МАТР3

МАТР3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1X4D, 1X4F
Идентификаторы
Псевдонимы	MATR3 , ALS21, MPD2, VCPDM, матрин 3
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 164015; МГИ : 1298379; гомологен : 7830; GeneCards : MATR3; OMA :MATR3 — ортологи
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ионов цинка; связывание белков; структурная молекулярная активность; связывание ионов металлов; связывание нуклеиновых кислот; Связывание РНК; идентичное связывание белков; связывание miRNA;
Клеточный компонент	ядерная матрица; внутренняя ядерная мембрана; мембрана; ядро;
Биологический процесс	посттранскрипционная регуляция экспрессии генов; активация врожденного иммунного ответа; процесс иммунной системы; врожденный иммунный ответ; развитие сердечного клапана; развитие межжелудочковой перегородки;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	9782
	17184
	ENSG00000015479 ; ENSG00000280987
	ENSMUSG00000037236
	Р43243
	Q8K310
NM_001194954 ; NM_001194955 ; NM_001194956 ; NM_001282278 ; NM_018834;
	NM_199189
	NM_010771
NP_001181883 ; NP_001181884 ; NP_001181885 ; NP_001269207 ; NP_061322;
	NP_954659
NP_034901 ; NP_001386912 ; NP_001386913 ; NP_001386914 ; NP_001386915;
	NP_001386917 ; NP_001386918 ; NP_001386919 ; NP_001386920 ; NP_001386921 ; NP_001386922
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок млекопитающих обнаружен у Homo sapiens

Матрин-3 — это белок , который у людей кодируется геном MATR3 . [ ^3]^[4]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, локализован в ядерном матриксе . Он может играть роль в транскрипции или может взаимодействовать с другими белками ядерного матрикса, образуя внутреннюю фиброгранулярную сеть. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. ^[4]

Патология

Мутации в гене Matrin 3 связаны с семейным боковым амиотрофическим склерозом . ^[5]

Ссылки

^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Belgrader P, Dey R, Berezney R (июнь 1991 г.). «Молекулярное клонирование матрина 3. Белок ядерного матрикса массой 125 килодальтон содержит обширный кислый домен». J Biol Chem . 266 (15): 9893–9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)92902-9 . PMID 2033075.
^ ab «Ген Энтрез: матрин MATR3 3» .
^ Джонсон Дж.О., Пиоро Э.П., Берингер А., Чиа Р., Фейт Х., Рентон А.Е., Плинер Х.А., Абрамзон Ю., Маранги Дж., Уинборн Б.Дж., Гиббс Дж.Р., Ноллс М.А., Морган С., Шоаи М., Харди Дж., Питтман А., Оррелл РВ, Маласпина А, Сидле КЦ, Фратта П, Хармс МБ, Балох РХ, Пестронк А, Вейль CC, Рогаева Э, Зинман Л, Дрори ВЕ, Боргеро Г, Мора Г, Кальво А, Ротштейн Дж.Д., Дреппер С, Сендтнер М, Синглтон А.Б., Тейлор Дж.П., Куксон М.Р., Рестаньо Г., Сабателли М., Баузер Р., Чио А. , Трейнор Би Джей (2014). «Мутации в гене Matrin 3 вызывают семейный боковой амиотрофический склероз». Нат. Neurosci . 17 (5): 664–6. doi :10.1038/nn.3688. PMC 4000579 . PMID 24686783.

Дальнейшее чтение

Stuurman N; Meijne AM; van der Pol AJ; et al. (1990). «Ядерный матрикс из клеток разного происхождения. Доказательства общего набора матричных белков». J. Biol. Chem . 265 (10): 5460–5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)39383-4 . PMID 2180926.
Andersson B; Wentland MA; Ricafrente JY; et al. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Anal. Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W; Andersson B; Worley KC; et al. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК». Genome Res . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .
Окумара К; Ногами М; Мацушима Й; и др. (1998). «Картирование ядерного белка, связывающего ДНК человека (NP220), на участке хромосомы 2p13.1-p13.2 и его связь с матрином 3». Biosci. Biotechnol. Biochem . 62 (8): 1640–2. doi : 10.1271/bbb.62.1640 . PMID 9757574.
Нагасе Т.; Ишикава К.; Суяма М.; и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 5 (5): 277–86. CiteSeerX 10.1.1.529.4378 . doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452.
Hu RM; Han ZG; Song HD; et al. (2000). «Профилирование экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H. doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901. PMID 10931946.
Чжан З., Кармайкл Г. Г. (2001). «Судьба дцРНК в ядре: комплекс, содержащий p54(nrb), опосредует ядерное удержание РНК, отредактированных беспорядочно от A к I». Cell . 106 (4): 465–75. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00466-4 . PMID 11525732. S2CID 18799711.
Bernert G, Fountoulakis M, Lubec G (2003). «Многократно сниженные уровни белка matrin 3, сниженный двигательный белок HMP и hlark в мозге плода с синдромом Дауна». Proteomics . 2 (12): 1752–7. doi :10.1002/1615-9861(200212)2:12<1752::AID-PROT1752>3.0.CO;2-Y. PMID 12469345. S2CID 32160196.
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Zhang C; Dowd DR; Staal A; et al. (2003). «Ядерный коактиватор-62 кДа/Ski-взаимодействующий белок — это связанный с ядерным матриксом коактиватор, который может связывать транскрипцию, опосредованную рецептором витамина D, и сплайсинг РНК». J. Biol. Chem . 278 (37): 35325–36. doi : 10.1074/jbc.M305191200 . PMID 12840015.
Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (2003). "hLodestar/HuF2 взаимодействует с CDC5L и участвует в сплайсинге пре-мРНК". Biochem. Biophys. Res. Commun . 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359 . doi :10.1016/S0006-291X(03)01486-4. PMID 12927788.
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Босолей СА; Едриховски М; Шварц Д; и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Rual JF; Venkatesan K; Hao T; et al. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Lim J; Hao T; Shaw C; et al. (2006). «Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье у человека». Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685.
Olsen JV; Blagoev B; Gnad F; et al. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM; Chu P; Elisma F; et al. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . PMID 17353931.
Валенсия, Калифорния, Джу В, Лю Р (2007). «Матрин 3 представляет собой белок, связывающий Ca2+/кальмодулин, расщепляемый каспазами». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 361 (2): 281–6. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.06.156. ПМИД 17658460.

Эта статья о белках — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[2] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2033075-3] Belgrader P, Dey R, Berezney R (июнь 1991 г.). «Молекулярное клонирование матрина 3. Белок ядерного матрикса массой 125 килодальтон содержит обширный кислый домен». J Biol Chem . 266 (15): 9893–9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)92902-9 . PMID 2033075.

[entrez-4] «Ген Энтрез: матрин MATR3 3» .

[pmid24686783-5] Джонсон Дж.О., Пиоро Э.П., Берингер А., Чиа Р., Фейт Х., Рентон А.Е., Плинер Х.А., Абрамзон Ю., Маранги Дж., Уинборн Б.Дж., Гиббс Дж.Р., Ноллс М.А., Морган С., Шоаи М., Харди Дж., Питтман А., Оррелл РВ, Маласпина А, Сидле КЦ, Фратта П, Хармс МБ, Балох РХ, Пестронк А, Вейль CC, Рогаева Э, Зинман Л, Дрори ВЕ, Боргеро Г, Мора Г, Кальво А, Ротштейн Дж.Д., Дреппер С, Сендтнер М, Синглтон А.Б., Тейлор Дж.П., Куксон М.Р., Рестаньо Г., Сабателли М., Баузер Р., Чио А. , Трейнор Би Джей (2014). «Мутации в гене Matrin 3 вызывают семейный боковой амиотрофический склероз». Нат. Neurosci . 17 (5): 664–6. doi :10.1038/nn.3688. PMC 4000579 . PMID 24686783.