OpenGALEN

OpenGALEN — некоммерческая организация, предоставляющая медицинскую терминологию с открытым исходным кодом . Эта терминология написана на формальном языке GRAIL (GALEN Representation And Integration Language) ^[1] и также распространяется в OWL .

Технологии GALEN были разработаны при финансировании исследований, предоставленном программами Европейского сообщества Framework III (проект GALEN) и Framework IV (проект GALEN-In-Use).

На ранних этапах программы GALEN был разработан язык моделирования концепций GRAIL, проведены эксперименты с различными структурами для общей референтной модели GALEN и параллельно проверена полезность подхода с помощью серии клинических демонстрационных проектов.

Более поздние этапы программы GALEN, в конце 1990-х годов, были сосредоточены на надежных реализациях GRAIL и сервера терминологии , разработке общей справочной модели GALEN как в объеме, так и в деталях, а также на разработке инструментов и методов, позволяющих дальнейшее развитие, масштабирование и обслуживание модели. Важным дополнительным фокусом была разработка инструментов и методов, с помощью которых мы можем сопоставлять информацию, найденную в существующих схемах кодирования и медицинской классификации , с общей справочной моделью GALEN .

OpenGALEN был создан как некоммерческий голландский фонд университетами Манчестера и Неймегена с целью сделать результаты проектов GALEN доступными всему миру.

Общая справочная модель GALEN — это модель медицинских концепций (или клинической терминологии), которая строится в GRAIL. Эта модель формирует базовую структурную основу для услуг, предоставляемых сервером терминологии GALEN .

Общая справочная модель GALEN написана на формальном языке GRAIL (см. ниже). Выражения GRAIL в модели эквивалентны предложениям вроде этих:

• Язва — это разновидность воспалительного поражения
• Процесс, результатом которого является язва, называется изъязвлением.
• Желудок является частью желудочно-кишечного тракта.
• Имеет смысл говорить о язвах, расположенных в желудке.
• Язвы, расположенные в желудке, называются язвами желудка.
• Язвы, расположенные в желудке, на самом деле расположены на слизистой оболочке стенки желудка.

Общая эталонная модель GALEN доступна в OpenGALEN Foundation как программное обеспечение с открытым исходным кодом.

Инструменты и технологии GALEN использовались во Франции для разработки французской классификации процедур Classification Commune des Actes Médicaux (CCAM).

• Ректор, А.; Роджерс, Дж.; Занстра, П .; Ван дер Харинг, Э. (2003). «OpenGALEN: Медицинская терминология и инструменты с открытым исходным кодом». Труды ежегодного симпозиума AMIA . 2003 : 982. PMC  1480228. PMID  14728486.
• Ректор, А .; Соломон, В.; Ноулан, В.; Раш, Т.; Занстра, П.; Классен, В. (1995). «Сервер терминологии для медицинских языковых и информационных систем». Методы информации в медицине . 34 ( 1– 2): 147– 157. doi : 10.1055/s-0038-1634569. hdl : 2066/21859 . PMID  9082124. S2CID  7978610.
• Ректор, А.; Занстра, П.; Соломон, В.; Роджерс, Дж.; Бод, Р.; Койстерс, В.; Клаассен, В.; Кирби, Дж.; Родригес, Дж.; Росси Мори, АР; Ван дер Харинг, Э.Дж.; Вагнер, Дж. (1998). «Согласование потребностей пользователей и формальных требований: проблемы разработки повторно используемой онтологии для медицины». Труды IEEE по информационным технологиям в биомедицине . 2 (4): 229– 242. doi :10.1109/4233.737578. PMID  10719533. S2CID  10702025.
• Роджерс, Дж.; Робертс, А.; Соломон, Д.; Ван дер Харинг, Э.; Вро, К.; Занстра, П.; Ректор, А. (2001). «GALEN десять лет спустя: задачи и вспомогательные инструменты». Исследования в области медицинских технологий и информатики . 84 (ч. 1): 256–260 . PMID  11604744.
• Ten Napel, H.; Rogers, J. (2001). «Оценка методологии GALEN по целостным классификациям для профессий, связанных с медициной». Исследования по технологиям здравоохранения и информатике . 84 (Pt 2): 1369– 1373. PMID  11604951.
• Роджерс, Дж.; Ректор, А. (2000). «Модель частей и целых ГАЛЕНА: Опыт и сравнения». Труды ежегодного симпозиума AMIA : 714–718 . PMC  2243933. PMID  11079977 .
• Соломон, В.; Робертс, А.; Роджерс, Дж.; Роу, К.; Ректор, А. (2000). «Съесть пирог и удержать его: как промежуточное представление GALEN примиряет внутреннюю сложность с требованиями пользователей к уместности и простоте». Труды ежегодного симпозиума AMIA : 819– 823. PMC  2244105. PMID  11079998 .
• Роджерс, Дж. (2006). «Обеспечение качества медицинских онтологий». Методы информации в медицине . 45 (3): 267– 274. doi :10.1055/s-0038-1634078. PMID  16685334. S2CID  9398450.

• Веб-сайт OpenGALEN
• CCAM, Классификация Коммуны медицинской практики
• Манчестерский университет, Группа биомедицинской информатики
• Университет Неймегена, медицинская информатика