Микобактероиды абсцесс

Виды бактерий

Микобактероиды абсцесс
Штамм Mycobacteroides abscessus GD01, выделенный от пациента
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Актиномицеты
Сорт:Актиномицеты
Заказ:Микобактерии
Семья:Микобактерии
Род:Микобактероиды
Разновидность:
М. абсцесс
Биномиальное имя
Микобактероиды абсцесс
(Мур и Фрерихс, 1953) Гупта и др. 2018 [1]
Тип штамма [2]
ATCC 19977
CCUG 20993
CIP 104536
DSM 43491
DSM 44196
Hauduroy L948
JCM 13569
L948
NCTC 13031
TMC 1543
Подвиды
  • M. a. subsp. abscessus (Мур и Фрерихс 1953) Гупта и др. 2018
  • М. а. подвид bolletii (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018 год
  • М. а. подвид Massiliense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018 год
Синонимы [1]
  • « Mycobacterium abscessus » Мур и Фрерихс, 1953 г.
  • Mycobacterium abscessus (Мур и Фрерихс, 1953) Кусуноки и Эзаки, 1992
  • Mycobacterium bolletii Adékambi et al. 2006 г.
  • Mycobacterium chelonae subsp. абсцесс корриг. (Мур и Фрерихс, 1953) Кубица и др. 1972 г. (утвержденные списки 1980 г.)
  • Mycobacterium chelonei subsp. abscessus (Мур и Фрерихс, 1953 г.) Кубица и др., 1972 г. (Утвержденные списки, 1980 г.)
  • Mycobacterium Massiliense Adékambi et al. 2006 г.

Mycobacteroides abscessus (ранее Mycobacterium abscessus [1] ) — это вид быстрорастущих, устойчивых ко многим лекарственным препаратам , нетуберкулезных микобактерий (НТМ), которые являются распространенным загрязнителем почвы и воды. Хотя M. abscessus чаще всего вызывает хроническую инфекцию легких и инфекцию кожи и мягких тканей (ИКМТ), он также может вызывать инфекцию практически во всех органах человека, в основном у пациентов с подавленной иммунной системой . [3] Среди видов НТМ, ответственных за заболевание, инфекция, вызванная комплексом M. abscessus , труднее поддается лечению из-за устойчивости к противомикробным препаратам. [4]

M. abscessus , выращенный в среде на основе крахмала в чашке Петри : колонии выглядят как светло-желтые полосы.

Описание

Клетки Mycobacteroides abscessus — грамположительные , неподвижные, кислотоустойчивые палочки длиной около 1,0–2,5 мкм и шириной 0,5 мкм. Они могут образовывать колонии на среде Левенштейна–Йенсена , которые кажутся гладкими или шероховатыми, белыми или сероватыми и нефотохромогенными . [ требуется цитата ]

Этимология

Abscessus назван в честь абсцессов . Это латинское слово, происходящее от ab- («прочь») + cedere («идти»), поскольку в древности считалось, что проявлением четырех жидкостей является выход гноя из организма. M. abscessus был впервые выделен из ягодичных абсцессов у 62-летней пациентки, которая в детстве повредила колено и 48 лет спустя перенесла диссеминированную инфекцию. Вид M. bolletii , впервые описанный в 2006 году, назван в честь покойного выдающегося французского микробиолога и таксономиста Клода Болле. [ необходима цитата ]

Физиология

M. abscessus показывает рост при 28 °C и 37 °C через 7 дней, но не при 43 °C. Он может расти на агаре Макконки при 28 °C и даже 37 °C. Он показывает устойчивость к солевым средам (5% NaCl) и 500 мг/л гидроксиламина (среда с яйцами Огавы) и 0,2% пикрата (среда с агаром Сотона). Было показано, что штаммы этого вида разрушают антибиотик p -аминосалицилат . Было также показано, что M. abscessus продуцирует арилсульфатазу , но не нитратредуктазу и гидролазу Твин 80. Он показывает отрицательный результат в тесте на поглощение железа и не использует фруктозу , глюкозу , оксалат или цитрат в качестве единственных источников углерода. [ необходима цитата ]

Отличительные характеристики

M. abscessus и M. chelonae можно отличить от M. fortuitum или M. peregrinum по их неспособности восстанавливать нитрат и поглощать железо. Устойчивость к 5% NaCl в среде Левенштейна-Йенсена, устойчивость к 0,2% пикрата в агаре Саутона и неиспользование цитрата в качестве единственного источника углерода являются характеристиками, которые отличают M. abscessus от M. chelonae . M. abscessus и M. chelonae sequevar I имеют одинаковую последовательность в области 54-510 16S рРНК , хотя оба вида можно дифференцировать по последовательностям генов hsp65 , ITS или rpoB . [ требуется ссылка ]

Генетика

Проект последовательности генома M. abscessus subsp. bolletii BD T был завершен в 2012 году. [5] С тех пор было секвенировано геномов большого количества штаммов этого подвида , что привело к уточнению границ подвидов. В 1992 году M. abscessus был впервые признан отдельным видом. В 2006 году эта группа была разделена на три подвида: M. a. abscessus , M. a. bolletii и M. a. massiliense . В 2011 году последние два были ненадолго объединены в один подвид, [6] но впоследствии были снова разделены после большей доступности данных о последовательности генома, которые показали, что три подвида образуют генетически различные группы. [7] [8] Было предложено восстановить M. bolletii и M. massiliense в качестве уникальных видов. [9]

Эти отдельные группы также соответствуют важным биологическим различиям. Клинически важные различия включают различную восприимчивость к антибиотикам. M. a. abscessus и M. a. bolletii несут общий ген устойчивости к антибиотикам , который обеспечивает устойчивость к макролидным антибиотикам , в то время как M. a. massiliense , как полагают, несет нефункциональную копию, поэтому более восприимчив к антибиотикам и легче поддается лечению. [7]

Патогенез

M. abscessus может вызывать заболевания легких , кожные инфекции, инфекции центральной нервной системы , бактериемию , инфекции глаз и другие, менее распространенные заболевания. [7]

Хроническое заболевание легких чаще всего встречается у уязвимых хозяев с фоновым заболеванием легких, таким как муковисцидоз , бронхоэктазы и предшествующий туберкулез . Клинические симптомы инфекции легких различаются по масштабу и интенсивности, но обычно включают хронический кашель, часто с гнойной мокротой. Также может присутствовать кровохарканье . Системные симптомы включают недомогание , усталость и потерю веса при запущенном заболевании. [10] Диагноз легочной инфекции M. abscessus требует наличия симптомов, рентгенологических отклонений и микробиологических культур . [ требуется ссылка ]

M. abscessus может вызывать кожные инфекции у пациентов с иммунодефицитом, у пациентов, недавно перенесших операцию, татуировку или иглоукалывание , или после воздействия горячих источников или спа. [7] Это может быть связано с инфекциями среднего уха ( средний отит ). [11]

Частота инфекций M. abscessus , по-видимому, со временем увеличивается. [7] [12] Вспышки M. abscessus были зарегистрированы в больницах и клинических учреждениях по всему миру. [13] В то время как вспышки, представляющие серьезную клиническую проблему, связаны с передачей (скорее всего, непрямой передачей) между уязвимыми пациентами, такими как те, кто получает трансплантацию легких или проходит лечение от муковисцидоза, вспышки также были зарегистрированы в клиниках, предоставляющих услуги косметической хирургии, липосакции , мезотерапии и внутривенного вливания клеточной терапии, хотя они больше связаны с загрязненными дезинфицирующими средствами, физиологическим раствором и инструментами, чем с контактом между пациентами. [7]

Управление

Бактериофаговая терапия

Исследование, проведенное в 2019 году, подтвердило способность фагов убивать устойчивые бактерии, не поддающиеся лечению антибиотиками. [14] Исследовательские лаборатории объединили усилия, чтобы найти эти фаги, собирая, изолируя и подвергая их воздействию устойчивых M. abscessus , которые были выделены у пациента в Лондоне. [14]

В пробирке

Бактериофаг, известный как Muddy, оказался эффективным в уничтожении штамма M. abscessus (GD01) у пациента , в то время как фаги, такие как ZoeJ и BP, имели сниженные возможности заражения GD01. [14] Однако смесь фагов, Muddy и сконструированных версий ZoeJ и BP полностью заразила и убила GD01. [14]

В естественных условиях

Коктейль из бактериофагов, Muddy, ZoeJ и BPs эффективно убил штамм M. abscessus in vitro . [14] Потенциал, который это показало, побудил начать лечение пациентов от инфекции GD01. [14] Каждые 12 часов пациент получал лечение коктейлем из бактериофагов. [14]

Один день лечения показал высокий уровень бактериофагов в кровотоке. [14] Это говорит о том, что они высвобождаются в кровоток и размножаются, чтобы заразить бактерии. [14] О существенных побочных эффектах не сообщалось. [14] Для этого пациента были найдены правильные фаги, но другой штамм может быть чувствителен к другим фагам. [14]

Тип штамма

Типовой штамм M. abscessus , чаще всего называемый ATCC 19977, был выделен в 1953 году из инфекции колена человека, проявляющейся в виде абсцессоподобных поражений, в результате чего штамм был назван « abscessus ». [15] Штамм не был признан отдельным видом до 1992 года, однако, когда работа по гибридизации ДНК идентифицировала его как генетически отличный от его родственника, M. chelonae . [16] Геном типового поезда был опубликован в 2009 году. [17]

Ссылки

В данной статье использован текст из CDC, являющийся общественным достоянием, как указано

  1. ^ abc Gupta, Radhey S.; Lo, Brian; Son, Jeen (2018-02-13). «Филогеномика и сравнительные геномные исследования убедительно поддерживают разделение рода Mycobacterium на исправленный род Mycobacterium и четыре новых рода». Frontiers in Microbiology . 9 : 67. doi : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN  1664-302X. PMC 5819568.  PMID 29497402  .
  2. ^ Euzéby JP, Parte AC. "Mycobacteroides abscessus". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 24 июня 2022 г.
  3. ^ Сон, Джун Ён; Сон, Чан Ук; Чон, Хе Вон; Чонг, Хи Джин; Ким, У Джу; Ким, Мин Джа (13.01.2006). «Вспышка кожной инфекции после акупунктуры, вызванной Mycobacterium abscessus». BMC Infectious Diseases . 6 : 6. doi : 10.1186/1471-2334-6-6 . ISSN  1471-2334. PMC 1361796. PMID 16412228  . 
  4. ^ Ли и др. (2015). «Инфекции комплекса абсцессов микобактерий у людей». Emerg Infect Dis . 21 (9): 1638– 1646. doi :10.3201/2109.141634. PMC 4550155. PMID  26295364 . 
  5. ^ Choi, G.-E.; Cho, Y.-J.; Koh, W.-J.; Chun, J.; Cho, S.-N.; Shin, SJ (24 апреля 2012 г.). "Проект последовательности генома Mycobacterium abscessus subsp. bolletii BDT". Журнал бактериологии . 194 (10): 2756– 2757. doi :10.1128/JB.00354-12. PMC 3347169. PMID 22535937  . 
  6. ^ Leao, SC; Tortoli, E; Euzéby, JP; Garcia, MJ (сентябрь 2011 г.). «Предложение об объединении Mycobacterium massiliense и Mycobacterium bolletii и их переклассификации в Mycobacterium abscessus subsp. bolletii comb. nov., обозначение Mycobacterium abscessus subsp. abscessus subsp. nov. и исправленное описание Mycobacterium abscessus». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (Pt 9): 2311– 3. doi : 10.1099/ijs.0.023770-0 . PMID  21037035.
  7. ^ abcdef Ли, Мэн-Руй; Шэн, Ван-Хуэй; Хун, Чиен-Чин; Ю, Чун-Джен; Ли, Ли-На; Сюэ, По-Рен (сентябрь 2015 г.). «Комплексные инфекции Mycobacterium abscessus у людей». Новые инфекционные заболевания . 21 (9): 1638– 46. doi :10.3201/2109.141634. PMC 4550155. PMID  26295364 . 
  8. ^ Tortoli E, Kohl TA, Brown-Elliott BA, Trovato A, Leao SC, Garcia MJ, Vasireddy S, Turenne CY, Griffith DE, Philley JV, Baldan R, Campana S, Cariani L, Colombo C, Taccetti G, Teri A, Niemann S, Wallace Jr RJ, Cirillo DM. (2016). "Исправленное описание Mycobacterium abscessus , Mycobacterium abscessus subsp. abscessus и Mycobacterium abscessus subsp. bolletii и обозначение Mycobacterium abscessus subsp. massiliense comb. nov". Int J Syst Evol Microbiol . 66 (11): 4471– 4479. doi :10.1099/ijsem.0.001376. PMID  27499141.
  9. ^ Сасси М., Дранкур М. (2014). «Анализ генома выявил три геномовида в Mycobacterium abscessus». BMC Genomics . 15 (1): 359. doi : 10.1186/1471-2164-15-359 . PMC 4035080. PMID  24886480 . 
  10. ^ Джонсон; Оделл (2014). «Нетуберкулезные микобактериальные легочные инфекции». J Thorac Dis . 6 (3): 210– 220. doi :10.3978 / j.issn.2072-1439.2013.12.24. PMC 3949190. PMID  24624285. 
  11. ^ Linmans JJ, Stokroos RJ, Linssen CF (сентябрь 2008 г.). «Mycobacterium abscessus, редкая причина хронического среднего отита: отчет о случае и обзор литературы». Arch. Otolaryngol. Head Neck Surg . 134 (9): 1004– 6. doi :10.1001/archotol.134.9.1004. PMID  18794448.[ постоянная мертвая ссылка ‍ ]
  12. ^ Маррас, Теодор К.; Мендельсон, Дэвид; Маршанд-Остин, Алекс; Мэй, Кевин; Джеймисон, Фрэнсис Б. (ноябрь 2013 г.). «Легочное нетуберкулезное микобактериальное заболевание, Онтарио, Канада, 1998–2010 гг.». Emerging Infectious Diseases . 19 (11): 1889–1891 . doi :10.3201/eid1911.130737. PMC 3837646. PMID  24210012 . 
  13. ^ Брайант, Жозефина М.; Грогоно, Дороти М.; Родригес-Ринкон, Даниэла; Всегда, Изобель; Браун, Карен П.; Морено, Пабло; Верма, Дипшиха; Хилл, Эмили; Дрейконинген, Юдит; Гиллиган, Питер; Эстер, Чарльз Р.; Никто, Пидар Г.; Гиддингс, Оливия; Белл, Скотт С.; Томсон, Рэйчел; Уэйнрайт, Клэр Э.; Коултер, Крис; Пандей, Сушил; Вуд, Мишель Э.; Стоквелл, Ребекка Э.; Рамзи, Кей А.; Шеррард, Лаура Дж.; Кидд, Тимоти Дж.; Джаббур, Насиб; Джонсон, Грэм Р.; Ниббс, Люк Д.; Моравска, Лидия; Хитрый, Питер Д.; Джонс, Эндрю; Билтон, Диана; Лоуренсон, Ян; Радди, Майкл; Бурк, Стивен; Боулер, Ян CJW; Чепмен, Стивен Дж.; Клейтон, Эндрю; Каллен, Майри; Демпси, Оуэн; Дентон, Майлз; Десаи, Майя; Дрю, Ричард Дж.; Эденборо, Фрэнк; Эванс , Джейсон; Фолб, Джонатан; Дэниелс, Томас; Хамфри, Хелен; Исальска, Барбара; Йенсен-Фангель, Сёрен; Йонссон, Бодил; Джонс, Эндрю М.; Катценштейн, Тереза ​​Л.; Лиллебек, Троелс; МакГрегор, Гордон; Мейелл , Сара; Миллар, Майкл; Мода, Дебора; Нэш, Эдвард Ф.; О'Брайен, Кристофер; О'Брайен, Дейрдре; Охри, Чандра; Пао, Кэролайн С.; Пекхэм, Дэниел; Перрин, Фелисити; Перри, Одри ; Пресслер, Таня; Пртак, Лаура; Квист, Тавс; Робб, Али; Роджерс, Хелен; Шаффер, Кирстен; Шафи, Надя; ван Инген, Якко; Уолшоу, Мартин; Уотсон, Дэни; Уэст, Норин; Уайтхаус, Джоанна; Хаворт, Чарльз С.; Харрис, Саймон Р.; Ордуэй, Дайан; Паркхилл, Джулиан; Флото, Р. Андрес (10 ноября 2016 г.). «Появление и распространение передающейся человеку нетуберкулезной микобактерии с множественной лекарственной устойчивостью». Наука . 354 (6313): 751–757 . Бибкод : 2016Sci...354..751B. doi : 10.1126/science.aaf8156. ПМК 5142603 . ПМИД  27846606. 
  14. ^ abcdefghijk "Сконструированные фаги лечат лекарственно-устойчивые инфекции". Национальные институты здравоохранения (NIH) . 2019-05-20 . Получено 06.11.2019 .
  15. ^ Мур, Моррис; Фрерихс, Джон Б. (февраль 1953 г.). «Необычная кислотоустойчивая инфекция колена с подкожными абсцессоподобными поражениями ягодичной области». Журнал исследовательской дерматологии . 20 (2): 133–169 . doi : 10.1038/jid.1953.18 . PMID  13035193.
  16. ^ Кусуноки, С.; Эзаки, Т.; и др. (1992). «Предложение о Mycobacterium peregrinum sp. nov., nom. rev. и повышение Mycobacterium chelonae subsp. abscessus (Kubica et al.) до статуса вида: Mycobacterium abscessus comb. nov.». Межд. Дж. Сист. Бактериол . 42 (2): 240–245 . doi : 10.1099/00207713-42-2-240 . ПМИД  1581184.
  17. ^ Риполь, Фабьен; Пасек, Софи; Шеновиц, Шанталь; Доссат, Кэрол; Барб, Валери; Роттман, Мартин; Мачерас, Эдуард; Привет, Беате; Херрманн, Жан-Луи; Даффе, Мамаду; Брош, Роланд; Рислер, Жан-Лу; Гайяр, Жан-Луи; Ахмед, Нияз (19 июня 2009 г.). «Гены немикобактериальной вирулентности в геноме нового патогена Mycobacterium abscessus». ПЛОС ОДИН . 4 (6): е5660. Бибкод : 2009PLoSO...4.5660R. дои : 10.1371/journal.pone.0005660 . ПМК 2694998 . PMID  19543527. 
  • Типовой штамм Mycobacteroides abscessus в BacDive - базе метаданных бактериального разнообразия
  • Мабеллини - аннотированный, смоделированный структурный протеом Mycobacteroides abscessus
  • Отчет HHMI об использовании фаговой терапии
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mycobacteroides_abscessus&oldid=1253597781"