Майкл Штернберг

Майк Стернберг
Рожденный
Майкл Джозеф Эзра Стернберг

( 1951-06-24 )24 июня 1951 г. (73 года) [3]
Альма-матер
Награды
Научная карьера
Поля
Учреждения
ТезисИсследования конформации белков  (1977)
научный руководительДэвид Чилтон Филлипс [2]
Веб-сайтwww.impial.ac.uk/people/m.sternberg

Майкл Джозеф Эзра Стернберг (родился 24 июня 1951 г.) [3]профессор Имперского колледжа Лондона , где он является директором Центра интегративной системной биологии и биоинформатики [4] и руководителем Группы структурной биоинформатики . [1] [5] [6] [7]

Образование

Стернберг получил образование в средней школе округа Хендон и колледже Гонвилл и Кайус в Кембридже , где в 1972 году ему была присвоена степень бакалавра гуманитарных наук по естественным наукам (теоретическая физика). [3] Затем он получил степень магистра наук по вычислительной технике в Имперском колледже Лондона, а затем степень доктора философии в Оксфордском университете ( колледж Вольфсона, Оксфорд ) в 1978 году за исследования под руководством Дэвида Чилтона Филлипса . [2] [8] [9] [10] [11] [12]

Карьера

После постдокторских исследований в Оксфордском университете Штернберг стал преподавателем кафедры кристаллографии в колледже Биркбек в Лондоне . Затем он работал в Имперском фонде исследований рака и присоединился к Имперскому колледжу в 2001 году. [3] [13] [14] [15] [16] Он является директором Центра интегративной системной биологии и биоинформатики [4] в Имперском колледже.

Исследовать

Научные интересы Стернберга лежат в области прогнозирования структуры белка , прогнозирования функции белка , прогнозирования макромолекулярной стыковки и взаимодействий, сетевого моделирования для системной биологии и логического проектирования лекарств . [13] [17] [18] [19] [20] [21] [22] [23] [24] [25]

Он является автором и соавтором нескольких книг, включая «От клеток к атомам: иллюстрированное введение в молекулярную биологию» [26] , «Белковая инженерия: практический подход» [27] и «Предсказание структуры белка: практический подход » [28] .

Во время своего исследования DPhil в Оксфорде он работал с Джанет Торнтон , и они провели некоторые из первых систематических анализов структуры белка . Они определили, что бета-альфа-бета-единица в белках почти всегда правосторонняя, и это объяснило замечательное сходство между структурами белков. [ необходима цитата ]

Его группа, в частности Лоуренс Келли, разработали широко используемый веб-сервер Phyre/Phyre2 [29] [30] [31] для предсказания структуры белка. Этот веб-ресурс использовали более 100 000 различных пользователей по всему миру. [ необходима цитата ]

Недавно его аспирант Крис Йейтс разработал SuSPect [32] — новый мощный метод прогнозирования фенотипических эффектов однонуклеотидных полиморфизмов и других вариантов аминокислот .

Награды и почести

Стернберг был избран членом Королевского биологического общества (FRSB) и членом Института биологии (FIBiol) . Он является заместителем редактора журнала « Journal of Molecular Biology» .

Ссылки

  1. ^ ab Публикации Майкла Стернберга, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ ab Sternberg, Michael Joseph Ezra (1977). Исследования конформации белков (диссертация на степень доктора философии). Оксфордский университет.
  3. ^ abcd "STERNBERG, Prof. Michael Joseph Ezra" . Who's Who . Vol. 2014 (онлайн-издание Oxford University Press  ). A & C Black. (Требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании.)
  4. ^ ab "Имперский колледж Лондона".
  5. ^ Публикации Майкла Стернберга, проиндексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  6. ^ Майкл Дж. Э. Стернберг на сервере библиографии DBLP
  7. ^ Публикации Майкла Стернберга, проиндексированные Microsoft Academic
  8. ^ Коэн, FE; Стернберг, MJ; Филлипс, DC; Кунц, ID; Коллман, PA (1980). "Модель диффузии-столкновения-адгезии для кинетики рефолдинга миоглобина". Nature . 286 (5773): 632–4. Bibcode :1980Natur.286..632C. doi :10.1038/286632a0. PMID  7402344. S2CID  4348559.
  9. ^ Artymiuk, PJ; Blake, CC; Grace, DE; Oatley, SJ; Phillips, DC; Sternberg, MJ (1979). «Кристаллографические исследования динамических свойств лизоцима». Nature . 280 (5723): 563–8. Bibcode :1979Natur.280..563A. doi :10.1038/280563a0. PMID  460438. S2CID  32299121.
  10. ^ Стернберг, М. Дж.; Грейс, Д. Э.; Филлипс, Д. К. (1979). «Динамическая информация из кристаллографии белков. Анализ температурных факторов из уточнения структуры лизоцима куриного яйца». Журнал молекулярной биологии . 130 (3): 231–52. doi :10.1016/0022-2836(79)90539-4. PMID  469942.
  11. ^ Филлипс, DC ; Стернберг, MJ; Торнтон, JM ; Уилсон, IA (1978). «Анализ структуры триозофосфатизомеразы и ее сравнение с лактатдегидрогеназой». Журнал молекулярной биологии . 119 (2): 329–51. doi :10.1016/0022-2836(78)90440-0. PMID  633372.
  12. ^ Филлипс, DC; Риверс, PS; Стернберг, MJ; Торнтон, JM; Уилсон, IA (1977). «Анализ трехмерной структуры куриной триозофосфатизомеразы». Труды биохимического общества . 5 (3): 642–7. doi :10.1042/bst0050642. PMID  902882.
  13. ^ ab Майкл Стернберг, Имперский колледж Лондона
  14. ^ Стернберг, М. Дж.; Торнтон, Дж. М. (1978). «Предсказание структуры белка из аминокислотной последовательности». Труды биохимического общества . 6 (6): 1119–23. doi :10.1042/bst0061119. PMID  744369.
  15. ^ Sternberg, MJ; Thornton, JM (1978). «Предсказание структуры белка по аминокислотной последовательности». Nature . 271 (5640): 15–20. Bibcode :1978Natur.271...15S. doi :10.1038/271015a0. PMID  342964. S2CID  4160357.
  16. ^ Blundell, TL ; Sibanda, BL; Sternberg, MJ; Thornton, JM (1987). «Предсказание структур белков на основе знаний и разработка новых молекул». Nature . 326 (6111): 347–52. Bibcode :1987Natur.326..347B. doi :10.1038/326347a0. PMID  3550471. S2CID  4330510.
  17. ^ Wass, MN; Barton, G.; Sternberg, MJE (2012). «Comb Func: Predicting protein function using heterogeneous data sources». Nucleic Acids Research . 40 (выпуск веб-сервера): W466–W470. doi :10.1093/nar/gks489. PMC 3394346. PMID 22641853  . 
  18. ^ Келли, LA; МакКаллум, RM; Стернберг, MJE (2000). «Улучшенная аннотация генома с использованием структурных профилей в программе 3D-PSSM». Журнал молекулярной биологии . 299 (2): 501–522. doi :10.1006/jmbi.2000.3741. PMID  10860755.
  19. ^ Gabb, HA; Jackson, RM; Sternberg, MJE (1997). «Моделирование стыковки белков с использованием комплементарности форм, электростатики и биохимической информации». Журнал молекулярной биологии . 272 ​​(1): 106–20. doi :10.1006/jmbi.1997.1203. PMID  9299341.
  20. ^ Barton, GJ; Sternberg, MJ (1987). «Стратегия быстрого множественного выравнивания последовательностей белков. Уровни достоверности из сравнений третичной структуры». Журнал молекулярной биологии . 198 (2): 327–37. doi :10.1016/0022-2836(87)90316-0. PMID  3430611.
  21. ^ Zvelebil, MJ; Barton, GJ; Taylor, WR; Sternberg, MJ (1987). «Прогнозирование вторичной структуры белка и активных участков с использованием выравнивания гомологичных последовательностей». Журнал молекулярной биологии . 195 (4): 957–61. doi :10.1016/0022-2836(87)90501-8. PMID  3656439.
  22. ^ King, RD ; Sternberg, MJE (1996). «Идентификация и применение концепций, важных для точного и надежного предсказания вторичной структуры белка». Protein Science . 5 (11): 2298–2310. doi :10.1002/pro.5560051116. PMC 2143286 . PMID  8931148. 
  23. ^ Льюис, TE; Силлитоэ, I; Андреева, A; Бланделл, TL; Бьюкен, DW; Чотия, C ; Коццетто, D; Дана, JM; Филиппис, I; Гоф, J ; Джонс, DT; Келли, LA; Клейвегт, GJ ; Миннечи, F; Мистри, J; Мурзин, AG; Очоа-Монтаньо, B; Оутс, ME; Пунта, M; Рэкхэм, OJ; Штальхаке, J; Штернберг, MJ; Веланкар, S; Оренго, C (2015). "Genome3D: использование структуры для помощи пользователям в понимании их последовательностей". Nucleic Acids Research . 43 (выпуск базы данных): D382–6. doi :10.1093/nar/gku973. PMC 4384030 . PMID  25348407. 
  24. ^ Радивожак, П.; Кларк, WT; Орон, ТР; Шнос, AM; Виткоп, Т.; Соколов А.; Грейм, К.; Функ, К.; Верспур, К.; Бен-Гур, А.; Панди, Г.; Юнес, Дж. М.; Талвалкар, AS; Репо, С.; Соуза, МЛ; Пиовесан, Д.; Касадио, Р.; Ван, З.; Ченг, Дж.; Фанг, Х.; Гоф, Дж.; Коскинен, П.; Тёрёнен, П.; Ноксо-Койвисто, Дж.; Холм, Л.; Коццетто, Д.; Бьюкен, DWA; Брайсон, К.; Джонс, DT; и др. (2013). «Крупномасштабная оценка вычислительного предсказания функций белка». Природные методы . 10 (3): 221–227. doi :10.1038/nmeth.2340. PMC 3584181. PMID 23353650  . 
  25. ^ Льюис, TE; Силлитоу, I; Андреева, A; Бланделл, TL; Бьюкен, DW; Чотия, C ; Кафф, A; Дана, JM; Филиппис, I; Гоф, J ; Хантер, S; Джонс, DT; Келли, LA; Клейвегт, GJ ; Миннечи, F; Митчелл, A; Мурзин, AG; Очоа-Монтаньо, B; Рэкхэм, OJ; Смит, J; Стернберг, MJ; Веланкар, S; Йетс, C; Оренго, C (2013). «Genome3D: совместный проект Великобритании по аннотированию геномных последовательностей с предсказанными трехмерными структурами на основе доменов SCOP и CATH». Nucleic Acids Research . 41 (выпуск базы данных): D499–507. doi : 10.1093/nar/gks1266. PMC 3531217. PMID  23203986 . 
  26. ^ От клеток к атомам: иллюстрированное введение в молекулярную биологию ISBN 0632008881 
  27. ^ Белковая инженерия: практический подход ISBN 0199631387 
  28. ^ Прогнозирование структуры белка: практический подход ISBN 0199634963 | 
  29. ^ Келли, LA; Стернберг, MJE (2009). «Прогнозирование структуры белка в Интернете: исследование случая с использованием сервера Phyre». Nature Protocols . 4 (3): 363–71. doi : 10.1038/nprot.2009.2. hdl : 10044/1/18157 . PMID  19247286. S2CID  12497300.
  30. ^ Беннетт-Ловси, Р. М.; Герберт, А. Д.; Стернберг, М. Дж. Э.; Келли, Л. А. (2007). «Изучение крайностей пространства последовательностей/структур с распознаванием ансамблевых складок в программе Phyre». Белки: структура, функция и биоинформатика . 70 (3): 611–625. doi :10.1002/prot.21688. PMID  17876813. S2CID  23530683.
  31. ^ «Перенаправление на Phyre2».
  32. ^ Йейтс, CM; Филиппис, I; Келли, LA; Стернберг, MJ (2014). «SuSPect: Улучшенное предсказание фенотипа варианта одной аминокислоты (SAV) с использованием сетевых характеристик». Журнал молекулярной биологии . 426 (14): 2692–701. doi :10.1016/j.jmb.2014.04.026. PMC 4087249. PMID  24810707 . 
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Michael_Sternberg&oldid=1189538365"