Эта статья может быть слишком технической для понимания большинства читателей . ( Май 2019 ) |
Моноцеркомоноиды | |
---|---|
Monocercomonoides melolanthae | |
Научная классификация | |
Домен: | |
(без рейтинга): | |
Тип: | |
Сорт: | |
Заказ: | |
Семья: | Полимастигиды |
Род: | Моноцеркомоноиды Трэвис, 1932 г. |
Разновидность | |
|
Monocercomonoides — род жгутиконосцев Excavata, принадлежащий к отряду Oxymonadida . Он был установлен Бернардом В. Тревисом и впервые был описан как род с «полимастигинидными жгутиконосцами, имеющими три передних жгутика и один задний, берущий начало в одной базальной грануле, расположенной перед расположенным спереди ядром , и более или менее четко выраженным аксостилем ». [14] Это первый эукариотический род, у которого полностью отсутствуют митохондрии и все отличительные белки, отвечающие за функцию митохондрий. У этого рода также отсутствуют какие-либо другие органеллы, связанные с митохондриями (MRO), такие как гидрогеносомы или митосомы . [15] Данные свидетельствуют о том, что отсутствие митохондрий не является предковой особенностью, а скорее вызвано вторичной утратой. Monocercomonoides sp. Было обнаружено, что они получают энергию посредством ферментативного действия питательных веществ, поглощаемых из окружающей среды. [15] Род заменил путь сборки кластера железа и серы на цитозольную систему мобилизации серы, вероятно, приобретенную путем горизонтального переноса генов от эубактерии общего предка оксимонад . [16] Эти организмы имеют важное значение, поскольку они подрывают предположения о том, что эукариоты должны иметь митохондрии для правильного функционирования. Геном Monocercomonoides exilis имеет приблизительно 82 миллиона пар оснований (82 Мбн), с 18 152 предсказанными генами, кодирующими белок . [17]
Большинство видов Monocercomonoides являются облигатными животными симбионтами , которые живут в пищеварительном тракте насекомых, амфибий, рептилий и млекопитающих. [18] Monocercomonoides распространены в отрядах насекомых Orthoptera и Coleoptera . Вид Monocercomonoides qadrii обнаружен в прямой кишке личинки навозного жука ( Oryctes rhinoceros ). [19] M. caviae, M. wenrichi, M. quadrifunilis и M. exilis обнаружены в слепой кишке морских свинок, а M. caprae был обнаружен в рубце коз. [20] Интересно, что некоторые виды Monocercomonoides были выделены из выгребных ям, [21] что позволяет предположить, что они могут выживать вне хозяина в определенных условиях окружающей среды. Организм использует ферменты, находящиеся в его цитоплазме, для расщепления пищи и получения энергии, поскольку митохондрии или присутствие кислорода отсутствуют. [22] Было отмечено, что Monocercomonoides поедают бактерии или древесину и питаются путем пиноцитоза , однако было проведено ограниченное количество исследований по способу питания.
Monocercomonoides — это небольшие свободноплавающие одноклеточные организмы длиной от 5 до 12 мкм и шириной от 4,5 до 14,5 мкм. [19] Тело может быть яйцевидным, грушевидным, сферическим или субсферическим; однако у них отсутствуют фиксаторы и есть небольшие аксостили. [ 23] Аксотиль — это одиночный сокращающийся придаток, состоящий из микротрубочек, который берет начало от заднего конца преаксостиля и расположен около задней пары базальных телец (известных как блефаропласт в старой цитологической литературе). [23] Цитоскелет основан на четырех базальных телах, передней паре и задней паре. [24] Преаксостиль проходит между двумя парами базальных телец и состоит из широкого изогнутого слоя микротрубочек. [24] Внутренняя поверхность слоя микротрубочек прилипает к паракристаллическому волокну (толщиной около 50 нм), что является общей характеристикой всех оксимонад. [24] Monocercomonoides sp. имеет четыре жгутика, которые берут начало в двух парах и возникают из каждого базального тельца, обнаруженного на переднем конце. [23] Три из четырех жгутиков примерно равны по длине (9,5-18 мкм), а четвертый отстающий жгутик немного длиннее, размером от 9,0 до 24,5 мкм. [19] Жгутики обладают биением и используются для быстрого движения. Проксимальная часть длинного жгутика может прилипать к пелликуле, что заставляет его тянуться назад. [23] Отстающий жгутик всегда направлен назад и прикреплен к телу на значительном расстоянии (6-9 мкм) с помощью вспомогательной нити, называемой funis. [19] Имеется от одной до четырех нитей (реброобразных стриктур), простирающихся назад под поверхностью тела. [19] У некоторых паразитов жгутики заканчиваются акронемами. Ядро обычно расположено около переднего конца тела и содержит центральную эндосому, окруженную гранулами хроматина, некоторые виды имеют пельта-подобные структуры под ядром. [23] Цитоплазма зернистая с вакуолями или без них. [23] Электронно-микроскопическое исследование Monocercomonoides показало, что внутриклеточная морфология не имеет аппарата Гольджи , митохондрий или потенциальных гомологов этих двух; были обнаружены ассоциированные с Гольджи белки, но не митохондриальные. [15]
Monocercomonoides sp. штамм PA203 (позже описанный как M. exilis [21] ) является первым эукариотом, у которого, как было обнаружено, отсутствуют какие-либо следы митохондрий. У всех других эукариот, у которых, по-видимому, отсутствуют митохондрии, есть ядерная ДНК, которая содержит некоторые гены, необходимые для сборки митохондрий, но у Monocercomonoides таких генов нет. [15] У него также отсутствуют какие-либо гены, обычно встречающиеся в митохондриальной ДНК, и гены, используемые для создания ферментов, извлекающих энергию, присутствующих в митохондриях. Monocercomonoides способны получать некоторую энергию из глюкозы, используя анаэробные метаболические пути, которые работают в цитоплазме, однако большую часть энергии он получает с помощью ферментов, которые расщепляют аминокислоту аргинин . [24]
Каждая молекула глюкозы, катаболизированная в Monocercomonoides, дает меньше АТФ по сравнению с митохондриальными эукариотами, которые используют цикл трикарбоновых кислот и цепь переноса электронов. [25] Для содействия энергосбережению Monocercomonoides адаптировал альтернативные гликолитические ферменты. Четыре альтернативных гликолитических фермента включают пирофосфат-фруктозо-6-фосфат фосфотрансферазу (PFP), фруктозо-бисфосфат альдолазу класса II (FBA класса II), 2,3-бисфосфоглицерат независимую фосфоглицератмутазу (iPGM) и пируватфосфатдикиназу (PPDK). [25] Предполагается, что глюкозо-6-фосфатизомераза (GPI) находится в Monocercomonoides, поскольку она повсеместно распространена среди эукариот, бактерий и некоторых архей и необходима для катаболического гликолиза, но пока не обнаружена. [25] Большинство гликолитических ферментов являются стандартными эукариотическими версиями, что делает метаболический путь Monocercomonoides мозаичным, похожим на таковой у других анаэробов. [25]
Добавление PPDK к превращению фосфоенолпирувата в пируват (обычно катализируемому исключительно пируваткиназой) оказывает сильное влияние на сохранение АТФ. [25] Как PFP, так и PPDK полагаются на неорганический фосфат (PPi) в качестве донора фосфата; поэтому вместо гидролиза АТФ выход АТФ увеличивается за счет использования побочного продукта анаболических процессов клетки в качестве источника энергии. [25] Эти реакции способны обеспечить большее сохранение АТФ и регулирование гликолиза из-за обратимой природы PPDK и использования неорганического фосфата, где пируваткиназа катализирует только прямую реакцию. [25]
В дополнение к скорректированному гликолизу, Monocercomonoides содержат ферменты, необходимые для пути аргининдезиминазы (деградации). [15] Путь аргининдезиминазы может использоваться для производства АТФ, как у Giardia intestinalis и Trichomonas vaginalis . [15] У G. intestinalis (анаэробный одноклеточный эукариот) этот путь производит в восемь раз больше АТФ, чем метаболизм сахара, и аналогичный выход ожидается у Monocercomonoides , но это еще не подтверждено. [15] Все 3 фермента пути аргининдезиминазы локализованы в цитозоле Monocercomonoides exilis , что может отражать предковое состояние у Metamonada . [26]
Железо-серные кластеры являются важными белковыми компонентами, которые синтезируются митохондриями. [16] Основная функция этих небольших неорганических простетических групп заключается в опосредовании электронного транспорта, что делает их ключевой частью фотосинтеза, дыхания, репликации/восстановления ДНК и регуляции экспрессии генов. [16] В эукариотических клетках общим путем синтеза кластера Fe-S является ISC (железо-серный кластер). В цитозоле цитозольная сборка железо-серного кластера (CIA) образует белки, содержащие кластер Fe-S, которые отвечают за созревание ядерных белков Fe-S. CIA уникален для эукариот и не имеет прокариотических гомологов. [16] Считается, что митохондриальный путь ISC необходим для функционирования CIA, поскольку он синтезирует и транспортирует неохарактеризованный серосодержащий предшественник в цитозоль и является основной причиной сохранения митохондриальных органелл у анаэробных эукариот. [16] Род Monocercomonoides содержит пути CIA, но полностью лишен пути ISC, а также любых митохондриальных белков. [16] Род содержит редуцированную версию пути SUF (фактор утилизации серы), имеющую только три белка - SufB, SufC и SufU. [16] Путь SUF является известным путем прокариот, и считается, что гены, используемые для построения системы SUF у Monocercomonoides, должны были произойти от прокариот. [16] Однако было обнаружено, что белки SUF Monocercomonoides не связаны с гомологами пластид или любыми другими микробными эукариотами. [16] Было высказано предположение, что этот путь был приобретен от эубактерии путем горизонтального переноса генов (HGT) у общего предка Monocercomonoides и Paratrismastrix (сестринского таксона оксимонад). [16] Генетическое приобретение не было продемонстрировано, несмотря на предположение, что оно должно было произойти.
Monocercomonoides не содержат никаких обнаружимых признаков того, что митохондрии когда-либо были частью организма. [15] Однако, поскольку широко признано, что все эукариоты имеют общего предка, у которого развились митохондрии, считается, что митохондрии должны были когда-то присутствовать у предков оксимонад, а затем вторично утрачены. Род амитохондрий демонстрирует, что митохондрии не являются абсолютно необходимыми для жизни эукариотической клетки.
Отсутствие митохондрий или каких-либо органелл, связанных с митохондриями, у Monocercomonoides exilis подтверждается его геномной последовательностью. Был проведен полный анализ геномной последовательности штамма PA203 Monocercomonoides exilis из Chinchilla lanigera . [15] Предполагаемый размер генома составляет ~75 Мб, а число предсказанных генов, кодирующих белок, составляет 16 629. [15] Более позднее повторное секвенирование генома с использованием Oxford nanopore показало, что размер генома составляет ~82 Мб. [17] Поиски гомологии выявили отсутствие генов, кодирующих митохондриальный импортный аппарат, белки транспорта метаболитов и железо-серные кластеры. [15] [17] Кроме того, отсутствие целевых важных генов и генов, кодирующих белки митохондриальной мембраны, было обнаружено при проведении поиска специфических N-концевых и C-концевых последовательностей. [15] [17] Гены, которые обычно кодируются в митохондриальных геномах (мтДНК), не были обнаружены среди собранного каркаса, что позволяет предположить, что у Monocercomonoides отсутствует мтДНК. [15] Гены 18S РНК были секвенированы и оказались длиной 2927 нт, и являются одними из самых длинных известных. [15] [21] Некоторые расширения были специфичны для Monocercomonoides, но многие были похожи на таковые в других родах оксимонад , но существенно длиннее. [15] Сравнение генов, кодирующих 𝛼-тубулин, 𝛽-тубулин, 𝛾-тубулин, EF-1𝛼, EF-2, cytHSP70, убиквитин, 18S рРНК и HSP90, позволяет разместить оксимонад рядом с дипломонадами и трихомонадами , при этом Monocercomonoides и Streblomastix составляют ветвь оксимонад. [15]
{{cite journal}}
: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )