Набор экспериментальных критериев, относящихся к микробному патогенезу
Молекулярные постулаты Коха представляют собой набор экспериментальных критериев, которые должны быть выполнены, чтобы показать, что ген, обнаруженный в патогенном микроорганизме, кодирует продукт, который способствует заболеванию, вызываемому патогеном. Гены, которые удовлетворяют молекулярным постулатам Коха, часто называют факторами вирулентности . Постулаты были сформулированы микробиологом Стэнли Фальковым в 1988 году и основаны на постулатах Коха . [1]
Постулаты
Согласно первоначальному описанию Фалькова, три постулата таковы: [1]
« Исследуемый фенотип или свойство должны быть связаны с патогенными представителями рода или патогенными штаммами вида .
Специфическая инактивация гена(ов), связанного с предполагаемым признаком вирулентности, должна приводить к измеримой потере патогенности или вирулентности .
Реверсия или аллельная замена мутировавшего гена должна привести к восстановлению патогенности».
Чтобы применить молекулярные постулаты Коха к человеческим заболеваниям, исследователи должны определить, какие микробные гены потенциально ответственны за симптомы патогенности, часто путем секвенирования всего генома, чтобы сравнить, какие нуклеотиды гомологичны генам, кодирующим белки других видов. В качестве альтернативы ученые могут определить, какие транскрипты мРНК находятся на повышенных уровнях в больных органах инфицированных хозяев. Кроме того, испытатель должен определить и проверить методы инактивации и реактивации изучаемого гена. [2]
В 1996 году Фредрикс и Релман предложили семь молекулярных принципов для установления причин микробных заболеваний : [3]
«Последовательность нуклеиновой кислоты, принадлежащая предполагаемому патогену, должна присутствовать в большинстве случаев инфекционного заболевания. Микробные нуклеиновые кислоты должны обнаруживаться преимущественно в тех органах или макроскопических анатомических участках, которые, как известно, поражены болезнью (т. е. с анатомическими, гистологическими, химическими или клиническими признаками патологии), а не в тех органах, в которых патологии нет».
У хозяев или тканей без заболеваний должно наблюдаться меньшее количество копий последовательностей нуклеиновых кислот, ассоциированных с патогенами, или их не должно быть вовсе.
При разрешении болезни (например, при клинически эффективном лечении) число копий патоген-ассоциированных последовательностей нуклеиновых кислот должно уменьшаться или становиться неопределяемым. При клиническом рецидиве должно происходить обратное.
Если последовательность была обнаружена до заболевания или число копий последовательности коррелирует с тяжестью заболевания или патологии, то связь между последовательностью и заболеванием, скорее всего, будет причинно-следственной.
Природа микроорганизма, выведенная из доступной последовательности, должна соответствовать известным биологическим характеристикам этой группы организмов. Когда фенотипы (например, патология, микробная морфология и клинические признаки) предсказываются филогенетическими отношениями на основе последовательности, значимость последовательности повышается.
Корреляты последовательности тканей следует искать на клеточном уровне: следует приложить усилия для демонстрации специфической гибридизации in situ микробной последовательности с областями патологии тканей и видимыми микроорганизмами или с областями, где предположительно находятся микроорганизмы.
Эти основанные на последовательностях формы доказательств микробной причинности должны быть воспроизводимыми».
Ссылки
^ ab Falkow, Stanley (1988). «Молекулярные постулаты Коха в применении к микробной патогенности». Reviews of Infectious Diseases . 10 (Supplement 2): S274–S276. doi :10.1093/cid/10.supplement_2.s274. ISSN 0162-0886. JSTOR 4454582. PMID 3055197 – через JSTOR .
^ Слончевски, Джоан; Фостер, Джон; Зинсер, Эрик (26 июня 2020 г.). Микробиология: развивающаяся наука (5-е изд.). Нью-Йорк, Нью-Йорк: WW Norton & Company . С. 1012–1020. ISBN978-0-393-93447-2.
^ Фредрикс, Дэвид; Релман, Дэвид (январь 1996 г.). «Идентификация микробных патогенов на основе последовательностей: пересмотр постулатов Коха». Clinical Microbiology Reviews . 9 (1): 18–33. doi :10.1128/CMR.9.1.18. PMC 172879. PMID 8665474 .