Фермент, разрушающий оксалаты

Фермент , разрушающий оксалат, — это тип фермента , который катализирует биодеградацию оксалата . Ферменты этого класса включают оксалатоксидазу , оксалатдекарбоксилазу , оксалил-КоА-декарбоксилазу и формил-КоА-трансферазу .

Специфические ферменты

Оксалатоксидаза ( ферментная комиссия номер EC 1.2.3.4 ^[2] ) встречается в основном в растениях. Она может расщеплять щавелевую кислоту на углекислый газ и перекись водорода . ^[3]

Оксалатдекарбоксилаза (OXDC, EC 4.1.1.2) — это разновидность фермента, разрушающего оксалат, содержащего Mn2 ⁺ , ^[4], встречающегося в основном в грибах или некоторых бактериях. Грибы бурой гнили выделяют оксалат для разрушения целлюлозных волокон древесины, но используют этот фермент для обеспечения регуляторного контроля над общим количеством присутствующего оксалата. ^[5] Он может появляться в отсутствие других кофакторов под действием деградации щавелевой кислоты непосредственно с образованием муравьиной кислоты и _CO2 .

Оксалил-КоА-декарбоксилаза ( EC 4.1.1.8) в основном опосредует деградацию бактериальной щавелевой кислоты.

Формил-КоА-трансфераза ( КФ 2.8.3.16) опосредует обмен оксалиловых и формильных групп на коферменте А , взаимопревращая формил-КоА и оксалил-КоА.

Камни из оксалата кальция и ферменты, разрушающие оксалаты

Оксалат кальция является основным компонентом наиболее распространенного типа почечных камней у людей.

Ссылки

^ Гибсон, Маркус И.; и др. (2016-01-12). "Одноуглеродная химия оксалатоксидоредуктазы, зафиксированная рентгеновской кристаллографией" (PDF) . Труды Национальной академии наук . 113 (2). PNAS: 320– 325. doi :10.1073/pnas.1518537113.
^ Дэниел Л. Пурич, Р. Дональд Эллисон (4 января 2003 г.). Справочник по ферментам: всеобъемлющее руководство по номенклатуре ферментов, реакциям и методам . Academic Press. стр. 633. ISBN 9780125680417.
^ G. Alan Rose, ред. (2012-12-06). Метаболизм оксалатов в связи с мочевыми камнями. Springer. стр. 50. ISBN 9781447116264.
^ Запись ENZYME: EC 4.1.1.2, портал биоинформатических ресурсов ExPASy, доступ 19 марта 2017 г.
^ Хаструп, Энн Кристин Стенкьер; Грин, Фредерик III; Лебоу, Патрисия К.; Йенсен, Бо (2012). «Ферментативная регуляция щавелевой кислоты, коррелирующая с деградацией древесины у четырех грибов бурой гнили» (PDF) . Международная биодеградация и биодеградация . 75 : 109–114 . doi :10.1016/j.ibiod.2012.05.030.

[1] Гибсон, Маркус И.; и др. (2016-01-12). "Одноуглеродная химия оксалатоксидоредуктазы, зафиксированная рентгеновской кристаллографией" (PDF) . Труды Национальной академии наук . 113 (2). PNAS: 320– 325. doi :10.1073/pnas.1518537113.

[Purich-2] Дэниел Л. Пурич, Р. Дональд Эллисон (4 января 2003 г.). Справочник по ферментам: всеобъемлющее руководство по номенклатуре ферментов, реакциям и методам . Academic Press. стр. 633. ISBN 9780125680417.

[3] G. Alan Rose, ред. (2012-12-06). Метаболизм оксалатов в связи с мочевыми камнями. Springer. стр. 50. ISBN 9781447116264.

[4] Запись ENZYME: EC 4.1.1.2, портал биоинформатических ресурсов ExPASy, доступ 19 марта 2017 г.

[5] Хаструп, Энн Кристин Стенкьер; Грин, Фредерик III; Лебоу, Патрисия К.; Йенсен, Бо (2012). «Ферментативная регуляция щавелевой кислоты, коррелирующая с деградацией древесины у четырех грибов бурой гнили» (PDF) . Международная биодеградация и биодеградация . 75 : 109–114 . doi :10.1016/j.ibiod.2012.05.030.