Майкл Джозеф Эзра Стернберг (родился 24 июня 1951 г.) [3] — профессор Имперского колледжа Лондона , где он является директором Центра интегративной системной биологии и биоинформатики [4] и руководителем Группы структурной биоинформатики . [1] [5] [6] [7]
Он является автором и соавтором нескольких книг, включая «От клеток к атомам: иллюстрированное введение в молекулярную биологию» [26] , «Белковая инженерия: практический подход» [27] и «Предсказание структуры белка: практический подход » [28] .
Во время своего исследования DPhil в Оксфорде он работал с Джанет Торнтон , и они провели некоторые из первых систематических анализов структуры белка . Они определили, что бета-альфа-бета-единица в белках почти всегда правосторонняя, и это объяснило замечательное сходство между структурами белков. [ необходима цитата ]
Его группа, в частности Лоуренс Келли, разработали широко используемый веб-сервер Phyre/Phyre2 [29] [30] [31] для предсказания структуры белка. Этот веб-ресурс использовали более 100 000 различных пользователей по всему миру. [ необходима цитата ]
Недавно его аспирант Крис Йейтс разработал SuSPect [32] — новый мощный метод прогнозирования фенотипических эффектов однонуклеотидных полиморфизмов и других вариантов аминокислот .
^ ab Публикации Майкла Стернберга, проиндексированные Google Scholar
^ ab Sternberg, Michael Joseph Ezra (1977). Исследования конформации белков (диссертация на степень доктора философии). Оксфордский университет.
^ abcd "STERNBERG, Prof. Michael Joseph Ezra" . Who's Who . Vol. 2014 (онлайн-издание Oxford University Press ). A & C Black.(Требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании.)
^ ab "Имперский колледж Лондона".
^ Публикации Майкла Стернберга, проиндексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
^ Майкл Дж. Э. Стернберг на сервере библиографии DBLP
^ Стернберг, М. Дж.; Грейс, Д. Э.; Филлипс, Д. К. (1979). «Динамическая информация из кристаллографии белков. Анализ температурных факторов из уточнения структуры лизоцима куриного яйца». Журнал молекулярной биологии . 130 (3): 231–52. doi :10.1016/0022-2836(79)90539-4. PMID 469942.
^ Филлипс, DC ; Стернберг, MJ; Торнтон, JM ; Уилсон, IA (1978). «Анализ структуры триозофосфатизомеразы и ее сравнение с лактатдегидрогеназой». Журнал молекулярной биологии . 119 (2): 329–51. doi :10.1016/0022-2836(78)90440-0. PMID 633372.
^ Филлипс, DC; Риверс, PS; Стернберг, MJ; Торнтон, JM; Уилсон, IA (1977). «Анализ трехмерной структуры куриной триозофосфатизомеразы». Труды биохимического общества . 5 (3): 642–7. doi :10.1042/bst0050642. PMID 902882.
^ ab Майкл Стернберг, Имперский колледж Лондона
^ Стернберг, М. Дж.; Торнтон, Дж. М. (1978). «Предсказание структуры белка из аминокислотной последовательности». Труды биохимического общества . 6 (6): 1119–23. doi :10.1042/bst0061119. PMID 744369.
^ Sternberg, MJ; Thornton, JM (1978). «Предсказание структуры белка по аминокислотной последовательности». Nature . 271 (5640): 15–20. Bibcode :1978Natur.271...15S. doi :10.1038/271015a0. PMID 342964. S2CID 4160357.
^ Blundell, TL ; Sibanda, BL; Sternberg, MJ; Thornton, JM (1987). «Предсказание структур белков на основе знаний и разработка новых молекул». Nature . 326 (6111): 347–52. Bibcode :1987Natur.326..347B. doi :10.1038/326347a0. PMID 3550471. S2CID 4330510.
^ Wass, MN; Barton, G.; Sternberg, MJE (2012). «Comb Func: Predicting protein function using heterogeneous data sources». Nucleic Acids Research . 40 (выпуск веб-сервера): W466–W470. doi :10.1093/nar/gks489. PMC 3394346. PMID 22641853 .
^ Келли, LA; МакКаллум, RM; Стернберг, MJE (2000). «Улучшенная аннотация генома с использованием структурных профилей в программе 3D-PSSM». Журнал молекулярной биологии . 299 (2): 501–522. doi :10.1006/jmbi.2000.3741. PMID 10860755.
^ Gabb, HA; Jackson, RM; Sternberg, MJE (1997). «Моделирование стыковки белков с использованием комплементарности форм, электростатики и биохимической информации». Журнал молекулярной биологии . 272 (1): 106–20. doi :10.1006/jmbi.1997.1203. PMID 9299341.
^ Barton, GJ; Sternberg, MJ (1987). «Стратегия быстрого множественного выравнивания последовательностей белков. Уровни достоверности из сравнений третичной структуры». Журнал молекулярной биологии . 198 (2): 327–37. doi :10.1016/0022-2836(87)90316-0. PMID 3430611.
^ Zvelebil, MJ; Barton, GJ; Taylor, WR; Sternberg, MJ (1987). «Прогнозирование вторичной структуры белка и активных участков с использованием выравнивания гомологичных последовательностей». Журнал молекулярной биологии . 195 (4): 957–61. doi :10.1016/0022-2836(87)90501-8. PMID 3656439.
^ King, RD ; Sternberg, MJE (1996). «Идентификация и применение концепций, важных для точного и надежного предсказания вторичной структуры белка». Protein Science . 5 (11): 2298–2310. doi :10.1002/pro.5560051116. PMC 2143286 . PMID 8931148.
^ Льюис, TE; Силлитоэ, I; Андреева, A; Бланделл, TL; Бьюкен, DW; Чотия, C ; Коццетто, D; Дана, JM; Филиппис, I; Гоф, J ; Джонс, DT; Келли, LA; Клейвегт, GJ ; Миннечи, F; Мистри, J; Мурзин, AG; Очоа-Монтаньо, B; Оутс, ME; Пунта, M; Рэкхэм, OJ; Штальхаке, J; Штернберг, MJ; Веланкар, S; Оренго, C (2015). "Genome3D: использование структуры для помощи пользователям в понимании их последовательностей". Nucleic Acids Research . 43 (выпуск базы данных): D382–6. doi :10.1093/nar/gku973. PMC 4384030 . PMID 25348407.
^ Прогнозирование структуры белка: практический подход ISBN 0199634963 |
^ Келли, LA; Стернберг, MJE (2009). «Прогнозирование структуры белка в Интернете: исследование случая с использованием сервера Phyre». Nature Protocols . 4 (3): 363–71. doi : 10.1038/nprot.2009.2. hdl : 10044/1/18157 . PMID 19247286. S2CID 12497300.
^ Беннетт-Ловси, Р. М.; Герберт, А. Д.; Стернберг, М. Дж. Э.; Келли, Л. А. (2007). «Изучение крайностей пространства последовательностей/структур с распознаванием ансамблевых складок в программе Phyre». Белки: структура, функция и биоинформатика . 70 (3): 611–625. doi :10.1002/prot.21688. PMID 17876813. S2CID 23530683.
^ «Перенаправление на Phyre2».
^ Йейтс, CM; Филиппис, I; Келли, LA; Стернберг, MJ (2014). «SuSPect: Улучшенное предсказание фенотипа варианта одной аминокислоты (SAV) с использованием сетевых характеристик». Журнал молекулярной биологии . 426 (14): 2692–701. doi :10.1016/j.jmb.2014.04.026. PMC 4087249. PMID 24810707 .