-2001-11-0026 . PMID  12239171. S2CID  13999973.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Ингибитор_циклинзависимой_киназы_1C&oldid=1205383599"