РНК MicF

РНК MicF
РНК MicF
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности MicF
Идентификаторы
Символ	МикФ
Рфам	РФ00033
Другие данные
Тип РНК	Ген ; антисмысловой
Домены	Бактерии
ИДТИ	GO:0006950 GO:0003729
ТАК	SO:0000383
Структуры PDB	ПДБе

Ген обнаружен у бактерий

РНК micF — это некодирующий ген стрессового ответа РНК, обнаруженный в Escherichia coli и родственных бактериях, который посттранскрипционно контролирует экспрессию гена порина внешней мембраны ompF. ^[1] Ген micF кодирует нетранслируемую антисмысловую РНК из 93 нуклеотидов , которая связывает свою целевую мРНК ompF и регулирует экспрессию ompF, ингибируя трансляцию и вызывая деградацию сообщения. Кроме того, в этой регуляторной системе играют роль и другие факторы, такие как белок-шаперон РНК StpA. Экспрессия micF контролируется как факторами окружающей среды, так и внутренними факторами стресса. Известно, что четыре транскрипционных регулятора связывают промоторную область micF и активируют экспрессию micF.

Распространение видов

Гомологи РНК MicF были охарактеризованы с помощью Саузерн-блоттинга у различных бактерий, включая Salmonella typhimurium , Klebsiella pneumoniae и Pseudomonas aeruginosa . ^[2] MicF также был идентифицирован вычислительным путем у Yersinia pestis и Yersinia enterocolitica . ^[3]

Ссылки

^ Делихас Н., Форст С. (октябрь 2001 г.). «MicF: ген антисмысловой РНК, участвующий в ответе Escherichia coli на глобальные стрессовые факторы». Журнал молекулярной биологии . 313 (1): 1–12. дои : 10.1006/jmbi.2001.5029. ПМИД 11601842.
^ Эстерлинг Л., Делихас Н. (май 1994 г.). «Ген регуляторной РНК micF присутствует в нескольких видах грамотрицательных бактерий и является филогенетически консервативным». Молекулярная микробиология . 12 (4): 639–646. doi :10.1111/j.1365-2958.1994.tb01051.x. PMID 7523827. S2CID 24389234.
^ Delihas N (июнь 2003 г.). «Аннотация и эволюционные связи малого регуляторного гена РНК micF и его целевого ompF у видов Yersinia». BMC Microbiology . 3 : 13. doi : 10.1186/1471-2180-3-13 . PMC 166144. PMID 12834539 .

Внешние ссылки

Страница для MicF RNA в Rfam

Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] Делихас Н., Форст С. (октябрь 2001 г.). «MicF: ген антисмысловой РНК, участвующий в ответе Escherichia coli на глобальные стрессовые факторы». Журнал молекулярной биологии . 313 (1): 1–12. дои : 10.1006/jmbi.2001.5029. ПМИД 11601842.

[pmid7523827-2] Эстерлинг Л., Делихас Н. (май 1994 г.). «Ген регуляторной РНК micF присутствует в нескольких видах грамотрицательных бактерий и является филогенетически консервативным». Молекулярная микробиология . 12 (4): 639–646. doi :10.1111/j.1365-2958.1994.tb01051.x. PMID 7523827. S2CID 24389234.

[pmid12834539-3] Delihas N (июнь 2003 г.). «Аннотация и эволюционные связи малого регуляторного гена РНК micF и его целевого ompF у видов Yersinia». BMC Microbiology . 3 : 13. doi : 10.1186/1471-2180-3-13 . PMC 166144. PMID 12834539 .