Семья НхаБ

Семейство NhaB (TC# 2.A.34) принадлежит к суперсемейству транспортеров ионов (IT) . ^[1] Представительный список белков, принадлежащих к семейству NhaB, можно найти в базе данных классификации транспортеров.

Гомологи NhaB обычно имеют длину около 500 аминоацильных остатков (aas) и обладают около 12 трансмембранными альфа-спиральными путями (TMS), хотя некоторые члены различаются по количеству TMS. Гомологи NhaB также демонстрируют область с ограниченным сходством последовательности с мембранным белком 46 кДа неизвестной функции из Mycobacterium leprae (spP46838), который также гомологичен члену насосов устойчивости к арсенату бактерий , архей и эукариот (TC# 3.A.4). Функционально охарактеризованы только грамотрицательные бактериальные белки.

E. coli NhaB на 58% идентичен ортологичному антипортеру Na ⁺ /H ⁺Vibrio alginolyticus . ^[2] Хотя последний белок, как предполагается, демонстрирует 10 TMS, построение слияний NhaB-phoA привело к доказательству модели из 9 TMS с N-концом в цитоплазме и C-концом в периплазме . ^[3] Расположенный в центре остаток аспартила в 3-м TMS сохраняется у всех членов семейства и важен для активности. ^[4]

Обобщенная транспортная реакция, катализируемая NhaB E. coli, выглядит следующим образом:

2 Na ⁺ (вход) + 3 H ⁺ (выход) ⇌ 2 Na ⁺ (выход) + 3 H ⁺ (вход).

Смотрите также

Ссылки

^ Пракаш, Шраддха; Купер, Гаррет; Сингхи, Сумья; Сайер, Милтон Х. (3 декабря 2003 г.). «Суперсемейство переносчиков ионов». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1618 (1): 79–92 . doi :10.1016/j.bbamem.2003.10.010. ISSN 0006-3002. ПМИД 14643936.
^ Пиннер, Э.; Падан, Э.; Шульдинер, С. (1992-06-05). «Клонирование, секвенирование и экспрессия гена nhaB, кодирующего антипортер Na+/H+ в Escherichia coli». Журнал биологической химии . 267 (16): 11064– 11068. doi : 10.1016/S0021-9258(19)49875-X . ISSN 0021-9258. PMID 1317851.
^ Эномото, Х.; Унемото, Т.; Нишибучи, М.; Падан, Э.; Накамура, Т. (6 марта 1998 г.). «Топологическое исследование антипортера Vibrio alginolyticus NhaB Na+/H+ с использованием слияния генов в клетках Escherichia coli». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1370 (1): 77–86 . doi : 10.1016/s0005-2736(97)00245-9 . ISSN 0006-3002. ПМИД 9518558.
^ Накамура, Т.; Фудзисаки, Ю.; Эномото, Х.; Накаяма, Ю.; Такабе, Т.; Ямагучи, Н.; Уозуми, Н. (1 октября 2001 г.). «Остаток аспартата-147 из третьей трансмембранной области Na(+)/H(+)-антипортера NhaB Vibrio alginolyticus играет роль в его активности». Журнал бактериологии . 183 (19): 5762–5767 . doi :10.1128/JB.183.19.5762-5767.2001. ISSN 0021-9193. ПМК 95471 . ПМИД 11544242.

На момент редактирования эта статья использует контент из "2.A.34 The NhaB Na+:H+ Antiporter (NhaB) Family" , который лицензирован таким образом, что позволяет повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , но не в соответствии с GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.

Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[:0-1] Пракаш, Шраддха; Купер, Гаррет; Сингхи, Сумья; Сайер, Милтон Х. (3 декабря 2003 г.). «Суперсемейство переносчиков ионов». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1618 (1): 79–92 . doi :10.1016/j.bbamem.2003.10.010. ISSN 0006-3002. ПМИД 14643936.

[2] Пиннер, Э.; Падан, Э.; Шульдинер, С. (1992-06-05). «Клонирование, секвенирование и экспрессия гена nhaB, кодирующего антипортер Na+/H+ в Escherichia coli». Журнал биологической химии . 267 (16): 11064– 11068. doi : 10.1016/S0021-9258(19)49875-X . ISSN 0021-9258. PMID 1317851.

[3] Эномото, Х.; Унемото, Т.; Нишибучи, М.; Падан, Э.; Накамура, Т. (6 марта 1998 г.). «Топологическое исследование антипортера Vibrio alginolyticus NhaB Na+/H+ с использованием слияния генов в клетках Escherichia coli». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1370 (1): 77–86 . doi : 10.1016/s0005-2736(97)00245-9 . ISSN 0006-3002. ПМИД 9518558.

[4] Накамура, Т.; Фудзисаки, Ю.; Эномото, Х.; Накаяма, Ю.; Такабе, Т.; Ямагучи, Н.; Уозуми, Н. (1 октября 2001 г.). «Остаток аспартата-147 из третьей трансмембранной области Na(+)/H(+)-антипортера NhaB Vibrio alginolyticus играет роль в его активности». Журнал бактериологии . 183 (19): 5762–5767 . doi :10.1128/JB.183.19.5762-5767.2001. ISSN 0021-9193. ПМК 95471 . ПМИД 11544242.