Ген NDUFB4, расположенный на плече q хромосомы 3 в позиции 13.33, имеет длину 6130 пар оснований. Белок NDUFB4 весит 15 кДа и состоит из 129 аминокислот. [6] [7] NDUFB4 является субъединицей фермента NADH-дегидрогеназы (убихинон) , самого большого из дыхательных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильным доменом для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH. [5] NDUFB4 является одной из примерно 31 гидрофобных субъединиц, которые образуют трансмембранную область комплекса I, и является некаталитической субъединицей комплекса. Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен имеет потенциал для сворачивания в альфа-спираль, охватывающую внутреннюю митохондриальную мембрану , с C-концевым гидрофильным доменом, взаимодействующим с глобулярными субъединицами Комплекса I. Высококонсервативная двухдоменная структура предполагает, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для комплекса НАДН-дегидрогеназы (убихинон) на внутренней митохондриальной мембране. [4]
Функция
Ген человека NDUFB4 кодирует субъединицу комплекса I дыхательной цепи , которая переносит электроны от NADH к убихинону . [4] Однако NDUFB4 является вспомогательной субъединицей комплекса, которая, как полагают, не участвует в катализе. [8] Комплекс I млекопитающих состоит из 45 различных субъединиц. Он располагается на внутренней мембране митохондрий . Этот белковый комплекс обладает активностью NADH-дегидрогеназы и оксидоредуктазной активностью. Он переносит электроны от NADH к дыхательной цепи . Непосредственным акцептором электронов для фермента, как полагают, является убихинон . [4] Первоначально NADH связывается с комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо простетического плеча флавинмононуклеотида (FMN) , образуя FMNH 2 . Электроны переносятся через ряд кластеров железа и серы (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH 2 ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизированной боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриальной матрицы. [5]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000065518 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ abc Voet D , Voet JG , Pratt CW (2013). "Глава 18". Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Hoboken, NJ: Wiley. стр. 581– 620. ISBN978-0-470-54784-7.
^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний». Circulation Research . 113 (9): 1043–53 . doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338 .
^ "NADH-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета субкомплекс субъединица 4". База знаний по атласу белков сердечной органеллы (COPaKB) .
^ "NDUFB4 - NADH-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета субкомплекс субъединица 4". UniProt: хаб для информации о белках . Консорциум UniProt . Получено 2 апреля 2015 г.