β-маннозидаза

Поиск
ЧВК	статьи
PubMed	статьи
NCBI	белки

β-маннозидаза
β-маннозидаза
Идентификаторы
Номер ЕС	3.2.1.25
Номер CAS	9025-43-8
Базы данных
ИнтЭнз	IntEnz вид
БРЕНДА	запись BRENDA
ExPASy	NiceZyme вид
КЕГГ	запись KEGG
МетаЦик	метаболический путь
ПРИАМ	профиль
Структуры PDB	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	AmiGO / QuickGO
ЧВК
Поиск
ЧВК	статьи
PubMed	статьи
NCBI	белки

МАНБА
Идентификаторы
Псевдонимы	MANBA , MANB1, маннозидаза бета
Внешние идентификаторы	OMIM : 609489; MGI : 88175; HomoloGene : 4317; GeneCards : MANBA; OMA :MANBA - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 4 (человек)
Конец	102,760,994 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	135,277,165 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	моноцит; ; стромальная клетка эндометрия; ; гранулоцит; ; околоушная железа; ; кора правого надпочечника; ; сухожилие двуглавой мышцы плеча; ; кровь; ; Ахиллово сухожилие; ; левый надпочечник; ; правое легкое;
	Верх выражен в
	мочка матки; ; вестибулярный сенсорный эпителий; ; вестибулярная мембрана улиткового протока; ; правая почка; ; строма костного мозга; ; эпителий тонкой кишки; ; собирательный проток мозгового вещества; ; человеческая почка; ; эпителий желудка; ; мешочек;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	гидролазная активность; гидролазная активность, гидролизующая О-гликозильные соединения; связывание маннозы; гидролазная активность, действующая на гликозильные связи; активность бета-маннозидазы;
Клеточный компонент	лизосома; лизосомальный просвет; плазматическая мембрана; мембрана азурофильных гранул; внутриклеточная мембранно-связанная органелла;
Биологический процесс	метаболизм; катаболический процесс олигосахаридов; дегрануляция нейтрофилов; процесс метаболизма углеводов; процесс катаболизма гликопротеина; катаболический процесс маннана;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	4126
	110173
	ENSG00000109323
	ENSMUSG00000028164
	О00462
	Q8K2I4
	NM_005908
	NM_027288
	NP_005899
	NP_081564
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у человека

β-Маннозидаза ( EC 3.2.1.25}, маннаназа , манназа , β- D -маннозидаза , β-маннозид манногидролаза , экзо-β- D -маннаназа , лизосомальная β A-маннозидаза ) — фермент с систематическим названием β- D -маннозид манногидролаза , который у людей кодируется геном MANBA . ^[5]^[6]^[7]^[8]^[9]^[10] Этот фермент катализирует следующую химическую реакцию

Гидролиз терминальных, невосстанавливающих остатков β- D -маннозы в β- D -маннозидах

Этот ген кодирует члена семейства гликозилгидролаз 2. Кодируемый белок локализуется в лизосоме , где он является конечной экзогликозидазой в пути катаболизма N -связанного гликопротеинового олигосахарида . Мутации в этом гене связаны с β-маннозидозом , лизосомной болезнью накопления , которая имеет широкий спектр неврологических проявлений. ^[5]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000109323 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028164 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab "Ген Энтреза: маннозидаза".
^ Chen H, Leipprandt JR, Traviss CE, Sopher BL, Jones MZ, Cavanagh KT, Friderici KH (февраль 1995 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика бычьей бета-маннозидазы». J. Biol. Chem . 270 (8): 3841– 8. doi : 10.1074/jbc.270.8.3841 . PMID 7876128.
^ Адамс, М.; Рихтмайер, НК и Хадсон, К.С. (1943). «Некоторые ферменты, присутствующие в высокоочищенных препаратах инвертазы; вклад в изучение фруктофуранозидаз, галактозидаз, глюкозидаз и маннозидаз». J. Am. Chem. Soc . 65 (7): 1369– 1380. doi :10.1021/ja01247a029.
^ Бартоломью, BA и Перри, AL (1973). «Свойства активности β-маннозидазы синовиальной жидкости». Biochim. Biophys. Acta . 315 (1): 123– 127. doi :10.1016/0005-2744(73)90136-8. PMID 4743897.
^ Деуэль, Х.; Левуенбергер Р. и Хубер Г. (1950). «Über den enzymatischen Abbau von Carubin, dem Galaktomannan aus Ceratonia siliqua L». Хелв. Хим. Акта . 33 (4): 942–946 . doi :10.1002/hlca.19500330424.
^ Хайлин, Дж. В. и Савай, К. (1964). «Ферментативный гидролиз галактоманнана Leucaena glauca. Выделение кристаллической деполимеразы галактоманнана». J. Biol. Chem . 239 : 990–992 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)91377-3 . PMID 14165949.

Дальнейшее чтение

Больмстедт А., Шёландер С., Хансен Дж. Э. и др. (1996). «Влияние N-связанных гликанов в области V4-V5 гликопротеина вируса иммунодефицита человека типа 1 gp160 на индукцию вируснейтрализующего гуморального ответа». J. Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol . 12 (3): 213– 20. doi : 10.1097/00042560-199607000-00001 . PMID 8673525.
Kalsi G, Kuo PH, Aliev F, et al. (2010). «Систематический скрининг chr4q22-q32 на основе генов выявляет связь нового гена восприимчивости, DKK2, с количественным признаком количества симптомов алкогольной зависимости». Hum. Mol. Genet . 19 (12): 2497– 506. doi : 10.1093/hmg/ddq112. PMC 2876884. PMID 20332099.
Levade T, Graber D, Flurin V и др. (1994). «Дефицит человеческой β-маннозидазы, связанный с периферической нейропатией». Ann. Neurol . 35 (1): 116– 9. doi :10.1002/ana.410350119. PMID 8285582. S2CID 71932852.
Hu H, Shioda T, Moriya C и др. (1996). «Инфекционность лентивирусов человека и других приматов активируется десиалилированием поверхности вириона». J. Virol . 70 (11): 7462– 70. doi :10.1128/jvi.70.11.7462-7470.1996. PMC 190813. PMID 8892864 .
Yeh JC, Seals JR, Murphy CI и др. (1993). «Сайт-специфическое N-гликозилирование и олигосахаридные структуры рекомбинантного ВИЧ-1 gp120, полученного из системы экспрессии бакуловируса». Биохимия . 32 (41): 11087– 99. doi :10.1021/bi00092a019. PMID 8218172.
Sabourdy F, Labauge P, Stensland HM и др. (2009). «Мутация MANBA, приводящая к остаточной активности бета-маннозидазы, связанной с тяжелой лейкоэнцефалопатией: возможный вариант псевдодефицита». BMC Med. Genet . 10 : 84. doi : 10.1186/1471-2350-10-84 . PMC 2745377. PMID 19728872 .
Hosgood HD, Zhang L, Shen M и др. (2009). «Связь между генетическими вариантами в VEGF, ERCC3 и профессиональной гематотоксичностью бензола». Occup Environ Med . 66 (12): 848– 53. doi :10.1136/oem.2008.044024. PMC 2928224. PMID 19773279 .
Alkhayat AH, Kraemer SA, Leipprandt JR и др. (1998). «Характеристика ДНК бета-маннозидазы человека и первая идентификация мутации, связанной с бета-маннозидозом человека». Hum. Mol. Genet . 7 (1): 75– 83. doi : 10.1093/hmg/7.1.75 . PMID 9384606.
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
Папандреу М.Дж., Фенуйе Э. (1997). «Влияние различных обработок гликозидазой на устойчивость оболочки ВИЧ-1 к деградации». FEBS Lett . 406 ( 1–2 ): 191–5 . doi : 10.1016/S0014-5793(97)00273-1 . PMID 9109416. S2CID 17660.
Gao J, Arbman G, He L и др. (2008). «Полиморфизм MANBA был связан с повышенным риском колоректального рака у шведов, но не у китайцев». Acta Oncol . 47 (3): 372– 8. doi :10.1080/02841860701644052. PMID 17899454. S2CID 45674826.
Robinson WE, Montefiori DC, Mitchell WM (1987). «Доказательства того, что остатки маннозила участвуют в патогенезе вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1)». AIDS Res. Hum. Retroviruses . 3 (3): 265– 82. doi :10.1089/aid.1987.3.265. PMID 2829950.
Montefiori DC, Robinson WE, Mitchell WM (1988). "Роль N-гликозилирования белка в патогенезе вируса иммунодефицита человека типа 1". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 85 (23): 9248– 52. Bibcode :1988PNAS...85.9248M. doi : 10.1073/pnas.85.23.9248 . PMC 282716 . PMID 3264072.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Фенуйе Э., Джонс И., Пауэлл Б. и др. (1993). «Функциональная роль гликанового кластера эктодомена трансмембранного гликопротеина (gp41) вируса иммунодефицита человека типа 1». J. Virol . 67 (1): 150– 60. doi :10.1128/jvi.67.1.150-160.1993. PMC 237347. PMID 8093218 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2002). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Land A, Braakman I (2001). «Сворачивание гликопротеина оболочки вируса иммунодефицита человека типа 1 в эндоплазматическом ретикулуме». Biochimie . 83 (8): 783– 90. doi :10.1016/S0300-9084(01)01314-1. hdl : 1874/5091 . PMID 11530211. S2CID 13576808.
Blough HA, Pauwels R, De Clercq E и др. (1986). «Ингибиторы гликозилирования блокируют экспрессию гликопротеинов LAV/HTLV-III (ВИЧ)». Biochem. Biophys. Res. Commun . 141 (1): 33– 8. doi :10.1016/S0006-291X(86)80330-8. PMID 3099781.
Hart ML, Saifuddin M, Spear GT (2003). «Ингибиторы гликозилирования и нейраминидаза усиливают связывание и нейтрализацию вируса иммунодефицита человека типа 1 маннозосвязывающим лектином». J. Gen. Virol . 84 (Pt 2): 353– 60. doi : 10.1099/vir.0.18734-0 . PMID 12560567.

Внешние ссылки

Расположение генома человека MANBA и страница с подробностями гена MANBA в браузере геномов UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q8K2I4 (мышиная бета-маннозидаза) на сайте PDBe-KB .

Эта статья о гене на хромосоме 4 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000109323 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028164 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] "Ген Энтреза: маннозидаза".

[pmid7876128-6] Chen H, Leipprandt JR, Traviss CE, Sopher BL, Jones MZ, Cavanagh KT, Friderici KH (февраль 1995 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика бычьей бета-маннозидазы». J. Biol. Chem . 270 (8): 3841– 8. doi : 10.1074/jbc.270.8.3841 . PMID 7876128.

[7] Адамс, М.; Рихтмайер, НК и Хадсон, К.С. (1943). «Некоторые ферменты, присутствующие в высокоочищенных препаратах инвертазы; вклад в изучение фруктофуранозидаз, галактозидаз, глюкозидаз и маннозидаз». J. Am. Chem. Soc . 65 (7): 1369– 1380. doi :10.1021/ja01247a029.

[8] Бартоломью, BA и Перри, AL (1973). «Свойства активности β-маннозидазы синовиальной жидкости». Biochim. Biophys. Acta . 315 (1): 123– 127. doi :10.1016/0005-2744(73)90136-8. PMID 4743897.

[9] Деуэль, Х.; Левуенбергер Р. и Хубер Г. (1950). «Über den enzymatischen Abbau von Carubin, dem Galaktomannan aus Ceratonia siliqua L». Хелв. Хим. Акта . 33 (4): 942–946 . doi :10.1002/hlca.19500330424.

[10] Хайлин, Дж. В. и Савай, К. (1964). «Ферментативный гидролиз галактоманнана Leucaena glauca. Выделение кристаллической деполимеразы галактоманнана». J. Biol. Chem . 239 : 990–992 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)91377-3 . PMID 14165949.