Во время учебы во ВГИКе Эген снял короткометражные фильмы «На день старше» (1998) и «Закрытое пространство» (1999). Его короткометражный фильм «Санжыра» был участником конкурсных программ более 50 международных фестивалей и получил премию «Лучший короткометражный иностранный фильм» на конкурсе Young Artist Awards в Лос-Анджелесе , США.
«Свадебный сундук» , художественный фильм Эгена об Айдаре, вернувшемся из Парижа в родной аил со своей французской невестой Изабель, получил премию «Лучший иностранный фильм» на церемонии вручения премии Young Artist Awards в Лос-Анджелесе , США, а также приз зрительских симпатий на кинофестивале в Котбусе, Германия . FBW ( Deutsche Film- und Medienbewertung ), немецкий федеральный орган по оценке и рейтингу кино и медиа, присвоил фильму сертификационный знак Wertvoll (ценный) за его высокое художественное качество.
В своих произведениях Нурбек Эген неоднократно обращается к родной культуре и традициям. Современная общественно-политическая жизнь Кыргызстана , а также его предыстория и культурное прошлое нашли отражение в его документальном фильме « Рождение Манаса как предчувствие» .
Социальная драма Эгена «Пустой дом » (2012) поднимает одну из самых актуальных и острых тем — эмиграцию, взаимопроникновение и взаимное отторжение разных культур, национальную идентичность. Фильм получил приз за лучший художественный фильм на 10-м Международном кинофестивале «Звезды Шакена» в Алматы, Казахстан.
В настоящее время Эген активно занимается кино- и телепроизводством.
Награды
1998 - Международный кинофестиваль Camerimage в Торуни, Польша - Бронзовый приз Tadpole (One Day Older)
1998 - Пятый фестиваль студенческих и дебютных фильмов «Святая Анна» - Первая премия фестиваля (за фильм «На день старше»)
1998 - 18-й Фестиваль ВГИК в Москве, Россия - Специальная премия Kodak «За выразительность камеры» (One Day Older)
1998 - Международный кинофестиваль «Послание к человеку» в Санкт-Петербурге, Россия
1998 - Международный кинофестиваль Tous Ecrans в Женеве, Швейцария.
2001 — номинация на премию «Оскар» в категории «Лучший студенческий фильм»
2001 - VIII Фестиваль студенческих и дебютных фильмов «Святая Анна» - Специальный приз Союза кинематографистов России «За следование гуманистической традиции отечественного кино» (Санжыра)
2001 — Международный кинофестиваль Ciné Cinécourt в Экс-ан-Провансе, Франция — Специальный приз жюри/Prix Ciné Cinécourts (Санжира)
2001 - Международный кинофестиваль в Амьене, Франция (Санжира)
2001 - 51-й Берлинский международный кинофестиваль, Германия - Kinderfilmfest (Санжыра)
2001 - 36-й Международный кинофестиваль в Карловых Варах, Чехия (Санжира)
2001 - Международный фестиваль в Капальбио, Италия - Специальный приз жюри (Санжыра)
2002 – Международный кинофестиваль Young Artist Awards в Лос-Анджелесе, США – Лучший короткометражный иностранный фильм («Санжыра»)
2002 - 16-й Международный кинофестиваль во Фрибурге, Швейцария (Санжира)
2002 - Эдинбургский международный кинофестиваль, Великобритания (Санжыра)
2002 - Всемирный кинофестиваль в Монреале, Канада (Санжыра)
2002 - Международный фестиваль фильмов об окружающей среде в Барселоне (FICMA), Испания - Приз за лучший короткометражный фильм («Санжыра»)
2002 - Международный кинофестиваль в Биаррице, Франция - Вторая премия (Санжыра)
2002 - Международный кинофестиваль в Ливии - Первая премия за лучший короткометражный фильм (Санжыра)
2002 - Фестиваль дебютного кино «Дух огня» в Ханты-Мансийске, Россия - Приз за лучший кадр фильма («Санжыра»)
2005 — Номинация на премию «Оскар» в категории «Лучший иностранный фильм» («Свадебный сундук»)
2006 - Международный кинофестиваль Young Artist Awards в Лос-Анджелесе, США - Премия за выдающуюся международную драму (Свадебный сундук)
2006 - Котбусский кинофестиваль молодого восточноевропейского кино, Германия - Приз зрительских симпатий, номинация на Главный приз (Свадебный сундук)
2006 - 41-й Международный кинофестиваль в Карловых Варах, Чехия - конкурсная программа (Сундук для бракосочетания)
2006 — Открытый кинофестиваль стран СНГ, Латвии, Литвы, Эстонии «Киношок» в Анапе — Специальный диплом жюри, Приз за лучший режиссерский дебют («Сундук свадебный»)
2006 - II Международный кинофестиваль «Золотой минбар» в Казани, Россия - Приз лучшему оператору, Специальный приз Президента Республики Татарстан за гуманизм в киноискусстве (фильм «Сундук с сокровищами»)
2006 - Международный кинофорум «Золотой Витязь» в Серпухове, Россия - Премия «Серебряный Витязь», Премия за лучшую операторскую работу, Премия за лучшую мужскую роль («Сундук невестки»)
2006 - Фестиваль кино и театра «Амурская осень» в Благовещенске, Россия - Приз за лучший сценарий («Сундук невестки»)
2006 - 3-й Международный кинофестиваль «Евразия» в Алматы, Казахстан - Специальный приз жюри («Сундук для невесты»)
2006 — Кинофестиваль «Новое кино» — Приз за лучшую режиссуру («Сундук для невесты»)