семейство предшественников микроРНК mir-196
РНК-семейство
семейство предшественников микроРНК mir-196
Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности mir-196
Идентификаторы
Символмир-196
РфамРФ00256
miRBaseMI0000238
семейство miRBaseMIPF0000031
Другие данные
Тип РНКГен ; миРНК
ДоменыЭукариоты
ИДТИGO:0035195 GO:0035068
ТАКSO:0001244
Структуры PDBПДБе

miR-196 — это некодирующая РНК, называемая микроРНК , которая, как было показано, экспрессируется у людей (MI0000238, MI0000279) и мышей (MI0000552, MI0000553). [1] [2] miR-196, по-видимому, является специфичной для позвоночных микроРНК и в настоящее время предсказана или экспериментально подтверждена у широкого спектра видов позвоночных (MIPF0000031). У многих видов miRNA, по-видимому, экспрессируется из межгенных областей в кластерах генов HOX. Предшественники шпилек прогнозируются на основе спаривания оснований и межвидовой консервации — их протяженность неизвестна. В этом случае зрелая последовательность вырезается из 5'-плеча шпильки.

Было высказано предположение, что редкий однонуклеотидный полиморфизм (rs11614913), который перекрывает hsa-mir-196a-2, связан с немелкоклеточной карциномой легких . [3]

Дальнейшее чтение

[4] [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11] [12] [13] [14] [15] [16] [17] [18] [19] [20] ] [21] [22] [23] [24]

Ссылки

  1. ^ Лагос-Кинтана М., Раухут Р., Мейер Дж., Боркхардт А., Тушл Т. (2003). «Новые микроРНК мыши и человека». РНК . 9 (2): 175– 9. doi :10.1261/rna.2146903. PMC  1370382. PMID  12554859 .
  2. ^ Lim LP, Glasner ME, Yekta S, Burge CB, Bartel DP (2003). «Гены микроРНК позвоночных». Science . 299 (5612): 1540. doi :10.1126/science.1080372. PMID  12624257. S2CID  37750545.
  3. ^ Hu Z, Chen J, Tian T, Zhou X, Gu H, Xu L, Zeng Y, Miao R, Jin G, Ma H, Chen Y, Shen H (2008). «Генетические варианты последовательностей miRNA и выживаемость при немелкоклеточном раке легких». J Clin Invest . 118 (7): 2600– 8. doi :10.1172/JCI34934. PMC 2402113. PMID  18521189 . 
  4. ^ Zhang XW, Pan SD, Feng YL, Liu JB, Dong J, Zhang YX, Chen JG, Hu ZB, Shen HB (2011). "[Связь между генетическим полиморфизмом в предшественниках микроРНК и генетической предрасположенностью к гепатоцеллюлярной карциноме]". Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi . 45 (3): 239– 43. PMID  21624236.
  5. ^ Жорж М (2011). «Долгая и извилистая дорога от корреляции к причинности». Nat Genet . 43 (3): 180– 1. doi :10.1038/ng0311-180. PMID  21350497. S2CID  205341688.
  6. ^ Брест П., Лапакетт П., Суиди М., Лебриганд К., Чезаро А., Вуре-Кравиари В., Мари Б., Барбри П., Монье Ж.Ф., Эбютерн X, Арель-Беллан А., Мограби Б., Дарфей-Мишо А., Хофман П. (2011). ). «Синонимичный вариант IRGM изменяет сайт связывания миР-196 и вызывает дерегуляцию IRGM-зависимой ксенофагии при болезни Крона». Нат Жене . 43 (3): 242–5 . doi : 10.1038/ng.762. PMID  21278745. S2CID  11224420.
  7. ^ Chen C, Zhang Y, Zhang L, Weakley SM, Yao Q (2011). «МикроРНК-196: критические роли и клинические применения в развитии и раке». J Cell Mol Med . 15 (1): 14– 23. doi :10.1111/j.1582-4934.2010.01219.x. PMC 3276076. PMID  21091634 . 
  8. ^ Scagnolari C, Zingariello P, Vecchiet J, Selvaggi C, Racciatti D, Taliani G, Riva E, Pizzigallo E, Antonelli G (2010). "Дифференциальная экспрессия интерферон-индуцированных микроРНК у пациентов с хронической инфекцией вируса гепатита С, леченных пегилированным интерфероном альфа". Virol J . 7 : 311. doi : 10.1186/1743-422X-7-311 . PMC 2996368 . PMID  21070682. 
  9. ^ Li Y, Zhang M, Chen H, Dong Z, Ganapathy V, Thangaraju M, Huang S (2010). «Соотношение miR-196s к РНК-мессенджеру HOXC8 коррелирует с миграцией клеток рака груди и метастазами». Cancer Res . 70 (20): 7894– 904. doi :10.1158/0008-5472.CAN-10-1675. PMC 2955846. PMID  20736365 . 
  10. ^ Guan Y, Mizoguchi M, Yoshimoto K, Hata N, Shono T, Suzuki SO, Araki Y, Kuga D, Nakamizo A, Amano T, Ma X, Hayashi K, Sasaki T (2010). «MiRNA-196 повышается при глиобластоме, но не при анапластической астроцитоме, и имеет прогностическое значение». Clin Cancer Res . 16 (16): 4289– 97. doi : 10.1158/1078-0432.CCR-10-0207 . PMID  20601442.
  11. ^ Асли НС, Кессель М (2010). «Пространственно-временная ограниченная регуляция общих программ двигательных нейронов посредством репрессии Hoxb8, опосредованной miR-196». Dev Biol . 344 (2): 857–68 . doi :10.1016/j.ydbio.2010.06.003. hdl : 11858/00-001M-0000-0011-F056-2 . PMID  20553899.
  12. ^ Шотте Д., Ланге-Туренхаут Э.А., Стампель DJ, Стам Р.В., Буйс-Гладдинес Дж.Г., Мейеринк Дж.П., Питерс Р., Ден Бур М.Л. (2010). «Экспрессия миР-196b не обусловлена ​​исключительно MLL, но особенно связана с активацией генов HOXA при остром лимфобластном лейкозе у детей». Гематологическая . 95 (10): 1675– 82. doi :10.3324/haematol.2010.023481. ПМК 2948092 . ПМИД  20494936. 
  13. ^ Hou W, Tian Q, Zheng J, Bonkovsky HL (2010). «МикроРНК-196 подавляет экспрессию белка Bach1 и гена вируса гепатита C в клетках гепатомы человека, экспрессирующих белки вируса гепатита C». Гепатология . 51 (5): 1494–504 . doi :10.1002/hep.23401. PMC 2862129. PMID  20127796 . 
  14. ^ McGlinn E, Yekta S, Mansfield JH, Soutschek J, Bartel DP, Tabin CJ (2009). «Применение антагомиР in ovo указывает на роль miR-196 в формировании осевого скелета цыпленка посредством регуляции генов Hox». Proc Natl Acad Sci USA . 106 (44): 18610– 5. doi : 10.1073/pnas.0910374106 . PMC 2773993 . PMID  19846767. 
  15. ^ Sehm T, Sachse C, Frenzel C, Echeverri K (2009). "miR- 196 является важным регулятором ранней стадии регенерации хвоста, предшествующим ключевым событиям формирования паттерна спинного мозга". Dev Biol . 334 (2): 468–80 . doi : 10.1016/j.ydbio.2009.08.008 . PMID  19682983.
  16. ^ Popovic R, Riesbeck LE, Velu CS, Chaubey A, Zhang J, Achille NJ, Erfurth FE, Eaton K, Lu J, Grimes HL, Chen J, Rowley JD, Zeleznik-Le NJ (2009). «Регулирование mir-196b с помощью MLL и его сверхэкспрессия слияниями MLL способствуют иммортализации». Blood . 113 (14): 3314– 22. doi :10.1182/blood-2008-04-154310. PMC 2665896 . PMID  19188669. 
  17. ^ Sonkoly E, Ståhle M, Pivarcsi A (2008). «МикроРНК и иммунитет: новые игроки в регуляции нормальной иммунной функции и воспаления». Semin Cancer Biol . 18 (2): 131– 40. doi :10.1016/j.semcancer.2008.01.005. PMID  18291670.
  18. ^ Woltering JM, Durston AJ (2008). "MiR-10 подавляет HoxB1a и HoxB3a у данио-рерио". PLOS ONE . ​​3 (1): e1396. doi : 10.1371/journal.pone.0001396 . PMC 2148072 . PMID  18167555. 
  19. ^ Richardson MK, Crooijmans RP, Groenen MA (2007). «Секвенирование и геномная аннотация куриных (Gallus gallus) Hox-кластеров и картирование эволюционно консервативных регионов». Cytogenet Genome Res . 117 ( 1–4 ): 110–9 . doi :10.1159/000103171. PMID  17675851. S2CID  2643703.
  20. ^ Кавасаки Х, Тайра К (2004). «МикроРНК-196 ингибирует экспрессию HOXB8 при миелоидной дифференцировке клеток HL60». Nucleic Acids Symp Ser (Oxf) . 48 (48): 211– 2. doi : 10.1093/nass/48.1.211 . PMID  17150553.
  21. ^ Чопра ВС, Мишра Р.К. (2006). ""Чудеса" в регуляции генов hox". BioEssays . 28 (5): 445– 8. doi : 10.1002/bies.20401 . PMID  16615131.
  22. ^ Ronshaugen M, Biemar F, Piel J, Levine M, Lai EC (2005). «МикроРНК iab-4 дрозофилы вызывает доминантную гомеотическую трансформацию жужжальца в крылья». Genes Dev . 19 (24): 2947– 52. doi :10.1101/gad.1372505. PMC 1315399. PMID  16357215 . 
  23. ^ Hornstein E, Mansfield JH, Yekta S, Hu JK, Harfe BD, McManus MT, Baskerville S, Bartel DP, Tabin CJ (2005). «МикроРНК miR-196 действует выше Hoxb8 и Shh в развитии конечностей». Nature . 438 (7068): 671– 4. doi :10.1038/nature04138. PMID  16319892. S2CID  2543608.
  24. ^ Yekta S, Shih IH, Bartel DP (2004). «Направленное микроРНК расщепление мРНК HOXB8». Science . 304 (5670): 594– 6. doi :10.1126/science.1097434. PMID  15105502. S2CID  20510339.
  • Страница для семейства предшественников микроРНК mir-196 в Rfam
  • MIPF0000031



Значок заглушки

Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mir-196_microRNA_precursor_family&oldid=1192034525"