Микропроцессорный комплексный субблок DGCR8

ДГКР8
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1X47, 2YT4, 3LE4, 5B16
Идентификаторы
Псевдонимы	DGCR8 , C22orf12, DGCRK6, Gy1, pasha, Pasha, DGCR8 микропроцессорный комплексный субъединица, микропроцессорный комплексный субъединица
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 609030; МГИ : 2151114; Гомологен : 11223; Генные карты : DGCR8; OMA :DGCR8 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 22 (человек)
Конец	20,111,877 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	правое полушарие мозжечка; ; икроножный нерв; ; правое яичко; ; левое яичко; ; тело матки; ; правый яичник; ; правая доля щитовидной железы; ; тело поджелудочной железы; ; левый яичник; ; верхушка сердца;
	н/д
	Больше данных по справочным выражениям
	; ; ; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	первичное связывание miRNA; активность рибонуклеазы III; связывание двухцепочечной РНК; связывание белков; связывание гема; активность гомодимеризации белка; связывание ионов металлов; Связывание РНК; идентичное связывание белков;
Клеточный компонент	цитоплазма; микропроцессорный комплекс; ядрышко; ядро; нуклеоплазма; постсинаптическая плотность;
Биологический процесс	регуляция пролиферации стволовых клеток; первичная обработка miRNA; Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, эндонуклеолитический; Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК; процесс метаболизма miRNA;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	54487
	94223
	ENSG00000128191
	ENSMUSG00000022718
	Q8WYQ5
	Q9EQM6
	NM_001190326 ; NM_022720
	NM_033324
	NP_001177255 ; NP_073557
	NP_201581
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Субъединица микропроцессорного комплекса DGCR8 ( критическая область 8 синдрома ДиДжорджи ) — это белок , который у людей кодируется геном DGCR8 . ^[4] У других животных, в частности, у распространенных модельных организмов Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans , этот белок известен как Pasha (партнер Drosha ). ^[5] Он является необходимым компонентом пути РНК-интерференции .

Функция

Субъединица DGCR8 локализована в ядре клетки и необходима для обработки микроРНК (miRNA). Она связывается с другой субъединицей Drosha , ферментом РНКазы III , для формирования комплекса микропроцессора , который расщепляет первичный транскрипт, известный как pri-miRNA, на характерную структуру стебля-петли, известную как pre-miRNA, которая затем далее обрабатывается до фрагментов miRNA ферментом Dicer . DGCR8 содержит домен связывания РНК и, как полагают, связывает pri-miRNA, чтобы стабилизировать ее для обработки Drosha. ^[6]

DGCR8 также требуется для некоторых типов репарации ДНК. Удаление фотопродуктов ДНК, вызванных УФ-излучением , во время транскрипционно-связанной репарации нуклеотидов (TC-NER) зависит от фосфорилирования JNK DGCR8 на серине 153. ^[7] Хотя известно, что DGCR8 функционирует в биогенезе микроРНК, эта активность не требуется для DGCR8-зависимого удаления фотопродуктов, вызванных УФ-излучением. ^[7] Нуклеотидная репарация эксцизии также необходима для восстановления окислительного повреждения ДНК, вызванного перекисью водорода ( H ₂ O ₂ ), и клетки с истощенным DGCR8 чувствительны к H ₂ O ₂ . ^[7]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000128191 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Ген Энтреза: DGCR8, ген критической области синдрома ДиДжорджи 8".
^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК микропроцессорным комплексом». Nature . 432 (7014): 231– 5. Bibcode :2004Natur.432..231D. doi :10.1038/nature03049. PMID 15531879. S2CID 4425505.
^ Yeom KH, Lee Y, Han J, Suh MR, Kim VN (2006). «Характеристика DGCR8/Pasha, основного кофактора для Drosha в первичной обработке miRNA». Nucleic Acids Research . 34 (16): 4622– 9. doi :10.1093/nar/gkl458. PMC 1636349. PMID 16963499 .
^ abc Calses PC, Диллон К.К., Такер Н., Чи Й., Хуанг Дж.В., Кавасуми М., Нгием П., Ван Й., Клерман Б.Е., Жакмон С., Гафкен П.Р., Сугасава К., Сайджо М., Танигучи Т. (2017). «DGCR8 опосредует восстановление повреждений ДНК, вызванных УФ-излучением, независимо от процессинга РНК». Представитель ячейки . 19 (1): 162–174 . doi :10.1016/j.celrep.2017.03.021. ПМЦ 5423785 . ПМИД 28380355.

Дальнейшее чтение

Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Reports . 1 (3): 287– 92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Shiohama A, Sasaki T, Noda S, Minoshima S, Shimizu N (апрель 2003 г.). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии нового гена DGCR8, расположенного в хромосомной области синдрома ДиДжорджи». Biochemical and Biophysical Research Communications . 304 (1): 184– 90. doi :10.1016/S0006-291X(03)00554-0. PMID 12705904.
Грегори Р.И., Ян К.П., Амутхан Г., Чендримада Т., Доратотай Б., Куч Н., Шихаттар Р. (ноябрь 2004 г.). «Микропроцессорный комплекс опосредует генезис микроРНК». Природа . 432 (7014): 235–40 . Бибкод : 2004Natur.432..235G. дои : 10.1038/nature03120. PMID 15531877. S2CID 4389261.
Han J, Lee Y, Yeom KH, Kim YK, Jin H, Kim VN (декабрь 2004 г.). «Комплекс Drosha-DGCR8 в первичной обработке микроРНК». Genes & Development . 18 (24): 3016– 27. doi :10.1101/gad.1262504. PMC 535913. PMID 15574589 .
Landthaler M, Yalcin A, Tuschl T (декабрь 2004 г.). «Ген 8 критической области синдрома ДиДжорджи у человека и его гомолог D. melanogaster необходимы для биогенеза miRNA». Current Biology . 14 (23): 2162– 7. Bibcode :2004CBio...14.2162L. doi :10.1016/j.cub.2004.11.001. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-EB83-3 . PMID 15589161. S2CID 13266269.
Han J, Lee Y, Yeom KH, Nam JW, Heo I, Rhee JK, Sohn SY, Cho Y, Zhang BT, Kim VN (июнь 2006 г.). «Молекулярная основа распознавания первичных микроРНК комплексом Drosha-DGCR8». Cell . 125 (5): 887– 901. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.043 . PMID 16751099.
Фаллер М., Мацунага М., Инь С., Лу Дж.А., Го Ф. (январь 2007 г.). «Гем участвует в процессинге микроРНК». Структурная и молекулярная биология природы . 14 (1): 23–9 . doi : 10.1038/nsmb1182. PMID 17159994. S2CID 17463646.
Sohn SY, Bae WJ, Kim JJ, Yeom KH, Kim VN, Cho Y (сентябрь 2007 г.). «Кристаллическая структура ядра человеческого DGCR8». Nature Structural & Molecular Biology . 14 (9): 847–53 . doi :10.1038/nsmb1294. PMID 17704815. S2CID 18561478.

Эта статья о гене на 22-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000128191 – Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-4] "Ген Энтреза: DGCR8, ген критической области синдрома ДиДжорджи 8".

[5] Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК микропроцессорным комплексом». Nature . 432 (7014): 231– 5. Bibcode :2004Natur.432..231D. doi :10.1038/nature03049. PMID 15531879. S2CID 4425505.

[6] Yeom KH, Lee Y, Han J, Suh MR, Kim VN (2006). «Характеристика DGCR8/Pasha, основного кофактора для Drosha в первичной обработке miRNA». Nucleic Acids Research . 34 (16): 4622– 9. doi :10.1093/nar/gkl458. PMC 1636349. PMID 16963499 .

[Calses-7] Calses PC, Диллон К.К., Такер Н., Чи Й., Хуанг Дж.В., Кавасуми М., Нгием П., Ван Й., Клерман Б.Е., Жакмон С., Гафкен П.Р., Сугасава К., Сайджо М., Танигучи Т. (2017). «DGCR8 опосредует восстановление повреждений ДНК, вызванных УФ-излучением, независимо от процессинга РНК». Представитель ячейки . 19 (1): 162–174 . doi :10.1016/j.celrep.2017.03.021. ПМЦ 5423785 . ПМИД 28380355.